Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_06086
• Subject: NM_004082.4
• Aligned Length: 1278
• Identities: 1132
• Gaps: 139

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  MAQSKRHVYSRTPSGSRMSAEASARPLRVGSRVEVIGKGHRGTVAYVGATLFATGKWVGVILDEAKGKNDGTVQ  74

Query    1  ------------------------------------------------------------MMRQAPTARKTTTR  14
                                                                        ....||||||||||
Sbjct   75  GRKYFTCDEGHGIFVRQSQIQVFEDGADTTSPETPDSSASKVLKREGTDTTAKTSKLRGLKPKKAPTARKTTTR  148

Query   15  RPKPTRPASTGVAGASSSLGPSGSASAGELSSSEPSTPAQTPLAAPIIPTPVLTSPGAVPPLPSPSKEEEGLRA  88
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  RPKPTRPASTGVAGASSSLGPSGSASAGELSSSEPSTPAQTPLAAPIIPTPVLTSPGAVPPLPSPSKEEEGLRA  222

Query   89  QVRDLEEKLETLRLKRAEDKAKLKELEKHKIQLEQVQEWKSKMQEQQADLQRRLKEARKEAKEALEAKERYMEE  162
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  QVRDLEEKLETLRLKRAEDKAKLKELEKHKIQLEQVQEWKSKMQEQQADLQRRLKEARKEAKEALEAKERYMEE  296

Query  163  MADTADAIEMATLDKEMAEERAESLQQEVEALKERVDELTTDLEILKAEIEEKGSDGAASSYQLKQLEEQNARL  236
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  MADTADAIEMATLDKEMAEERAESLQQEVEALKERVDELTTDLEILKAEIEEKGSDGAASSYQLKQLEEQNARL  370

Query  237  KDALVRMRDLSSSEKQEHVKLQKLMEKKNQELEVVRQQRERLQEELSQAESTIDELKEQVDAALGAEEMVEMLT  310
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  KDALVRMRDLSSSEKQEHVKLQKLMEKKNQELEVVRQQRERLQEELSQAESTIDELKEQVDAALGAEEMVEMLT  444

Query  311  DRNLNLEEKVRELRETVGDLEAMNEMNDELQENARETELELREQLDMAGARVREAQKRVEAAQETVADYQQTIK  384
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  DRNLNLEEKVRELRETVGDLEAMNEMNDELQENARETELELREQLDMAGARVREAQKRVEAAQETVADYQQTIK  518

Query  385  KYRQLTANLQDVNRELTNQQEASVERQQQPPPETFDFKIKFAETKAHAKAIEMELRQMEVAQANRHMSLLTAFM  458
            |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  KYRQLTAHLQDVNRELTNQQEASVERQQQPPPETFDFKIKFAETKAHAKAIEMELRQMEVAQANRHMSLLTAFM  592

Query  459  PDSFLRPGGDHDCVLVLLLMPRLICRAELIRKQAQEKFELSENCSERPGLRGAAGEQLSFAAGLVYSLSLLQAT  532
            |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  PDSFLRPGGDHDCVLVLLLMPRLICKAELIRKQAQEKFELSENCSERPGLRGAAGEQLSFAAGLVYSLSLLQAT  666

Query  533  LHRYEHALSQCSVDVYKKVGSLYPEMSAHERSLDFLIELLHKDQLDETVNVEPLTKAIKYYQHLYSIHLAEQPE  606
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  LHRYEHALSQCSVDVYKKVGSLYPEMSAHERSLDFLIELLHKDQLDETVNVEPLTKAIKYYQHLYSIHLAEQPE  740

Query  607  DCTMQLADHIKFTQSALDCMSVEVGRLRAFLQGGQEATDIALLLRDLETSCSDIRQFCKKIRRRMPGTDAPGIP  680
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  DCTMQLADHIKFTQSALDCMSVEVGRLRAFLQGGQEATDIALLLRDLETSCSDIRQFCKKIRRRMPGTDAPGIP  814

Query  681  AALAFGPQVSDTLLDCRKHLTWVVAVLQEVAAAAAQLIAPLAENEGLLVAALEELAFKASEQIYGTPSSSPYEC  754
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AALAFGPQVSDTLLDCRKHLTWVVAVLQEVAAAAAQLIAPLAENEGLLVAALEELAFKASEQIYGTPSSSPYEC  888

Query  755  LRQSCNILISTMNKLATAMQEGEYDAERPPSKPPPVELRAAALRAEITDAEGLGLKLEDRETVIKELKKSLKIK  828
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  LRQSCNILISTMNKLATAMQEGEYDAERPPSKPPPVELRAAALRAEITDAEGLGLKLEDRETVIKELKKSLKIK  962

Query  829  GEELSEANVRLSLLEKKLDSAAKDADERIEKVQTRLEETQALLRKKEKEFEETMDALQADIDQLEAEKAELKQR  902
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GEELSEANVRLSLLEKKLDSAAKDADERIEKVQTRLEETQALLRKKEKEFEETMDALQADIDQLEAEKAELKQR  1036

Query  903  LNSQSKRTIEGLRGPPPSGIATLVSGIAG-----GAIPGQAPGSVPGPGLVKDSPLLLQQISAMRLHISQLQHE  971
            |||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  LNSQSKRTIEGLRGPPPSGIATLVSGIAGEEQQRGAIPGQAPGSVPGPGLVKDSPLLLQQISAMRLHISQLQHE  1110

Query  972  NSILKGAQMKASLASLPPLHVAKLSHEGPGSELPAGALYRKTSQLLETLNQLSTHTHVVDITRTSPAAKSPSAQ  1045
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  NSILKGAQMKASLASLPPLHVAKLSHEGPGSELPAGALYRKTSQLLETLNQLSTHTHVVDITRTSPAAKSPSAQ  1184

Query 1046  LMEQVAQLKSLSDTVEKLKDEVLKETVSQRPGATVPTDFATFPSSAFLRAKEEQQDDTVYMGKVTFSCAAGFGQ  1119
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  LMEQVAQLKSLSDTVEKLKDEVLKETVSQRPGATVPTDFATFPSSAFLRAKEEQQDDTVYMGKVTFSCAAGFGQ  1258

Query 1120  RHRLVLTQEQLHQLHIRLIS  1139
            |||||||||||||||.||||
Sbjct 1259  RHRLVLTQEQLHQLHSRLIS  1278