Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_06088
• Subject: NM_001321027.1
• Aligned Length: 969
• Identities: 872
• Gaps: 78

Alignment

Query   1  ATGGATTCGAAATATCAGTGTGTGAAGCTGAATGATGGTCACTTCATGCCTGTCCTGGGATTTGGCACCTATGC  74
           ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ATGGATTCGAAATACCAGTGTGTGAAGCTGAATGATGGTCACTTCATGCCTGTCCTGGGATTTGGCACCTATGC  74

Query  75  GCCTGCAGAGGTTCCTAAAAGTAAAGCTTTAGAGGCCACCAAATTGGCAATTGAAGCTGGCTTCCGCCATATTG  148
           ||||||||||||||||||||||||||||.||||||||..||||||||||||.|||||.||.||||.||||||||
Sbjct  75  GCCTGCAGAGGTTCCTAAAAGTAAAGCTCTAGAGGCCGTCAAATTGGCAATAGAAGCCGGGTTCCACCATATTG  148

Query 149  ATTCTGCTCATTTATACAATAATGAGGAGCAGGTTGGACTGGCCATCCGAAGCAAGATTGCAGATGGCAGTGTG  222
           |||||||.|||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  ATTCTGCACATGTTTACAATAATGAGGAGCAGGTTGGACTGGCCATCCGAAGCAAGATTGCAGATGGCAGTGTG  222

Query 223  AAGAGAGAAGACATATTCTACACTTCAAAGCTTTGGTGCAATTCCCATCGACCAGAGTTGGTCCGACCAGCCTT  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  AAGAGAGAAGACATATTCTACACTTCAAAGCTTTGGAGCAATTCCCATCGACCAGAGTTGGTCCGACCAGCCTT  296

Query 297  GGAAAGGTCACTGAAAAATCTTCAATTGGATTATGTTGACCTCTACCTTATTCATTTTCCAGTGTCTGTAAAGC  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||   
Sbjct 297  GGAAAGGTCACTGAAAAATCTTCAATTGGACTATGTTGACCTCTATCTTATTCATTTTCCAGTGTCTGTAA---  367

Query 371  CAGGTGAGGAAGTGATCCCAAAAGATGAAAATGGAAAAATACTATTTGACACAGTGGATCTCTGTGCCACGTGG  444
                                                                                     
Sbjct 368  --------------------------------------------------------------------------  367

Query 445  GAGGCCGTGGAGAAGTGTAAAGATGCAGGATTGGCCAAGTCCATCGGGGTGTCCAACTTCAACCGCAGGCAGCT  518
            |||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct 368  -AGGCCATGGAGAAGTGTAAAGATGCAGGATTGGCCAAGTCCATCGGGGTGTCCAACTTCAACCACAGGCTGCT  440

Query 519  GGAGATGATCCTCAACAAGCCAGGGCTCAAGTACAAGCCTGTCTGCAACCAGGTGGAATGTCATCCTTACTTCA  592
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 441  GGAGATGATCCTCAACAAGCCAGGGCTCAAGTACAAGCCTGTCTGCAACCAGGTGGAATGTCATCCTTACTTCA  514

Query 593  ACCAGAGAAAACTGCTGGATTTCTGCAAGTCAAAAGACATTGTTCTGGTTGCCTATAGTGCTCTGGGATCCCAC  666
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 515  ACCAGAGAAAACTGCTGGATTTCTGCAAGTCAAAAGACATTGTTCTGGTTGCCTATAGTGCTCTGGGATCCCAT  588

Query 667  CGAGAAGAACCATGGGTGGACCCGAACTCCCCGGTGCTCTTGGAGGACCCAGTCCTTTGTGCCTTGGCAAAAAA  740
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 589  CGAGAAGAACCATGGGTGGACCCGAACTCCCCGGTGCTCTTGGAGGACCCAGTCCTTTGTGCCTTGGCAAAAAA  662

Query 741  GCACAAGCGAACCCCAGCCCTGATTGCCCTGCGCTACCAGCTACAGCGTGGGGTTGTGGTCCTGGCCAAGAGCT  814
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 663  GCACAAGCGAACCCCAGCCCTGATTGCCCTGCGCTACCAGCTGCAGCGTGGGGTTGTGGTCCTGGCCAAGAGCT  736

Query 815  ACAATGAGCAGCGCATCAGACAGAACGTGCAGGTGTTTGAATTCCAGTTGACTTCAGAGGAGATGAAAGCCATA  888
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 737  ACAATGAGCAGCGCATCAGACAGAACGTGCAGGTGTTTGAATTCCAGTTGACTTCAGAGGAGATGAAAGCCATA  810

Query 889  GATGGCCTAAACAGAAATGTGCGATATTTGACCCTTGATATTTTTGCTGGCCCCCCTAATTATCCATTTTCTGA  962
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 811  GATGGCCTAAACAGAAATGTGCGATATTTGACCCTTGATATTTTTGCTGGCCCCCCTAATTATCCATTTTCTGA  884

Query 963  TGAATAT  969
           |||||||
Sbjct 885  TGAATAT  891