Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_06106
• Subject: NM_001374269.1
• Aligned Length: 2601
• Identities: 2547
• Gaps: 48

Alignment

Query    1  ATGGGCAACCGCGGCATGGAAGATCTCATCCCGCTGGTCAACCGGCTGCAAGACGCCTTCTCTGCCATCGGCCA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGCAACCGCGGCATGGAAGATCTCATCCCGCTGGTCAACCGGCTGCAAGACGCCTTCTCTGCCATCGGCCA  74

Query   75  GAACGCGGACCTCGACCTGCCGCAGATCGCTGTGGTGGGCGGCCAGAGCGCCGGCAAGAGCTCGGTGCTCGAGA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GAACGCGGACCTCGACCTGCCGCAGATCGCTGTGGTGGGCGGCCAGAGCGCCGGCAAGAGCTCGGTGCTCGAGA  148

Query  149  ATTTCGTAGGCAGGGACTTCTTGCCTCGAGGATCTGGCATTGTCACCCGACGTCCCCTGGTCTTGCAGCTGGTC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ATTTCGTAGGCAGGGACTTCTTGCCTCGAGGATCTGGCATTGTCACCCGACGTCCCCTGGTCTTGCAGCTGGTC  222

Query  223  AATGCAACCACAGAATATGCCGAGTTCCTGCACTGCAAGGGAAAGAAATTCACCGACTTCGAGGAGGTGCGCCT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AATGCAACCACAGAATATGCCGAGTTCCTGCACTGCAAGGGAAAGAAATTCACCGACTTCGAGGAGGTGCGCCT  296

Query  297  TGAGATCGAGGCCGAGACCGACAGGGTCACCGGCACCAACAAGGGCATCTCGCCGGTGCCTATCAACCTCCGCG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGAGATCGAGGCCGAGACCGACAGGGTCACCGGCACCAACAAGGGCATCTCGCCGGTGCCTATCAACCTCCGCG  370

Query  371  TCTACTCGCCGCACGTGCTGAACCTGACCCTGGTGGACCTGCCCGGAATGACCAAGGTCCCGGTGGGGGACCAA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TCTACTCGCCGCACGTGCTGAACCTGACCCTGGTGGACCTGCCCGGAATGACCAAGGTCCCGGTGGGGGACCAA  444

Query  445  CCTCCCGACATCGAGTTCCAGATCCGAGACATGCTTATGCAGTTTGTCACCAAGGAGAACTGCCTCATCCTGGC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CCTCCCGACATCGAGTTCCAGATCCGAGACATGCTTATGCAGTTTGTCACCAAGGAGAACTGCCTCATCCTGGC  518

Query  519  CGTGTCCCCCGCCAACTCTGACCTGGCCAATTCTGACGCCCTCAAGGTCGCCAAGGAGGTGGACCCCCAGGGCC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CGTGTCCCCCGCCAACTCTGACCTGGCCAATTCTGACGCCCTCAAGGTCGCCAAGGAGGTGGACCCCCAGGGCC  592

Query  593  AGCGCACCATCGGGGTCATCACCAAGCTGGACCTGATGGACGAGGGCACAGATGCCCGTGATGTGCTGGAGAAC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AGCGCACCATCGGGGTCATCACCAAGCTGGACCTGATGGACGAGGGCACAGATGCCCGTGATGTGCTGGAGAAC  666

Query  667  AAGCTGCTCCCCCTGCGCAGAGGCTACATTGGAGTGGTGAACCGGAGCCAGAAGGACATTGATGGCAAGAAGGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AAGCTGCTCCCCCTGCGCAGAGGCTACATTGGAGTGGTGAACCGGAGCCAGAAGGACATTGATGGCAAGAAGGA  740

Query  741  CATTACCGCCGCCTTGGCTGCTGAACGAAAGTTCTTCCTCTCCCATCCATCTTATCGCCACTTGGCTGACCGTA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CATTACCGCCGCCTTGGCTGCTGAACGAAAGTTCTTCCTCTCCCATCCATCTTATCGCCACTTGGCTGACCGTA  814

Query  815  TGGGCACGCCCTACCTGCAGAAGGTCCTCAATCAGCAACTGACGAACCACATCCGGGACACACTGCCGGGGCTG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TGGGCACGCCCTACCTGCAGAAGGTCCTCAATCAGCAACTGACGAACCACATCCGGGACACACTGCCGGGGCTG  888

Query  889  CGGAACAAGCTGCAGAGCCAGCTACTGTCCATTGAGAAGGAGGTGGAGGAATACAAGAACTTCCGCCCTGATGA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CGGAACAAGCTGCAGAGCCAGCTACTGTCCATTGAGAAGGAGGTGGAGGAATACAAGAACTTCCGCCCTGATGA  962

Query  963  CCCAGCTCGCAAGACCAAGGCCCTGCTGCAGATGGTCCAGCAGTTTGCCGTAGACTTTGAGAAGCGCATTGAGG  1036
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CCCAGCTCGCAAGACCAAGGCCCTGCTGCAGATGGTCCAGCAGTTCGCCGTAGACTTTGAGAAGCGCATTGAGG  1036

Query 1037  GCTCAGGAGATCAGATCGACACCTACGAACTGTCAGGGGGAGCCCGCATTAACCGAATCTTCCACGAGCGCTTC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GCTCAGGAGATCAGATCGACACCTACGAACTGTCAGGGGGAGCCCGCATTAACCGAATCTTCCACGAGCGCTTC  1110

Query 1111  CCTTTCGAGCTGGTCAAGATGGAGTTTGATGAGAAGGAACTCCGAAGGGAGATCAGCTATGCTATCAAGAATAT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CCTTTCGAGCTGGTCAAGATGGAGTTTGATGAGAAGGAACTCCGAAGGGAGATCAGCTATGCTATCAAGAATAT  1184

Query 1185  CCATGGCATTAGAACGGGGCTGTTTACCCCAGACATGGCCTTTGAGACCATTGTGAAAAAGCAGGTGAAGAAGA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CCATGGCATTAGAACGGGGCTGTTTACCCCAGACATGGCCTTTGAGACCATTGTGAAAAAGCAGGTGAAGAAGA  1258

Query 1259  TCCGAGAACCGTGTCTCAAGTGTGTGGACATGGTTATCTCGGAGCTAATCAGCACCGTTAGACAGTGCACCAAG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TCCGAGAACCGTGTCTCAAGTGTGTGGACATGGTTATCTCGGAGCTAATCAGCACCGTTAGACAGTGCACCAAG  1332

Query 1333  AAGCTCCAGCAGTACCCGCGGCTACGGGAGGAGATGGAGCGCATCGTGACCACCCACATCCGGGAGCGCGAGGG  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  AAGCTCCAGCAGTACCCGCGGCTACGGGAGGAGATGGAGCGCATCGTGACCACCCACATCCGGGAGCGCGAGGG  1406

Query 1407  CCGCACTAAGGAGCAGGTCATGCTTCTCATCGATATCGAGCTGGCTTACATGAACACCAACCATGAGGACTTCA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CCGCACTAAGGAGCAGGTCATGCTTCTCATCGATATCGAGCTGGCTTACATGAACACCAACCATGAGGACTTCA  1480

Query 1481  TAGGCTTTGCCAATGCTCAGCAGAGGAGCAACCAGATGAACAAGAAGAAGACTTCAGGGAACCAGGATGAGATT  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TAGGCTTTGCCAATGCTCAGCAGAGGAGCAACCAGATGAACAAGAAGAAGACTTCAGGGAACCAGGATGAGATT  1554

Query 1555  CTGGTCATCCGCAAGGGCTGGCTGACTATCAATAATATTGGCATCATGAAAGGGGGCTCCAAGGAGTACTGGTT  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CTGGTCATCCGCAAGGGCTGGCTGACTATCAATAATATTGGCATCATGAAAGGGGGCTCCAAGGAGTACTGGTT  1628

Query 1629  TGTGCTGACTGCTGAGAATCTGTCCTGGTACAAGGATTATGAGGAGAAAGAGAAGAAATACATGCTGTCTGTGG  1702
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  TGTGCTGACTGCTGAGAATCTGTCCTGGTACAAGGATGATGAGGAGAAAGAGAAGAAATACATGCTGTCTGTGG  1702

Query 1703  ACAACCTCAAGCTGCGGGACGTGGAGAAGGGCTTTATGTCGAGCAAGCATATCTTTGCCCTCTTTAACACGGAG  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  ACAACCTCAAGCTGCGGGACGTGGAGAAGGGCTTTATGTCGAGCAAGCATATCTTTGCCCTCTTTAACACGGAG  1776

Query 1777  CAGAGGAATGTCTACAAGGATTATCGGCAGCTGGAGCTAGCCTGTGAGACACAGGAGGAGGTGGACAGCTGGAA  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  CAGAGGAATGTCTACAAGGATTATCGGCAGCTGGAGCTAGCCTGTGAGACACAGGAGGAGGTGGACAGCTGGAA  1850

Query 1851  GGCCTCCTTCCTGAGGGCTGGCGTGTACCCTGAGCGTGTTGGGGACAAAGAGAAAGCCAGCGAGACCGAGGAGA  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  GGCCTCCTTCCTGAGGGCTGGCGTGTACCCTGAGCGTGTTGGGGACAAAGAGAAAGCCAGCGAGACCGAGGAGA  1924

Query 1925  ATGGCTCCGACAGCTTCATGCATTCCATGGACCCACAGCTGGAACGGCAAGTGGAGACCATCCGGAATCTTGTG  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  ATGGCTCCGACAGCTTCATGCATTCCATGGACCCACAGCTGGAACGGCAAGTGGAGACCATCCGGAATCTTGTG  1998

Query 1999  GACTCATACATGGCCATTGTCAACAAGACCGTGAGGGACCTCATGCCCAAGACCATCATGCACCTCATGATTAA  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  GACTCATACATGGCCATTGTCAACAAGACCGTGAGGGACCTCATGCCCAAGACCATCATGCACCTCATGATTAA  2072

Query 2073  CAATACCAAGGAGTTCATCTTCTCGGAGCTGCTGGCCAACCTGTACTCGTGTGGGGACCAGAACACGCTGATGG  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  CAATACCAAGGAGTTCATCTTCTCGGAGCTGCTGGCCAACCTGTACTCGTGTGGGGACCAGAACACGCTGATGG  2146

Query 2147  AGGAGTCGGCGGAGCAGGCACAGCGGCGCGACGAGATGCTGCGCATGTACCACGCACTGAAGGAGGCGCTCAGC  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  AGGAGTCGGCGGAGCAGGCACAGCGGCGCGACGAGATGCTGCGCATGTACCACGCACTGAAGGAGGCGCTCAGC  2220

Query 2221  ATCATCGGCGACATCAACACGACCACCGTCAGCACGCCCATGCCCCCGCCCGTGGACGACTCCTGGCTGCAGGT  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  ATCATCGGCGACATCAACACGACCACCGTCAGCACGCCCATGCCCCCGCCCGTGGACGACTCCTGGCTGCAGGT  2294

Query 2295  GCAGAGCGTACCGGCCGGACGCAGGTCGCCCACGTCCAGCCCCACGCCGCAGCGCCGAGCCCCCGCCGTGCCCC  2368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  GCAGAGCGTACCGGCCGGACGCAGGTCGCCCACGTCCAGCCCCACGCCGCAGCGCCGAGCCCCCGCCGTGCCCC  2368

Query 2369  CAGCCCGGCCCGGGTCGCGGGGCCCTGCTCCTGGGCCTCCGCCTGCTGGGTCCGCCCTGGGGGGGGCGCCCCCC  2442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  CAGCCCGGCCCGGGTCGCGGGGCCCTGCTCCTGGGCCTCCGCCTGCTGGGTCCGCCCTGGGGGGGGCGCCCCCC  2442

Query 2443  GTGCCCTCCAGGCCGGGGGCTTCCCCTGACCCTTTCGGCCCTCCCCCTCAGGTGCCCTCGCGCCCCAACCGCGC  2516
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  GTGCCCTCCAGGCCGGGGGCTTCCCCTGACCCTTTCGGCCCTCCCCCTCAGGTGCCCTCGCGCCCCAACCGCGC  2516

Query 2517  CCCGCCCGGGGTCCCCAGAA-----------TCA-CTATCAG---TG-ACCCC---------------------  2553
            ||||||||||||||||||.|           ||| |||..||   || |.|||                     
Sbjct 2517  CCCGCCCGGGGTCCCCAGGAAGGGCCCAGCCTCACCTACGAGACCTGCAGCCCCCCGACCAGCTGAGGCTCCCC  2590

Query 2554  -----------  2553
                       
Sbjct 2591  TCTTAGACTTA  2601