Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_06090
• Subject: NM_005216.5
• Aligned Length: 1368
• Identities: 1315
• Gaps: 51

Alignment

Query    1  ATGGGGTACTTCCGGTGTGCAGGTGCTGGGTCCTTCGGCAGGAGGAGGAAGATGGAGCCCAGCACCGCGGCCCG  74
                                                               |||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ---------------------------------------------------ATGGAGCCCAGCACCGCGGCCCG  23

Query   75  GGCTTGGGCCCTCTTTTGGTTGCTGCTGCCCTTGCTTGGCGCGGTTTGCGCCAGCGGACCCCGCACCTTAGTGC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   24  GGCTTGGGCCCTCTTTTGGTTGCTGCTGCCCTTGCTTGGCGCGGTTTGCGCCAGCGGACCCCGCACCTTAGTGC  97

Query  149  TGCTGGACAACCTCAACGTGCGGGAGACTCATTCGCTTTTCTTCCGGAGCCTGAAGGACCGGGGCTTTGAGCTC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   98  TGCTGGACAACCTCAACGTGCGGGAGACTCATTCGCTTTTCTTCCGGAGCCTGAAGGACCGGGGCTTTGAGCTC  171

Query  223  ACATTCAAGACCGCTGATGACCCCAGCCTGTCTCTCATAAAGTATGGGGAATTCCTCTATGACAATCTCATCAT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  172  ACATTCAAGACCGCTGATGACCCCAGCCTGTCTCTCATAAAGTATGGGGAATTCCTCTATGACAATCTCATCAT  245

Query  297  TTTCTCCCCTTCGGTAGAAGATTTTGGAGGCAACATCAACGTGGAGACCATCAGTGCCTTTATTGACGGTGGAG  370
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  246  TTTCTCCCCTTCGGTAGAAGATTTTGGAGGCAACATCAACGTGGAGACCATCAGTGCCTTTATTGACGGCGGAG  319

Query  371  GCAGTGTGCTGGTAGCTGCCAGCTCCGACATTGGTGACCCTCTTCGAGAGCTGGGCAGTGAGTGCGGGATTGAG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  320  GCAGTGTGCTGGTAGCTGCCAGCTCCGACATTGGTGACCCTCTTCGAGAGCTGGGCAGTGAGTGCGGGATTGAG  393

Query  445  TTTGACGAGGAGAAAACGGCTGTCATTGACCATCACAACTATGACATCTCAGACCTTGGCCAGCATACGCTCAT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  394  TTTGACGAGGAGAAAACGGCTGTCATTGACCATCACAACTATGACATCTCAGACCTTGGCCAGCATACGCTCAT  467

Query  519  CGTGGCTGACACTGAGAACCTGCTGAAGGCCCCAACCATCGTTGGGAAATCATCTCTAAATCCCATCCTCTTTC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  468  CGTGGCTGACACTGAGAACCTGCTGAAGGCCCCAACCATCGTTGGGAAATCATCTCTAAATCCCATCCTCTTTC  541

Query  593  GAGGTGTTGGGATGGTGGCCGATCCTGATAACCCTTTGGTGCTGGACATCCTGACGGGCTCTTCCACCTCTTAC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  542  GAGGTGTTGGGATGGTGGCCGATCCTGATAACCCTTTGGTGCTGGACATCCTGACGGGCTCTTCCACCTCTTAC  615

Query  667  TCCTTCTTCCCGGACAAGCCTATCACCCAGTATCCACATGCGGTGGGGAAGAACACCCTCCTCATTGCTGGGCT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  616  TCCTTCTTCCCGGACAAGCCTATCACCCAGTATCCACATGCGGTGGGGAAGAACACCCTCCTCATTGCTGGGCT  689

Query  741  CCAGGCCAGGAACAATGCCCGCGTCATCTTCAGCGGCTCCCTCGACTTCTTCAGCGACTCCTTCTTCAACTCAG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  690  CCAGGCCAGGAACAATGCCCGCGTCATCTTCAGCGGCTCCCTCGACTTCTTCAGCGACTCCTTCTTCAACTCAG  763

Query  815  CAGTGCAGAAGGCGGCGCCCGGCTCCCAGAGGTATTCCCAGACAGGCAACTATGAACTAGCTGTGGCCCTCTCC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  764  CAGTGCAGAAGGCGGCGCCCGGCTCCCAGAGGTATTCCCAGACAGGCAACTATGAACTAGCTGTGGCCCTCTCC  837

Query  889  CGCTGGGTGTTCAAGGAGGAGGGTGTCCTCCGTGTGGGGCCTGTGTCCCATCATCGGGTGGGTGAGACAGCCCC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  838  CGCTGGGTGTTCAAGGAGGAGGGTGTCCTCCGTGTGGGGCCTGTGTCCCATCATCGGGTGGGCGAGACAGCCCC  911

Query  963  ACCCAATGCCTACACTGTCACTGACCTAGTGGAGTATAGCATCGTGATCCAGCAGCTCTCAAATGGCAAATGGG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  912  ACCCAATGCCTACACTGTCACTGACCTAGTGGAGTATAGCATCGTGATCCAGCAGCTCTCAAATGGCAAATGGG  985

Query 1037  TCCCCTTTGATGGCGATGACATTCAGCTGGAGTTTGTCCGCATTGATCCTTTTGTGAGGACCTTCCTGAAGAAG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  986  TCCCCTTTGATGGCGATGACATTCAGCTGGAGTTTGTCCGCATTGATCCTTTTGTGAGGACCTTCCTGAAGAAG  1059

Query 1111  AAAGGTGGCAAATACAGTGTTCAGTTCAAGTTGCCCGACGTGTATGGTGTATTCCAGTTTAAAGTGGATTACAA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1060  AAAGGTGGCAAATACAGTGTTCAGTTCAAGTTGCCCGACGTGTATGGTGTATTCCAGTTTAAAGTGGATTACAA  1133

Query 1185  CCGGCTAGGCTACACACACCTGTACTCTTCCACTCAGGTATCCGTGCGGCCACTCCAGCACACGCAGTATGAGC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1134  CCGGCTAGGCTACACACACCTGTACTCTTCCACTCAGGTATCCGTGCGGCCACTCCAGCACACGCAGTATGAGC  1207

Query 1259  GCTTCATCCCCTCGGCCTACCCCTACTACGCCAGCGCCTTCTCCATGATGCTGGGGCTCTTCATCTTCAGCATC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1208  GCTTCATCCCCTCGGCCTACCCCTACTACGCCAGCGCCTTCTCCATGATGCTGGGGCTCTTCATCTTCAGCATC  1281

Query 1333  GTCTTCTTGCACATGAAGGAGAAGGAGAAGTCCGAC  1368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1282  GTCTTCTTGCACATGAAGGAGAAGGAGAAGTCCGAC  1317