Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_06258
- Subject:
- NM_001145662.1
- Aligned Length:
- 1440
- Identities:
- 1397
- Gaps:
- 42
Alignment
Query 1 ATGGAGGTGGCGCCGGAGCAGCCGCGCTGGATGGCGCACCCGGCCGTGCTGAATGCGCAGCACCCCGACTCACA 74
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Sbjct 1 ATGGAGGTGGCGCCCGAGCAGCCGCGCTGGATGGCGCACCCGGCCGTGCTGAATGCGCAGCACCCCGACTCACA 74
Query 75 CCACCCGGGCCTGGCGCACAACTACATGGAACCCGCGCAGCTGCTGCCTCCAGACGAGGTGGACGTCTTCTTCA 148
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Sbjct 75 CCACCCGGGCCTGGCGCACAACTACATGGAACCCGCGCAGCTGCTGCCTCCAGACGAGGTGGACGTCTTCTTCA 148
Query 149 ATCACCTCGACTCGCAGGGCAACCCCTACTATGCCAACCCCGCTCACGCGCGGGCGCGCGTCTCCTACAGCCCC 222
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Sbjct 149 ATCACCTCGACTCGCAGGGCAACCCCTACTATGCCAACCCCGCTCACGCGCGGGCGCGCGTCTCCTACAGCCCC 222
Query 223 GCGCACGCCCGCCTGACCGGAGGCCAGATGTGCCGCCCACACTTGTTGCACAGCCCGGGTTTGCCCTGGCTGGA 296
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Sbjct 223 GCGCACGCCCGCCTGACCGGAGGCCAGATGTGCCGCCCACACTTGTTGCACAGCCCGGGTTTGCCCTGGCTGGA 296
Query 297 CGGGGGCAAAGCAGCCCTCTCTGCCGCTGCGGCCCACCACCACAACCCCTGGACCGTGAGCCCCTTCTCCAAGA 370
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Sbjct 297 CGGGGGCAAAGCAGCCCTCTCTGCCGCTGCGGCCCACCACCACAACCCCTGGACCGTGAGCCCCTTCTCCAAGA 370
Query 371 CGCCACTGCACCCCTCAGCTGCTGGAGGCCCTGGAGGCCCACTCTCTGTGTACCCAGGGGCTGGGGGTGGGAGC 444
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Sbjct 371 CGCCACTGCACCCCTCAGCTGCTGGAGGCCCTGGAGGCCCACTCTCTGTGTACCCAGGGGCTGGGGGTGGGAGC 444
Query 445 GGGGGAGGCAGCGGGAGCTCAGTGGCCTCCCTCACCCCTACAGCAGCCCACTCTGGCTCCCACCTTTTCGGCTT 518
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Sbjct 445 GGGGGAGGCAGCGGGAGCTCAGTGGCCTCCCTCACCCCTACAGCAGCCCACTCTGGCTCCCACCTTTTCGGCTT 518
Query 519 CCCACCCACGCCACCCAAAGAAGTGTCTCCTGACCCTAGCACCACGGGGGCTGCGTCTCCAGCCTCATCTTCCG 592
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Sbjct 519 CCCACCCACGCCACCCAAAGAAGTGTCTCCTGACCCTAGCACCACGGGGGCTGCGTCTCCAGCCTCATCTTCCG 592
Query 593 CGGGGGGTAGTGCAGCCCGAGGAGAGGACAAGGACGGCGTCAAGTACCAGGTGTCACTGACGGAGAGCATGAAG 666
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Sbjct 593 CGGGGGGTAGTGCAGCCCGAGGAGAGGACAAGGACGGCGTCAAGTACCAGGTGTCACTGACGGAGAGCATGAAG 666
Query 667 ATGGAAAGTGGCAGTCCCCTGCGCCCAGGCCTAGCTACTATGGGCACCCAGCCTGCTACACACCACCCCATCCC 740
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Sbjct 667 ATGGAAAGTGGCAGTCCCCTGCGCCCAGGCCTAGCTACTATGGGCACCCAGCCTGCTACACACCACCCCATCCC 740
Query 741 CACCTACCCCTCCTATGTGCCGGCGGCTGCCCACGACTACAGCAGCGGACTCTTCCACCCCGGAGGCTTCCTGG 814
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Sbjct 741 CACCTACCCCTCCTATGTGCCGGCGGCTGCCCACGACTACAGCAGCGGACTCTTCCACCCCGGAGGCTTCCTGG 814
Query 815 GGGGACCGGCCTCCAGCTTCACCCCTAAGCAGCGCAGCAAGGCTCGTTCCTGTTCAGAAGGCCGGGAGTGTGTC 888
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Sbjct 815 GGGGACCGGCCTCCAGCTTCACCCCTAAGCAGCGCAGCAAGGCTCGTTCCTGTTCAGAAGGCCGGGAGTGTGTC 888
Query 889 AACTGTGGGGCCACAGCCACCCCTCTCTGGCGGCGGGACGGCACCGGCCACTACCTGTGCAATGCCTGTGGCCT 962
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Sbjct 889 AACTGTGGGGCCACAGCCACCCCTCTCTGGCGGCGGGACGGCACCGGCCACTACCTGTGCAATGCCTGTGGCCT 962
Query 963 CTACCACAAGATGAATGGGCAGAACCGACCACTCATCAAGCCCAAGCGAAGACTGTCGGCCGCCAGAAGAGCCG 1036
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Sbjct 963 CTACCACAAGATGAATGGGCAGAACCGACCACTCATCAAGCCCAAGCGAAGACT-------------------- 1016
Query 1037 GCACCTGTTGTGCAAATTGTCAGACGACAACCACCACCTTATGGCGCCGAAACGCCAACGGGGACCCTGTCTGC 1110
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Sbjct 1017 ----------------------GACGACAACCACCACCTTATGGCGCCGAAACGCCAACGGGGACCCTGTCTGC 1068
Query 1111 AACGCCTGTGGCCTCTACTACAAGCTGCACAATGTTAACAGGCCACTGACCATGAAGAAGGAAGGGATCCAGAC 1184
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Sbjct 1069 AACGCCTGTGGCCTCTACTACAAGCTGCACAATGTTAACAGGCCACTGACCATGAAGAAGGAAGGGATCCAGAC 1142
Query 1185 TCGGAACCGGAAGATGTCCAACAAGTCCAAGAAGAGCAAGAAAGGGGCGGAGTGCTTCGAGGAGCTGTCAAAGT 1258
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Sbjct 1143 TCGGAACCGGAAGATGTCCAACAAGTCCAAGAAGAGCAAGAAAGGGGCGGAGTGCTTCGAGGAGCTGTCAAAGT 1216
Query 1259 GCATGCAGGAGAAGTCATCCCCCTTCAGTGCAGCTGCCCTGGCTGGACACATGGCACCTGTGGGCCACCTCCCG 1332
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Sbjct 1217 GCATGCAGGAGAAGTCATCCCCCTTCAGTGCAGCTGCCCTGGCTGGACACATGGCACCTGTGGGCCACCTCCCG 1290
Query 1333 CCCTTCAGCCACTCCGGACACATCCTGCCCACTCCGACGCCCATCCACCCCTCCTCCAGCCTCTCCTTCGGCCA 1406
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Sbjct 1291 CCCTTCAGCCACTCCGGACACATCCTGCCCACTCCGACGCCCATCCACCCCTCCTCCAGCCTCTCCTTCGGCCA 1364
Query 1407 CCCCCACCCGTCCAGCATGGTGACCGCCATGGGC 1440
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Sbjct 1365 CCCCCACCCGTCCAGCATGGTGACCGCCATGGGC 1398