Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_06100
• Subject: NM_030225.4
• Aligned Length: 1365
• Identities: 1212
• Gaps: 9

Alignment

Query    1  ATGCTGTCCCGATCCCGCTGTGTGTCTCGGGCGTTCAGCCGCTCGCTCTCCGCCTTCCAGAAGGGGAACTGCCC  74
            |||||||||||.||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCTGTCCCGGTCACGCTGCGTGTCCCGGGCGTTCAGCCGCTCGCTTTCTGCCTTCCAGAAGGGGAACTGCCC  74

Query   75  TCTAGGGAGACGTTCCCTGCCTGGGGTCTCCTTATGCCAGGGACCAGGTTACCCTAACAGCAGGAAGGTTGTCA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||||||||||||||||.|||.|||||||.|.||||
Sbjct   75  TCTAGGGAGACGTTCCCTGCCTGGGGTCTCCTTATGTCGGGGACCAGGTTACCCTGACAACAGGAAGATGGTCA  148

Query  149  TTAACA---ACAGTGTCTTCAGTGTTCGCTTTTTCAGAACTACAGCTGTATGCAAGGATGACTTGGTTACAGTC  219
            ||||||   ..||.||||||||.||||||||.|||..|||.||.|||||.||||||.||||..||.|.||||||
Sbjct  149  TTAACAGTGGTAGCGTCTTCAGGGTTCGCTTCTTCCAAACCACGGCTGTGTGCAAGAATGATGTGATAACAGTC  222

Query  220  AAAACCCCAGCGTTTGCAGAATCTGTCACAGAGGGAGATGTCAGGTGGGAGAAAGCTGTTGGAGACACAGTTGC  293
            .|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|.|||||
Sbjct  223  CAAACCCCAGCGTTTGCAGAGTCTGTCACAGAGGGAGATGTCAGGTGGGAGAAAGCTGTTGGAGATGCGGTTGC  296

Query  294  AGAAGATGAAGTGGTTTGTGAGATTGAAACTGACAAGACATCTGTGCAGGTTCCATCACCAGCAAATGGCGTGA  367
            |||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||.|.|
Sbjct  297  AGAAGATGAAGTGGTGTGTGAGATTGAGACAGACAAGACTTCTGTGCAGGTTCCGTCGCCAGCAAATGGCATCA  370

Query  368  TTGAAGCTCTTTTGGTACCTGATGGGGGAAAAGTCGAAGGAGGCACTCCACTTTTCACACTCAGGAAAACTGGT  441
            |||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TTGAAGCTCTTTTGGTACCCGATGGGGGCAAAGTTGAAGGAGGAACTCCTCTGTTCACACTCAGGAAAACTGGT  444

Query  442  GCTGCTCCTGCTAAGGCCAAGCCGGCTGAAGCTCCTGCTGCTGCAGCCCCAAAAGCAGAACCTACAGCA---GC  512
            ||||||||||||||||||||.||.||||||.|||   |||||.||||||..||||||||.||..|||||   ||
Sbjct  445  GCTGCTCCTGCTAAGGCCAAACCAGCTGAAACTC---CTGCTCCAGCCCACAAAGCAGAGCCCGCAGCACCGGC  515

Query  513  GGCAGTTCCTCCCCCTGCAGCACCCATACCCACTCAGATGCCACCGGTGCCCTCGCCCTCACAACCTCCTTCTG  586
            |||...|||||||||.||||||||..|.|.|||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||.
Sbjct  516  GGCCCCTCCTCCCCCCGCAGCACCTGTGCTCACTCAGATGCCACCAGTGCCCTCACCCTCACAGCCTCCTTCTA  589

Query  587  GCAAACCTGTGTCTGCAGTAAAACCCACTGTTGCCCCACCACTAGCTGAGCCAGGAGCTGGCAAAGGTCTGCGT  660
            |||||||.|||||||||.||||||||||||.||||||.|||||.||||||.|||||||||..||||||||||||
Sbjct  590  GCAAACCAGTGTCTGCAATAAAACCCACTGCTGCCCCTCCACTGGCTGAGGCAGGAGCTGCTAAAGGTCTGCGT  663

Query  661  TCAGAACATCGGGAGAAAATGAACAGGATGCGGCAGCGCATTGCTCAGCGTCTGAAGGAGGCCCAGAATACATG  734
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||.||.||
Sbjct  664  TCAGAACATCGGGAGAAAATGAACAGGATGCGGCAGCGCATCGCCCAGCGTCTGAAGGAAGCCCAGAACACGTG  737

Query  735  TGCAATGCTGACAACTTTTAATGAGATTGACATGAGTAACATCCAGGAGATGAGGGCTCGGCACAAAGAGGCTT  808
            ||||||||||||.|||||.||||||.||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||.||||
Sbjct  738  TGCAATGCTGACGACTTTCAATGAGGTTGACATGAGTAACATACAAGAGATGAGAGCTCGGCACAAGGATGCTT  811

Query  809  TTTTGAAGAAACATAACCTCAAACTAGGCTTCATGTCGGCATTTGTGAAGGCCTCAGCCTTTGCCTTGCAGGAA  882
            |..||||.|||||||||||||||.|||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.
Sbjct  812  TCCTGAAAAAACATAACCTCAAATTAGGCTTCATGTCAGCATTTGTGAAGGCCTCGGCGTTCGCCTTGCAGGAG  885

Query  883  CAGCCTGTTGTAAATGCAGTGATTGACGACACAACCAAAGAGGTGGTGTATAGGGATTATATTGACATCAGTGT  956
            ||||||||||||||||||||||||||.||..|||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  886  CAGCCTGTTGTAAATGCAGTGATTGATGATGCAACCAAGGAAGTGGTGTATAGAGATTATATTGACATCAGTGT  959

Query  957  TGCAGTGGCCACCCCACGGGGTCTGGTGGTTCCAGTCATCAGGAATGTGGAAGCTATGAATTTTGCAGATATTG  1030
            ||||||.||.|||||..|||||||.||||||||.||||||||||||||||||.|||||||.|.|||||||||||
Sbjct  960  TGCAGTTGCTACCCCGAGGGGTCTCGTGGTTCCTGTCATCAGGAATGTGGAAACTATGAACTATGCAGATATTG  1033

Query 1031  AACGGACCATCACTGAACTGGGAGAGAAGGCCCGAAAGAATGAACTTGCCATTGAAGATATGGATGGCGGTACC  1104
            ||||||||||.|.||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1034  AACGGACCATTAATGAACTAGGAGAGAAGGCCCGGAAGAATGAACTTGCCATTGAAGATATGGATGGTGGTACC  1107

Query 1105  TTCACCATTAGCAATGGAGGCGTTTTTGGCTCGCTCTTTGGAACACCCATTATCAACCCCCCTCAGTCTGCCAT  1178
            ||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1108  TTCACCATCAGCAACGGAGGAGTTTTTGGCTCACTTTTTGGAACACCCATTATCAACCCCCCTCAATCTGCCAT  1181

Query 1179  CCTGGGGATGCATGGCATCTTTGACAGGCCAGTGGCTATAGGAGGCAAGGTAGAGGTGCGGCCCATGATGTACG  1252
            ||||||.|||||.|.|||||||||||||||.||||||.|.|||||||||||.||.||.||.||.||||||||.|
Sbjct 1182  CCTGGGCATGCACGCCATCTTTGACAGGCCTGTGGCTGTGGGAGGCAAGGTGGAAGTTCGACCTATGATGTATG  1255

Query 1253  TGGCACTGACCTATGATCACCGGCTGATTGATGGCAGAGAGGCTGTGACTTTCCTCCGCAAAATCAAGGCAGCG  1326
            |.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.
Sbjct 1256  TAGCCCTGACCTATGACCACCGGCTGATTGATGGCAGAGAGGCTGTGACTTTCCTCCGAAAAATCAAGGCAGCA  1329

Query 1327  GTAGAGGATCCCAGAGTCCTCCTCCTGGATCTT  1359
            |||||.|||||.||||||||||||||.||.|||
Sbjct 1330  GTAGAAGATCCAAGAGTCCTCCTCCTAGACCTT  1362