Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_06034
• Subject: NM_004377.4
• Aligned Length: 2316
• Identities: 2315
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGCGGAAGCTCACCAGGCCGTGGCCTTCCAGTTCACGGTGACCCCAGACGGGGTCGACTTCCGGCTCAGTCG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGGAAGCTCACCAGGCCGTGGCCTTCCAGTTCACGGTGACCCCAGACGGGGTCGACTTCCGGCTCAGTCG  74

Query   75  GGAGGCCCTGAAACACGTCTACCTGTCTGGGATCAACTCCTGGAAGAAACGCCTGATCCGCATCAAGAATGGCA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGAGGCCCTGAAACACGTCTACCTGTCTGGGATCAACTCCTGGAAGAAACGCCTGATCCGCATCAAGAATGGCA  148

Query  149  TCCTCAGGGGCGTGTACCCTGGCAGCCCCACCAGCTGGCTGGTCGTCATCATGGCAACAGTGGGTTCCTCCTTC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TCCTCAGGGGCGTGTACCCTGGCAGCCCCACCAGCTGGCTGGTCGTCATCATGGCAACAGTGGGTTCCTCCTTC  222

Query  223  TGCAACGTGGACATCTCCTTGGGGCTGGTCAGTTGCATCCAGAGATGCCTCCCTCAGGGGTGTGGCCCCTACCA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TGCAACGTGGACATCTCCTTGGGGCTGGTCAGTTGCATCCAGAGATGCCTCCCTCAGGGGTGTGGCCCCTACCA  296

Query  297  GACCCCGCAGACCCGGGCACTTCTCAGCATGGCCATCTTCTCCACGGGCGTCTGGGTGACGGGCATCTTCTTCT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GACCCCGCAGACCCGGGCACTTCTCAGCATGGCCATCTTCTCCACGGGCGTCTGGGTGACGGGCATCTTCTTCT  370

Query  371  TCCGCCAAACCCTGAAGCTGCTTCTCTGCTACCATGGGTGGATGTTTGAGATGCATGGCAAGACCAGCAACTTG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TCCGCCAAACCCTGAAGCTGCTTCTCTGCTACCATGGGTGGATGTTTGAGATGCATGGCAAGACCAGCAACTTG  444

Query  445  ACCAGGATCTGGGCTATGTGTATCCGCCTTCTATCCAGCCGGCACCCTATGCTCTACAGCTTCCAGACATCTCT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ACCAGGATCTGGGCTATGTGTATCCGCCTTCTATCCAGCCGGCACCCTATGCTCTACAGCTTCCAGACATCTCT  518

Query  519  GCCCAAGCTTCCTGTGCCCAGGGTGTCAGCCACAATTCAGCGGTACCTAGAGTCTGTGCGCCCCTTGTTGGATG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GCCCAAGCTTCCTGTGCCCAGGGTGTCAGCCACAATTCAGCGGTACCTAGAGTCTGTGCGCCCCTTGTTGGATG  592

Query  593  ATGAGGAATATTACCGCATGGAGTTGCTGGCCAAAGAATTCCAGGACAAGACTGCCCCCAGGCTGCAGAAATAC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ATGAGGAATATTACCGCATGGAGTTGCTGGCCAAAGAATTCCAGGACAAGACTGCCCCCAGGCTGCAGAAATAC  666

Query  667  CTGGTGCTCAAGTCATGGTGGGCAAGTAACTATGTGAGTGACTGGTGGGAAGAGTACATCTACCTTCGAGGCAG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CTGGTGCTCAAGTCATGGTGGGCAAGTAACTATGTGAGTGACTGGTGGGAAGAGTACATCTACCTTCGAGGCAG  740

Query  741  GAGCCCTCTCATGGTGAACAGCAACTATTATGTCATGGACCTTGTGCTCATCAAGAATACAGACGTGCAGGCAG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GAGCCCTCTCATGGTGAACAGCAACTATTATGTCATGGACCTTGTGCTCATCAAGAATACAGACGTGCAGGCAG  814

Query  815  CCCGCCTGGGAAACATCATCCACGCCATGATCATGTATCGCCGTAAACTGGACCGTGAAGAAATCAAGCCTGTG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CCCGCCTGGGAAACATCATCCACGCCATGATCATGTATCGCCGTAAACTGGACCGTGAAGAAATCAAGCCTGTG  888

Query  889  ATGGCACTGGGCATAGTGCCTATGTGCTCCTACCAGATGGAGGGGATGTTCAACACCACTCGGATCCCGGGCAA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ATGGCACTGGGCATAGTGCCTATGTGCTCCTACCAGATGGAGAGGATGTTCAACACCACTCGGATCCCGGGCAA  962

Query  963  GGACACAGATGTGCTACAGCACCTCTCAGACAGCCGGCACGTGGCTGTCTACCACAAGGGACGCTTCTTCAAGC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GGACACAGATGTGCTACAGCACCTCTCAGACAGCCGGCACGTGGCTGTCTACCACAAGGGACGCTTCTTCAAGC  1036

Query 1037  TGTGGCTCTATGAGGGCGCCCGTCTGCTCAAGCCTCAGGATCTGGAGATGCAGTTCCAGAGGATCCTGGACGAC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TGTGGCTCTATGAGGGCGCCCGTCTGCTCAAGCCTCAGGATCTGGAGATGCAGTTCCAGAGGATCCTGGACGAC  1110

Query 1111  CCCTCCCCACCTCAGCCTGGGGAGGAGAAGCTGGCAGCCCTCACTGCAGGAGGAAGGGTGGAGTGGGCGCAGGC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CCCTCCCCACCTCAGCCTGGGGAGGAGAAGCTGGCAGCCCTCACTGCAGGAGGAAGGGTGGAGTGGGCGCAGGC  1184

Query 1185  ACGCCAGGCCTTCTTTAGCTCTGGAAAGAATAAGGCTGCCTTGGAGGCCATCGAGCGTGCCGCTTTCTTCGTGG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  ACGCCAGGCCTTCTTTAGCTCTGGAAAGAATAAGGCTGCCTTGGAGGCCATCGAGCGTGCCGCTTTCTTCGTGG  1258

Query 1259  CCCTGGATGAGGAATCCTACTCCTATGACCCCGAAGATGAGGCCAGCCTCAGCCTCTATGGCAAGGCCCTGCTA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CCCTGGATGAGGAATCCTACTCCTATGACCCCGAAGATGAGGCCAGCCTCAGCCTCTATGGCAAGGCCCTGCTA  1332

Query 1333  CATGGCAACTGCTACAACAGGTGGTTTGACAAATCCTTCACTCTCATTTCCTTCAAGAATGGCCAGTTGGGTCT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CATGGCAACTGCTACAACAGGTGGTTTGACAAATCCTTCACTCTCATTTCCTTCAAGAATGGCCAGTTGGGTCT  1406

Query 1407  CAATGCAGAGCATGCGTGGGCAGATGCTCCCATCATTGGGCACCTCTGGGAGTTTGTCCTGGGCACAGACAGCT  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CAATGCAGAGCATGCGTGGGCAGATGCTCCCATCATTGGGCACCTCTGGGAGTTTGTCCTGGGCACAGACAGCT  1480

Query 1481  TCCACCTGGGCTACACGGAGACCGGGCACTGCCTGGGCAAACCGAACCCTGCGCTCGCACCTCCTACACGGCTG  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TCCACCTGGGCTACACGGAGACCGGGCACTGCCTGGGCAAACCGAACCCTGCGCTCGCACCTCCTACACGGCTG  1554

Query 1555  CAGTGGGACATTCCAAAACAGTGCCAGGCGGTCATCGAGAGTTCCTACCAGGTGGCCAAGGCGTTGGCAGACGA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CAGTGGGACATTCCAAAACAGTGCCAGGCGGTCATCGAGAGTTCCTACCAGGTGGCCAAGGCGTTGGCAGACGA  1628

Query 1629  CGTGGAGTTGTACTGCTTCCAGTTCCTGCCCTTTGGCAAAGGCCTCATCAAGAAGTGCCGGACCAGCCCTGATG  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CGTGGAGTTGTACTGCTTCCAGTTCCTGCCCTTTGGCAAAGGCCTCATCAAGAAGTGCCGGACCAGCCCTGATG  1702

Query 1703  CCTTTGTGCAGATCGCGCTGCAGCTGGCTCACTTCCGGGACAGGGGTAAGTTCTGCCTGACCTATGAGGCCTCA  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  CCTTTGTGCAGATCGCGCTGCAGCTGGCTCACTTCCGGGACAGGGGTAAGTTCTGCCTGACCTATGAGGCCTCA  1776

Query 1777  ATGACCAGAATGTTCCGGGAGGGACGGACTGAGACTGTGCGTTCCTGTACCAGCGAGTCCACAGCCTTTGTGCA  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  ATGACCAGAATGTTCCGGGAGGGACGGACTGAGACTGTGCGTTCCTGTACCAGCGAGTCCACAGCCTTTGTGCA  1850

Query 1851  GGCCATGATGGAGGGGTCCCACACAAAAGCAGACCTGCGAGATCTCTTCCAGAAGGCTGCTAAGAAGCACCAGA  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  GGCCATGATGGAGGGGTCCCACACAAAAGCAGACCTGCGAGATCTCTTCCAGAAGGCTGCTAAGAAGCACCAGA  1924

Query 1925  ATATGTACCGCCTGGCCATGACCGGGGCAGGGATCGACAGGCACCTCTTCTGCCTTTACTTGGTCTCCAAGTAC  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  ATATGTACCGCCTGGCCATGACCGGGGCAGGGATCGACAGGCACCTCTTCTGCCTTTACTTGGTCTCCAAGTAC  1998

Query 1999  CTAGGAGTCAGCTCTCCTTTCCTTGCTGAGGTGCTCTCGGAACCCTGGCGTCTCTCCACCAGCCAGATCCCCCA  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  CTAGGAGTCAGCTCTCCTTTCCTTGCTGAGGTGCTCTCGGAACCCTGGCGTCTCTCCACCAGCCAGATCCCCCA  2072

Query 2073  ATCCCAGATCCGCATGTTCGACCCAGAGCAGCACCCCAATCACCTGGGCGCTGGAGGTGGCTTTGGCCCTGTAG  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  ATCCCAGATCCGCATGTTCGACCCAGAGCAGCACCCCAATCACCTGGGCGCTGGAGGTGGCTTTGGCCCTGTAG  2146

Query 2147  CAGATGATGGCTATGGAGTTTCCTACATGATTGCAGGCGAGAACACGATCTTCTTCCACATCTCCAGCAAGTTC  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  CAGATGATGGCTATGGAGTTTCCTACATGATTGCAGGCGAGAACACGATCTTCTTCCACATCTCCAGCAAGTTC  2220

Query 2221  TCAAGCTCAGAGACGAACGCCCAGCGCTTTGGAAACCACATCCGCAAAGCCCTGCTGGACATTGCTGATCTTTT  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  TCAAGCTCAGAGACGAACGCCCAGCGCTTTGGAAACCACATCCGCAAAGCCCTGCTGGACATTGCTGATCTTTT  2294

Query 2295  CCAAGTTCCCAAGGCCTACAGC  2316
            ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  CCAAGTTCCCAAGGCCTACAGC  2316