Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_06219
- Subject:
- NM_002025.4
- Aligned Length:
- 3933
- Identities:
- 3901
- Gaps:
- 30
Alignment
Query 1 ATGGATCTATTCGACTTTTTCAGAGACTGGGACTTGGAGCAGCAGTGTCACTATGAACAAGACCGTAGTGCACT 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGATCTATTCGACTTTTTCAGAGACTGGGACTTGGAGCAGCAGTGTCACTATGAACAAGACCGTAGTGCACT 74
Query 75 TAAAAAAAGGGAATGGGAGCGGAGGAATCAAGAAGTCCAGCAAGAAGACGATCTCTTTTCTTCAGGCTTTGATC 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 TAAAAAAAGGGAATGGGAGCGGAGGAATCAAGAAGTCCAGCAAGAAGACGATCTCTTTTCTTCAGGCTTTGATC 148
Query 149 TTTTTGGGGAGCCATACAAG------------ACAAACAAAGGTGATGCACTTGCCAACCGAGTCCAGAACAAG 210
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 149 TTTTTGGGGAGCCATACAAGGTAGCTGAATATACAAACAAAGGTGATGCACTTGCCAACCGAGTCCAGAACACG 222
Query 211 CTTGGAAACTATGATGAAATGAAGAATTTGCTAACTAACCATTCTAATCAGAATCACCTAGTGGGAATTCCAAA 284
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CTTGGAAACTATGATGAAATGAAGAATTTGCTAACTAACCATTCTAATCAGAATCACCTAGTGGGAATTCCAAA 296
Query 285 GAATTCTGTGCCCCAGAATCCCAACAACAAAAATGAACCAAGCTTTTTTCCAGAACAAAAGAACAGAATAATTC 358
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GAATTCTGTGCCCCAGAATCCCAACAACAAAAATGAACCAAGCTTTTTTCCAGAACAAAAGAACAGAATAATTC 370
Query 359 CACCTCACCAGGATAATACCCATCCTTCAGCACCAATGCCTCCACCTTCTGTTGTGATACTGAATTCAACTCTA 432
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CACCTCACCAGGATAATACCCATCCTTCAGCACCAATGCCTCCACCTTCTGTTGTGATACTGAATTCAACTCTA 444
Query 433 ATACACAGCAACAGAAAATCAAAACCTGAGTGGTCACGTGATAGTCATAACCCTAGCACTGTACTGGCAAGCCA 506
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 ATACACAGCAACAGAAAATCAAAACCTGAGTGGTCACGTGATAGTCATAACCCTAGCACTGTACTGGCAAGCCA 518
Query 507 GGCCAGTGGTCAGCCAAACAAGATGCAGACTTTGACACAGGACCAGTCTCAAGCCAAACTGGAAGACTTCTTTG 580
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GGCCAGTGGTCAGCCAAACAAGATGCAGACTTTGACACAGGACCAGTCTCAAGCCAAACTGGAAGACTTCTTTG 592
Query 581 TCTACCCAGCTGAACAGCCCCAGATTGGAGAAGTTGAAGAGTCAAACCCATCTGCAAAGGAAGACAGTAACCCT 654
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TCTACCCAGCTGAACAGCCCCAGATTGGAGAAGTTGAAGAGTCAAACCCATCTGCAAAGGAAGACAGTAACCCT 666
Query 655 AATTCTAGTGGAGAAGATGCTTTCAAAGAAATCTTTCAATCCAATTCACCGGAAGAATCTGAATTCGCCGTGCA 728
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 AATTCTAGTGGAGAAGATGCTTTCAAAGAAATCTTTCAATCCAATTCACCGGAAGAATCTGAATTCGCCGTGCA 740
Query 729 AGCGCCTGGGTCTCCCCTAGTGGCTTCCTCTTTATTAGCTCCTAGCAGTGGCCTTTCAGTTCAAAACTTCCCAC 802
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 AGCGCCTGGGTCTCCCCTAGTGGCTTCCTCTTTATTAGCTCCTAGCAGTGGCCTTTCAGTTCAAAACTTCCCAC 814
Query 803 CAGGGCTTTACTGCAAAACAAGCATGGGGCAGCAAAAGCCAACTGCATACGTCAGACCCATGGATGGCCAGGAC 876
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 CAGGGCTTTACTGCAAAACAAGCATGGGGCAGCAAAAGCCAACTGCATACGTCAGACCCATGGATGGCCAGGAC 888
Query 877 CAGGCACCGGACATCTCACCAACACTGAAACCTTCAATTGAATTTGAGAACAGCTTTGGGAATCTGTCATTTGG 950
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 CAGGCACCGGACATCTCACCAACACTGAAACCTTCAATTGAATTTGAGAACAGCTTTGGGAATCTGTCATTTGG 962
Query 951 AACACTCTTGGATGGAAAACCCAGTGCAGCCAGTTCAAAGACTAAACTGCCAAAGTTCACCATCCTCCAAACAA 1024
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 AACACTCTTGGATGGAAAACCCAGTGCAGCCAGTTCAAAGACTAAACTGCCAAAGTTCACCATCCTCCAAACAA 1036
Query 1025 GTGAAGTAAGCCTTCCCAGTGATCCAAGCTGTGTTGAAGAAATCTTGCGGGAGATGACCCATTCCTGGCCTACT 1098
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 GTGAAGTAAGCCTTCCCAGTGATCCAAGCTGTGTTGAAGAAATCTTGCGGGAGATGACCCATTCCTGGCCTACT 1110
Query 1099 CCTCTCACTTCCATGCATACTGCTGGACACTCTGAGCAGAGCACCTTTTCCATCCCAGGACAGGAATCGCAGCA 1172
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 CCTCTCACTTCCATGCATACTGCTGGACACTCTGAGCAGAGCACCTTTTCCATCCCAGGACAGGAATCGCAGCA 1184
Query 1173 TCTGACCCCAGGATTCACCTTACAAAAGTGGAATGACCCAACCACCAGAGCTTCTACAAA-------------- 1232
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 TCTGACCCCAGGATTCACCTTACAAAAGTGGAATGACCCAACCACCAGAGCTTCTACAAAGTCAGTGTCTTTCA 1258
Query 1233 ----GATGCTTGAGGATGACCTGAAGCTGAGCAGTGATGAAGATGACCTTGAGCCTGTGAAGACCTTGACCACT 1302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 AATCGATGCTTGAGGATGACCTGAAGCTGAGCAGTGATGAAGATGACCTTGAGCCTGTGAAGACCTTGACCACT 1332
Query 1303 CAGTGCACTGCCACTGAGCTCTACCAGGCTGTTGAAAAGGCAAAACCTAGGAATAATCCTGTGAACCCACCCTT 1376
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 CAGTGCACTGCCACTGAGCTCTACCAGGCTGTTGAAAAGGCAAAACCTAGGAATAATCCTGTGAACCCACCCTT 1406
Query 1377 GGCCACTCCCCAGCCCCCACCTGCAGTGCAAGCCAGCGGGGGTTCTGGCAGCTCCAGCGAATCGGAGAGCAGCT 1450
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 GGCCACTCCCCAGCCCCCACCTGCAGTGCAAGCCAGCGGGGGTTCTGGCAGCTCCAGCGAATCGGAGAGCAGCT 1480
Query 1451 CTGAGTCGGATTCAGACACTGAAAGTAGCACCACTGACAGCGAATCTAATGAGGCACCTCGTGTGGCAACTCCA 1524
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 CTGAGTCGGATTCAGACACTGAAAGTAGCACCACTGACAGCGAATCTAATGAGGCACCTCGTGTGGCAACTCCA 1554
Query 1525 GAGCCTGAGCCACCCTCAACCAACAAGTGGCAACTGGATAAATGGCTTAACAAAGTGACATCCCAGAACAAGTC 1598
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 GAGCCTGAGCCACCCTCAACCAACAAGTGGCAACTGGATAAATGGCTTAACAAAGTGACATCCCAGAACAAGTC 1628
Query 1599 TTTTATTTGTGGCCAAAATGAAACACCCATGGAGACTATTTCTCTGCCTCCTCCAATCATCCAACCAATGGAAG 1672
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 TTTTATTTGTGGCCAAAATGAAACACCCATGGAGACTATTTCTCTGCCTCCTCCAATCATCCAACCAATGGAAG 1702
Query 1673 TCCAGATGAAAGTGAAGACGAATGCCAGTCAGGTCCCAGCTGAACCCAAAGAAAGGCCTCTCCTCAGTCTCATT 1746
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 TCCAGATGAAAGTGAAGACGAATGCCAGTCAGGTCCCAGCTGAACCCAAAGAAAGGCCTCTCCTCAGTCTCATT 1776
Query 1747 AGGGAGAAAGCCCGTCCACGGCCCACTCAGAAAATTCCAGAAACAAAGGCTTTGAAGCATAAGTTGTCAACAAC 1820
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 AGGGAGAAAGCCCGTCCACGGCCCACTCAGAAAATTCCAGAAACAAAGGCTTTGAAGCATAAGTTGTCAACAAC 1850
Query 1821 TAGTGAGACAGTGTCTCAAAGGACAATTGGGAAAAAACAGCCCAAAAAAGTTGAGAAGAACACCAGCACTGACG 1894
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 TAGTGAGACAGTGTCTCAAAGGACAATTGGGAAAAAACAGCCCAAAAAAGTTGAGAAGAACACCAGCACTGACG 1924
Query 1895 AGTTTACCTGGCCCAAACCAAATATTACCAGCAGCACTCCCAAAGAAAAAGAAAGTGTGGAGCTTCATGACCCA 1968
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 AGTTTACCTGGCCCAAACCAAATATTACCAGCAGCACTCCCAAAGAAAAAGAAAGTGTGGAGCTTCATGACCCA 1998
Query 1969 CCAAGAGGCCGCAACAAAGCCACTGCCCACAAACCAGCCCCTAGGAAAGAACCAAGACCTAACATCCCTTTGGC 2042
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 CCAAGAGGCCGCAACAAAGCCACTGCCCACAAACCAGCCCCTAGGAAAGAACCAAGACCTAACATCCCTTTGGC 2072
Query 2043 TCCCGAGAAGAAGAAGTACAGAGGGCCTGGCAAGATTGTGCCAAAGTCTCGGGAATTCATTGAAACAGATTCAT 2116
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 TCCCGAGAAGAAGAAGTACAGAGGGCCTGGCAAGATTGTGCCAAAGTCTCGGGAATTCATTGAAACAGATTCAT 2146
Query 2117 CTACATCTGACTCCAACACAGATCAGGAAGAGACCCTGCAAATCAAAGTCCTGCCTCCGTGCATTATTTCTGGA 2190
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 CTACATCTGACTCCAACACAGATCAGGAAGAGACCCTGCAAATCAAAGTCCTGCCTCCGTGCATTATTTCTGGA 2220
Query 2191 GGTAATACTGCCAAATCCAAGGAAATCTGTGGTGCCAGCCTGACCCTCAGCACCTTAATGAGTAGCAGTGGCAG 2264
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 GGTAATACTGCCAAATCCAAGGAAATCTGTGGTGCCAGCCTGACCCTCAGCACCTTAATGAGTAGCAGTGGCAG 2294
Query 2265 CAACAACAACTTATCCATCAGTAATGAAGAGCCAACATTTTCACCTATTCCTGTCATGCAAACTGAAATCCTGT 2338
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 CAACAACAACTTATCCATCAGTAATGAAGAGCCAACATTTTCACCTATTCCTGTCATGCAAACTGAAATCCTGT 2368
Query 2339 CCCCTCTGCGAGATCATGAGAACCTGAAAAACCTCTGGGTGAAGATTGACCTTGACTTACTCTCTAGAGTACCT 2412
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369 CCCCTCTGCGAGATCATGAGAACCTGAAAAACCTCTGGGTGAAGATTGACCTTGACTTACTCTCTAGAGTACCT 2442
Query 2413 GGCCACAGCTCACTCCATGCAGCACCTGCCAAGCCAGACCACAAGGAGACTGCCACAAAACCCAAGCGTCAGAC 2486
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443 GGCCACAGCTCACTCCATGCAGCACCTGCCAAGCCAGACCACAAGGAGACTGCCACAAAACCCAAGCGTCAGAC 2516
Query 2487 AGCTGTCACAGCTGTGGAGAAACCAGCCCCTAAGGGCAAACGTAAGCACAAGCCAATAGAAGTTGCAGAGAAGA 2560
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517 AGCTGTCACAGCTGTGGAGAAACCAGCCCCTAAGGGCAAACGTAAGCACAAGCCAATAGAAGTTGCAGAGAAGA 2590
Query 2561 TCCCTGAGAAGAAGCAGCGCCTGGAGGAGGCCACAACTATCTGCTTGCTCCCTCCTTGCATCTCACCAGCCCCA 2634
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591 TCCCTGAGAAGAAGCAGCGCCTGGAGGAGGCCACAACTATCTGCTTGCTCCCTCCTTGCATCTCACCAGCCCCA 2664
Query 2635 CCCCACAAGCCTCCCAACACTAGAGAAAATAATTCATCCAGGAGAGCAAATAGAAGAAAGGAAGAAAAACTATT 2708
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665 CCCCACAAGCCTCCCAACACTAGAGAAAATAATTCATCCAGGAGAGCAAATAGAAGAAAGGAAGAAAAACTATT 2738
Query 2709 TCCTCCTCCACTTTCCCCACTGCCAGAGGACCCTCCACGCCGCAGAAATGTCAGTGGCAATAATGGTCCCTTTG 2782
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739 TCCTCCTCCACTTTCCCCACTGCCAGAGGACCCTCCACGCCGCAGAAATGTCAGTGGCAATAATGGTCCCTTTG 2812
Query 2783 GTCAAGACAAAAACATCGCCATGACTGGACAAATCACATCTACCAAACCTAAGAGAACTGAAGGCAAATTCTGT 2856
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813 GTCAAGACAAAAACATCGCCATGACTGGACAAATCACATCTACCAAACCTAAGAGAACTGAAGGCAAATTCTGT 2886
Query 2857 GCTACTTTCAAAGGGATATCGGTAAATGAGGGAGACACTCCAAAAAAGGCATCCTCTGCCACCATCACTGTCAC 2930
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887 GCTACTTTCAAAGGGATATCGGTAAATGAGGGAGACACTCCAAAAAAGGCATCCTCTGCCACCATCACTGTCAC 2960
Query 2931 CAATACTGCTATTGCCACTGCTACTGTCACTGCTACTGCCATTGTCACCACCACTGTCACAGCTACTGCCACCG 3004
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961 CAATACTGCTATTGCCACTGCTACTGTCACTGCTACTGCCATTGTCACCACCACTGTCACAGCTACTGCCACCG 3034
Query 3005 CCACGGCCACCACCACAACTACTACCACTACCATTTCCACCATCACCTCTACCATCACTACTGGCCTCATGGAT 3078
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3035 CCACGGCCACCACCACAACTACTACCACTACCATTTCCACCATCACCTCTACCATCACTACTGGCCTCATGGAT 3108
Query 3079 AGCAGTCACCTGGAGATGATGTCCTGGGCGGCTCTGCCCCTTCTATCCAGCAGCAGCACTAATGTCCGGAGACC 3152
|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3109 AGCAGTCACCTGGAGATGACGTCCTGGGCGGCTCTGCCCCTTCTATCCAGCAGCAGCACTAATGTCCGGAGACC 3182
Query 3153 CAAGCTCACTTTTGATGACTCGGTTCACAATGCTGATTATTACATGCAAGAAGCTAAGAAGCTGAAGCACAAAG 3226
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3183 CAAGCTCACTTTTGATGACTCGGTTCACAATGCTGATTATTACATGCAAGAAGCTAAGAAGCTGAAGCACAAAG 3256
Query 3227 CTGATGCACTGTTCGAGAAATTTGGCAAAGCTGTGAATTATGCTGATGCCGCCCTCTCCTTCACTGAATGTGGC 3300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3257 CTGATGCACTGTTCGAGAAATTTGGCAAAGCTGTGAATTATGCTGATGCCGCCCTCTCCTTCACTGAATGTGGC 3330
Query 3301 AATGCCATGGAACGCGACCCTCTGGAAGCAAAGTCCCCATACACCATGTACTCTGAGACTGTGGAGCTCCTCAG 3374
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3331 AATGCCATGGAACGCGACCCTCTGGAAGCAAAGTCCCCATACACCATGTACTCTGAGACTGTGGAGCTCCTCAG 3404
Query 3375 GTATGCAATGAGGCTGAAGAACTTTGCAAGTCCCTTGGCTTCGGATGGGGACAAAAAGCTAGCAGTACTATGCT 3448
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3405 GTATGCAATGAGGCTGAAGAACTTTGCAAGTCCCTTGGCTTCGGATGGGGACAAAAAGCTAGCAGTACTATGCT 3478
Query 3449 ACCGATGTTTATCACTCCTCTATTTGAGAATGTTTAAGCTGAAGAAGGACCATGCTATGAAGTACTCCAGATCA 3522
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3479 ACCGATGTTTATCACTCCTCTATTTGAGAATGTTTAAGCTGAAGAAGGACCATGCTATGAAGTACTCCAGATCA 3552
Query 3523 CTGATGGAATATTTTAAGCAAAATGCTTCAAAAGTCGCACAGATACCCTCTCCATGGGTAAGCAATGGAAAGAA 3596
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3553 CTGATGGAATATTTTAAGCAAAATGCTTCAAAAGTCGCACAGATACCCTCTCCATGGGTAAGCAATGGAAAGAA 3626
Query 3597 CACTCCATCCCCAGTGTCTCTCAACAACGTCTCCCCCATCAACGCAATGGGGAACTGTAACAATGGCCCAGTCA 3670
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3627 CACTCCATCCCCAGTGTCTCTCAACAACGTCTCCCCCATCAACGCAATGGGGAACTGTAACAATGGCCCAGTCA 3700
Query 3671 CCATTCCCCAGCGCATTCACCACATGGCTGCCAGCCACGTCAACATCACTAGCAATGTGTTACGGGGCTATGAA 3744
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3701 CCATTCCCCAGCGCATTCACCACATGGCTGCCAGCCACGTCAACATCACTAGCAATGTGTTACGGGGCTATGAA 3774
Query 3745 CACTGGGATATGGCCGACAAACTGACAAGAGAAAACAAAGAATTCTTTGGTGATCTGGACACGCTGATGGGGCC 3818
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3775 CACTGGGATATGGCCGACAAACTGACAAGAGAAAACAAAGAATTCTTTGGTGATCTGGACACGCTGATGGGGCC 3848
Query 3819 TCTGACCCAGCACAGCAGCATGACCAATCTTGTCCGCTACGTTCGCCAAGGACTGTGTTGGCTGCGCATCGATG 3892
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3849 TCTGACCCAGCACAGCAGCATGACCAATCTTGTCCGCTACGTTCGCCAAGGACTGTGTTGGCTGCGCATCGATG 3922
Query 3893 CCCACTTGTTG 3903
|||||||||||
Sbjct 3923 CCCACTTGTTG 3933