Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_06242
- Subject:
- NM_008068.3
- Aligned Length:
- 1359
- Identities:
- 1149
- Gaps:
- 30
Alignment
Query 1 ATGGCGTCGTCTCTGCCCTGGCTGTGCATTATTCTGTGGCTAGAAAATGCCCTAGGGAAACTCGAAGTTGAAGG 74
||||..|.|..|||.||||||||.|.|||||||||.||||||||||||||||.||...||||.||||.||||||
Sbjct 1 ATGGTCTTGCTTCTCCCCTGGCTCTTCATTATTCTATGGCTAGAAAATGCCCAAGCTCAACTTGAAGATGAAGG 74
Query 75 CAACTTCTACTCAGAAAACGTCAGTCGGATCCTGGACAACTTGCTTGAAGGCTATGACAATCGGCTGCGGCCGG 148
||||||||||||.|||||.|||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||.||.||.|||||.|
Sbjct 75 CAACTTCTACTCTGAAAATGTCAGTCGGATTCTTGACAACTTGCTGGAAGGCTATGACAACCGTCTACGGCCAG 148
Query 149 GATTTGGAGGTGCTGTCACTGAAGTCAAAACAGACATTTATGTGACCAGTTTTGGGCCCGTGTCAGATGTGGAG 222
|||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||
Sbjct 149 GATTTGGGGGTGCTGTAACAGAAGTCAAAACAGACATCTATGTGACCAGCTTTGGACCTGTGTCAGATGTGGAG 222
Query 223 ATGGAGTATACGATGGATGTTTTTTTCCGCCAGACCTGGACTGATGAGAGGTTGAAGTTTGGGGGGCCAACTGA 296
|| |||.||||||||||||||..||||.|||...||.||..||||
Sbjct 223 AT------------------------------GACTTGGACTGATGAGAGACTGAAATTTAAAGGCCCTGCTGA 266
Query 297 GATTCTGAGTCTGAATAATTTGATGGTCAGTAAAATCTGGACGCCTGACACCTTTTTCAGAAATGGTAAAAAGT 370
|||||||||..|.|||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||.|.|||||.|||||||
Sbjct 267 GATTCTGAGCTTAAATAACTTGATGGTCAGTAAGATCTGGACTCCTGACACTTTTTTCCGGAATGGGAAAAAGT 340
Query 371 CCATTGCTCACAACATGACAACTCCTAATAAACTCTTCAGAATAATGCAGAATGGAACCATTTTATACACCATG 444
|.|||||||||||||||||.||.||.||.||.||||||.||.||||||||||||||||.||..|.||.||||||
Sbjct 341 CAATTGCTCACAACATGACCACCCCCAACAAGCTCTTCCGATTAATGCAGAATGGAACAATCCTCTATACCATG 414
Query 445 AGGCTTACCATCAATGCTGACTGTCCCATGAGGCTGGTTAACTTTCCTATGGATGGGCATGCTTGTCCACTCAA 518
|||||.||||||||.|||||.||.||||||||..||||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct 415 AGGCTCACCATCAACGCTGATTGCCCCATGAGATTGGTTAACTTCCCTATGGATGGACACGCTTGTCCACTCAA 488
Query 519 GTTTGGGAGCTATGCTTATCCCAAAAGTGAAATCATATATACGTGGAAAAAAGGACCACTTTACTCAGTAGAAG 592
|||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 489 GTTTGGGAGCTATGCTTATCCTAAAACTGAAATCATATATACATGGAAAAAAGGACCACTTTACTCAGTAGAAG 562
Query 593 TCCCAGAAGAATCTTCAAGCCTTCTCCAGTATGATCTGATTGGACAAACAGTATCTAGTGAGACAATTAAATCT 666
||||||||||||||||.|||||.||||||||||||.|||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 563 TCCCAGAAGAATCTTCTAGCCTCCTCCAGTATGATTTGATTGGGCAAACAGTTTCTAGTGAGACAATTAAATCT 636
Query 667 AACACAGGTGAATACGTTATAATGACAGTTTACTTCCACTTGCAAAGGAAGATGGGCTACTTCATGATACAGAT 740
|||||.||||||||.||.||.||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||
Sbjct 637 AACACTGGTGAATATGTAATCATGACAGTCTATTTCCACTTACAAAGGAAGATGGGCTATTTCATGATCCAGAT 710
Query 741 ATACACTCCTTGCATTATGACAGTCATTCTTTCCCAGGTGTCTTTCTGGATTAATAAGGAGTCCGTCCCAGCAA 814
|||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 711 ATACACTCCGTGCATCATGACAGTCATTCTTTCTCAAGTGTCTTTCTGGATTAATAAGGAGTCAGTCCCAGCAA 784
Query 815 GAACTGTTTTTGGGATCACCACTGTTTTAACTATGACCACTTTGAGCATCAGTGCCCGGCACTCTTTGCCAAAA 888
|||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||.|||||||||.|.||.|||
Sbjct 785 GAACTGTCTTTGGAATCACCACTGTTTTAACCATGACCACCTTAAGCATCAGTGCTCGGCACTCTCTACCCAAA 858
Query 889 GTGTCATATGCCACTGCCATGGATTGGTTCATAGCTGTTTGCTTTGCATTCGTCTTCTCTGCTCTTATCGAGTT 962
|||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||.||.||.||
Sbjct 859 GTGTCCTATGCAACCGCCATGGATTGGTTCATAGCTGTATGCTTTGCTTTTGTCTTTTCTGCTCTCATTGAATT 932
Query 963 CGCAGCTGTCAACTACTTTACCAATCTTCAGACACAGAAGGCCAAAAGGAAGGCACAGTTTGCAGCCCCACCCA 1036
||||||||||||||||||.||||||||.|||.||||||||||..|||||.|||||||...|||||||.|.|||.
Sbjct 933 CGCAGCTGTCAACTACTTCACCAATCTCCAGTCACAGAAGGCTGAAAGGCAGGCACAAACTGCAGCCACGCCCC 1006
Query 1037 CAGTGACAATATCAAAAGCTACTGAACCTTTGGAAGCTGAGATTGTTTTGCATCCTGACTCCAAATATCATCTG 1110
|.|||.|||..||||||||..|||||.|..||.||||.|||||||||.|||||.||||||||||.||.||||||
Sbjct 1007 CTGTGGCAAAGTCAAAAGCGTCTGAATCCCTGCAAGCAGAGATTGTTGTGCATTCTGACTCCAAGTACCATCTG 1080
Query 1111 AAGAAAAGGATCACTTCTCTGTCTTTGCCAATAGTTTCATCTTCCGAGGCCAATAAAGTGCTCACGAGAGCGCC 1184
|||||.||.||||..||||||.|||||||.||.|||.|||||||.|||||||..||||..||||..|||.||||
Sbjct 1081 AAGAAGAGAATCAGCTCTCTGACTTTGCCCATCGTTCCATCTTCTGAGGCCAGCAAAGCCCTCAGTAGAACGCC 1154
Query 1185 CATCTTACAATCAACACCTGTCACACCCCCACCACTCTCGCCAGCCTTTGGAGGCACCAGTAAAATAGACCAGT 1258
|||||||.||||.||.||||||.|.||||||...||||..||||||..|||.||||||||.||||||||.||||
Sbjct 1155 CATCTTAAAATCGACGCCTGTCTCTCCCCCATTGCTCTTACCAGCCACTGGGGGCACCAGCAAAATAGATCAGT 1228
Query 1259 ATTCTCGAATTCTCTTCCCAGTTGCATTTGCAGGATTCAACCTTGTGTACTGGGTAGTTTATCTTTCCAAAGAT 1332
||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||.|||||||.||||||||||||
Sbjct 1229 ATTCTCGAATTCTCTTCCCAGTAGCTTTTGCAGGATTCAACCTTGTGTACTGGATAGTTTACCTTTCCAAAGAT 1302
Query 1333 ACAATGGAAGTGAGTAGCAGTGTTGAA 1359
||||||||||||||.||.|.||||||.
Sbjct 1303 ACAATGGAAGTGAGCAGTACTGTTGAG 1329