Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_06261
• Subject: XM_011543818.2
• Aligned Length: 1329
• Identities: 1324
• Gaps: 3

Alignment

Query    1  ATGTATCAGAGCTTGGCCATGGCCGCCAACCACGGGCCGCCCCCCGGTGCCTACGAGGCGGGCGGCCCCGGCGC  74
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Sbjct    1  ATGTATCAGAGCTTGGCCATGGCCGCCAACCACGGGCCGCCCCCCGGTGCCTACGAGGCGGGCGGCCCCGGCGC  74

Query   75  CTTCATGCACGGCGCGGGCGCCGCGTCCTCGCCAGTCTACGTGCCCACACCGCGGGTGCCCTCCTCCGTGCTGG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CTTCATGCACGGCGCGGGCGCCGCGTCCTCGCCAGTCTACGTGCCCACACCGCGGGTGCCCTCCTCCGTGCTGG  148

Query  149  GCCTGTCCTACCTCCAGGGCGGAGGCGCGGGCTCTGCGTCCGGAGGCGCCTCGGGCGGCAGCTCCGGTGGGGCC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GCCTGTCCTACCTCCAGGGCGGAGGCGCGGGCTCTGCGTCCGGAGGCGCCTCGGGCGGCAGCTCCGGTGGGGCC  222

Query  223  GCGTCTGGTGCGGGGCCCGGGACCCAGCAGGGCAGCCCGGGATGGAGCCAGGCGGGAGCCGACGGAGCCGCTTA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GCGTCTGGTGCGGGGCCCGGGACCCAGCAGGGCAGCCCGGGATGGAGCCAGGCGGGAGCCGACGGAGCCGCTTA  296

Query  297  CACCCCGCCGCCGGTGTCGCCGCGCTTCTCCTTCCCGGGGACCACCGGGTCCCTGGCGGCCGCCGCCGCCGCTG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CACCCCGCCGCCGGTGTCGCCGCGCTTCTCCTTCCCGGGGACCACCGGGTCCCTGGCGGCCGCCGCCGCCGCTG  370

Query  371  CCGCGGCCCGGGAAGCTGCGGCCTACAGCAGTGGCGGCGGAGCGGCGGGTGCGGGCCTGGCGGGCCGCGAGCAG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CCGCGGCCCGGGAAGCTGCGGCCTACAGCAGTGGCGGCGGAGCGGCGGGTGCGGGCCTGGCGGGCCGCGAGCAG  444

Query  445  TACTGGCGCGCCGGCTTCGCGGGCTCCTACTCCAGCCCCTACCCGGCTTACATGGCCGACGTGGGCGCGTCCTG  518
            |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TACGGGCGCGCCGGCTTCGCGGGCTCCTACTCCAGCCCCTACCCGGCTTACATGGCCGACGTGGGCGCGTCCTG  518

Query  519  GGCCGCAGCCGCCGCCGCCTCCGCCGGCCCCTTCGACAGCCCGGTCCTGCACAGCCTGCCCGGCCGGGCCAACC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GGCCGCAGCCGCCGCCGCCTCCGCCGGCCCCTTCGACAGCCCGGTCCTGCACAGCCTGCCCGGCCGGGCCAACC  592

Query  593  CGGCCGCCCGACACCCCAATCTC---GATATGTTTGACGACTTCTCAGAAGGCAGAGAGTGTGTCAACTGTGGG  663
            |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CGGCCGCCCGACACCCCAATCTCGTAGATATGTTTGACGACTTCTCAGAAGGCAGAGAGTGTGTCAACTGTGGG  666

Query  664  GCTATGTCCACCCCGCTCTGGAGGCGAGATGGGACTGGTCACTATCTGTGCAACGCCTGCGGCCTCTACCACAA  737
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Sbjct  667  GCTATGTCCACCCCGCTCTGGAGGCGAGATGGGACGGGTCACTATCTGTGCAACGCCTGCGGCCTCTACCACAA  740

Query  738  GATGAACGGCATCAACCGGCCGCTCATCAAGCCTCAGCGCCGGCTGTCCGCCTCCCGCCGAGTGGGCCTCTCCT  811
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Sbjct  741  GATGAACGGCATCAACCGGCCGCTCATCAAGCCTCAGCGCCGGCTGTCCGCCTCCCGCCGAGTGGGCCTCTCCT  814

Query  812  GTGCCAACTGCCAGACCACCACCACCACGCTGTGGCGCCGCAATGCGGAGGGCGAGCCTGTGTGCAATGCCTGC  885
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Sbjct  815  GTGCCAACTGCCAGACCACCACCACCACGCTGTGGCGCCGCAATGCGGAGGGCGAGCCTGTGTGCAATGCCTGC  888

Query  886  GGCCTCTACATGAAGCTCCACGGGGTCCCCAGGCCTCTTGCAATGCGGAAAGAGGGGATCCAAACCAGAAAACG  959
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Sbjct  889  GGCCTCTACATGAAGCTCCACGGGGTCCCCAGGCCTCTTGCAATGCGGAAAGAGGGGATCCAAACCAGAAAACG  962

Query  960  GAAGCCCAAGAACCTGAATAAATCTAAGACACCAGCAGCTCCTTCAGGCAGTGAGAGCCTTCCTCCCGCCAGCG  1033
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Sbjct  963  GAAGCCCAAGAACCTGAATAAATCTAAGACACCAGCAGCTCCTTCAGGCAGTGAGAGCCTTCCTCCCGCCAGCG  1036

Query 1034  GTGCTTCCAGCAACTCCAGCAACGCCACCACCAGCAGCAGCGAGGAGATGCGTCCCATCAAGACGGAGCCTGGC  1107
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Sbjct 1037  GTGCTTCCAGCAACTCCAGCAACGCCACCACCAGCAGCAGCGAGGAGATGCGTCCCATCAAGACGGAGCCTGGC  1110

Query 1108  CTGTCATCTCACTACGGGCACAGCAGCTCCGTGTCCCAGACGTTCTCAGTCAGTGCGATGTCTGGCCATGGGCC  1181
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Sbjct 1111  CTGTCATCTCACTACGGGCACAGCAGCTCCGTGTCCCAGACGTTCTCAGTCAGTGCGATGTCTGGCCATGGGCC  1184

Query 1182  CTCCATCCACCCTGTCCTCTCGGCCCTGAAGCTCTCCCCACAAGGCTATGCGTCTCCCGTCAGCCAGTCTCCAC  1255
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Sbjct 1185  CTCCATCCACCCTGTCCTCTCGGCCCTGAAGCTCTCCCCACAAGGCTATGCGTCTCCCGTCAGCCAGTCTCCAC  1258

Query 1256  AGACCAGCTCCAAGCAGGACTCTTGGAACAGCCTGGTCTTGGCCGACAGTCACGGGGACATAATCACTGCG  1326
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Sbjct 1259  AGACCAGCTCCAAGCAGGACTCTTGGAACAGCCTGGTCTTGGCCGACAGTCACGGGGACATAATCACTGCG  1329