Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_06183
- Subject:
- NM_013986.4
- Aligned Length:
- 1989
- Identities:
- 1031
- Gaps:
- 933
Alignment
Query 1 ATGGCGTCCACGGATTACAGTACCTATAGCCAAGCTGCAGCGCAGCAGGGCTACAGTGCTTACACCGCCCAGCC 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCGTCCACGGATTACAGTACCTATAGCCAAGCTGCAGCGCAGCAGGGCTACAGTGCTTACACCGCCCAGCC 74
Query 75 CACTCAAGGATATGCACAGACCACCCAGGCATATGGGCAACAAAGCTATGGAACCTATGGACAGCCCACTGATG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CACTCAAGGATATGCACAGACCACCCAGGCATATGGGCAACAAAGCTATGGAACCTATGGACAGCCCACTGATG 148
Query 149 TCAGCTATACCCAGGCTCAGACCACTGCAACCTATGGGCAGACCGCCTATGCAACTTCTTATGGACAGCCTCCC 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TCAGCTATACCCAGGCTCAGACCACTGCAACCTATGGGCAGACCGCCTATGCAACTTCTTATGGACAGCCTCCC 222
Query 223 ACT------------------GGTTATACTACTCCAACTGCCCCCCAGGCATACAGCCAGCCTGTCCAGGGGTA 278
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 ACTGTAGAAGGGACCAGTACAGGTTATACTACTCCAACTGCCCCCCAGGCATACAGCCAGCCTGTCCAGGGGTA 296
Query 279 TGGCACTGGTGCTTATGATACCACCACTGCTACAGTCACCACCACCCAGGCCTCCTATGCAGCTCAGTCTGCAT 352
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TGGCACTGGTGCTTATGATACCACCACTGCTACAGTCACCACCACCCAGGCCTCCTATGCAGCTCAGTCTGCAT 370
Query 353 ATGGCACTCAGCCTGCTTATCCAGCCTATGGGCAGCAGCCAGCAGCCACTGCACCTACAAGACCGCAGGATGGA 426
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 ATGGCACTCAGCCTGCTTATCCAGCCTATGGGCAGCAGCCAGCAGCCACTGCACCTACAAGACCGCAGGATGGA 444
Query 427 AACAAGCCCACTGAGACTAGTCAACCTCAATCTAGCACAGGGGGTTACAACCAGCCCAGCCTAGGATATGGACA 500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 AACAAGCCCACTGAGACTAGTCAACCTCAATCTAGCACAGGGGGTTACAACCAGCCCAGCCTAGGATATGGACA 518
Query 501 GAGTAACTACAGTTATCCCCAGGTACCTGGGAGCTACCCCATGCAGCCAGTCACTGCACCTCCATCCTACCCTC 574
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GAGTAACTACAGTTATCCCCAGGTACCTGGGAGCTACCCCATGCAGCCAGTCACTGCACCTCCATCCTACCCTC 592
Query 575 CTACCAGCTATTCCTCTACACAGCCGACTAGTTATGATCAGAGCAGTTACTCTCAGCAGAACACCTATGGGCAA 648
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 CTACCAGCTATTCCTCTACACAGCCGACTAGTTATGATCAGAGCAGTTACTCTCAGCAGAACACCTATGGGCAA 666
Query 649 CCGAGCAGCTATGGACAGCAGAGTAGCTATGGTCAACAAAGCAGCTATGGGCAGCAGCCTCCCACTAGTTACCC 722
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 CCGAGCAGCTATGGACAGCAGAGTAGCTATGGTCAACAAAGCAGCTATGGGCAGCAGCCTCCCACTAGTTACCC 740
Query 723 ACCCCAAACTGGATCCTACAGCCAAGCTCCAAGTCAATATAGCCAACAGAGCAGCAGCTACGGGCAGCAGAGTT 796
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 ACCCCAAACTGGATCCTACAGCCAAGCTCCAAGTCAATATAGCCAACAGAGCAGCAGCTACGGGCAGCAGAGTT 814
Query 797 CATTCCGACAGGACCACCCCAGTAGCATGGGTGTTTATGGGCAGGAGTCTGGAGGATTTTCCGGACCAGGAGAG 870
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 CATTCCGACAGGACCACCCCAGTAGCATGGGTGTTTATGGGCAGGAGTCTGGAGGATTTTCCGGACCAGGAGAG 888
Query 871 AACCGGAGCATGAGTGGCCCTGATAACCGGGGCAGGGGAAGAGGGGGATTTGATCGTGGAGGCATGAGCAGAGG 944
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 AACCGGAGCATGAGTGGCCCTGATAACCGGGGCAGGGGAAGAGGGGGATTTGATCGTGGAGGCATGAGCAGAGG 962
Query 945 TGGGCGGGGAGGAGGACGCGGTGTAATGGG-GTTACAAAGTGAG------------AGCCTTGTATACACTTCA 1005
|||||||||||||||||||||||.|||||| |.|..|.||.||| |||||.||..||.|.|..
Sbjct 963 TGGGCGGGGAGGAGGACGCGGTGGAATGGGCGCTGGAGAGCGAGGTGGCTTCAATAAGCCTGGTGGACCCATGG 1036
Query 1006 ATACTTAAAAAGTACCCGTACT-----------------------CAG-----TACTCAGCCGGCA--GCA--- 1046
|| .|||.|||.|..|| ||| .||||.|.|..|| |||
Sbjct 1037 AT------GAAGGACCAGATCTTGATCTAGGCCCACCTGTAGATCCAGATGAAGACTCTGACAACAGTGCAATT 1104
Query 1047 TA---------ATGAAA----AGTGGGAC--------------------------------------------- 1062
|| ||.||| ||||.|||
Sbjct 1105 TATGTACAAGGATTAAATGACAGTGTGACTCTAGATGATCTGGCAGACTTCTTTAAGCAGTGTGGGGTTGTTAA 1178
Query 1063 -------------------------------------------------------------------------- 1062
Sbjct 1179 GATGAACAAGAGAACTGGGCAACCCATGATCCACATCTACCTGGACAAGGAAACAGGAAAGCCCAAAGGCGATG 1252
Query 1063 -------------------------------------------------------------------------- 1062
Sbjct 1253 CCACAGTGTCCTATGAAGACCCACCCACTGCCAAGGCTGCCGTGGAATGGTTTGATGGGAAAGATTTTCAAGGG 1326
Query 1063 -------------------------------------------------------------------------- 1062
Sbjct 1327 AGCAAACTTAAAGTCTCCCTTGCTCGGAAGAAGCCTCCAATGAACAGTATGCGGGGTGGTCTGCCACCCCGTGA 1400
Query 1063 -------------------------------------------------------------------------- 1062
Sbjct 1401 GGGCAGAGGCATGCCACCACCACTCCGTGGAGGTCCAGGAGGCCCAGGAGGTCCTGGGGGACCCATGGGTCGCA 1474
Query 1063 -------------------------------------------------------------------------- 1062
Sbjct 1475 TGGGAGGCCGTGGAGGAGATAGAGGAGGCTTCCCTCCAAGAGGACCCCGGGGTTCCCGAGGGAACCCCTCTGGA 1548
Query 1063 -------------------------------------------------------------------------- 1062
Sbjct 1549 GGAGGAAACGTCCAGCACCGAGCTGGAGACTGGCAGTGTCCCAATCCGGGTTGTGGAAACCAGAACTTCGCCTG 1622
Query 1063 -------------------------------------------------------------------------- 1062
Sbjct 1623 GAGAACAGAGTGCAACCAGTGTAAGGCCCCAAAGCCTGAAGGCTTCCTCCCGCCACCCTTTCCGCCCCCGGGTG 1696
Query 1063 -------------------------------------------------------------------------- 1062
Sbjct 1697 GTGATCGTGGCAGAGGTGGCCCTGGTGGCATGCGGGGAGGAAGAGGTGGCCTCATGGATCGTGGTGGTCCCGGT 1770
Query 1063 -------------------------------------------------------------------------- 1062
Sbjct 1771 GGAATGTTCAGAGGTGGCCGTGGTGGAGACAGAGGTGGCTTCCGTGGTGGCCGGGGCATGGACCGAGGTGGCTT 1844
Query 1063 -------------------------------------------------------------------------- 1062
Sbjct 1845 TGGTGGAGGAAGACGAGGTGGCCCTGGGGGGCCCCCTGGACCTTTGATGGAACAGATGGGAGGAAGAAGAGGAG 1918
Query 1063 ----------------------------------------------------------------- 1062
Sbjct 1919 GACGTGGAGGACCTGGAAAAATGGATAAAGGCGAGCACCGTCAGGAGCGCAGAGATCGGCCCTAC 1983
