Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_06246
• Subject: XM_006532199.1
• Aligned Length: 1425
• Identities: 1219
• Gaps: 81

Alignment

Query    1  ATGAGTTCGCCAAATATATGGAGCACAGGAAGCTCAGTCTACTCGACTCCTGTATTTTCACAGAAAATGACGGT  74
                                                             .||.||        |||||||||.|
Sbjct    1  -------------------------------------------------ATGAAT--------AAAATGACGCT  17

Query   75  GTGGATTCTGCTCCTGCTGTCGCTCTACCCTGGCTTCACTAGCCAGAAATCTGATGATGACTATGAAGATTATG  148
            ||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||.||.||.||||||||||||||||||||.|
Sbjct   18  GTGGATTCTGCTCCTGCTATCGCTCTACCCAGGCTTCACAAGCCAAAAGTCAGATGATGACTATGAAGATTACG  91

Query  149  CTTCTAACAAAACATGGGTCTTGACTCCAAAAGTTCCTGAGGGTGATGTCACTGTCATCTTAAACAACCTGCTG  222
            |||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   92  CTTCTAATAAAACATGGGTGTTGACTCCAAAAGTTCCAGAGGGTGATGTCACTGTCATCTTAAACAACCTGCTG  165

Query  223  GAAGGATATGACAATAAACTTCGGCCTGATATAGGAGTGAAGCCAACGTTAATTCACACAGACATGTATGTGAA  296
            |||||.||||||||.||||||||.|||||.||.||||||||.|||||.||||||||.|||||.|||||||||||
Sbjct  166  GAAGGGTATGACAACAAACTTCGACCTGACATCGGAGTGAAACCAACATTAATTCATACAGATATGTATGTGAA  239

Query  297  TAGCATTGGTCCAGTGAACGCTATCAATATGGAATACACTATTGATATATTTTTTGCGCAAACGTGGTATGACA  370
            .|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct  240  CAGCATTGGTCCAGTGAATGCTATCAATATGGAATATACAATTGATATTTTTTTTGCCCAAACCTGGTATGACA  313

Query  371  GACGTTTGAAATTTAACAGCACCATTAAAGTCCTCCGATTGAACAGCAACATGGTGGGGAAAATCTGGATTCCA  444
            |||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  314  GACGTTTGAAATTTAACAGTACCATTAAAGTTCTCCGGTTGAATAGCAATATGGTGGGGAAAATCTGGATTCCA  387

Query  445  GACACTTTCTTCAGAAATTCCAAAAAAGCTGATGCACACTGGATCACCACCCCCAACAGGATGCTGAGAATTTG  518
            ||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  388  GACACTTTCTTCAGGAACTCCAAAAAGGCTGATGCTCACTGGATCACCACTCCCAACAGGATGCTGAGAATTTG  461

Query  519  GAATGATGGTCGAGTGCTCTACACCCTAAGGTTGACAATTGATGCTGAGTGCCAATTACAATTGCACAATTTTC  592
            |||||||||||||||.|||||||||.|||||.|.||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||.||.|
Sbjct  462  GAATGATGGTCGAGTTCTCTACACCTTAAGGCTAACAATTGATGCTGAGTGCCAGTTGCAATTACACAACTTCC  535

Query  593  CAATGGATGAACACTCCTGCCCCTTGGAGTTCTCCAGTTATGGCTATCCACGTGAAGAAATTGTTTATCAATGG  666
            |||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  536  CAATGGATGAACACTCCTGCCCCCTGGAGTTCTCCAGTTATGGATATCCTCGTGAAGAAATTGTTTATCAATGG  609

Query  667  AAGCGAAGTTCTGTTGAAGTGGGCGACACAAGATCCTGGAGGCTTTATCAATTCTCATTTGTTGGTCTAAGAAA  740
            |||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||.||.||||||||..|.||.||
Sbjct  610  AAGCGCAGTTCTGTTGAAGTGGGTGACACAAGATCATGGAGGCTGTATCAATTTTCCTTTGTTGGATTGAGGAA  683

Query  741  TACCACCGAAGTAGTGAAGACAACTTCCGGAGATTATGTGGTCATGTCTGTCTACTTTGATCTGAGCAGAAGAA  814
            |||.||.||||||||||||||||||||.||.||.||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||
Sbjct  684  TACAACTGAAGTAGTGAAGACAACTTCTGGTGACTATGTGGTGATGTCTGTGTACTTCGATCTGAGCAGAAGAA  757

Query  815  TGGGATACTTTACCATCCAGACCTATATCCCCTGCACACTCATTGTCGTCCTATCCTGGGTGTCTTTCTGGATC  888
            ||||.|||||.|||||||||||.||.||.||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||.|||||||||
Sbjct  758  TGGGCTACTTCACCATCCAGACTTACATTCCCTGCACACTCATCGTGGTCCTGTCCTGGGTGTCCTTCTGGATC  831

Query  889  AATAAGGATGCTGTTCCAGCCAGAACATCTTTAGGTATCACCACTGTCCTGACAATGACCACCCTCAGCACCAT  962
            |||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||..|.||||||||
Sbjct  832  AATAAGGATGCTGTTCCTGCCAGAACATCTTTAGGAATCACTACTGTCCTGACCATGACAACTTTAAGCACCAT  905

Query  963  TGCCCGGAAATCGCTCCCCAAGGTCTCCTATGTCACAGCGATGGATCTCTTTGTATCTGTTTGTTTCATCTTTG  1036
            .|||.|.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  906  AGCCAGAAAATCTCTGCCCAAGGTCTCCTATGTCACAGCAATGGATCTCTTTGTATCTGTTTGCTTCATCTTTG  979

Query 1037  TCTTCTCTGCTCTGGTGGAGTATGGCACCTTGCATTATTTTGTCAGCAACCGGAAACCAAGCAAGGACAAAGAT  1110
            |.||.||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.
Sbjct  980  TGTTTTCTGCTTTGGTGGAGTATGGCACCCTGCATTATTTTGTCAGCAACCGGAAGCCAAGCAAGGATAAAGAC  1053

Query 1111  AAAAAGAAGAAAAACCCT------------------------GCCCCTACCATTGATATCCGCCCAAGATCAGC  1160
            ||||||||||||||||||                        |||||||||||||||||.||.||.||||||||
Sbjct 1054  AAAAAGAAGAAAAACCCTCTTCTTCGGATGTTTTCCTTCAAGGCCCCTACCATTGATATTCGTCCCAGATCAGC  1127

Query 1161  AACCATTCAAATGAATAATGCTACACACCTTCAAGAGAGAGATGAAGAGTACGGCTATGAGTGTCTGGACGGCA  1234
            |||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||.||||.||||
Sbjct 1128  AACCATTCAAATGAACAATGCCACACACCTTCAAGAGAGGGATGAAGAATATGGCTATGAGTGTTTGGATGGCA  1201

Query 1235  AGGACTGTGCCAGTTTTTTCTGCTGTTTTGAAGATTGTCGAACAGGAGCTTGGAGACATGGGAGGATACATATC  1308
            ||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1202  AGGACTGTGCCAGTTTCTTCTGCTGTTTTGAAGATTGCCGAACAGGAGCCTGGAGACATGGGAGGATACATATT  1275

Query 1309  CGCATTGCCAAAATGGACTCCTATGCTCGGATCTTCTTCCCCACTGCCTTCTGCCTGTTTAATCTGGTCTATTG  1382
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||.||||.|||||.||.||.||
Sbjct 1276  CGCATTGCCAAAATGGACTCCTATGCTCGGATCTTCTTCCCTACCGCCTTTTGCTTGTTCAATCTTGTTTACTG  1349

Query 1383  GGTCTCCTACCTCTACCTG  1401
            |||||||||.||.||.|||
Sbjct 1350  GGTCTCCTATCTTTATCTG  1368