Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_06034
- Subject:
- NM_001145134.2
- Aligned Length:
- 2316
- Identities:
- 2213
- Gaps:
- 102
Alignment
Query 1 ATGGCGGAAGCTCACCAGGCCGTGGCCTTCCAGTTCACGGTGACCCCAGACGGGGTCGACTTCCGGCTCAGTCG 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCGGAAGCTCACCAGGCCGTGGCCTTCCAGTTCACGGTGACCCCAGACGGGGTCGACTTCCGGCTCAGTCG 74
Query 75 GGAGGCCCTGAAACACGTCTACCTGTCTGGGATCAACTCCTGGAAGAAACGCCTGATCCGCATCAAGAATGGCA 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GGAGGCCCTGAAACACGTCTACCTGTCTGGGATCAACTCCTGGAAGAAACGCCTGATCCGCATCAAGAATGGCA 148
Query 149 TCCTCAGGGGCGTGTACCCTGGCAGCCCCACCAGCTGGCTGGTCGTCATCATGGCAACAGTGGGTTCCTCCTTC 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TCCTCAGGGGCGTGTACCCTGGCAGCCCCACCAGCTGGCTGGTCGTCATCATGGCAACAGTGGGTTCCTCCTTC 222
Query 223 TGCAACGTGGACATCTCCTTGGGGCTGGTCAGTTGCATCCAGAGATGCCTCCCTCAGGGGTGTGGCCCCTACCA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 TGCAACGTGGACATCTCCTTGGGGCTGGTCAGTTGCATCCAGAGATGCCTCCCTCAGGGGTGTGGCCCCTACCA 296
Query 297 GACCCCGCAGACCCGGGCACTTCTCAGCATGGCCATCTTCTCCACGGGCGTCTGGGTGACGGGCATCTTCTTCT 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GACCCCGCAGACCCGGGCACTTCTCAGCATGGCCATCTTCTCCACGGGCGTCTGGGTGACGGGCATCTTCTTCT 370
Query 371 TCCGCCAAACCCTGAAGCTGCTTCTCTGCTACCATGGGTGGATGTTTGAGATGCATGGCAAGACCAGCAACTTG 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TCCGCCAAACCCTGAAGCTGCTTCTCTGCTACCATGGGTGGATGTTTGAGATGCATGGCAAGACCAGCAACTTG 444
Query 445 ACCAGGATCTGGGCTATGTGTATCCGCCTTCTATCCAGCCGGCACCCTATGCTCTACAGCTTCCAGACATCTCT 518
|||||||||||||||
Sbjct 445 ACCAGGATCTGGGCT----------------------------------------------------------- 459
Query 519 GCCCAAGCTTCCTGTGCCCAGGGTGTCAGCCACAATTCAGCGGTACCTAGAGTCTGTGCGCCCCTTGTTGGATG 592
|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 460 -------------------------------------------TACCTAGAGTCTGTGCGCCCCTTGTTGGATG 490
Query 593 ATGAGGAATATTACCGCATGGAGTTGCTGGCCAAAGAATTCCAGGACAAGACTGCCCCCAGGCTGCAGAAATAC 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 491 ATGAGGAATATTACCGCATGGAGTTGCTGGCCAAAGAATTCCAGGACAAGACTGCCCCCAGGCTGCAGAAATAC 564
Query 667 CTGGTGCTCAAGTCATGGTGGGCAAGTAACTATGTGAGTGACTGGTGGGAAGAGTACATCTACCTTCGAGGCAG 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 565 CTGGTGCTCAAGTCATGGTGGGCAAGTAACTATGTGAGTGACTGGTGGGAAGAGTACATCTACCTTCGAGGCAG 638
Query 741 GAGCCCTCTCATGGTGAACAGCAACTATTATGTCATGGACCTTGTGCTCATCAAGAATACAGACGTGCAGGCAG 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 639 GAGCCCTCTCATGGTGAACAGCAACTATTATGTCATGGACCTTGTGCTCATCAAGAATACAGACGTGCAGGCAG 712
Query 815 CCCGCCTGGGAAACATCATCCACGCCATGATCATGTATCGCCGTAAACTGGACCGTGAAGAAATCAAGCCTGTG 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 713 CCCGCCTGGGAAACATCATCCACGCCATGATCATGTATCGCCGTAAACTGGACCGTGAAGAAATCAAGCCTGTG 786
Query 889 ATGGCACTGGGCATAGTGCCTATGTGCTCCTACCAGATGGAGGGGATGTTCAACACCACTCGGATCCCGGGCAA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 787 ATGGCACTGGGCATAGTGCCTATGTGCTCCTACCAGATGGAGAGGATGTTCAACACCACTCGGATCCCGGGCAA 860
Query 963 GGACACAGATGTGCTACAGCACCTCTCAGACAGCCGGCACGTGGCTGTCTACCACAAGGGACGCTTCTTCAAGC 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 861 GGACACAGATGTGCTACAGCACCTCTCAGACAGCCGGCACGTGGCTGTCTACCACAAGGGACGCTTCTTCAAGC 934
Query 1037 TGTGGCTCTATGAGGGCGCCCGTCTGCTCAAGCCTCAGGATCTGGAGATGCAGTTCCAGAGGATCCTGGACGAC 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 935 TGTGGCTCTATGAGGGCGCCCGTCTGCTCAAGCCTCAGGATCTGGAGATGCAGTTCCAGAGGATCCTGGACGAC 1008
Query 1111 CCCTCCCCACCTCAGCCTGGGGAGGAGAAGCTGGCAGCCCTCACTGCAGGAGGAAGGGTGGAGTGGGCGCAGGC 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1009 CCCTCCCCACCTCAGCCTGGGGAGGAGAAGCTGGCAGCCCTCACTGCAGGAGGAAGGGTGGAGTGGGCGCAGGC 1082
Query 1185 ACGCCAGGCCTTCTTTAGCTCTGGAAAGAATAAGGCTGCCTTGGAGGCCATCGAGCGTGCCGCTTTCTTCGTGG 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1083 ACGCCAGGCCTTCTTTAGCTCTGGAAAGAATAAGGCTGCCTTGGAGGCCATCGAGCGTGCCGCTTTCTTCGTGG 1156
Query 1259 CCCTGGATGAGGAATCCTACTCCTATGACCCCGAAGATGAGGCCAGCCTCAGCCTCTATGGCAAGGCCCTGCTA 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1157 CCCTGGATGAGGAATCCTACTCCTATGACCCCGAAGATGAGGCCAGCCTCAGCCTCTATGGCAAGGCCCTGCTA 1230
Query 1333 CATGGCAACTGCTACAACAGGTGGTTTGACAAATCCTTCACTCTCATTTCCTTCAAGAATGGCCAGTTGGGTCT 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1231 CATGGCAACTGCTACAACAGGTGGTTTGACAAATCCTTCACTCTCATTTCCTTCAAGAATGGCCAGTTGGGTCT 1304
Query 1407 CAATGCAGAGCATGCGTGGGCAGATGCTCCCATCATTGGGCACCTCTGGGAGTTTGTCCTGGGCACAGACAGCT 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1305 CAATGCAGAGCATGCGTGGGCAGATGCTCCCATCATTGGGCACCTCTGGGAGTTTGTCCTGGGCACAGACAGCT 1378
Query 1481 TCCACCTGGGCTACACGGAGACCGGGCACTGCCTGGGCAAACCGAACCCTGCGCTCGCACCTCCTACACGGCTG 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1379 TCCACCTGGGCTACACGGAGACCGGGCACTGCCTGGGCAAACCGAACCCTGCGCTCGCACCTCCTACACGGCTG 1452
Query 1555 CAGTGGGACATTCCAAAACAGTGCCAGGCGGTCATCGAGAGTTCCTACCAGGTGGCCAAGGCGTTGGCAGACGA 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1453 CAGTGGGACATTCCAAAACAGTGCCAGGCGGTCATCGAGAGTTCCTACCAGGTGGCCAAGGCGTTGGCAGACGA 1526
Query 1629 CGTGGAGTTGTACTGCTTCCAGTTCCTGCCCTTTGGCAAAGGCCTCATCAAGAAGTGCCGGACCAGCCCTGATG 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1527 CGTGGAGTTGTACTGCTTCCAGTTCCTGCCCTTTGGCAAAGGCCTCATCAAGAAGTGCCGGACCAGCCCTGATG 1600
Query 1703 CCTTTGTGCAGATCGCGCTGCAGCTGGCTCACTTCCGGGACAGGGGTAAGTTCTGCCTGACCTATGAGGCCTCA 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1601 CCTTTGTGCAGATCGCGCTGCAGCTGGCTCACTTCCGGGACAGGGGTAAGTTCTGCCTGACCTATGAGGCCTCA 1674
Query 1777 ATGACCAGAATGTTCCGGGAGGGACGGACTGAGACTGTGCGTTCCTGTACCAGCGAGTCCACAGCCTTTGTGCA 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1675 ATGACCAGAATGTTCCGGGAGGGACGGACTGAGACTGTGCGTTCCTGTACCAGCGAGTCCACAGCCTTTGTGCA 1748
Query 1851 GGCCATGATGGAGGGGTCCCACACAAAAGCAGACCTGCGAGATCTCTTCCAGAAGGCTGCTAAGAAGCACCAGA 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1749 GGCCATGATGGAGGGGTCCCACACAAAAGCAGACCTGCGAGATCTCTTCCAGAAGGCTGCTAAGAAGCACCAGA 1822
Query 1925 ATATGTACCGCCTGGCCATGACCGGGGCAGGGATCGACAGGCACCTCTTCTGCCTTTACTTGGTCTCCAAGTAC 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1823 ATATGTACCGCCTGGCCATGACCGGGGCAGGGATCGACAGGCACCTCTTCTGCCTTTACTTGGTCTCCAAGTAC 1896
Query 1999 CTAGGAGTCAGCTCTCCTTTCCTTGCTGAGGTGCTCTCGGAACCCTGGCGTCTCTCCACCAGCCAGATCCCCCA 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1897 CTAGGAGTCAGCTCTCCTTTCCTTGCTGAGGTGCTCTCGGAACCCTGGCGTCTCTCCACCAGCCAGATCCCCCA 1970
Query 2073 ATCCCAGATCCGCATGTTCGACCCAGAGCAGCACCCCAATCACCTGGGCGCTGGAGGTGGCTTTGGCCCTGTAG 2146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1971 ATCCCAGATCCGCATGTTCGACCCAGAGCAGCACCCCAATCACCTGGGCGCTGGAGGTGGCTTTGGCCCTGTAG 2044
Query 2147 CAGATGATGGCTATGGAGTTTCCTACATGATTGCAGGCGAGAACACGATCTTCTTCCACATCTCCAGCAAGTTC 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2045 CAGATGATGGCTATGGAGTTTCCTACATGATTGCAGGCGAGAACACGATCTTCTTCCACATCTCCAGCAAGTTC 2118
Query 2221 TCAAGCTCAGAGACGAACGCCCAGCGCTTTGGAAACCACATCCGCAAAGCCCTGCTGGACATTGCTGATCTTTT 2294
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2119 TCAAGCTCAGAGACGAACGCCCAGCGCTTTGGAAACCACATCCGCAAAGCCCTGCTGGACATTGCTGATCTTTT 2192
Query 2295 CCAAGTTCCCAAGGCCTACAGC 2316
||||||||||||||||||||||
Sbjct 2193 CCAAGTTCCCAAGGCCTACAGC 2214