Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_06034
- Subject:
- NM_009948.2
- Aligned Length:
- 2321
- Identities:
- 1992
- Gaps:
- 10
Alignment
Query 1 ATGGCGGAAGCTCACCAGGCCGTGGCCTTCCAGTTCACGGTGACCCCAGACGGGGTCGACTTCCGGCTCAGTCG 74
|||||||||||.||||||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1 ATGGCGGAAGCACACCAGGCAGTAGCTTTCCAGTTCACTGTGACCCCAGACGGGGTCGACTTCCGGCTTAGTCG 74
Query 75 GGAGGCCCTGAAACACGTCTACCTGTCTGGGATCAACTCCTGGAAGAAACGCCTGATCCGCATCAAGAATGGCA 148
||||||.||||.||||.|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||
Sbjct 75 GGAGGCTCTGAGACACATCTACCTGTCTGGAATCAACTCCTGGAAGAAACGCCTTATTCGAATCAAGAATGGCA 148
Query 149 TCCTCAGGGGCGTGTACCCTGGCAGCCCCACCAGCTGGCTGGTCGTCATCATGGCAACAGTGGGTTCCTCCTTC 222
||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||..|||||||||||||.||||||..||.|
Sbjct 149 TCCTTAGGGGTGTGTACCCTGGCAGCCCCACCAGCTGGCTGGTTGTTGTCATGGCAACAGTTGGTTCCAACTAC 222
Query 223 TGCAACGTGGACATCTCCTTGGGGCTGGTCAGTTGCATCCAGAGATGCCTCCCTCAGGGGTGTGGCCCCTACCA 296
|||||.||||||||||||.||||.||||||..|||||||||||||||||||||..|..|||.|||||.||....
Sbjct 223 TGCAAGGTGGACATCTCCATGGGACTGGTCGATTGCATCCAGAGATGCCTCCCGGAAAGGTATGGCCACTTTGG 296
Query 297 GACCCCGCAGACCCGGGCACTTCTCAGCATGGCCATCTTCTCCACGGGCGTCTGGGTGACGGGCATCTTCTTCT 370
||||||.|||||...|||||||||||||||||.||||||||||||.||.|||||||.|||.|||||.|||||||
Sbjct 297 GACCCCACAGACAGAGGCACTTCTCAGCATGGTCATCTTCTCCACCGGAGTCTGGGCGACAGGCATTTTCTTCT 370
Query 371 TCCGCCAAACCCTGAAGCTGCTTCTCTGCTACCATGGGTGGATGTTTGAGATGCATGGCAAGACCAGCAACTTG 444
||||.|||||||||||||||||.||||.||||||.|||||||||||.||||||||..||||||||||| |.||
Sbjct 371 TCCGACAAACCCTGAAGCTGCTGCTCTCCTACCACGGGTGGATGTTCGAGATGCACAGCAAGACCAGC--CATG 442
Query 445 --ACCAGGATCTGGGCTATGTGTATCCGCCTTCTATCCAGCCGGCACCCTATGCTCTACAGCTTCCAGACATCT 516
||||.||||||||||||.|||.||||.||.||.||||||||||..||.|||||||||||||||||.||.||.
Sbjct 443 CCACCAAGATCTGGGCTATCTGTGTCCGTCTCCTGTCCAGCCGGCGGCCCATGCTCTACAGCTTCCAAACGTCA 516
Query 517 CTGCCCAAGCTTCCTGTGCCCAGGGTGTCAGCCACAATTCAGCGGTACCTAGAGTCTGTGCGCCCCTTGTTGGA 590
|||||.|||||||||||.|||||.|||.|||||||||||||.||||||.|.||.||||||||.|||||.|||||
Sbjct 517 CTGCCTAAGCTTCCTGTCCCCAGCGTGCCAGCCACAATTCACCGGTACTTGGATTCTGTGCGGCCCTTATTGGA 590
Query 591 TGATGAGGAATATTACCGCATGGAGTTGCTGGCCAAAGAATTCCAGGACAAGACTGCCCCCAGGCTGCAGAAAT 664
||||||.|.||||||||||||||||....|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 591 TGATGAAGCATATTACCGCATGGAGACATTGGCCAAGGAATTCCAGGACAAGACTGCCCCCAGGCTGCAGAAAT 664
Query 665 ACCTGGTGCTCAAGTCATGGTGGGCAAGTAACTATGTGAGTGACTGGTGGGAAGAGTACATCTACCTTCGAGGC 738
|||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.||..|||||||.|||.||
Sbjct 665 ACCTGGTGCTCAAGTCATGGTGGGCAACTAACTATGTGAGTGACTGGTGGGAAGAATATGTCTACCTCCGAAGC 738
Query 739 AGGAGCCCTCTCATGGTGAACAGCAACTATTATGTCATGGACCTTGTGCTCATCAAGAATACAGACGTGCAGGC 812
||||||||.|||||||||||||||||||||||||.||||||..|||||||.||.|||||.|||.|.|||||.||
Sbjct 739 AGGAGCCCCCTCATGGTGAACAGCAACTATTATGCCATGGATTTTGTGCTTATTAAGAACACAAATGTGCAAGC 812
Query 813 AGCCCGCCTGGGAAACATCATCCACGCCATGATCATGTATCGCCGTAAACTGGACCGTGAAGAAATCAAGCCTG 886
||||||.||.||.||...|.|.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|
Sbjct 813 AGCCCGTCTAGGCAATGCCGTTCACGCCATGATCATGTATCGCCGCAAACTGGACCGTGAAGAGATCAAGCCGG 886
Query 887 TGATGGCACTGGGCATAGTGCCTATGTGCTCCTACCAGATGGAGGGGATGTTCAACACCACTCGGATCCCGGGC 960
|.|||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||||.||.||.|||||.|||
Sbjct 887 TCATGGCACTGGGTATGGTGCCCATGTGCTCCTACCAGATGGAGAGGATGTTCAACACTACACGCATCCCAGGC 960
Query 961 AAGGACACAGATGTGCTACAGCACCTCTCAGACAGCCGGCACGTGGCTGTCTACCACAAGGGACGCTTCTTCAA 1034
||.||.|||||..|||||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||
Sbjct 961 AAAGAGACAGACTTGCTACAGCACCTCTCAGAGAGCAGGCACGTGGCTGTCTACCACAAAGGTCGCTTCTTCAA 1034
Query 1035 GCTGTGGCTCTATGAGGGCGCCCGTCTGCTCAAGCCTCAGGATCTGGAGATGCAGTTCCAGAGGATCCTGGACG 1108
|.|.|||||||||||||||.|.||.|||||||||||.|..||.||||||||||||||||||||.|||||.||||
Sbjct 1035 GGTCTGGCTCTATGAGGGCTCGCGCCTGCTCAAGCCCCGAGACCTGGAGATGCAGTTCCAGAGAATCCTCGACG 1108
Query 1109 ACCCCTCCCCACCTCAGCCTGGGGAGGAGAAGCTGGCAGCCCTCACTGCAGGAGGAAGGGTGGAGTGGGCGCAG 1182
||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||..||
Sbjct 1109 ACCCTTCCCCACCTCAGCCTGGGGAGGAGAAGCTGGCAGCCCTCACCGCAGGAGGAAGGGTAGAGTGGGCAGAG 1182
Query 1183 GCACGCCAGGCCTTCTTTAGCTCTGGAAAGAATAAGGCTGCCT-TGGAGGCCATCGAGCGTGCCGCTTTCTTCG 1255
|||||.|||.|||||||.||||||||.|||||.|| |.||.|| ||||.||||||||.|||||.||||||||.|
Sbjct 1183 GCACGTCAGACCTTCTTCAGCTCTGGCAAGAACAA-GATGTCTCTGGACGCCATCGAACGTGCTGCTTTCTTTG 1255
Query 1256 TGGCCCTGGATGAGGAATCCTACTCCTATGACCCCGAAGATGAGGCCAGCCTCAGCCTCTATGGCAAGGCCCTG 1329
||.||||||||||.||.||..|.|.|||..||||.||.||||||.||||.||.||||||||.|||||.|||.||
Sbjct 1256 TGACCCTGGATGAAGATTCTCATTGCTACAACCCTGACGATGAGACCAGTCTTAGCCTCTACGGCAAAGCCTTG 1329
Query 1330 CTACATGGCAACTGCTACAACAGGTGGTTTGACAAATCCTTCACTCTCATTTCCTTCAAGAATGGCCAGTTGGG 1403
||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.||.||||.|||||||||||.|||.||
Sbjct 1330 CTCCATGGCAACTGCTATAACAGGTGGTTTGACAAATCTTTCACCCTTATCTCCTGCAAGAATGGCCTGTTAGG 1403
Query 1404 TCTCAATGCAGAGCATGCGTGGGCAGATGCTCCCATCATTGGGCACCTCTGGGAGTTTGTCCTGGGCACAGACA 1477
.|||||..|.||.||..||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|
Sbjct 1404 CCTCAACACCGAACACTCGTGGGCAGACGCGCCCATCATTGGGCACCTCTGGGAGTTTGTCCTGGGCACTGATA 1477
Query 1478 GCTTCCACCTGGGCTACACGGAGACCGGGCACTGCCTGGGCAAACCGAACCCTGCGCTCGCACCTCCTACA-CG 1550
.|||.||||||||||||||||||||.||.|||||..||||..|.||.|||.|..||.|..||||.||| || ||
Sbjct 1478 CCTTTCACCTGGGCTACACGGAGACAGGACACTGTGTGGGTGAGCCAAACACCACGTTGCCACCCCCT-CAGCG 1550
Query 1551 GCTGCAGTGGGACATTCCAAAACAGTGCCAGGCGGTCATCGAGAGTTCCTACCAGGTGGCCAAGGCGTTGGCAG 1624
|||||.||||||||||||..|.|||||||.||..|.||||||||..||.|||||.||.||||||||..||||.|
Sbjct 1551 GCTGCCGTGGGACATTCCCGAGCAGTGCCGGGAAGCCATCGAGAACTCGTACCAAGTAGCCAAGGCACTGGCCG 1624
Query 1625 ACGACGTGGAGTTGTACTGCTTCCAGTTCCTGCCCTTTGGCAAAGGCCTCATCAAGAAGTGCCGGACCAGCCCT 1698
|.|||||||||.|.|||||||||||||||.|.||||||||||||||.||.|||||||||||..||||||||||.
Sbjct 1625 ATGACGTGGAGCTCTACTGCTTCCAGTTCTTACCCTTTGGCAAAGGTCTTATCAAGAAGTGTAGGACCAGCCCC 1698
Query 1699 GATGCCTTTGTGCAGATCGCGCTGCAGCTGGCTCACTTCCGGGACAGGGGTAAGTTCTGCCTGACCTATGAGGC 1772
||.||.|||||||||||.||.||.|||||||||||.||||||||||..||.||||||||||||||.||.|||||
Sbjct 1699 GACGCTTTTGTGCAGATTGCCCTACAGCTGGCTCATTTCCGGGACAAAGGCAAGTTCTGCCTGACTTACGAGGC 1772
Query 1773 CTCAATGACCAGAATGTTCCGGGAGGGACGGACTGAGACTGTGCGTTCCTGTACCAGCGAGTCCACAGCCTTTG 1846
|||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.|||||||||
Sbjct 1773 CTCGATGACAAGAATGTTCCGAGAGGGGCGGACTGAGACTGTGCGTTCCTGTACCAACGAGTCCGCAGCCTTTG 1846
Query 1847 TGCAGGCCATGATGGAGGGGTCCCACACAAAAGCAGACCTGCGAGATCTCTTCCAG-AAGGCTGCTAAGAAGCA 1919
||||||||||||||.||||||||||.|..|||..||||||.|.|||||||||||.| |||.||.|.|| |||||
Sbjct 1847 TGCAGGCCATGATGAAGGGGTCCCATAAGAAACAAGACCTCCAAGATCTCTTCCGGAAAGCCTCCGAA-AAGCA 1919
Query 1920 CCAGAATATGTACCGCCTGGCCATGACCGGGGCAGGGATCGACAGGCACCTCTTCTGCCTTTACTTGGTCTCCA 1993
|||.||.|||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||.||||||||||||||||||||.|.|||||||
Sbjct 1920 CCAAAACATGTACCGCCTAGCCATGACAGGGGCTGGGATCGACCGGCACCTCTTCTGCCTTTACATCGTCTCCA 1993
Query 1994 AGTACCTAGGAGTCAGCTCTCCTTTCCTTGCTGAGGTGCTCTCGGAACCCTGGCGTCTCTCCACCAGCCAGATC 2067
|||||.|||||||.||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||||||.|.||||||||||||||||||
Sbjct 1994 AGTACTTAGGAGTTAGCTCTCCTTTCCTGGCTGAGGTACTTTCTGAACCCTGGAGCCTCTCCACCAGCCAGATC 2067
Query 2068 CCCCAATCCCAGATCCGCATGTTCGACCCAGAGCAGCACCCCAATCACCTGGGCGCTGGAGGTGGCTTTGGCCC 2141
|||||.|.|||||||.|||||||.||||||.|.|||.|.||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||
Sbjct 2068 CCCCAGTTCCAGATCTGCATGTTTGACCCAAAACAGTATCCCAATCATCTGGGTGCTGGAGGTGGCTTTGGTCC 2141
Query 2142 TGTAGCAGATGATGGCTATGGAGTTTCCTACATGATTGCAGGCGAGAACACGATCTTCTTCCACATCTCCAGCA 2215
.||.||.|||||||||||.||.||.||.||||||||.|||||.||.|||||.||.|||||||||||||||||||
Sbjct 2142 CGTGGCGGATGATGGCTACGGGGTCTCTTACATGATCGCAGGAGAAAACACCATGTTCTTCCACATCTCCAGCA 2215
Query 2216 AGTTCTCAAGCTCAGAGACGAACGCCCAGCGCTTTGGAAACCACATCCGCAAAGCCCTGCTGGACATTGCTGAT 2289
|.|.||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.||||.|||.|||||||.||.||.
Sbjct 2216 AATACTCAAGTTCAGAGACGAACGCCCAGCGCTTTGGGAACCACATCCGCCAAGCACTGTTGGACATCGCCGAA 2289
Query 2290 CTTTTCCAAGTTCCCAAGGCCTACAGC 2316
||||||.||.||.|||||.|..|||||
Sbjct 2290 CTTTTCAAAATTTCCAAGACAGACAGC 2316