Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_06233
- Subject:
- NM_018594.2
- Aligned Length:
- 2517
- Identities:
- 2348
- Gaps:
- 168
Alignment
Query 1 ------------------------------ATGGCGAAATATAACACGGGGGGCAACCCGACAGAGGATGTCTC 44
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGATGGAAAGGCAGATGTAAAGTCCCTCATGGCGAAATATAACACGGGGGGCAACCCGACAGAGGATGTCTC 74
Query 45 AGTCAATAGCCGACCCTTCAGAGTCACAGGGCCAAACTCATCTTCAGGAATACAAGCAAGAAAGAACTTATTCA 118
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 AGTCAATAGCCGACCCTTCAGAGTCACAGGGCCAAACTCATCTTCAGGAATACAAGCAAGAAAGAACTTATTCA 148
Query 119 ACAACCAAGGAAATGCCAGCCCTCCTGCAGGACCCAGCAATGTACCTAAGTTTGGGTCCCCAAAGCCACCTGTG 192
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 ACAACCAAGGAAATGCCAGCCCTCCTGCAGGACCCAGCAATGTACCTAAGTTTGGGTCCCCAAAGCCACCTGTG 222
Query 193 GCAGTCAAACCTTCTTCTGAGGAAAAGCCTGACAAGGAACCCAAGCCCCCGTTTCTAAAGCCCACTGGAGCAGG 266
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GCAGTCAAACCTTCTTCTGAGGAAAAGCCTGACAAGGAACCCAAGCCCCCGTTTCTAAAGCCCACTGGAGCAGG 296
Query 267 CCAAAGATTCGGAACACCAGCCAGCTTGACCACCAGAGACCCCGAGGCGAAAGTGGGATTTCTGAAACCTGTAG 340
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CCAAAGATTCGGAACACCAGCCAGCTTGACCACCAGAGACCCCGAGGCGAAAGTGGGATTTCTGAAACCTGTAG 370
Query 341 GCCCCAAGCCCATCAACTTGCCCAAAGAAGATTCCAAACCTACATTTCCCTGGCCTCCTGGAAACAAGCCATCT 414
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 GCCCCAAGCCCATCAACTTGCCCAAAGAAGATTCCAAACCTACATTTCCCTGGCCTCCTGGAAACAAGCCATCT 444
Query 415 CTTCACAGTGTAAACCAAGACCATGACTTAAAGCCACTAGGCCCGAAATCTGGGCCTACTCCTCCAACCTCAGA 488
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CTTCACAGTGTAAACCAAGACCATGACTTAAAGCCACTAGGCCCGAAATCTGGGCCTACTCCTCCAACCTCAGA 518
Query 489 AAATGAACAGAAGCAAGCGTTTCCCAAATTGACTGGGGTTAAAGGGAAATTTATGTCAGCATCACAAGATCTTG 562
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 AAATGAACAGAAGCAAGCGTTTCCCAAATTGACTGGGGTTAAAGGGAAATTTATGTCAGCATCACAAGATCTTG 592
Query 563 AACCCAAGCCCCTCTTCCCCAAACCCGCCTTTGGCCAGAAGCCGCCCCTAAGTACCGAGAACTCCCATGAAGAC 636
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 AACCCAAGCCCCTCTTCCCCAAACCCGCCTTTGGCCAGAAGCCGCCCCTAAGTACCGAGAACTCCCATGAAGAC 666
Query 637 GAAAGCCCCATGAAGAATGTGTCTTCATCAAAAGGGTCCCCAGCTCCCCTGGGAGTCAGGTCCAAAAGCGGCCC 710
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GAAAGCCCCATGAAGAATGTGTCTTCATCAAAAGGGTCCCCAGCTCCCCTGGGAGTCAGGTCCAAAAGCGGCCC 740
Query 711 TTTAAAACCAGCAAGGGAAGACTCAGAAAATAAAGACCATGCAGGGGAGATTTCAAGTTTGCCCTTTCCTGGAG 784
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TTTAAAACCAGCAAGGGAAGACTCAGAAAATAAAGACCATGCAGGGGAGATTTCAAGTTTGCCCTTTCCTGGAG 814
Query 785 TGGTTTTGAAACCTGCTGCGAGCAGGGGAGGCCCAGGTCTCTCCAAAAATGGTGAAGAAAAAAAGGAAGATAGG 858
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TGGTTTTGAAACCTGCTGCGAGCAGGGGAGGCCCAGGTCTCTCCAAAAATGGTGAAGAAAAAAAGGAAGATAGG 888
Query 859 AAGATAGATGCTGCTAAGAACACCTTCCAGAGCAAAATAAATCAGGAAGAGTTGGCCTCAGGGACTCCTCCTGC 932
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 AAGATAGATGCTGCTAAGAACACCTTCCAGAGCAAAATAAATCAGGAAGAGTTGGCCTCAGGGACTCCTCCTGC 962
Query 933 CAGGTTCCCTAAGGCCCCTTCTAAGCTGACAGTGGGGGGGCCATGGGGCCAAAGTCAGGAAAAGGAAAAGGGAG 1006
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CAGGTTCCCTAAGGCCCCTTCTAAGCTGACAGTGGGGGGGCCATGGGGCCAAAGTCAGGAAAAGGAAAAGGGAG 1036
Query 1007 ACAAGAATTCAGCCACCCCGAAACAGAAGCCATTGCCTCCCTTGTTTACCTTGGGTCCACCTCCACCAAAACCC 1080
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 ACAAGAATTCAGCCACCCCGAAACAGAAGCCATTGCCTCCCTTGTTTACCTTGGGTCCACCTCCACCAAAACCC 1110
Query 1081 AACAGACCACCAAATGTTGACCTGACGAAATTCCACAAAACCTCTTCTGGAAACAGTACTAGCAAAGGCCAGAC 1154
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 AACAGACCACCAAATGTTGACCTGACGAAATTCCACAAAACCTCTTCTGGAAACAGTACTAGCAAAGGCCAGAC 1184
Query 1155 GTCTTACTCAACAACTTCCCTGCCACCACCTCCACCATCCCATCCGGCCAGCCAACCACCATTGCCAGCATCTC 1228
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 GTCTTACTCAACAACTTCCCTGCCACCACCTCCACCATCCCATCCGGCCAGCCAACCACCATTGCCAGCATCTC 1258
Query 1229 ACCCATCACAACCACCAGTCCCAAGCCTACCTCCCAGAAACATTAAACCTCCGTTTGACCTAAAAAGCCCTGTC 1302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 ACCCATCACAACCACCAGTCCCAAGCCTACCTCCCAGAAACATTAAACCTCCGTTTGACCTAAAAAGCCCTGTC 1332
Query 1303 AATGAAGACAATCAAGATGGTGTCACGCACTCTGATGGTGCTGGAAATCTAGATGAGGAACAAGACAGTGAAGG 1376
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 AATGAAGACAATCAAGATGGTGTCACGCACTCTGATGGTGCTGGAAATCTAGATGAGGAACAAGACAGTGAAGG 1406
Query 1377 AGAAACATATGAAGACATAGAAGCATCCAAAGAAAGAGAGAAGAAAAGGGAAAAGGAAGAAAAGAAGAGGTTAG 1450
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 AGAAACATATGAAGACATAGAAGCATCCAAAGAAAGAGAGAAGAAAAGGGAAAAGGAAGAAAAGAAGAGGTTAG 1480
Query 1451 AGCTGGAGAAAAAGGAACAGAAAGAGAAAGAAAAGAAAGAACAAGAAATAAAGAAGAAATTTAAACTAACAGGC 1524
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 AGCTGGAGAAAAAGGAACAGAAAGAGAAAGAAAAGAAAGAACAAGAAATAAAGAAGAAATTTAAACTAACAGGC 1554
Query 1525 CCTATTCAAGTCATCCATCTTGCAAAAGCTTGTTGTGATGTCAAAGGAGGAAAGAATGAACTGAGCTTCAAGCA 1598
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 CCTATTCAAGTCATCCATCTTGCAAAAGCTTGTTGTGATGTCAAAGGAGGAAAGAATGAACTGAGCTTCAAGCA 1628
Query 1599 AGGAGAGCAAATTGAAATCATCCGCATCACAGACAACCCAGAAGGAAAATGGTTGGGCAGAACAGCAAGGGGTT 1672
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 AGGAGAGCAAATTGAAATCATCCGCATCACAGACAACCCAGAAGGAAAATGGTTGGGCAGAACAGCAAGGGGTT 1702
Query 1673 CATATGGCTATATTAAAACAACTGCTGTAGAGATTGACTATGATTCTTTGAAACTGAAAAAAGACTCTCTTGGT 1746
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 CATATGGCTATATTAAAACAACTGCTGTAGAGATTGACTATGATTCTTTGAAACTGAAAAAAGACTCTCTTGGT 1776
Query 1747 GCCCCTTCAAGACCTATTGAAGATGACCAAGAAGTATATGATGATGTTGCAGAGCAGGATGATATTAGCAGCCA 1820
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 GCCCCTTCAAGACCTATTGAAGATGACCAAGAAGTATATGATGATGTTGCAGAGCAGGATGATATTAGCAGCCA 1850
Query 1821 CAGTCAGAGTGGAAGTGGAGGGATATTCCCTCCACCACCAGATGATGACATTTATGATGGGATTGAAGAGGAAG 1894
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 CAGTCAGAGTGGAAGTGGAGGGATATTCCCTCCACCACCAGATGATGACATTTATGATGGGATTGAAGAGGAAG 1924
Query 1895 ATGCTGATGATGGCTCCACACTACAGGTTCAAGAGAAGAGTAATACGTGGTCCTGGGGGATTTTGAAGATGTTA 1968
|||||||||||||
Sbjct 1925 ATGCTGATGATGG------------------------------------------------------------- 1937
Query 1969 AAGGGAAAAGATGACAGAAAGAAAAGTATACGAGAGAAACCTAAAGTCTCTGACTCAGACAATAATGAAGGTTC 2042
Sbjct 1938 -------------------------------------------------------------------------- 1937
Query 2043 ATCTTTCCCTGCTCCTCCTAAACAATTGGACATGGGAGATGAAGTTTACGATGATGTGGATACCTCTGATTTCC 2116
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1938 ---TTTCCCTGCTCCTCCTAAACAATTGGACATGGGAGATGAAGTTTACGATGATGTGGATACCTCTGATTTCC 2008
Query 2117 CTGTTTCATCAGCAGAGATGAGTCAAGGAACTAATTTTGGAAAAGCTAAGACAGAAGAAAAGGACCTTAAGAAG 2190
|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2009 CTGTTTCATCAGCAGAGATGAGTCAAGGAACTAATGTTGGAAAAGCTAAGACAGAAGAAAAGGACCTTAAGAAG 2082
Query 2191 CTAAAAAAGCAGGAAAAAGAAGAAAAAGACTTCAGGAAAAAATTTAAATATGATGGTGAAATTAGAGTCCTATA 2264
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2083 CTAAAAAAGCAGGAAAAAGAAGAAAAAGACTTCAGGAAAAAATTTAAATATGATGGTGAAATTAGAGTCCTATA 2156
Query 2265 TTCAACTAAAGTTACAACTTCCATAACTTCTAAAAAGTGGGGAACCAGAGATCTACAGGTAAAACCTGGTGAAT 2338
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2157 TTCAACTAAAGTTACAACTTCCATAACTTCTAAAAAGTGGGGAACCAGAGATCTACAGGTAAAACCTGGTGAAT 2230
Query 2339 CTCTAGAAGTTATACAAACCACAGATGACACAAAAGTTCTCTGCAGAAATGAAGAAGGGAAATATGGTTATGTC 2412
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2231 CTCTAGAAGTTATACAAACCACAGATGACACAAAAGTTCTCTGCAGAAATGAAGAAGGGAAATATGGTTATGTC 2304
Query 2413 CTTCGGAGTTACCTAGCGGACAATGATGGAGAGATCTATGATGATATTGCTGATGGCTGCATCTATGACAATGA 2486
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2305 CTTCGGAGTTACCTAGCGGACAATGATGGAGAGATCTATGATGATATTGCTGATGGCTGCATCTATGACAATGA 2378
Query 2487 C 2487
|
Sbjct 2379 C 2379