Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_06246
• Subject: NM_198903.2
• Aligned Length: 1545
• Identities: 1400
• Gaps: 144

Alignment

Query    1  ATGAGTTCGCCAAATATATGGAGCACAGGAAGCTCAGTCTACTCGACTCCTGTATTTTCACAGAAAATGACGGT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAGTTCGCCAAATATATGGAGCACAGGAAGCTCAGTCTACTCGACTCCTGTATTTTCACAGAAAATGACGGT  74

Query   75  GTGGATTCTGCTCCTGCTGTCGCTCTACCCTGGCTTCACTAGCCAGAAATCTGATGATGACTATGAAGATTATG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GTGGATTCTGCTCCTGCTGTCGCTCTACCCTGGCTTCACTAGCCAGAAATCTGATGATGACTATGAAGATTATG  148

Query  149  CTTCTAACAAAACATGGGTCTTGACTCCAAAAGTTCCTGAGGGTGATGTCACTGTCATCTTAAACAACCTGCTG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CTTCTAACAAAACATGGGTCTTGACTCCAAAAGTTCCTGAGGGTGATGTCACTGTCATCTTAAACAACCTGCTG  222

Query  223  GAAGGATATGACAATAAACTTCGGCCTGATATAGGAGTGAAGCCAACGTTAATTCACACAGACATGTATGTGAA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GAAGGATATGACAATAAACTTCGGCCTGATATAGGAGTGAAGCCAACGTTAATTCACACAGACATGTATGTGAA  296

Query  297  TAGCATTGGTCCAGTGAACGCTATCAATATGGAATACACTATTGATATATTTTTTGCGCAAACGTGGTATGACA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TAGCATTGGTCCAGTGAACGCTATCAATATGGAATACACTATTGATATATTTTTTGCGCAAACGTGGTATGACA  370

Query  371  GACGTTTGAAATTTAACAGCACCATTAAAGTCCTCCGATTGAACAGCAACATGGTGGGGAAAATCTGGATTCCA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GACGTTTGAAATTTAACAGCACCATTAAAGTCCTCCGATTGAACAGCAACATGGTGGGGAAAATCTGGATTCCA  444

Query  445  GACACTTTCTTCAGAAATTCCAAAAAAGCTGATGCACACTGGATCACCACCCCCAACAGGATGCTGAGAATTTG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GACACTTTCTTCAGAAATTCCAAAAAAGCTGATGCACACTGGATCACCACCCCCAACAGGATGCTGAGAATTTG  518

Query  519  GAATGATGGTCGAGTGCTCTACACCCTAAGGTTGACAATTGATGCTGAGTGCCAATTACAATTGCACAATTTTC  592
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  519  GAATGATGGTCGAGTGCTCTACACCCTAAGGTTGACAATTGATGCTGAGTGCCAATTACAATTGCACAACTTTC  592

Query  593  CAATGGATGAACACTCCTGCCCCTTGGAGTTCTCCAGTT-----------------------------------  631
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                                   
Sbjct  593  CAATGGATGAACACTCCTGCCCCTTGGAGTTCTCCAGTTGGTCTCGTTCTATTGCCCAGGCTGGAATGTGCAGT  666

Query  632  --------------------------------------------------------------------------  631
                                                                                      
Sbjct  667  GGTGTGATCTCGGCTCACTACAGCCTTCGCTTCTGGGGCTCAACTGATCCTCCCACCTTGGCCTCCAGAGTAGC  740

Query  632  -----------ATGGCTATCCACGTGAAGAAATTGTTTATCAATGGAAGCGAAGTTCTGTTGAAGTGGGCGACA  694
                       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGGGATTTCAGATGGCTATCCACGTGAAGAAATTGTTTATCAATGGAAGCGAAGTTCTGTTGAAGTGGGCGACA  814

Query  695  CAAGATCCTGGAGGCTTTATCAATTCTCATTTGTTGGTCTAAGAAATACCACCGAAGTAGTGAAGACAACTTCC  768
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CAAGATCCTGGAGGCTTTATCAATTCTCATTTGTTGGTCTAAGAAATACCACCGAAGTAGTGAAGACAACTTCC  888

Query  769  GGAGATTATGTGGTCATGTCTGTCTACTTTGATCTGAGCAGAAGAATGGGATACTTTACCATCCAGACCTATAT  842
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GGAGATTATGTGGTCATGTCTGTCTACTTTGATCTGAGCAGAAGAATGGGATACTTTACCATCCAGACCTATAT  962

Query  843  CCCCTGCACACTCATTGTCGTCCTATCCTGGGTGTCTTTCTGGATCAATAAGGATGCTGTTCCAGCCAGAACAT  916
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CCCCTGCACACTCATTGTCGTCCTATCCTGGGTGTCTTTCTGGATCAATAAGGATGCTGTTCCAGCCAGAACAT  1036

Query  917  CTTTAGGTATCACCACTGTCCTGACAATGACCACCCTCAGCACCATTGCCCGGAAATCGCTCCCCAAGGTCTCC  990
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CTTTAGGTATCACCACTGTCCTGACAATGACCACCCTCAGCACCATTGCCCGGAAATCGCTCCCCAAGGTCTCC  1110

Query  991  TATGTCACAGCGATGGATCTCTTTGTATCTGTTTGTTTCATCTTTGTCTTCTCTGCTCTGGTGGAGTATGGCAC  1064
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TATGTCACAGCGATGGATCTCTTTGTATCTGTTTGTTTCATCTTTGTCTTCTCTGCTCTGGTGGAGTATGGCAC  1184

Query 1065  CTTGCATTATTTTGTCAGCAACCGGAAACCAAGCAAGGACAAAGATAAAAAGAAGAAAAACCCT----------  1128
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          
Sbjct 1185  CTTGCATTATTTTGTCAGCAACCGGAAACCAAGCAAGGACAAAGATAAAAAGAAGAAAAACCCTCTTCTTCGGA  1258

Query 1129  --------------GCCCCTACCATTGATATCCGCCCAAGATCAGCAACCATTCAAATGAATAATGCTACACAC  1188
                          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TGTTTTCCTTCAAGGCCCCTACCATTGATATCCGCCCAAGATCAGCAACCATTCAAATGAATAATGCTACACAC  1332

Query 1189  CTTCAAGAGAGAGATGAAGAGTACGGCTATGAGTGTCTGGACGGCAAGGACTGTGCCAGTTTTTTCTGCTGTTT  1262
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CTTCAAGAGAGAGATGAAGAGTACGGCTATGAGTGTCTGGACGGCAAGGACTGTGCCAGTTTTTTCTGCTGTTT  1406

Query 1263  TGAAGATTGTCGAACAGGAGCTTGGAGACATGGGAGGATACATATCCGCATTGCCAAAATGGACTCCTATGCTC  1336
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TGAAGATTGTCGAACAGGAGCTTGGAGACATGGGAGGATACATATCCGCATTGCCAAAATGGACTCCTATGCTC  1480

Query 1337  GGATCTTCTTCCCCACTGCCTTCTGCCTGTTTAATCTGGTCTATTGGGTCTCCTACCTCTACCTG  1401
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  GGATCTTCTTCCCCACTGCCTTCTGCCTGTTTAATCTGGTCTATTGGGTCTCCTACCTCTACCTG  1545