Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_06183
- Subject:
- XM_024452181.1
- Aligned Length:
- 1751
- Identities:
- 960
- Gaps:
- 742
Alignment
Query 1 ATGGCGTCCACGGATTACAGTACCTATAGCCAAGCTGCAGCGCAGCAGGGCTACAGTGCTTACACCGCCCAGCC 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCGTCCACGGATTACAGTACCTATAGCCAAGCTGCAGCGCAGCAGGGCTACAGTGCTTACACCGCCCAGCC 74
Query 75 CACTCAAGGATATGCACAGACCACCCAGGCATATGGGCAACAAAGCTATGGAACCTATGGACAGCCCACTGATG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CACTCAAGGATATGCACAGACCACCCAGGCATATGGGCAACAAAGCTATGGAACCTATGGACAGCCCACTGATG 148
Query 149 TCAGCTATACCCAGGCTCAGACCACTGCAACCTATGGGCAGACCGCCTATGCAACTTCTTATGGACAGCCTCCC 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TCAGCTATACCCAGGCTCAGACCACTGCAACCTATGGGCAGACCGCCTATGCAACTTCTTATGGACAGCCTCCC 222
Query 223 ACTGGTTATACTACTCCAACTGCCCCCCAGGCATACAGCCAGCCTGTCCAGGGGTATGGCACTGGTGCTTATGA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 ACTGGTTATACTACTCCAACTGCCCCCCAGGCATACAGCCAGCCTGTCCAGGGGTATGGCACTGGTGCTTATGA 296
Query 297 TACCACCACTGCTACAGTCACCACCACCCAGGCCTCCTATGCAGCTCAGTCTGCATATGGCACTCAGCCTGCTT 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TACCACCACTGCTACAGTCACCACCACCCAGGCCTCCTATGCAGCTCAGTCTGCATATGGCACTCAGCCTGCTT 370
Query 371 ATCCAGCCTATGGGCAGCAGCCAGCAGCCACTGCACCTACAAGACCGCAGGATGGAAACAAGCCCACTGAGACT 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 ATCCAGCCTATGGGCAGCAGCCAGCAGCCACTGCACCTACAAGACCGCAGGATGGAAACAAGCCCACTGAGACT 444
Query 445 AGTCAACCTCAATCTAGCACAGGGGGTTACAACCAGCCCAGCCTAGGATATGGACAGAGTAACTACAGTTATCC 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 AGTCAACCTCAATCTAGCACAGGGGGTTACAACCAGCCCAGCCTAGGATATGGACAGAGTAACTACAGTTATCC 518
Query 519 CCAGGTACCTGGGAGCTACCCCATGCAGCCAGTCACTGCACCTCCATCCTACCCTCCTACCAGCTATTCCTCTA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CCAGGTACCTGGGAGCTACCCCATGCAGCCAGTCACTGCACCTCCATCCTACCCTCCTACCAGCTATTCCTCTA 592
Query 593 CACAGCCGACTAGTTATGATCAGAGCAGTTACTCTCAGCAGAACACCTATGGGCAACCGAGCAGCTATGGACAG 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 CACAGCCGACTAGTTATGATCAGAGCAGTTACTCTCAGCAGAACACCTATGGGCAACCGAGCAGCTATGGACAG 666
Query 667 CAGAGTAGCTATGGTCAACAAAGCAGCTATGGGCAGCAGCCTCCCACTAGTTACCCACCCCAAACTGGATCCTA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 CAGAGTAGCTATGGTCAACAAAGCAGCTATGGGCAGCAGCCTCCCACTAGTTACCCACCCCAAACTGGATCCTA 740
Query 741 CAGCCAAGCTCCAAGTCAATATAGCCAACAGAGCAGCAGCTACGGGCAGCAGAG-----TTCATTCCGACAGGA 809
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |..|| || ||||
Sbjct 741 CAGCCAAGCTCCAAGTCAATATAGCCAACAGAGCAGCAGCTACGGGCAGCAGAGACCCATGGAT---GA-AGGA 810
Query 810 CCA----------------CCCCAGTAG-------------------CATGGGTG---TTTATG---------- 835
||| |.||.|||| ||...||| ||||||
Sbjct 811 CCAGATCTTGATCTAGGCCCACCTGTAGATCCAGATGAAGACTCTGACAACAGTGCAATTTATGTACAAGGATT 884
Query 836 ----GGCAG---GAGTCTGGAGGATTTTCCGGAC---------CAG---------------------GAGAGAA 872
|.||| ||.|||.||.|||.|..|.||| ||| .||||||
Sbjct 885 AAATGACAGTGTGACTCTAGATGATCTGGCAGACTTCTTTAAGCAGTGTGGGGTTGTTAAGATGAACAAGAGAA 958
Query 873 CCGGAGCATGAGTGGCCC-TGAT-------AACCGGGGCAGGGGAAGAG-----------GGGGAT------TT 921
|.|| ||| .||| |||| .|||.||.||.||.||.|| ||.||| .|
Sbjct 959 CTGG-GCA------ACCCATGATCCACATCTACCTGGACAAGGAAACAGGAAAGCCCAAAGGCGATGCCACAGT 1025
Query 922 GATCGTGGAGGCATGA-------------GCAGAGGTGGGCGGGGAGGAGGACGCGGTGTAATGGG-----GTT 977
| ||.| |||| ||..|||..|.||.||| ..|||.|.||||| .||
Sbjct 1026 G-TCCT------ATGAAGACCCACCCACTGCCAAGGCTGCCGTGGA-------ATGGTTTGATGGGAAAGATTT 1085
Query 978 ACAAAGTGAGAGCCTTGTATACACTTCAATACTTAAAAAGT-ACCCGTACTCAGTACTCAGCCGGCAGCAT--A 1048
.||| |.|||| |.|||| ||||| .|||.|.|||.|.| |.|||.| |
Sbjct 1086 TCAA---GGGAGC-------AAACTT----------AAAGTCTCCCTTGCTCGGAA--------GAAGCCTCCA 1131
Query 1049 ATGAAAAGT----GGG----------AC---------------------------------------------- 1062
|||||.||| ||| ||
Sbjct 1132 ATGAACAGTATGCGGGGTGGTCTGCCACCCCGTGAGGGCAGAGGCATGCCACCACCACTCCGTGGAGGTCCAGG 1205
Query 1063 -------------------------------------------------------------------------- 1062
Sbjct 1206 AGGCCCAGGAGGTCCTGGGGGACCCATGGGTCGCATGGGAGGCCGTGGAGGAGATAGAGGAGGCTTCCCTCCAA 1279
Query 1063 -------------------------------------------------------------------------- 1062
Sbjct 1280 GAGGACCCCGGGGTTCCCGAGGGAACCCCTCTGGAGGAGGAAACGTCCAGCACCGAGCTGGAGACTGGCAGTGT 1353
Query 1063 -------------------------------------------------------------------------- 1062
Sbjct 1354 CCCAATCCGGGTTGTGGAAACCAGAACTTCGCCTGGAGAACAGAGTGCAACCAGTGTGGTGATCGTGGCAGAGG 1427
Query 1063 -------------------------------------------------------------------------- 1062
Sbjct 1428 TGGCCCTGGTGGCATGCGGGGAGGAAGAGGTGGCCTCATGGATCGTGGTGGTCCCGGTGGAATGTTCAGAGGTG 1501
Query 1063 -------------------------------------------------------------------------- 1062
Sbjct 1502 GCCGTGGTGGAGACAGAGGTGGCTTCCGTGGTGGCCGGGGCATGGACCGAGGTGGCTTTGGTGGAGGAAGACGA 1575
Query 1063 -------------------------------------------------------------------------- 1062
Sbjct 1576 GGTGGCCCTGGGGGGCCCCCTGGACCTTTGATGGAACAGATGGGAGGAAGAAGAGGAGGACGTGGAGGACCTGG 1649
Query 1063 ------------------------------------------------- 1062
Sbjct 1650 AAAAATGGATAAAGGCGAGCACCGTCAGGAGCGCAGAGATCGGCCCTAC 1698
