Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_06291
• Subject: NM_010305.1
• Aligned Length: 1062
• Identities: 937
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGGCTGCACGCTGAGCGCCGAGGACAAGGCGGCGGTGGAGCGGAGTAAGATGATCGACCGCAACCTCCGTGA  74
            |||||||||||..|||||||.||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||
Sbjct    1  ATGGGCTGCACATTGAGCGCTGAGGACAAGGCGGCCGTGGAGCGCAGCAAGATGATCGACCGCAACCTCCGGGA  74

Query   75  GGACGGCGAGAAGGCGGCGCGCGAGGTCAAGCTGCTGCTGCTCGGTGCTGGTGAATCTGGTAAAAGTACAATTG  148
            |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||.|||||.||||
Sbjct   75  GGACGGCGAGAAGGCGGCGCGGGAGGTCAAGCTGCTGCTGCTGGGTGCTGGGGAATCTGGAAAGAGTACCATTG  148

Query  149  TGAAGCAGATGAAAATTATCCATGAAGCTGGTTATTCAGAAGAGGAGTGTAAACAATACAAAGCAGTGGTCTAC  222
            |||||||||||||.||||||||.|||||.||.||.||.||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||
Sbjct  149  TGAAGCAGATGAAGATTATCCACGAAGCCGGCTACTCGGAAGAGGAGTGTAAGCAGTACAAGGCAGTGGTCTAC  222

Query  223  AGTAACACCATCCAGTCAATTATTGCTATCATTAGGGCTATGGGGAGGTTGAAGATAGACTTTGGTGACTCAGC  296
            ||.|||||.||||||||.||.|||||.||||||||.||.||||||||||||||.||.|||||.||.|||||.||
Sbjct  223  AGCAACACTATCCAGTCCATCATTGCCATCATTAGAGCCATGGGGAGGTTGAAAATCGACTTCGGAGACTCTGC  296

Query  297  CCGGGCGGATGATGCACGCCAACTCTTTGTGCTAGCTGGAGCTGCTGAAGAAGGCTTTATGACTGCAGAACTTG  370
            .||||||||||||||.||||||||.||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||.|
Sbjct  297  TCGGGCGGATGATGCTCGCCAACTTTTCGTGCTTGCTGGGGCTGCAGAAGAAGGCTTTATGACTGCAGAGCTCG  370

Query  371  CTGGAGTTATAAAGAGATTGTGGAAAGATAGTGGTGTACAAGCCTGTTTCAACAGATCCCGAGAGTACCAGCTT  444
            |.||.||.|||||||||.||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.
Sbjct  371  CCGGTGTCATAAAGAGACTGTGGAAAGACAGTGGTGTGCAAGCCTGCTTCAACAGATCCCGGGAGTACCAGCTG  444

Query  445  AATGATTCTGCAGCATACTATTTGAATGACTTGGACAGAATAGCTCAACCAAATTACATCCCGACTCAACAAGA  518
            ||.|||||.|||||.||||||.||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||.||
Sbjct  445  AACGATTCGGCAGCGTACTATCTGAATGACTTGGACAGAATAGCACAGCCAAATTACATCCCAACTCAGCAGGA  518

Query  519  TGTTCTCAGAACTAGAGTGAAAACTACAGGAATTGTTGAAACCCATTTTACTTTCAAAGATCTTCATTTTAAAA  592
            |||.||||||||.||||||||.||.|||||.|||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGTCCTCAGAACCAGAGTGAAGACCACAGGGATTGTGGAAACCCACTTTACCTTCAAAGATCTTCATTTTAAAA  592

Query  593  TGTTTGATGTGGGAGGTCAGAGATCTGAGCGGAAGAAGTGGATTCATTGCTTCGAAGGAGTGGCGGCGATCATC  666
            |||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||.|||||.|||||.|||.|.||.||||||
Sbjct  593  TGTTTGACGTGGGAGGTCAGAGGTCAGAGCGGAAGAAGTGGATCCACTGCTTTGAAGGGGTGACCGCCATCATC  666

Query  667  TTCTGTGTAGCACTGAGTGACTACGACCTGGTTCTAGCTGAAGATGAAGAAATGAACCGAATGCATGAAAGCAT  740
            ||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||
Sbjct  667  TTCTGTGTGGCCCTGAGTGACTATGACCTGGTTCTTGCTGAAGATGAAGAAATGAACCGTATGCACGAGAGCAT  740

Query  741  GAAATTGTTTGACAGCATATGTAACAACAAGTGGTTTACAGATACATCCATTATACTTTTTCTAAACAAGAAGG  814
            |||..||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.|||||.||.||||||||||
Sbjct  741  GAAGCTGTTCGATAGCATCTGTAACAACAAGTGGTTTACAGACACGTCCATCATCCTTTTCCTCAACAAGAAGG  814

Query  815  ATCTTTTTGAAGAAAAAATCAAAAAGAGCCCTCTCACTATATGCTATCAAGAATATGCAGGATCAAACACATAT  888
            |.||.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||.|.||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  815  ACCTCTTCGAAGAAAAAATAAAAAAGAGCCCCCTCACGATATGCTACCCAGAATATGCAGGCTCAAACACATAT  888

Query  889  GAAGAGGCAGCTGCATATATTCAATGTCAGTTTGAAGACCTCAATAAAAGAAAGGACACAAAGGAAATATACAC  962
            |||||.||.||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||
Sbjct  889  GAAGAAGCGGCCGCGTATATTCAGTGTCAGTTTGAAGACCTCAATAAAAGGAAGGACACAAAGGAAATTTACAC  962

Query  963  CCACTTCACATGTGCCACAGATACTAAGAATGTGCAGTTTGTTTTTGATGCTGTAACAGATGTCATCATAAAAA  1036
            |||||||||.||.|||||||||||.|||||.||||||||.||.||.||||||||||||||.|||||||||||.|
Sbjct  963  CCACTTCACGTGCGCCACAGATACGAAGAACGTGCAGTTCGTGTTCGATGCTGTAACAGACGTCATCATAAAGA  1036

Query 1037  ATAATCTAAAAGATTGTGGTCTCTTT  1062
            ||||.||||||||.|||||||||||.
Sbjct 1037  ATAACCTAAAAGACTGTGGTCTCTTC  1062