Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_06239
• Subject: XM_006724811.3
• Aligned Length: 1476
• Identities: 1019
• Gaps: 456

Alignment

Query    1  ATGATAATCACACAAACAAGTCACTGTTACATGACCAGCCTTGGGATTCTTTTCCTGATTAATATTCTCCCTGG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGATAATCACACAAACAAGTCACTGTTACATGACCAGCCTTGGGATTCTTTTCCTGATTAATATTCTCCCTGG  74

Query   75  AACCACTGGTCAAGGGGAATCAAGACGACAAGAACCCGGGGACTTTGTGAAGCAGGACATTGGCGGGCTGTCTC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AACCACTGGTCAAGGGGAATCAAGACGACAAGAACCCGGGGACTTTGTGAAGCAGGACATTGGCGGGCTGTCTC  148

Query  149  CTAAGCATGCCCCAGATATTCCTGATGACAGCACTGACAACATCACTATCTTCACCAGAATCTTGGATCGTCTT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CTAAGCATGCCCCAGATATTCCTGATGACAGCACTGACAACATCACTATCTTCACCAGAATCTTGGATCGTCTT  222

Query  223  CTGGACGGCTATGACAACCGGCTGCGACCTGGGCTTGGAGATGCAGTGACTGAAGTGAAGACTGACATCTACGT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CTGGACGGCTATGACAACCGGCTGCGACCTGGGCTTGGAGATGCAGTGACTGAAGTGAAGACTGACATCTACGT  296

Query  297  GACCAGTTTTGGCCCTGTGTCAGACACTGACATGGAGTACACTATTGATGTATTTTTTCGGCAGACATGGCATG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GACCAGTTTTGGCCCTGTGTCAGACACTGACATGGAGTACACTATTGATGTATTTTTTCGGCAGACATGGCATG  370

Query  371  ATGAAAGACTGAAATTTGATGGCCCCATGAAGATCCTTCCACTGAACAATCTCCTGGCTAGTAAGATCTGGACA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ATGAAAGACTGAAATTTGATGGCCCCATGAAGATCCTTCCACTGAACAATCTCCTGGCTAGTAAGATCTGGACA  444

Query  445  CCGGACACCTTCTTCCACAATGGCAAGAAATCAGTGGCTCATAACATGACCACGCCCAACAAGCTGCTCAGATT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CCGGACACCTTCTTCCACAATGGCAAGAAATCAGTGGCTCATAACATGACCACGCCCAACAAGCTGCTCAGATT  518

Query  519  GGTGGACAACGGAACCCTCCCCTATACAATGAGGTTAACAATTCATGCTGAGTGTCCCATGCATTTGGAAGATT  592
            ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GGTGGACAACGGAACCCTCCTCTATACAATGAGGTTAACAATTCATGCTGAGTGTCCCATGCATTTGGAAGATT  592

Query  593  TTCCCATGGATGTGCATGCCTGCCCACTGAAGTTTGGAAGCTATGCCTATACAACAGCTGAAGTGGTTTATTCT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TTCCCATGGATGTGCATGCCTGCCCACTGAAGTTTGGAAGCTATGCCTATACAACAGCTGAAGTGGTTTATTCT  666

Query  667  TGGACTCTCGGAAAGAACAAATCCGTGGAAGTGGCACAGGATGGTTCTCGCTTGAACCAGTATGACCTTTTGGG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TGGACTCTCGGAAAGAACAAATCCGTGGAAGTGGCACAGGATGGTTCTCGCTTGAACCAGTATGACCTTTTGGG  740

Query  741  CCATGTTGTTGGGACAGAGATAATCCGGTCTAGTACAGGAGAATATGTCGTCATGACAACCCACTTCCATCTCA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CCATGTTGTTGGGACAGAGATAATCCGGTCTAGTACAGGAGAATATGTCGTCATGACAACCCACTTCCATCTCA  814

Query  815  AGCGAAAAATTGGCTACTTTGTGATCCAGACCTACTTGCCATGTATCATGACTGTCATTCTGTCACAAGTGTCG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AGCGAAAAATTGGCTACTTTGTGATCCAGACCTACTTGCCATGTATCATGACTGTCATTCTGTCACAAGTGTCG  888

Query  889  TTCTGGCTCAACAGAGAGTCTGTTCCTGCCCGTACAGTCTTTGGTGTCACCACTGTGCTTACCATGACCACCTT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                                
Sbjct  889  TTCTGGCTCAACAGAGAGTCTGTTCCTGCCCGTACAGTCTTT--------------------------------  930

Query  963  GAGTATCAGTGCCAGAAATTCCTTACCTAAAGTGGCATATGCGACGGCCATGGACTGGTTCATAGCCGTCTGTT  1036
                                                                                      
Sbjct  931  --------------------------------------------------------------------------  930

Query 1037  ATGCCTTTGTATTTTCTGCACTGATTGAATTTGCCACTGTCAACTATTTCACCAAGCGGAGTTGGGCTTGGGAA  1110
                                                                                      
Sbjct  931  --------------------------------------------------------------------------  930

Query 1111  GGCAAGAAGGTGCCAGAGGCCCTGGAGATGAAGAAGAAAACACCAGCAGCCCCAGCAAAGAAAACCAGCACTAC  1184
                                            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  931  --------------------------------GAAGAAAACACCAGCAGCCCCAGCAAAGAAAACCAGCACTAC  972

Query 1185  CTTCAACATCGTGGGGACCACCTATCCCATCAACCTGGCCAAGGACACTGAATTTTCCACCATCTCCAAGGGCG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                          
Sbjct  973  CTTCAACATCGTGGGGACCACCTATCCCATCAACCTGGCCAAGGACAC--------------------------  1020

Query 1259  CTGCTCCCAGTGCCTCCTCAACCCCAACAATCATTGCTTCACCCAAGGCCACCTACGTGCAGGACAGCCCGACT  1332
                                                                                      
Sbjct 1021  --------------------------------------------------------------------------  1020

Query 1333  GAGACCAAGACCTACAACAGTGTCAGCAAGGTTGACAAAATTTCCCGCATCATCTTTCCTGTGCTCTTTGCCAT  1406
                                                                                      
Sbjct 1021  --------------------------------------------------------------------------  1020

Query 1407  ATTCAATCTGGTCTATTGGGCCACATATGTCAACCGGGAGTCAGCTATCAAGGGCATGATCCGCAAACAG  1476
                                                                                  
Sbjct 1021  ----------------------------------------------------------------------  1020