Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_06239
- Subject:
- XM_006527823.3
- Aligned Length:
- 1479
- Identities:
- 1341
- Gaps:
- 6
Alignment
Query 1 ATGATAATCACACAAACAAGTCACTGTTACATGACCAGCCTTGGGATTCTTTTCCTGATTAATATTCTCCCTGG 74
||||||||||||||||...|.||||.|||..|||||||..|||...|||||.|||||||||.||||||||||||
Sbjct 1 ATGATAATCACACAAATGTGGCACTTTTATGTGACCAGAGTTGTACTTCTTCTCCTGATTAGTATTCTCCCTGG 74
Query 75 AACCACTGGTCAAGGGGAATCAAGACGACAAGAACCCGGGGACTTTGTGAAGCAGGACATTGGCGGGCTGTCTC 148
|||||||.|.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||.|||||.||.||.||||
Sbjct 75 AACCACTAGCCAAGGGGAATCAAGACGACAAGAACCTGGGGACTTTGTGAAACAAGATATTGGAGGACTCTCTC 148
Query 149 CTAAGCATGCCCCAGATATTCCTGATGACAGCACTGACAACATCACTATCTTCACCAGAATCTTGGATCGTCTT 222
|.|||||||||||||||||||||||.||.||.||.||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||
Sbjct 149 CCAAGCATGCCCCAGATATTCCTGACGATAGTACAGATAATATCACTATCTTCACTAGAATCTTGGATCGGCTT 222
Query 223 CTGGACGGCTATGACAACCGGCTGCGACCTGGGCTTGGAGATGCAGTGACTGAAGTGAAGACTGACATCTACGT 296
.||||.||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||
Sbjct 223 TTGGATGGCTATGATAACCGGCTTCGACCTGGACTTGGAGATGCAGTGACTGAAGTGAAGACAGACATCTATGT 296
Query 297 GACCAGTTTTGGCCCTGTGTCAGACACTGACATGGAGTACACTATTGATGTATTTTTTCGGCAGACATGGCATG 370
||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||.|.|||||||||||||
Sbjct 297 GACCAGTTTTGGCCCTGTGTCAGACACTGATATGGAATATACTATTGATGTATTTTTTAGACAGACATGGCATG 370
Query 371 ATGAAAGACTGAAATTTGATGGCCCCATGAAGATCCTTCCACTGAACAATCTCCTGGCTAGTAAGATCTGGACA 444
||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.
Sbjct 371 ATGAAAGACTGAAATTTGATGGACCAATGAAGATCCTTCCACTGAACAATCTTCTGGCTAGTAAGATATGGACT 444
Query 445 CCGGACACCTTCTTCCACAATGGCAAGAAATCAGTGGCTCATAACATGACCACGCCCAACAAGCTGCTCAGATT 518
||.||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||.|
Sbjct 445 CCTGATACCTTCTTCCACAATGGTAAAAAATCAGTGGCTCACAATATGACCACACCCAACAAGCTGCTCAGACT 518
Query 519 GGTGGACAACGGAACCCTCCCCTATACAATGAGGTTAACAATTCATGCTGAGTGTCCCATGCATTTGGAAGATT 592
|||.||.||.||.|||||||.|||||||||||||||||||||.||.|||||.||.|||||||||||||||||||
Sbjct 519 GGTAGATAATGGGACCCTCCTCTATACAATGAGGTTAACAATACACGCTGAATGCCCCATGCATTTGGAAGATT 592
Query 593 TTCCCATGGATGTGCATGCCTGCCCACTGAAGTTTGGAAGCTATGCCTATACAACAGCTGAAGTGGTTTATTCT 666
|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||..||||||||
Sbjct 593 TCCCCATGGATGTGCATGCCTGCCCACTGAAGTTTGGAAGCTATGCCTATACCAAAGCTGAAGTAATTTATTCT 666
Query 667 TGGACTCTCGGAAAGAACAAATCCGTGGAAGTGGCACAGGATGGTTCTCGCTTGAACCAGTATGACCTTTTGGG 740
||||||||.||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||.||.|||.||||.|||||||||.|..|.||
Sbjct 667 TGGACTCTTGGGAAGAACAAATCTGTGGAAGTAGCACAGGATGGCTCACGCCTGAATCAGTATGACTTGCTTGG 740
Query 741 CCATGTTGTTGGGACAGAGATAATCCGGTCTAGTACAGGAGAATATGTCGTCATGACAACCCACTTCCATCTCA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|
Sbjct 741 CCATGTTGTTGGGACAGAGATAATCCGGTCTAGTACAGGAGAATATGTCGTCATGACAACCCACTTTCATCTGA 814
Query 815 AGCGAAAAATTGGCTACTTTGTGATCCAGACCTACTTGCCATGTATCATGACTGTCATTCTGTCACAAGTGTCG 888
||.|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 815 AGAGAAAAATTGGCTACTTTGTCATCCAGACCTACTTGCCATGTATCATGACTGTCATTCTGTCACAAGTGTCT 888
Query 889 TTCTGGCTCAACAGAGAGTCTGTTCCTGCCCGTACAGTCTTTGGTGTCACCACTGTGCTTACCATGACCACCTT 962
||||||||.||.|||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct 889 TTCTGGCTTAATAGAGAATCTGTCCCTGCCCGCACAGTCTTTGGTGTCACCACTGTTCTCACCATGACCACCTT 962
Query 963 GAGTATCAGTGCCAGAAATTCCTTACCTAAAGTGGCATATGCGACGGCCATGGACTGGTTCATAGCCGTCTGTT 1036
||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GAGTATCAGTGCCAGAAACTCTTTACCTAAAGTGGCATACGCGACGGCCATGGACTGGTTCATAGCCGTCTGTT 1036
Query 1037 ATGCCTTTGTATTTTCTGCACTGATTGAATTTGCCACTGTCAACTATTTCACCAAGCGGAGTTGGGCTTGGGAA 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 ATGCCTTTGTATTTTCTGCACTGATTGAATTTGCTACTGTCAACTACTTCACCAAGCGGAGTTGGGCTTGGGAA 1110
Query 1111 GGCAAGAAGGTGCCAGAGGCCCTGGAGATGAAGAAGAAAACACCAGCAGCCCCAGCAAAGAAAACCAGCACTAC 1184
|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.|||||||| |.|||.||
Sbjct 1111 GGCAAGAAGGTACCAGAGGCCCTGGAGATGAAGAAGAAAACACCAGCAGCTCCAACAAAGAAA---AACACCAC 1181
Query 1185 CTTCAACATCGTGGGGACCACCTATCCCATCAACCTGGCCAAGGACACTGAATTTTCCACCATCTCCAAG---G 1255
|||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||.||||||||||||||| |
Sbjct 1182 CTTCAACATAGTGGGTACCACCTATCCTATCAATCTGGCCAAGGATACTGAGTTCTCCACCATCTCCAAGTCTG 1255
Query 1256 GCGCTGCTCCCAGTGCCTCCTCAACCCCAACAATCATTGCTTCACCCAAGGCCACCTACGTGCAGGACAGCCCG 1329
..||||||||||||||.||.|||||.||||||...|||||||||||||||||.||.||.|||||.|||||.||.
Sbjct 1256 CTGCTGCTCCCAGTGCTTCTTCAACTCCAACAGCGATTGCTTCACCCAAGGCTACTTATGTGCAAGACAGTCCT 1329
Query 1330 ACTGAGACCAAGACCTACAACAGTGTCAGCAAGGTTGACAAAATTTCCCGCATCATCTTTCCTGTGCTCTTTGC 1403
.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1330 GCTGAGACCAAGACCTACAACAGTGTCAGCAAGGTTGACAAAATTTCCCGCATCATCTTCCCTGTGCTCTTTGC 1403
Query 1404 CATATTCAATCTGGTCTATTGGGCCACATATGTCAACCGGGAGTCAGCTATCAAGGGCATGATCCGCAAACAG 1476
||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1404 CATATTCAATCTTGTCTATTGGGCTACATATGTGAACCGGGAATCAGCTATCAAGGGCATGATCCGCAAACAG 1476