Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_06086
• Subject: NM_023019.3
• Aligned Length: 3432
• Identities: 3414
• Gaps: 15

Alignment

Query    1  ATGATGAGACAGGCACCGACAGCCCGAAAGACCACAACTCGGCGACCCAAGCCCACGCGCCCAGCCAGTACTGG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGATGAGACAGGCACCGACAGCCCGAAAGACCACAACTCGGCGACCCAAGCCCACGCGCCCAGCCAGTACTGG  74

Query   75  GGTGGCTGGGGCCAGTAGCTCCCTGGGCCCCTCTGGCTCAGCGTCAGCAGGTGAGCTGAGCAGCAGTGAGCCCA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGTGGCTGGGGCCAGTAGCTCCCTGGGCCCCTCTGGCTCAGCGTCAGCAGGTGAGCTGAGCAGCAGTGAGCCCA  148

Query  149  GCACCCCGGCTCAGACTCCGCTGGCAGCACCCATCATCCCCACGCCGGTCCTCACCTCTCCTGGAGCAGTCCCC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GCACCCCGGCTCAGACTCCGCTGGCAGCACCCATCATCCCCACGCCGGTCCTCACCTCTCCTGGAGCAGTCCCC  222

Query  223  CCGCTTCCTTCCCCATCCAAGGAGGAGGAGGGACTAAGGGCTCAGGTGCGGGACCTGGAGGAGAAACTAGAGAC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CCGCTTCCTTCCCCATCCAAGGAGGAGGAGGGACTAAGGGCTCAGGTGCGGGACCTGGAGGAGAAACTAGAGAC  296

Query  297  CCTGAGACTGAAACGGGCAGAAGACAAAGCAAAGCTAAAAGAGCTGGAGAAACACAAAATCCAGCTGGAGCAGG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCTGAGACTGAAACGGGCAGAAGACAAAGCAAAGCTAAAAGAGCTGGAGAAACACAAAATCCAGCTGGAGCAGG  370

Query  371  TGCAGGAATGGAAGAGCAAAATGCAGGAGCAGCAGGCCGACCTGCAGCGGCGCCTCAAGGAGGCGAGAAAGGAA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TGCAGGAATGGAAGAGCAAAATGCAGGAGCAGCAGGCCGACCTGCAGCGGCGCCTCAAGGAGGCGAGAAAGGAA  444

Query  445  GCCAAGGAGGCGCTGGAGGCAAAGGAACGCTATATGGAGGAGATGGCTGATACTGCTGATGCCATTGAGATGGC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GCCAAGGAGGCGCTGGAGGCAAAGGAACGCTATATGGAGGAGATGGCTGATACTGCTGATGCCATTGAGATGGC  518

Query  519  CACTTTGGACAAGGAGATGGCTGAAGAGCGGGCTGAGTCCCTGCAGCAGGAGGTGGAGGCACTGAAGGAGCGGG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CACTTTGGACAAGGAGATGGCTGAAGAGCGGGCTGAGTCCCTGCAGCAGGAGGTGGAGGCACTGAAGGAGCGGG  592

Query  593  TGGACGAGCTCACTACTGACTTAGAGATCCTCAAGGCTGAGATTGAAGAGAAGGGCTCAGATGGCGCTGCATCC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TGGACGAGCTCACTACTGACTTAGAGATCCTCAAGGCTGAGATTGAAGAGAAGGGCTCAGATGGCGCTGCATCC  666

Query  667  AGTTATCAGCTCAAGCAGCTTGAGGAGCAGAATGCCCGCCTGAAGGATGCCCTGGTGAGGATGCGGGATCTTTC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AGTTATCAGCTCAAGCAGCTTGAGGAGCAGAATGCCCGCCTGAAGGATGCCCTGGTGAGGATGCGGGATCTTTC  740

Query  741  TTCCTCAGAGAAGCAGGAGCATGTGAAGCTCCAGAAGCTCATGGAAAAGAAGAACCAAGAGCTGGAAGTTGTGA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TTCCTCAGAGAAGCAGGAGCATGTGAAGCTCCAGAAGCTCATGGAAAAGAAGAACCAAGAGCTGGAAGTTGTGA  814

Query  815  GGCAACAGCGGGAGCGTCTGCAGGAGGAGCTAAGCCAGGCAGAGAGCACCATTGATGAGCTCAAGGAGCAGGTG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GGCAACAGCGGGAGCGTCTGCAGGAGGAGCTAAGCCAGGCAGAGAGCACCATTGATGAGCTCAAGGAGCAGGTG  888

Query  889  GATGCTGCTCTGGGTGCTGAGGAGATGGTGGAGATGCTGACAGATCGGAACCTGAATCTGGAAGAGAAAGTGCG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GATGCTGCTCTGGGTGCTGAGGAGATGGTGGAGATGCTGACAGATCGGAACCTGAATCTGGAAGAGAAAGTGCG  962

Query  963  CGAGTTGAGGGAGACTGTGGGAGACTTGGAAGCGATGAATGAGATGAACGATGAGCTGCAGGAGAATGCACGTG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CGAGTTGAGGGAGACTGTGGGAGACTTGGAAGCGATGAATGAGATGAACGATGAGCTGCAGGAGAATGCACGTG  1036

Query 1037  AGACAGAACTGGAGCTGCGGGAGCAGCTGGACATGGCAGGCGCGCGGGTTCGTGAGGCCCAGAAGCGTGTGGAG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AGACAGAACTGGAGCTGCGGGAGCAGCTGGACATGGCAGGCGCGCGGGTTCGTGAGGCCCAGAAGCGTGTGGAG  1110

Query 1111  GCAGCCCAGGAGACGGTTGCAGACTACCAGCAGACCATCAAGAAGTACCGCCAGCTGACCGCCAATCTACAGGA  1184
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1111  GCAGCCCAGGAGACGGTTGCAGACTACCAGCAGACCATCAAGAAGTACCGCCAGCTGACCGCCCATCTACAGGA  1184

Query 1185  TGTGAATCGGGAACTGACAAACCAGCAGGAAGCATCTGTGGAGAGGCAACAGCAGCCACCTCCAGAGACCTTTG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TGTGAATCGGGAACTGACAAACCAGCAGGAAGCATCTGTGGAGAGGCAACAGCAGCCACCTCCAGAGACCTTTG  1258

Query 1259  ACTTCAAAATCAAGTTTGCTGAGACTAAGGCCCATGCCAAGGCAATTGAGATGGAATTGAGGCAGATGGAGGTG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  ACTTCAAAATCAAGTTTGCTGAGACTAAGGCCCATGCCAAGGCAATTGAGATGGAATTGAGGCAGATGGAGGTG  1332

Query 1333  GCCCAGGCCAATCGACACATGTCCCTGCTGACAGCCTTCATGCCTGACAGCTTCCTTCGGCCAGGTGGGGACCA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GCCCAGGCCAATCGACACATGTCCCTGCTGACAGCCTTCATGCCTGACAGCTTCCTTCGGCCAGGTGGGGACCA  1406

Query 1407  TGACTGCGTTCTGGTGCTGTTGCTCATGCCTCGTCTCATTTGCAGGGCAGAGCTGATCCGGAAGCAGGCCCAGG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TGACTGCGTTCTGGTGCTGTTGCTCATGCCTCGTCTCATTTGCAAGGCAGAGCTGATCCGGAAGCAGGCCCAGG  1480

Query 1481  AGAAGTTTGAACTAAGTGAGAACTGTTCAGAGCGGCCTGGGCTGCGAGGAGCTGCTGGGGAGCAACTCAGCTTT  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  AGAAGTTTGAACTAAGTGAGAACTGTTCAGAGCGGCCTGGGCTGCGAGGAGCTGCTGGGGAGCAACTCAGCTTT  1554

Query 1555  GCTGCTGGACTGGTGTACTCGCTGAGCCTGCTGCAGGCCACGCTACACCGCTATGAGCATGCCCTCTCTCAGTG  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GCTGCTGGACTGGTGTACTCGCTGAGCCTGCTGCAGGCCACGCTACACCGCTATGAGCATGCCCTCTCTCAGTG  1628

Query 1629  CAGTGTGGATGTGTATAAGAAAGTGGGCAGCCTGTACCCTGAGATGAGTGCCCATGAGCGCTCCTTGGATTTCC  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CAGTGTGGATGTGTATAAGAAAGTGGGCAGCCTGTACCCTGAGATGAGTGCCCATGAGCGCTCCTTGGATTTCC  1702

Query 1703  TCATTGAACTGCTGCACAAGGATCAGCTGGATGAGACTGTCAATGTGGAGCCTCTCACCAAGGCCATCAAGTAC  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  TCATTGAACTGCTGCACAAGGATCAGCTGGATGAGACTGTCAATGTGGAGCCTCTCACCAAGGCCATCAAGTAC  1776

Query 1777  TATCAGCATCTGTACAGCATCCACCTTGCCGAACAGCCTGAGGACTGTACTATGCAGCTGGCTGACCACATTAA  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  TATCAGCATCTGTACAGCATCCACCTTGCCGAACAGCCTGAGGACTGTACTATGCAGCTGGCTGACCACATTAA  1850

Query 1851  GTTCACGCAGAGTGCTCTGGACTGCATGAGTGTGGAGGTAGGACGGCTGCGTGCCTTCTTGCAGGGTGGGCAGG  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  GTTCACGCAGAGTGCTCTGGACTGCATGAGTGTGGAGGTAGGACGGCTGCGTGCCTTCTTGCAGGGTGGGCAGG  1924

Query 1925  AGGCTACAGATATTGCCCTCCTGCTCCGGGATCTGGAAACTTCATGCAGTGACATCCGCCAGTTCTGCAAGAAG  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  AGGCTACAGATATTGCCCTCCTGCTCCGGGATCTGGAAACTTCATGCAGTGACATCCGCCAGTTCTGCAAGAAG  1998

Query 1999  ATCCGAAGGCGAATGCCAGGGACAGATGCTCCTGGGATCCCAGCTGCACTGGCCTTTGGACCACAGGTATCTGA  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  ATCCGAAGGCGAATGCCAGGGACAGATGCTCCTGGGATCCCAGCTGCACTGGCCTTTGGACCACAGGTATCTGA  2072

Query 2073  CACGCTCCTAGACTGCAGGAAACACTTGACGTGGGTCGTGGCTGTGCTGCAGGAGGTGGCAGCTGCTGCTGCCC  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  CACGCTCCTAGACTGCAGGAAACACTTGACGTGGGTCGTGGCTGTGCTGCAGGAGGTGGCAGCTGCTGCTGCCC  2146

Query 2147  AGCTCATTGCCCCACTGGCAGAGAATGAGGGGCTACTTGTGGCTGCTCTGGAGGAACTGGCTTTCAAAGCAAGC  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  AGCTCATTGCCCCACTGGCAGAGAATGAGGGGCTACTTGTGGCTGCTCTGGAGGAACTGGCTTTCAAAGCAAGC  2220

Query 2221  GAGCAGATCTATGGGACCCCCTCCAGCAGCCCCTATGAGTGTCTGCGCCAGTCATGCAACATCCTCATCAGTAC  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  GAGCAGATCTATGGGACCCCCTCCAGCAGCCCCTATGAGTGTCTGCGCCAGTCATGCAACATCCTCATCAGTAC  2294

Query 2295  CATGAACAAGCTGGCCACAGCCATGCAGGAGGGGGAGTATGATGCAGAGCGGCCCCCCAGCAAGCCTCCACCGG  2368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  CATGAACAAGCTGGCCACAGCCATGCAGGAGGGGGAGTATGATGCAGAGCGGCCCCCCAGCAAGCCTCCACCGG  2368

Query 2369  TTGAACTGCGGGCTGCTGCCCTTCGTGCAGAGATCACAGATGCTGAAGGCCTGGGTTTGAAGCTCGAAGATCGA  2442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  TTGAACTGCGGGCTGCTGCCCTTCGTGCAGAGATCACAGATGCTGAAGGCCTGGGTTTGAAGCTCGAAGATCGA  2442

Query 2443  GAGACAGTTATTAAGGAGTTGAAGAAGTCACTCAAGATTAAGGGAGAGGAGCTAAGTGAGGCCAATGTGCGGCT  2516
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  GAGACAGTTATTAAGGAGTTGAAGAAGTCACTCAAGATTAAGGGAGAGGAGCTAAGTGAGGCCAATGTGCGGCT  2516

Query 2517  GAGCCTCCTGGAGAAGAAGTTGGACAGTGCTGCCAAGGATGCAGATGAGCGCATCGAGAAAGTCCAGACTCGGC  2590
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517  GAGCCTCCTGGAGAAGAAGTTGGACAGTGCTGCCAAGGATGCAGATGAGCGCATCGAGAAAGTCCAGACTCGGC  2590

Query 2591  TGGAGGAGACCCAGGCACTGCTGCGAAAGAAGGAGAAAGAGTTTGAGGAGACAATGGATGCACTCCAGGCTGAC  2664
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591  TGGAGGAGACCCAGGCACTGCTGCGAAAGAAGGAGAAAGAGTTTGAGGAGACAATGGATGCACTCCAGGCTGAC  2664

Query 2665  ATCGACCAGCTGGAGGCAGAGAAGGCAGAACTAAAGCAGCGTCTGAACAGCCAGTCCAAACGCACGATTGAGGG  2738
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665  ATCGACCAGCTGGAGGCAGAGAAGGCAGAACTAAAGCAGCGTCTGAACAGCCAGTCCAAACGCACGATTGAGGG  2738

Query 2739  ACTCCGGGGCCCTCCTCCTTCAGGCATTGCTACTCTGGTCTCTGGCATTGCTGGT---------------GGAG  2797
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||               ||||
Sbjct 2739  ACTCCGGGGCCCTCCTCCTTCAGGCATTGCTACTCTGGTCTCTGGCATTGCTGGTGAAGAACAGCAGCGAGGAG  2812

Query 2798  CCATCCCTGGGCAGGCTCCAGGGTCTGTGCCAGGCCCAGGGCTGGTGAAGGACTCACCACTGCTGCTTCAGCAG  2871
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813  CCATCCCTGGGCAGGCTCCAGGGTCTGTGCCAGGCCCAGGGCTGGTGAAGGACTCACCACTGCTGCTTCAGCAG  2886

Query 2872  ATCTCTGCCATGAGGCTGCACATCTCCCAGCTCCAGCATGAGAACAGCATCCTCAAGGGAGCCCAGATGAAGGC  2945
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887  ATCTCTGCCATGAGGCTGCACATCTCCCAGCTCCAGCATGAGAACAGCATCCTCAAGGGAGCCCAGATGAAGGC  2960

Query 2946  ATCCTTGGCATCCCTGCCCCCTCTGCATGTTGCAAAGCTATCCCATGAGGGCCCTGGCAGTGAGTTACCAGCTG  3019
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961  ATCCTTGGCATCCCTGCCCCCTCTGCATGTTGCAAAGCTATCCCATGAGGGCCCTGGCAGTGAGTTACCAGCTG  3034

Query 3020  GAGCGCTGTATCGTAAGACCAGCCAGCTGCTGGAGACATTGAATCAATTGAGCACACACACGCACGTAGTAGAC  3093
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3035  GAGCGCTGTATCGTAAGACCAGCCAGCTGCTGGAGACATTGAATCAATTGAGCACACACACGCACGTAGTAGAC  3108

Query 3094  ATCACTCGCACCAGCCCTGCTGCCAAGAGCCCGTCGGCCCAACTTATGGAGCAAGTGGCTCAGCTTAAGTCCCT  3167
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3109  ATCACTCGCACCAGCCCTGCTGCCAAGAGCCCGTCGGCCCAACTTATGGAGCAAGTGGCTCAGCTTAAGTCCCT  3182

Query 3168  GAGTGACACCGTCGAGAAGCTCAAGGATGAGGTCCTCAAGGAGACAGTATCTCAGCGCCCTGGAGCCACAGTAC  3241
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3183  GAGTGACACCGTCGAGAAGCTCAAGGATGAGGTCCTCAAGGAGACAGTATCTCAGCGCCCTGGAGCCACAGTAC  3256

Query 3242  CCACTGACTTTGCCACCTTCCCTTCATCAGCCTTCCTCAGGGCCAAGGAGGAGCAGCAGGATGACACAGTCTAC  3315
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3257  CCACTGACTTTGCCACCTTCCCTTCATCAGCCTTCCTCAGGGCCAAGGAGGAGCAGCAGGATGACACAGTCTAC  3330

Query 3316  ATGGGCAAAGTGACCTTCTCATGTGCGGCTGGTTTTGGACAGCGACACCGGCTGGTGCTGACCCAGGAGCAGCT  3389
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3331  ATGGGCAAAGTGACCTTCTCATGTGCGGCTGGTTTTGGACAGCGACACCGGCTGGTGCTGACCCAGGAGCAGCT  3404

Query 3390  GCACCAGCTTCACATTCGCCTCATCTCC  3417
            ||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 3405  GCACCAGCTTCACAGTCGCCTCATCTCC  3432