Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_06246
• Subject: NM_198904.3
• Aligned Length: 1425
• Identities: 1400
• Gaps: 24

Alignment

Query    1  ATGAGTTCGCCAAATATATGGAGCACAGGAAGCTCAGTCTACTCGACTCCTGTATTTTCACAGAAAATGACGGT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAGTTCGCCAAATATATGGAGCACAGGAAGCTCAGTCTACTCGACTCCTGTATTTTCACAGAAAATGACGGT  74

Query   75  GTGGATTCTGCTCCTGCTGTCGCTCTACCCTGGCTTCACTAGCCAGAAATCTGATGATGACTATGAAGATTATG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GTGGATTCTGCTCCTGCTGTCGCTCTACCCTGGCTTCACTAGCCAGAAATCTGATGATGACTATGAAGATTATG  148

Query  149  CTTCTAACAAAACATGGGTCTTGACTCCAAAAGTTCCTGAGGGTGATGTCACTGTCATCTTAAACAACCTGCTG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CTTCTAACAAAACATGGGTCTTGACTCCAAAAGTTCCTGAGGGTGATGTCACTGTCATCTTAAACAACCTGCTG  222

Query  223  GAAGGATATGACAATAAACTTCGGCCTGATATAGGAGTGAAGCCAACGTTAATTCACACAGACATGTATGTGAA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GAAGGATATGACAATAAACTTCGGCCTGATATAGGAGTGAAGCCAACGTTAATTCACACAGACATGTATGTGAA  296

Query  297  TAGCATTGGTCCAGTGAACGCTATCAATATGGAATACACTATTGATATATTTTTTGCGCAAACGTGGTATGACA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TAGCATTGGTCCAGTGAACGCTATCAATATGGAATACACTATTGATATATTTTTTGCGCAAACGTGGTATGACA  370

Query  371  GACGTTTGAAATTTAACAGCACCATTAAAGTCCTCCGATTGAACAGCAACATGGTGGGGAAAATCTGGATTCCA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GACGTTTGAAATTTAACAGCACCATTAAAGTCCTCCGATTGAACAGCAACATGGTGGGGAAAATCTGGATTCCA  444

Query  445  GACACTTTCTTCAGAAATTCCAAAAAAGCTGATGCACACTGGATCACCACCCCCAACAGGATGCTGAGAATTTG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GACACTTTCTTCAGAAATTCCAAAAAAGCTGATGCACACTGGATCACCACCCCCAACAGGATGCTGAGAATTTG  518

Query  519  GAATGATGGTCGAGTGCTCTACACCCTAAGGTTGACAATTGATGCTGAGTGCCAATTACAATTGCACAATTTTC  592
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  519  GAATGATGGTCGAGTGCTCTACACCCTAAGGTTGACAATTGATGCTGAGTGCCAATTACAATTGCACAACTTTC  592

Query  593  CAATGGATGAACACTCCTGCCCCTTGGAGTTCTCCAGTTATGGCTATCCACGTGAAGAAATTGTTTATCAATGG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CAATGGATGAACACTCCTGCCCCTTGGAGTTCTCCAGTTATGGCTATCCACGTGAAGAAATTGTTTATCAATGG  666

Query  667  AAGCGAAGTTCTGTTGAAGTGGGCGACACAAGATCCTGGAGGCTTTATCAATTCTCATTTGTTGGTCTAAGAAA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AAGCGAAGTTCTGTTGAAGTGGGCGACACAAGATCCTGGAGGCTTTATCAATTCTCATTTGTTGGTCTAAGAAA  740

Query  741  TACCACCGAAGTAGTGAAGACAACTTCCGGAGATTATGTGGTCATGTCTGTCTACTTTGATCTGAGCAGAAGAA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TACCACCGAAGTAGTGAAGACAACTTCCGGAGATTATGTGGTCATGTCTGTCTACTTTGATCTGAGCAGAAGAA  814

Query  815  TGGGATACTTTACCATCCAGACCTATATCCCCTGCACACTCATTGTCGTCCTATCCTGGGTGTCTTTCTGGATC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TGGGATACTTTACCATCCAGACCTATATCCCCTGCACACTCATTGTCGTCCTATCCTGGGTGTCTTTCTGGATC  888

Query  889  AATAAGGATGCTGTTCCAGCCAGAACATCTTTAGGTATCACCACTGTCCTGACAATGACCACCCTCAGCACCAT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AATAAGGATGCTGTTCCAGCCAGAACATCTTTAGGTATCACCACTGTCCTGACAATGACCACCCTCAGCACCAT  962

Query  963  TGCCCGGAAATCGCTCCCCAAGGTCTCCTATGTCACAGCGATGGATCTCTTTGTATCTGTTTGTTTCATCTTTG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TGCCCGGAAATCGCTCCCCAAGGTCTCCTATGTCACAGCGATGGATCTCTTTGTATCTGTTTGTTTCATCTTTG  1036

Query 1037  TCTTCTCTGCTCTGGTGGAGTATGGCACCTTGCATTATTTTGTCAGCAACCGGAAACCAAGCAAGGACAAAGAT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TCTTCTCTGCTCTGGTGGAGTATGGCACCTTGCATTATTTTGTCAGCAACCGGAAACCAAGCAAGGACAAAGAT  1110

Query 1111  AAAAAGAAGAAAAACCCT------------------------GCCCCTACCATTGATATCCGCCCAAGATCAGC  1160
            ||||||||||||||||||                        ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AAAAAGAAGAAAAACCCTCTTCTTCGGATGTTTTCCTTCAAGGCCCCTACCATTGATATCCGCCCAAGATCAGC  1184

Query 1161  AACCATTCAAATGAATAATGCTACACACCTTCAAGAGAGAGATGAAGAGTACGGCTATGAGTGTCTGGACGGCA  1234
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  AACCATTCAAATGAATAATGCTACACACCTTCAAGAGAGAGATGAAGAGTACGGCTATGAGTGTCTGGACGGCA  1258

Query 1235  AGGACTGTGCCAGTTTTTTCTGCTGTTTTGAAGATTGTCGAACAGGAGCTTGGAGACATGGGAGGATACATATC  1308
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AGGACTGTGCCAGTTTTTTCTGCTGTTTTGAAGATTGTCGAACAGGAGCTTGGAGACATGGGAGGATACATATC  1332

Query 1309  CGCATTGCCAAAATGGACTCCTATGCTCGGATCTTCTTCCCCACTGCCTTCTGCCTGTTTAATCTGGTCTATTG  1382
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CGCATTGCCAAAATGGACTCCTATGCTCGGATCTTCTTCCCCACTGCCTTCTGCCTGTTTAATCTGGTCTATTG  1406

Query 1383  GGTCTCCTACCTCTACCTG  1401
            |||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GGTCTCCTACCTCTACCTG  1425