Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_06100
• Subject: XR_001750184.2
• Aligned Length: 1400
• Identities: 1118
• Gaps: 281

Alignment

Query    1  -----------------------------------------ATGCTGTCCCGATCCCGCTGTGTGTCTCGGGCG  33
                                                     |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  CCTATATCCGGTGTCCGCCCGCCCTCGGCTCCTCCGCCGTGATGCTGTCCCGATCCCGCTGTGTGTCTCGGGCG  74

Query   34  TTCAGCCGCTCGCTCTCCGCCTTCCAGAAGGGGAACTGCCCTCTAGGGAGACGTTCCCTGCCTGGGGTCTCCTT  107
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TTCAGCCGCTCGCTCTCCGCCTTCCAGAAGGGGAACTGCCCTCTAGGGAGACGTTCCCTGCCTGGGGTCTCCTT  148

Query  108  ATGCCAGGGACCAGGTTACCCTAACAGCAGGAAGGTTGTCATTAACAACAGTGTCTTCAGTGTTCGCTTTTTCA  181
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ATGCCAGGGACCAGGTTACCCTAACAGCAGGAAGGTTGTCATTAACAACAGTGTCTTCAGTGTTCGCTTTTTCA  222

Query  182  GAACTACAGCTGTATGCAAGGATGACTTGGTTACAGTCAAAACCCCAGCGTTTGCAGAATCTGTCACAGAGGGA  255
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GAACTACAGCTGTATGCAAGGATGACTTGGTTACAGTCAAAACCCCAGCGTTTGCAGAATCTGTCACAGAGGGA  296

Query  256  GATGTCAGGTGGGAGAAAGCTGTTGGAGACACAGTTGCAGAAGATGAAGTGGTTTGTGAGATTGAAACTGACAA  329
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GATGTCAGGTGGGAGAAAGCTGTTGGAGACACAGTTGCAGAAGATGAAGTGGTTTGTGAGATTGAAACTGACAA  370

Query  330  GACATCTGTGCAGGTTCCATCACCAGCAAATGGCGTGATTGAAGCTCTTTTGGTACCTGATGGGGGAAAAGTCG  403
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GACATCTGTGCAGGTTCCATCACCAGCAAATGGCGTGATTGAAGCTCTTTTGGTACCTGATGGGGGAAAAGTCG  444

Query  404  AAGGAGGCACTCCACTTTTCACACTCAGGAAAACTGGTGCTGCTCCTGCTAAGGCCAAGCCGGCTGAAGCTCCT  477
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AAGGAGGCACTCCACTTTTCACACTCAGGAAAACTGGTGCTGCTCCTGCTAAGGCCAAGCCGGCTGAAGCTCCT  518

Query  478  GCTGCTGCAGCCCCAAAAGCAGAACCTACAGCAGCGGCAGTTCCTCCCCCTGCAGCACCCATACCCACTCAGAT  551
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GCTGCTGCAGCCCCAAAAGCAGAACCTACAGCAGCGGCAGTTCCTCCCCCTGCAGCACCCATACCCACTCAGAT  592

Query  552  GCCACCGGTGCCCTCGCCCTCACAACCTCCTTCTGGCAAACCTGTGTCTGCAGTAAAACCCACTGTTGCCCCAC  625
            ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GCCACCGGTGCCCTCGCCCTCACAGCCTCCTTCTGGCAAACCTGTGTCTGCAGTAAAACCCACTGTTGCCCCAC  666

Query  626  CACTAGCTGAGCCAGGAGCTGGCAAAGGTCTGCGTTCAGAACATCGGGAGAAAATGAACAGGATGCGGCAGCGC  699
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                            
Sbjct  667  CACTAGCTGAGCCAGGAGCTGGCAAAGGTCTGCGTTCAGAACATCG----------------------------  712

Query  700  ATTGCTCAGCGTCTGAAGGAGGCCCAGAATACATGTGCAATGCTGACAACTTTTAATGAGATTGACATGAGTAA  773
                                                                                  ||||
Sbjct  713  ----------------------------------------------------------------------GTAA  716

Query  774  CATCCAGGAGATGAGGGCTCGGCACAAAGAGGCTTTTTTGAAGAAACATAACCTCAAACTAGGCTTCATGTCGG  847
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  717  CATCCAGGAGATGAGGGCTCGGCACAAAGAGGCTTTTTTGAAGAAACATAACCTCAAACTAGGCTTCATGTCGG  790

Query  848  CATTTGTGAAGGCCTCAGCCTTTGCCTTGCAGGAACAGCCTGTTGTAAATGCAGTGATTGACGACACAACCAAA  921
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  791  CATTTGTGAAGGCCTCAGCCTTTGCCTTGCAGGAACAGCCTGTTGTAAATGCAGTGATTGACGACACAACCAAA  864

Query  922  GAGGTGGTGTATAGGGATTATATTGACATCAGTGTTGCAGTGGCCACCCCACGGGGTCTGGTGGTTCCAGTCAT  995
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  865  GAGGTGGTGTATAGGGATTATATTGACATCAGTGTTGCAGTGGCCACCCCACGGGGTCTGGTGGTTCCAGTCAT  938

Query  996  CAGGAATGTGGAAGCTATGAATTTTGCAGATATTGAACGGACCATCACTGAACTGGGAGAGAAGGCCCGAAAGA  1069
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  939  CAGGAATGTGGAAGCTATGAATTTTGCAGATATTGAACGGACCATCACTGAACTGGGAGAGAAGGCCCGAAAGA  1012

Query 1070  ATGAACTTGCCATTGAAGATATGGATGGCGGTACCTTCACCATTAGCAATGGAGGCGTTTTTGGCTCGCTCTTT  1143
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1013  ATGAACTTGCCATTGAAGATATGGATGGCGGTACCTTCACCATTAGCAATGGAGGCGTTTTTGGCTCGCTCTTT  1086

Query 1144  GGAACACCCATTATCAACCCCCCTCAGTCTGCCATCCTGGGGATGCATGGCATCTTTGACAGGCCAGTGGCTAT  1217
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1087  GGAACACCCATTATCAACCCCCCTCAGTCTGCCATCCTGGGGATGCATGGCATCTTTGACAGGCCAGTGGCTAT  1160

Query 1218  AGGAGGCAAGGTAGAGGTGCGGCCCATGATGTACGTGGCACTGACCTATGATCACCGGCTGATTGATGGCAGAG  1291
                                                                                      
Sbjct 1161  --------------------------------------------------------------------------  1160

Query 1292  AGGCTGTGACTTTCCTCCGCAAAATCAAGGCAGCGGTAGAGGATCCCAGAGTCCTCCTCCTGGATCTT  1359
                                                                                
Sbjct 1161  --------------------------------------------------------------------  1160