Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_06291
- Subject:
- NM_010306.3
- Aligned Length:
- 1064
- Identities:
- 856
- Gaps:
- 4
Alignment
Query 1 ATGGGCTGCACGCTGAGCGCCGAGGACAAGGCGGCGGTGGAGCGGAGTAAGATGATCGACCGCAACCTCCGTGA 74
||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.|.||.||
Sbjct 1 ATGGGCTGCACGTTGAGCGCCGAGGACAAGGCGGCGGTGGAGCGGAGCAAGATGATCGACCGCAACTTGCGGGA 74
Query 75 GGACGGCGAGAAGGCGGCGCGCGAGGTCAAGCTGCTGCTGCTCGGTGCTGGTGAATCTGGTAAAAGTACAATTG 148
||||||.|||||.|||||....||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.|
Sbjct 75 GGACGGGGAGAAAGCGGCCAAAGAAGTGAAGCTGCTGCTGCTCGGCGCTGGAGAATCTGGTAAAAGTACCATCG 148
Query 149 TGAAGCAGATGAAAATTATCCATGAAGCTGGTTATTCAGAAGAGGAGTGTAAACAATACAAAGCAGTGGTCTAC 222
||||.|||||||||||.||.|||||.|..||.||||||||.||.||.||||||||.||.||||.|||.||||||
Sbjct 149 TGAAACAGATGAAAATCATTCATGAGGACGGCTATTCAGAGGACGAATGTAAACAGTATAAAGTAGTTGTCTAC 222
Query 223 AGTAACACCATCCAGTCAATTATTGCTATCATTAGGGCTATGGGGAGGTTGAAGATAGACTTTGGTGACTCAGC 296
||.||.||.||.|||||.||.|||||.|||||..|.||.|||||..||||||||||.||.|||||.||.||.||
Sbjct 223 AGCAATACTATTCAGTCCATCATTGCAATCATACGAGCCATGGGACGGTTGAAGATTGATTTTGGGGAATCTGC 296
Query 297 CCGGGCGGATGATGCACGCCAACTCTTTGTGCTAGCT-GGAGCTGCTGAAGAAGGCTTTATGACTGCAGAACTT 369
|.|.||.||||||||.||.||..|.|||||..||||| |||| ||||||||||||..|.||||||.|||||||.
Sbjct 297 CAGAGCAGATGATGCCCGACAGTTATTTGTTTTAGCTGGGAG-TGCTGAAGAAGGAGTCATGACTTCAGAACTA 369
Query 370 GCTGGAGTTATAAAGAGATTGTGGAAAGATAGTGGTGTACAAGCCTGTTTCAACAGATCCCGAGAGTACCAGCT 443
||.||.||.||.||..|.||.|||..||||.|.||.|||||.||.||.||.|.|||.|||.|.||.||.|||||
Sbjct 370 GCAGGCGTGATTAAACGTTTATGGCGAGATGGCGGGGTACAGGCATGCTTTAGCAGGTCCAGGGAATATCAGCT 443
Query 444 TAATGATTCTGCAGCATACTATTTGAATGACTTGGACAGAATAGCTCA-ACCAAATTACATCCCGACTCAACAA 516
.|||||||||||..|||||||..|.|||||.|||||.||||||.|.|| ||| ||.|||||.||.|||||.|||
Sbjct 444 CAATGATTCTGCTTCATACTACCTAAATGATTTGGATAGAATATCCCAGACC-AACTACATTCCAACTCAGCAA 516
Query 517 GATGTTCTCAGAACTAGAGTGAAAACTACAGGAATTGTTGAAACCCATTTTACTTTCAAAGATCTTCATTTTAA 590
||||||||..|.||.||||||||.||||||||.|||||.||.|||||.||.||.|||||.||.||..|.||.||
Sbjct 517 GATGTTCTTCGGACAAGAGTGAAGACTACAGGCATTGTGGAGACCCACTTCACCTTCAAGGAACTCTACTTCAA 590
Query 591 AATGTTTGATGTGGGAGGTCAGAGATCTGAGCGGAAGAAGTGGATTCATTGCTTCGAAGGAGTGGCGGCGATCA 664
||||||||||||.||.||.||.|||||.||.||.||.|||||||||||.||.||.||.||||||.|.||.||.|
Sbjct 591 AATGTTTGATGTAGGTGGCCAAAGATCCGAACGAAAAAAGTGGATTCACTGTTTTGAGGGAGTGACAGCAATTA 664
Query 665 TCTTCTGTGTAGCACTGAGTGACTACGACCTGGTTCTAGCTGAAGATGAAGAAATGAACCGAATGCATGAAAGC 738
||||.|||||.||.||.|||||.||||||||.|||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 665 TCTTTTGTGTGGCTCTCAGTGATTACGACCTTGTTCTGGCTGAGGATGAGGAAATGAACCGAATGCATGAAAGC 738
Query 739 ATGAAATTGTTTGACAGCATATGTAACAACAAGTGGTTTACAGATACATCCATTATACTTTTTCTAAACAAGAA 812
||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.||.||.||.||.|||||.||.|||||
Sbjct 739 ATGAAATTGTTTGACAGCATTTGTAACAACAAATGGTTTACAGACACTTCAATCATTCTCTTTCTTAATAAGAA 812
Query 813 GGATCTTTTTGAAGAAAAAATCAAAAAGAGCCCTCTCACTATATGCTATCAAGAATATGCAGGATCAAACACAT 886
.||.||||||||.||||||||.||.|.|||.||..|.||.||.||.||||.||||||..||||.||.||.||||
Sbjct 813 AGACCTTTTTGAGGAAAAAATAAAGAGGAGTCCATTAACAATCTGTTATCCAGAATACACAGGTTCCAATACAT 886
Query 887 ATGAAGAGGCAGCTGCATATATTCAATGTCAGTTTGAAGACCTCAATAAAAGAAAGGACACAAAGGAAATATAC 960
|.||||||||||||||.||.|||||.||.|||||||||||.||.||...||||||.||.||.|||||..|.|||
Sbjct 887 ACGAAGAGGCAGCTGCTTACATTCAGTGCCAGTTTGAAGATCTGAACCGAAGAAAAGATACCAAGGAGGTCTAC 960
Query 961 ACCCACTTCACATGTGCCACAGATACTAAGAATGTGCAGTTTGTTTTTGATGCTGTAACAGATGTCATCATAAA 1034
||.||||||||.|||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||
Sbjct 961 ACTCACTTCACCTGTGCCACAGACACCAAAAATGTGCAGTTTGTTTTTGATGCTGTTACGGATGTCATCATTAA 1034
Query 1035 AAATAATCTAAAAGATTGTGGTCTCTTT 1062
|||.||..||||.||.|||||.||.|.|
Sbjct 1035 AAACAACTTAAAGGAATGTGGGCTTTAT 1062