Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_06239
• Subject: XM_017318383.1
• Aligned Length: 1572
• Identities: 1341
• Gaps: 99

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGAAGGGAGAGAAGAGAGAAAAGGAGGAAGCTCACACTTTGGTCCTGAAGAGAGAAATCTCACAGGTCTCTT  74

Query    1  -------------------ATGATAATCACACAAACAAGTCACTGTTACATGACCAGCCTTGGGATTCTTTTCC  55
                               ||||||||||||||||...|.||||.|||..|||||||..|||...|||||.|||
Sbjct   75  CAAGTTGCTGTCTAAGAAGATGATAATCACACAAATGTGGCACTTTTATGTGACCAGAGTTGTACTTCTTCTCC  148

Query   56  TGATTAATATTCTCCCTGGAACCACTGGTCAAGGGGAATCAAGACGACAAGAACCCGGGGACTTTGTGAAGCAG  129
            ||||||.|||||||||||||||||||.|.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.
Sbjct  149  TGATTAGTATTCTCCCTGGAACCACTAGCCAAGGGGAATCAAGACGACAAGAACCTGGGGACTTTGTGAAACAA  222

Query  130  GACATTGGCGGGCTGTCTCCTAAGCATGCCCCAGATATTCCTGATGACAGCACTGACAACATCACTATCTTCAC  203
            ||.|||||.||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||.||.||.||.||.||||||||||||||
Sbjct  223  GATATTGGAGGACTCTCTCCCAAGCATGCCCCAGATATTCCTGACGATAGTACAGATAATATCACTATCTTCAC  296

Query  204  CAGAATCTTGGATCGTCTTCTGGACGGCTATGACAACCGGCTGCGACCTGGGCTTGGAGATGCAGTGACTGAAG  277
            .||||||||||||||.|||.||||.||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TAGAATCTTGGATCGGCTTTTGGATGGCTATGATAACCGGCTTCGACCTGGACTTGGAGATGCAGTGACTGAAG  370

Query  278  TGAAGACTGACATCTACGTGACCAGTTTTGGCCCTGTGTCAGACACTGACATGGAGTACACTATTGATGTATTT  351
            |||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||
Sbjct  371  TGAAGACAGACATCTATGTGACCAGTTTTGGCCCTGTGTCAGACACTGATATGGAATATACTATTGATGTATTT  444

Query  352  TTTCGGCAGACATGGCATGATGAAAGACTGAAATTTGATGGCCCCATGAAGATCCTTCCACTGAACAATCTCCT  425
            |||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  445  TTTAGACAGACATGGCATGATGAAAGACTGAAATTTGATGGACCAATGAAGATCCTTCCACTGAACAATCTTCT  518

Query  426  GGCTAGTAAGATCTGGACACCGGACACCTTCTTCCACAATGGCAAGAAATCAGTGGCTCATAACATGACCACGC  499
            ||||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||.||||||||.|
Sbjct  519  GGCTAGTAAGATATGGACTCCTGATACCTTCTTCCACAATGGTAAAAAATCAGTGGCTCACAATATGACCACAC  592

Query  500  CCAACAAGCTGCTCAGATTGGTGGACAACGGAACCCTCCCCTATACAATGAGGTTAACAATTCATGCTGAGTGT  573
            |||||||||||||||||.||||.||.||.||.|||||||.|||||||||||||||||||||.||.|||||.||.
Sbjct  593  CCAACAAGCTGCTCAGACTGGTAGATAATGGGACCCTCCTCTATACAATGAGGTTAACAATACACGCTGAATGC  666

Query  574  CCCATGCATTTGGAAGATTTTCCCATGGATGTGCATGCCTGCCCACTGAAGTTTGGAAGCTATGCCTATACAAC  647
            ||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.
Sbjct  667  CCCATGCATTTGGAAGATTTCCCCATGGATGTGCATGCCTGCCCACTGAAGTTTGGAAGCTATGCCTATACCAA  740

Query  648  AGCTGAAGTGGTTTATTCTTGGACTCTCGGAAAGAACAAATCCGTGGAAGTGGCACAGGATGGTTCTCGCTTGA  721
            |||||||||..||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||.||.|||.|||
Sbjct  741  AGCTGAAGTAATTTATTCTTGGACTCTTGGGAAGAACAAATCTGTGGAAGTAGCACAGGATGGCTCACGCCTGA  814

Query  722  ACCAGTATGACCTTTTGGGCCATGTTGTTGGGACAGAGATAATCCGGTCTAGTACAGGAGAATATGTCGTCATG  795
            |.|||||||||.|..|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ATCAGTATGACTTGCTTGGCCATGTTGTTGGGACAGAGATAATCCGGTCTAGTACAGGAGAATATGTCGTCATG  888

Query  796  ACAACCCACTTCCATCTCAAGCGAAAAATTGGCTACTTTGTGATCCAGACCTACTTGCCATGTATCATGACTGT  869
            |||||||||||.|||||.|||.|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ACAACCCACTTTCATCTGAAGAGAAAAATTGGCTACTTTGTCATCCAGACCTACTTGCCATGTATCATGACTGT  962

Query  870  CATTCTGTCACAAGTGTCGTTCTGGCTCAACAGAGAGTCTGTTCCTGCCCGTACAGTCTTTGGTGTCACCACTG  943
            ||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CATTCTGTCACAAGTGTCTTTCTGGCTTAATAGAGAATCTGTCCCTGCCCGCACAGTCTTTGGTGTCACCACTG  1036

Query  944  TGCTTACCATGACCACCTTGAGTATCAGTGCCAGAAATTCCTTACCTAAAGTGGCATATGCGACGGCCATGGAC  1017
            |.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1037  TTCTCACCATGACCACCTTGAGTATCAGTGCCAGAAACTCTTTACCTAAAGTGGCATACGCGACGGCCATGGAC  1110

Query 1018  TGGTTCATAGCCGTCTGTTATGCCTTTGTATTTTCTGCACTGATTGAATTTGCCACTGTCAACTATTTCACCAA  1091
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||
Sbjct 1111  TGGTTCATAGCCGTCTGTTATGCCTTTGTATTTTCTGCACTGATTGAATTTGCTACTGTCAACTACTTCACCAA  1184

Query 1092  GCGGAGTTGGGCTTGGGAAGGCAAGAAGGTGCCAGAGGCCCTGGAGATGAAGAAGAAAACACCAGCAGCCCCAG  1165
            ||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.
Sbjct 1185  GCGGAGTTGGGCTTGGGAAGGCAAGAAGGTACCAGAGGCCCTGGAGATGAAGAAGAAAACACCAGCAGCTCCAA  1258

Query 1166  CAAAGAAAACCAGCACTACCTTCAACATCGTGGGGACCACCTATCCCATCAACCTGGCCAAGGACACTGAATTT  1239
            ||||||||   |.|||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||.
Sbjct 1259  CAAAGAAA---AACACCACCTTCAACATAGTGGGTACCACCTATCCTATCAATCTGGCCAAGGATACTGAGTTC  1329

Query 1240  TCCACCATCTCCAAG---GGCGCTGCTCCCAGTGCCTCCTCAACCCCAACAATCATTGCTTCACCCAAGGCCAC  1310
            |||||||||||||||   |..||||||||||||||.||.|||||.||||||...|||||||||||||||||.||
Sbjct 1330  TCCACCATCTCCAAGTCTGCTGCTGCTCCCAGTGCTTCTTCAACTCCAACAGCGATTGCTTCACCCAAGGCTAC  1403

Query 1311  CTACGTGCAGGACAGCCCGACTGAGACCAAGACCTACAACAGTGTCAGCAAGGTTGACAAAATTTCCCGCATCA  1384
            .||.|||||.|||||.||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1404  TTATGTGCAAGACAGTCCTGCTGAGACCAAGACCTACAACAGTGTCAGCAAGGTTGACAAAATTTCCCGCATCA  1477

Query 1385  TCTTTCCTGTGCTCTTTGCCATATTCAATCTGGTCTATTGGGCCACATATGTCAACCGGGAGTCAGCTATCAAG  1458
            ||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||
Sbjct 1478  TCTTCCCTGTGCTCTTTGCCATATTCAATCTTGTCTATTGGGCTACATATGTGAACCGGGAATCAGCTATCAAG  1551

Query 1459  GGCATGATCCGCAAACAG  1476
            ||||||||||||||||||
Sbjct 1552  GGCATGATCCGCAAACAG  1569