Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_06012
• Subject: NM_009906.6
• Aligned Length: 1692
• Identities: 1459
• Gaps: 9

Alignment

Query    1  ATGGGACTCCAAGCCTGCCTCCTAGGGCTCTTTGCCCTCATCCTCTCTGGCAAATGCAGTTACAGCCCGGAGCC  74
            |||||||||||||||.||||||||||||||.||||.|||.||.||.|.||||||||||.|||||.|||.|||||
Sbjct    1  ATGGGACTCCAAGCCCGCCTCCTAGGGCTCCTTGCTCTCGTCATCGCCGGCAAATGCACTTACAACCCTGAGCC  74

Query   75  CGACCAGCGGAGGACGCTGCCCCCAGGCTGGGTGTCCCTGGGCCGTGCGGACCCTGAGGAAGAGCTGAGTCTCA  148
            .|||||||||.|||.||||||.|||||||||||||||||||||||.|.|||.||.|||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGACCAGCGGTGGATGCTGCCTCCAGGCTGGGTGTCCCTGGGCCGCGTGGATCCCGAGGAAGAGCTGAGTCTCA  148

Query  149  CCTTTGCCCTGAGACAGCAGAATGTGGAAAGACTCTCGGAGCTGGTGCAGGCTGTGTCGGATCCCAGCTCTCCT  222
            |.|||||.||||.|||||.|||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  149  CTTTTGCGCTGAAACAGCGGAACCTGGAAAGACTCTCGGAGCTGGTGCAGGCTGTGTCGGATCCTAGCTCTCCT  222

Query  223  CAATACGGAAAATACCTGACCCTAGAGAATGTGGCTGATCTGGTGAGGCCATCCCCACTGACCCTCCACACGGT  296
            |||||.|||||.|||||.|||||.|||.||||.|||||.|||||....|||||.||.||||||||||.|||.||
Sbjct  223  CAATATGGAAAGTACCTAACCCTGGAGGATGTAGCTGAGCTGGTTCAACCATCACCCCTGACCCTCCTCACTGT  296

Query  297  GCAAAAATGGCTCTTGGCAGCCGGAGCCCAGAAGTGCCATTCTGTGATCACACAGGACTTTCTGACTTGCTGGC  370
            .|||||.|||||||..|||||.|||||||.|||.|||.||||.||||.|||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCAAAAGTGGCTCTCAGCAGCTGGAGCCCGGAACTGCGATTCAGTGACCACCCAGGACTTTCTGACTTGCTGGC  370

Query  371  TGAGCATCCGACAAGCAGAGCTGCTGCTCCCTGGGGCTGAGTTTCATCACTATGTGGGAGGACCTACGGAAACC  444
            ||||..|||||||.||.||||||||||||||.||.|||||||||||||.||||||.||.||||||||..|.|||
Sbjct  371  TGAGTGTCCGACAGGCTGAGCTGCTGCTCCCAGGAGCTGAGTTTCATCGCTATGTAGGGGGACCTACAAAGACC  444

Query  445  CATGTTGTAAGGTCCCCACATCCCTACCAGCTTCCACAGGCCTTGGCCCCCCATGTGGACTTTGTGGGGGGACT  518
            ||||||.||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||
Sbjct  445  CATGTTATAAGGTCCCCACATCCCTACCAGCTTCCCCAGGCCTTGGCCCCTCATGTGGATTTTGTGGGGGGGCT  518

Query  519  GCACCGTTTTCCCCCAACATCATCCCTGAGGCAACGTCCTGAGCC---GCAGGTGACAGGGACTGTAGGCCTGC  589
            |||||||||.||||   |.|||||.|..||.||||||||.||.||   .|||||   |||.|||||..||||||
Sbjct  519  GCACCGTTTCCCCC---CTTCATCTCCAAGACAACGTCCAGAACCACAACAGGT---AGGAACTGTTAGCCTGC  586

Query  590  ATCTGGGGGTAACCCCCTCTGTGATCCGTAAGCGATACAACTTGACCTCACAAGACGTGGGCTCTGGCACCAGC  663
            |..||||.||.||.||.||||||.|||||.|||||||||||.||||..|..||||.||||||||.|||||||.|
Sbjct  587  ACTTGGGAGTGACTCCGTCTGTGCTCCGTCAGCGATACAACCTGACAGCCAAAGATGTGGGCTCAGGCACCACC  660

Query  664  AATAACAGCCAAGCCTGTGCCCAGTTCCTGGAGCAGTATTTCCATGACTCAGACCTGGCTCAGTTCATGCGCCT  737
            ||.||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||.||||.||.|||.||.|||||||||||||
Sbjct  661  AACAATAGCCAGGCCTGTGCCCAGTTCCTGGAACAGTACTTCCATAACTCGGATCTGACTGAGTTCATGCGCCT  734

Query  738  CTTCGGTGGCAACTTTGCACATCAGGCATCAGTAGCCCGTGTGGTTGGACAACAGGGCCGGGGCCGGGCCGGGA  811
            .||||||||||..|||.||||.|||||.||||||||....||.||||||.|.||.||.||.|||||.||.||||
Sbjct  735  ATTCGGTGGCAGTTTTACACACCAGGCCTCAGTAGCAAAAGTTGTTGGAAAGCAAGGGCGAGGCCGAGCTGGGA  808

Query  812  TTGAGGCCAGTCTAGATGTGCAGTACCTGATGAGTGCTGGTGCCAACATCTCCACCTGGGTCTACAGTAGCCCT  885
            |.||||||||||||||||||.|.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  809  TCGAGGCCAGTCTAGATGTGGAATACCTGATGAGTGCTGGTGCCAATATCTCCACTTGGGTCTACAGTAGCCCT  882

Query  886  GGCCGGCATGAGGGACAGGAGCCCTTCCTGCAGTGGCTCATGCTGCTCAGTAATGAGTCAGCCCTGCCACATGT  959
            |||||.|||||||.|||||||||||||.|.||.||||||.||||.||.||.|||||||||.|..||||||||||
Sbjct  883  GGCCGCCATGAGGCACAGGAGCCCTTCTTACAATGGCTCCTGCTTCTTAGCAATGAGTCATCTTTGCCACATGT  956

Query  960  GCATACTGTGAGCTATGGAGATGATGAGGACTCCCTCAGCAGCGCCTACATCCAGCGGGTCAACACTGAGCTCA  1033
            .|||||||||||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||..||||||||||.|.||||||||||||.|||
Sbjct  957  ACATACTGTGAGTTACGGAGACGATGAAGACTCCCTCAGCAGCATCTACATCCAGAGAGTCAACACTGAGTTCA  1030

Query 1034  TGAAGGCTGCCGCTCGGGGTCTCACCCTGCTCTTCGCCTCAGGTGACAGTGGGGCCGGGTGTTGGTCTGTCTCT  1107
            ||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||.|||.||.|||||||||||||||||.
Sbjct 1031  TGAAGGCTGCTGCTCGGGGTCTCACCCTCCTTTTTGCCTCAGGTGACACTGGAGCTGGGTGTTGGTCTGTCTCC  1104

Query 1108  GGAAGACACGAGTTCCGCCCTACCTTCCCTGCCTCCAGCCCCTATGTCACCACAGTGGGAGGCACATCCTTCCA  1181
            |||||||||.||||||||||||.|||||||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||.||.||||||.|
Sbjct 1105  GGAAGACACAAGTTCCGCCCTAGCTTCCCTGCTTCCAGCCCCTATGTTACTACAGTTGGAGGAACCTCCTTCAA  1178

Query 1182  GGAACCTTTCCTCATCACAAATGAAATTGTTGACTATATCAGTGGTGGTGGCTTCAGCAATGTGTTCCCACGGC  1255
            |.|.|||||||||||||||.|||||.|.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1179  GAATCCTTTCCTCATCACAGATGAAGTAGTTGACTATATCAGTGGTGGAGGCTTCAGCAATGTTTTCCCACGGC  1252

Query 1256  CTTCATACCAGGAGGAAGCTGTAACGAAGTTCCTGAGCTCTAGCCCCCACCTGCCACCATCCAGTTACTTCAAT  1329
            ||.|.||||||||||||||.||..|..|||||.|||..||.|||.|.||.||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1253  CTCCCTACCAGGAGGAAGCAGTGGCCCAGTTCTTGAAATCCAGCTCTCATCTACCACCATCCAGTTACTTCAAT  1326

Query 1330  GCCAGTGGCCGTGCCTACCCAGATGTGGCTGCACTTTCTGATGGCTACTGGGTGGTCAGCAACAGAGTGCCCAT  1403
            ||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||..||.|||||
Sbjct 1327  GCTAGTGGCCGTGCCTACCCAGATGTTGCCGCACTATCTGATGGCTACTGGGTGGTCAGCAACATGGTCCCCAT  1400

Query 1404  TCCATGGGTGTCCGGAACCTCGGCCTCTACTCCAGTGTTTGGGGGGATCCTATCCTTGATCAATGAGCACAGGA  1477
            |||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||..||||||||||.|||||||||||.|
Sbjct 1401  TCCATGGGTATCTGGAACCTCGGCCTCTACTCCAGTGTTTGGGGGAATTTTATCCTTGATAAATGAGCACAGAA  1474

Query 1478  TCCTTAGTGGCCGCCCCCCTCTTGGCTTTCTCAACCCAAGGCTCTACCAGCAGCATGGGGCAGGACTCTTTGAT  1551
            ||||.|.|||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1475  TCCTCAATGGCCGCCCTCCTCTTGGCTTTCTCAACCCCAGGCTCTATCAGCAGCATGGGACAGGACTCTTTGAT  1548

Query 1552  GTAACCCGTGGCTGCCATGAGTCCTGTCTGGATGAAGAGGTAGAGGGCCAGGGTTTCTGCTCTGGTCCTGGCTG  1625
            |||||||..|||||||||||||||||||||.|||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1549  GTAACCCACGGCTGCCATGAGTCCTGTCTGAATGAAGAAGTGGAGGGTCAGGGTTTCTGCTCTGGTCCTGGCTG  1622

Query 1626  GGATCCTGTAACAGGCTGGGGAACACCCAACTTCCCAGCTTTGCTGAAGACTCTACTCAACCCC  1689
            |||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||..|.||||||||.||.||||||||.
Sbjct 1623  GGATCCTGTGACAGGTTGGGGAACACCCAACTTCCCAGCCCTACTGAAGACCCTGCTCAACCCT  1686