Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_06224
- Subject:
- NM_013523.3
- Aligned Length:
- 2088
- Identities:
- 1802
- Gaps:
- 15
Alignment
Query 1 ATGGCCCTGCTCCTGGTCTCTTTGCTGGCATTCCTGAGCTTGGGCTCAGGATGTCATCATCGGATCTGTCACTG 74
||||||.|||||||||||||.||||||||||||.||.|||.|||.||.|||||||||||..||.|.|||||.||
Sbjct 1 ATGGCCTTGCTCCTGGTCTCCTTGCTGGCATTCTTGGGCTCGGGATCTGGATGTCATCACTGGCTGTGTCATTG 74
Query 75 CTCTAACAGGGTTTTTCTCTGCCAAGAGAGCAAGGTGACAGAGATTCCTTCTGACCTCCCGAGGAATGCCATTG 148
||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||..|.||||||||..||||.|||||||
Sbjct 75 CTCTAACAGGGTCTTCCTCTGCCAAGATAGCAAGGTGACCGAGATTCCGCCCGACCTCCCCCGGAACGCCATTG 148
Query 149 AACTGAGGTTTGTCCTCACCAAGCTTCGAGTCATCCAAAAAGGTGCATTTTCAGGATTTGGGGACCTGGAGAAA 222
|||||||.|||||.||||||||||||||||||||.|.||||||..|||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 149 AACTGAGATTTGTGCTCACCAAGCTTCGAGTCATTCCAAAAGGATCATTTTCTGGATTTGGGGACCTGGAGAAA 222
Query 223 ATAGAGATCTCTCAGAATGATGTCTTGGAGGTGATAGAGGCAGATGTGTTCTCCAACCTTCCCAAATTACATGA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||
Sbjct 223 ATAGAGATCTCTCAGAATGATGTCTTGGAGGTAATAGAGGCAGATGTGTTCTCCAACCTACCCAACTTGCATGA 296
Query 297 AATTAGAATTGAAAAGGCCAACAACCTGCTCTACATCAACCCTGAGGCCTTCCAGAACCTTCCCAACCTTCAAT 370
||||||.|||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||..||.|.||
Sbjct 297 AATTAGGATTGAAAAGGCTAACAATCTGCTGTACATCAACCCTGAGGCCTTCCAGAATCTTCCCAGTCTCCGAT 370
Query 371 ATCTGTTAATATCCAACACAGGTATTAAGCACCTTCCAGATGTTCACAAGATTCATTCTCTCCAAAAAGTTTTA 444
||||||||||||||||||||||.|||||.|||.|.||||...||||||||||.||.|||||||||||.||||||
Sbjct 371 ATCTGTTAATATCCAACACAGGCATTAAACACTTGCCAGCCTTTCACAAGATCCAGTCTCTCCAAAAGGTTTTA 444
Query 445 CTTGACATTCAAGATAACATAAACATCCACACAATTGAAAGAAATTCTTTCGTGGGGCTGAGCTTTGAAAGTGT 518
.|.||||||||||||||||||||||||||||..||||..||.||.||.|||.||||.|||||||||||||||||
Sbjct 445 TTAGACATTCAAGATAACATAAACATCCACATCATTGCCAGGAACTCCTTCATGGGACTGAGCTTTGAAAGTGT 518
Query 519 GATTCTATGGCTGAATAAGAATGGGATTCAAGAAATACACAACTGTGCATTCAATGGAACCCAACTAGATGAGC 592
.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|
Sbjct 519 AATTCTATGGCTGAATAAGAATGGGATTCAAGAAATACACAACTGTGCATTCAACGGAACCCAGCTAGATGAAC 592
Query 593 TGAATCTAAGCGATAATAATAATTTAGAAGAATTGCCTAATGATGTTTTCCACGGAGCCTCTGGACCAGTCATT 666
||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||.|||||||||||||.|||||||||||.||||||.||
Sbjct 593 TGAATCTAAGCGATAACAATAATTTGGAAGAATTGCCTGATGATGTTTTCCAGGGAGCCTCTGGGCCAGTCGTT 666
Query 667 CTAGATATTTCAAGAACAAGGATCCATTCCCTGCCTAGCTATGGCTTAGAAAATCTTAAGAAGCTGAGGGCCAG 740
.||||.||.|||||.||||.|.||.||||||||||.|.|.||||||||||||||||.||||||.||||||||||
Sbjct 667 TTAGACATCTCAAGGACAAAGGTCTATTCCCTGCCCAACCATGGCTTAGAAAATCTGAAGAAGTTGAGGGCCAG 740
Query 741 GTCGACTTACAACTTAAAAAAGCTGCCTACTCTGGAAAAGCTTGTCGCCCTCATGGAAGCCAGCCTCACCTATC 814
|||.||.|||..|||.||||||||.||||.|||.||.|||.|||||...|||||.||.||||||||.|||||.|
Sbjct 741 GTCAACATACCGCTTGAAAAAGCTCCCTAGTCTAGACAAGTTTGTCATGCTCATTGAGGCCAGCCTTACCTACC 814
Query 815 CCAGCCATTGCTGTGCCTTTGCAAACTGGAGACGGCAAATCTCTGAGCTTCATCCAATTTGCAACAAATCTATT 888
||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||.||||||.||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 815 CCAGTCACTGCTGTGCCTTTGCAAACTGGAGGCGGCAAACCTCTGAACTTCATCCAATTTGCAACAAGTCTATT 888
Query 889 TTAAGGCAAGAAGTTGATTATATGACTCAGACTAGGGGTCAGAGATCCTCTCTGGCAGAAGACAATGAGTCCAG 962
|.|||||||||..|||||.|||||||||||.||.|||.|||||||..||||||.|.|||.| ||||..||||
Sbjct 889 TCAAGGCAAGATATTGATGATATGACTCAGCCTGGGGATCAGAGAGTCTCTCTCGTAGATG---ATGAACCCAG 959
Query 963 CTACAGCAGAGGATTTGACATGACGTACACTGAGTTTGACTATGACTTATGCAATGAAGTGGTTGACGTGACCT 1036
.||..|.|.|||||.|||||||..|||.|.|||.||||||||||||||||||||||||.|.|||||.|||||||
Sbjct 960 TTATGGAAAAGGATCTGACATGTTGTATAGTGAATTTGACTATGACTTATGCAATGAATTTGTTGATGTGACCT 1033
Query 1037 GCTCCCCTAAGCCAGATGCATTCAACCCATGTGAAGATATCATGGGGTACAACATCCTCAGAGTCCTGATATGG 1110
||||.||.||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1034 GCTCGCCAAAGCCAGATGCATTTAATCCATGTGAAGACATCATGGGGTACAACATCCTCAGAGTCTTGATATGG 1107
Query 1111 TTTATCAGCATCCTGGCCATCACTGGGAACATCATAGTGCTAGTGATCCTAACTACCAGCCAATATAAACTCAC 1184
|||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||.|||.||||.||.||.||||||||.||||||||
Sbjct 1108 TTTATCAGCATCCTGGCCATCACTGGGAACACCACAGTGCTGGTGGTCCTGACCACAAGCCAATACAAACTCAC 1181
Query 1185 AGTCCCCAGGTTCCTTATGTGCAACCTGGCCTTTGCTGATCTCTGCATTGGAATCTACCTGCTGCTCATTGCAT 1258
.||.|||.|||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.||||||.||||.||.||.||.|
Sbjct 1182 TGTGCCCCGGTTCCTTATGTGTAACCTCGCCTTTGCTGATCTTTGCATTGGGATCTACTTGCTACTTATAGCCT 1255
Query 1259 CAGTTGATATCCATACCAAGAGCCAATATCACAACTATGCCATTGACTGGCAAACTGGGGCAGGCTGTGATGCT 1332
||||||||||||||||.||||||||.||.|||||.||.|||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.
Sbjct 1256 CAGTTGATATCCATACTAAGAGCCAGTACCACAATTACGCCATTGACTGGCAAACAGGAGCAGGCTGCGATGCC 1329
Query 1333 GCTGGCTTTTTCACTGTCTTTGCCAGTGAGCTGTCAGTCTACACTCTGACAGCTATCACCTTGGAAAGATGGCA 1406
|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||..||.||||.||.|||.|.|||||||||||
Sbjct 1330 GCTGGCTTTTTCACTGTCTTTGCCAGTGAACTGTCAGTCTACACATTGGCAGCCATAACCCTAGAAAGATGGCA 1403
Query 1407 TACCATCACGCATGCCATGCAGCTGGACTGCAAGGTGCAGCTCCGCCATGCTGCCAGTGTCATGGTGATGGGCT 1480
|||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||.||||||.|||||||||||||..||||||||.||||||
Sbjct 1404 TACCATCACACATGCCATGCAACTGGAATGCAAGGTACAGCTCTGCCATGCTGCCAGCATCATGGTGCTGGGCT 1477
Query 1481 GGATTTTTGCTTTTGCAGCTGCCCTCTTTCCCATCTTTGGCATCAGCAGCTACATGAAGGTGAGCATCTGCCTG 1554
||...|||||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1478 GGGCCTTTGCCTTTGCGGCTGCTCTCTTCCCCATCTTTGGCATCAGTAGCTACATGAAAGTGAGCATCTGCCTG 1551
Query 1555 CCCATGGATATTGACAGCCCTTTGTCACAGCTGTATGTCATGTCCCTCCTTGTGCTCAATGTCCTGGCCTTTGT 1628
|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||.|||||||.||.|||||.|.||||||||||||
Sbjct 1552 CCCATGGATATCGACAGCCCTTTGTCGCAGCTGTATGTTATGGCCCTCCTCGTACTCAACGCCCTGGCCTTTGT 1625
Query 1629 GGTCATCTGTGGCTGCTATATCCACATCTACCTCACAGTGCGGAACCCCAACATCGTGTCCTCCTCTAGTGACA 1702
||||||||||||.|||||.|.|||||||||||||||||||.||||.||.|||||.||||||||.||.||.||||
Sbjct 1626 GGTCATCTGTGGTTGCTACACCCACATCTACCTCACAGTGAGGAATCCTAACATTGTGTCCTCGTCAAGAGACA 1699
Query 1703 CCAGGATCGCCAAGCGCATGGCCATGCTCATCTTCACTGACTTCCTCTGCATGGCACCCATTTCTTTCTTTGCC 1776
|||.|||.||||||||||||||||..|||||||||||.|||||.|||||||||||.||.||||..|||||||||
Sbjct 1700 CCAAGATTGCCAAGCGCATGGCCACACTCATCTTCACGGACTTTCTCTGCATGGCCCCAATTTTATTCTTTGCC 1773
Query 1777 ATTTCTGCCTCCCTCAAGGTGCCCCTCATCACTGTGTCCAAAGCAAAGATTCTGCTGGTTCTGTTTCACCCCAT 1850
|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.||.||||||||..|||||||
Sbjct 1774 ATTTCCGCCTCCCTCAAGGTGCCCCTCATCACTGTGTCCAAGGCCAAGATCCTCCTAGTTCTGTTCTACCCCAT 1847
Query 1851 CAACTCCTGTGCCAACCCCTTCCTCTATGCCATCTTTACCAAAAACTTTCGCAGAGATTTCTTCATTCTGCTGA 1924
|||.||.||||||||.||.||||||||||||||.||.|||||.|||||.|||||.||.||||||.|.|||.|||
Sbjct 1848 CAATTCTTGTGCCAATCCTTTCCTCTATGCCATTTTCACCAAGAACTTCCGCAGGGACTTCTTCGTCCTGATGA 1921
Query 1925 GCAAGTGTGGCTGCTATGAAATGCAAGCCCAAATTTATAGGACAGAAACTTCATCCACTGTCCACAACACCCA- 1997
||||||.||||||.|||||..||||||||||.|||||.|.|||||||||.|||||.|.|..|||||||..|||
Sbjct 1922 GCAAGTTTGGCTGTTATGAGGTGCAAGCCCAGATTTACAAGACAGAAACCTCATCTATTACCCACAACTTCCAC 1995
Query 1998 TCC--AAGGAATGGCCACTGCTCTTCAGCTCCCAGAGTCACCAATGGTTCCACTTACATACTTGTCCCTCTAAG 2069
||| ||.|||| |.|||.||.||.|||||||||||||||||| |.||||.|.|||||||||||||.
Sbjct 1996 TCCAGAAAGAAT---CCCTGTTCCTCGGCTCCCAGAGTCACCAAT------AGTTACGTGCTTGTCCCTCTAAA 2060
Query 2070 TCATTTAGCCCAAAAC 2085
|||||.||.|||.|||
Sbjct 2061 TCATTCAGTCCAGAAC 2076