Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_06183
- Subject:
- XM_011530002.3
- Aligned Length:
- 1844
- Identities:
- 960
- Gaps:
- 835
Alignment
Query 1 ATGGCGTCCACGGATTACAGTACCTATAGCCAAGCTGCAGCGCAGCAGGGCTACAGTGCTTACACCGCCCAGCC 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCGTCCACGGATTACAGTACCTATAGCCAAGCTGCAGCGCAGCAGGGCTACAGTGCTTACACCGCCCAGCC 74
Query 75 CACTCAAGGATATGCACAGACCACC---CAGGCATATGGGCAACAAAGCTATGGAACCTATGGACAGCCCACTG 145
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CACTCAAGGATATGCACAGACCACCCAGCAGGCATATGGGCAACAAAGCTATGGAACCTATGGACAGCCCACTG 148
Query 146 ATGTCAGCTATACCCAGGCTCAGACCACTGCAACCTATGGGCAGACCGCCTATGCAACTTCTTATGGACAGCCT 219
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 ATGTCAGCTATACCCAGGCTCAGACCACTGCAACCTATGGGCAGACCGCCTATGCAACTTCTTATGGACAGCCT 222
Query 220 CCCACTGGTTATACTACTCCAACTGCCCCCCAGGCATACAGCCAGCCTGTCCAGGGGTATGGCACTGGTGCTTA 293
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CCCACTGGTTATACTACTCCAACTGCCCCCCAGGCATACAGCCAGCCTGTCCAGGGGTATGGCACTGGTGCTTA 296
Query 294 TGATACCACCACTGCTACAGTCACCACCACCCAGGCCTCCTATGCAGCTCAGTCTGCATATGGCACTCAGCCTG 367
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TGATACCACCACTGCTACAGTCACCACCACCCAGGCCTCCTATGCAGCTCAGTCTGCATATGGCACTCAGCCTG 370
Query 368 CTTATCCAGCCTATGGGCAGCAGCCAGCAGCCACTGCACCTACAAGACCGCAGGATGGAAACAAGCCCACTGAG 441
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CTTATCCAGCCTATGGGCAGCAGCCAGCAGCCACTGCACCTACAAGACCGCAGGATGGAAACAAGCCCACTGAG 444
Query 442 ACTAGTCAACCTCAATCTAGCACAGGGGGTTACAACCAGCCCAGCCTAGGATATGGACAGAGTAACTACAGTTA 515
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 ACTAGTCAACCTCAATCTAGCACAGGGGGTTACAACCAGCCCAGCCTAGGATATGGACAGAGTAACTACAGTTA 518
Query 516 TCCCCAGGTACCTGGGAGCTACCCCATGCAGCCAGTCACTGCACCTCCATCCTACCCTCCTACCAGCTATTCCT 589
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TCCCCAGGTACCTGGGAGCTACCCCATGCAGCCAGTCACTGCACCTCCATCCTACCCTCCTACCAGCTATTCCT 592
Query 590 CTACACAGCCGACTAGTTATGATCAGAGCAGTTACTCTCAGCAGAACACCTATGGGCAACCGAGCAGCTATGGA 663
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 CTACACAGCCGACTAGTTATGATCAGAGCAGTTACTCTCAGCAGAACACCTATGGGCAACCGAGCAGCTATGGA 666
Query 664 CAGCAGAGTAGCTATGGTCAACAAAGCAGCTATGGGCAGCAGCCTCCCACTAGTTACCCACCCCAAACTGGATC 737
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 CAGCAGAGTAGCTATGGTCAACAAAGCAGCTATGGGCAGCAGCCTCCCACTAGTTACCCACCCCAAACTGGATC 740
Query 738 CTACAGCCAAGCTCCAAGTCAATATAGCCAACAGAGCAGCAGCTACGGGCAGCAGAG-----TTCATTCCGACA 806
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |..|| || |
Sbjct 741 CTACAGCCAAGCTCCAAGTCAATATAGCCAACAGAGCAGCAGCTACGGGCAGCAGAGACCCATGGAT---GA-A 810
Query 807 GGACCA----------------CCCCAGTAG-------------------CATGGGTG---TTTATG------- 835
|||||| |.||.|||| ||...||| ||||||
Sbjct 811 GGACCAGATCTTGATCTAGGCCCACCTGTAGATCCAGATGAAGACTCTGACAACAGTGCAATTTATGTACAAGG 884
Query 836 -------GGCAG---GAGTCTGGAGGATTTTCCGGAC---------CAG---------------------GAGA 869
|.||| ||.|||.||.|||.|..|.||| ||| .|||
Sbjct 885 ATTAAATGACAGTGTGACTCTAGATGATCTGGCAGACTTCTTTAAGCAGTGTGGGGTTGTTAAGATGAACAAGA 958
Query 870 GAACCGGAGCATGAGTGGCCC-TGAT-------AACCGGGGCAGGGGAAGAG-----------GGGGAT----- 919
||||.|| ||| .||| |||| .|||.||.||.||.||.|| ||.|||
Sbjct 959 GAACTGG-GCA------ACCCATGATCCACATCTACCTGGACAAGGAAACAGGAAAGCCCAAAGGCGATGCCAC 1025
Query 920 -TTGATCGTGGAGGCATGA-------------GCAGAGGTGGGCGGGGAGGAGGACGCGGTGTAATGGG----- 974
.|| ||.| |||| ||..|||..|.||.||| ..|||.|.|||||
Sbjct 1026 AGTG-TCCT------ATGAAGACCCACCCACTGCCAAGGCTGCCGTGGA-------ATGGTTTGATGGGAAAGA 1085
Query 975 GTTACAAAGTGAGAGCCTTGTATACACTTCAATACTTAAAAAGT-ACCCGTACTCAGTACTCAGCCGGCAGCAT 1047
.||.||| |.|||| |.|||| ||||| .|||.|.|||.|.| |.|||.|
Sbjct 1086 TTTTCAA---GGGAGC-------AAACTT----------AAAGTCTCCCTTGCTCGGAA--------GAAGCCT 1131
Query 1048 --AATGAAAAGT----GGG----------AC------------------------------------------- 1062
||||||.||| ||| ||
Sbjct 1132 CCAATGAACAGTATGCGGGGTGGTCTGCCACCCCGTGAGGGCAGAGGCATGCCACCACCACTCCGTGGAGGTCC 1205
Query 1063 -------------------------------------------------------------------------- 1062
Sbjct 1206 AGGAGGCCCAGGAGGTCCTGGGGGACCCATGGGTCGCATGGGAGGCCGTGGAGGAGATAGAGGAGGCTTCCCTC 1279
Query 1063 -------------------------------------------------------------------------- 1062
Sbjct 1280 CAAGAGGACCCCGGGGTTCCCGAGGGAACCCCTCTGGAGGAGGAAACGTCCAGCACCGAGCTGGAGACTGGCAG 1353
Query 1063 -------------------------------------------------------------------------- 1062
Sbjct 1354 TGTCCCAATCCTTCAATTGGTGATTTCTGCTGTGATGTAATTGTATGCAGGGGTTGTGGAAACCAGAACTTCGC 1427
Query 1063 -------------------------------------------------------------------------- 1062
Sbjct 1428 CTGGAGAACAGAGTGCAACCAGTGTAAGGCCCCAAAGCCTGAAGGCTTCCTCCCGCCACCCTTTCCGCCCCCGG 1501
Query 1063 -------------------------------------------------------------------------- 1062
Sbjct 1502 GTGGTGATCGTGGCAGAGGTGGCCCTGGTGGCATGCGGGGAGGAAGAGGTGGCCTCATGGATCGTGGTGGTCCC 1575
Query 1063 -------------------------------------------------------------------------- 1062
Sbjct 1576 GGTGGAATGTTCAGAGGTGGCCGTGGTGGAGACAGAGGTGGCTTCCGTGGTGGCCGGGGCATGGACCGAGGTGG 1649
Query 1063 -------------------------------------------------------------------------- 1062
Sbjct 1650 CTTTGGTGGAGGAAGACGAGGTGGCCCTGGGGGGCCCCCTGGACCTTTGATGGAACAGATGGGAGGAAGAAGAG 1723
Query 1063 -------------------------------------------------------------------- 1062
Sbjct 1724 GAGGACGTGGAGGACCTGGAAAAATGGATAAAGGCGAGCACCGTCAGGAGCGCAGAGATCGGCCCTAC 1791
