Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_06321
- Subject:
- NM_001004056.2
- Aligned Length:
- 1734
- Identities:
- 1637
- Gaps:
- 96
Alignment
Query 1 ATGGAGCTCGAGAACATCGTGGCCAACTCGCTGCTGCTGAAAGCGCGTCAAGGAGGATATGGCAAAAAAAGTGG 74
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGAGCTCGAGAACATCGTGGCCAACTCGCTGCTGCTGAAAGCGCGTCAA----------------------- 51
Query 75 TCGTAGTAAAAAATGGAAGGAGATACTGACACTGCCTCCTGTCAGCCAGTGCAGTGAGCTTAGACATTCCATTG 148
|
Sbjct 52 -------------------------------------------------------------------------G 52
Query 149 AAAAGGATTATAGCAGTCTTTGTGACAAGCAACCGATAGGAAGACGTCTCTTCAGGCAGTTCTGTGATACCAAA 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 53 AAAAGGATTATAGCAGTCTTTGTGACAAGCAACCGATAGGAAGACGTCTCTTCAGGCAGTTCTGTGATACCAAA 126
Query 223 CCCACTCTAAAGAGGCACATTGAATTCTTGGATGCAGTGGCAGAATATGAAGTTGCCGATGATGAGGACCGAAG 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 127 CCCACTCTAAAGAGGCACATTGAATTCTTGGATGCAGTGGCAGAATATGAAGTTGCCGATGATGAGGACCGAAG 200
Query 297 TGATTGTGGACTGTCAATCTTAGATAGATTCTTCAATGATAAGTTGGCAGCCCCTTTACCAGAAATACCTCCAG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 201 TGATTGTGGACTGTCAATCTTAGATAGATTCTTCAATGATAAGTTGGCAGCCCCTTTACCAGAAATACCTCCAG 274
Query 371 ATGTTGTGACAGAATGTAGATTGGGACTGAAGGAGGAGAACCCTTCCAAAAAAGCCTTTGAGGAATGTACTAGA 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 275 ATGTTGTGACAGAATGTAGATTGGGACTGAAGGAGGAGAACCCTTCCAAAAAAGCCTTTGAGGAATGTACTAGA 348
Query 445 GTTGCCCATAACTACCTAAGAGGGGAACCATTTGAAGAATACCAAGAAAGCTCATATTTTTCTCAGTTTTTACA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 349 GTTGCCCATAACTACCTAAGAGGGGAACCATTTGAAGAATACCAAGAAAGCTCATATTTTTCTCAGTTTTTACA 422
Query 519 ATGGAAATGGCTGGAAAGGCAACCCGTAACAAAGAACACATTTAGACATTACAGAGTTCTAGGAAAAGGCGGAT 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 423 ATGGAAATGGCTGGAAAGGCAACCCGTAACAAAGAACACATTTAGACATTACAGAGTTCTAGGAAAAGGCGGAT 496
Query 593 TTGGAGAGGTTTGCGCCTGTCAAGTGCGAGCCACAGGAAAAATGTATGCCTGCAAAAAGCTACAAAAAAAAAGA 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 497 TTGGAGAGGTTTGCGCCTGTCAAGTGCGAGCCACAGGAAAAATGTATGCCTGCAAAAAGCTACAAAAAAAAAGA 570
Query 667 ATAAAGAAGAGGAAAGGTGAAGCTATGGCTCTAAATGAGAAAAGAATTCTGGAGAAAGTGCAAAGTAGATTCGT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 571 ATAAAGAAGAGGAAAGGTGAAGCTATGGCTCTAAATGAGAAAAGAATTCTGGAGAAAGTGCAAAGTAGATTCGT 644
Query 741 AGTTAGTTTAGCCTACGCTTATGAAACCAAAGATGCCTTGTGCTTGGTGCTCACCATTATGAATGGAGGGGATT 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 645 AGTTAGTTTAGCCTACGCTTATGAAACCAAAGATGCCTTGTGCTTGGTGCTCACCATTATGAATGGAGGGGATT 718
Query 815 TGAAGTTTCACATTTACAACCTGGGCAATCCCGGCTTTGATGAGCAGAGAGCCGTTTTCTATGCTGCAGAGCTG 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 719 TGAAGTTTCACATTTACAACCTGGGCAATCCCGGCTTTGATGAGCAGAGAGCCGTTTTCTATGCTGCAGAGCTG 792
Query 889 TGTTGCGGCTTGGAAGATTTACAGAGGGAAAGAATTGTATACAGAGACTTGAAGCCTGAGAATATTCTCCTTGA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 793 TGTTGCGGCTTGGAAGATTTACAGAGGGAAAGAATTGTATACAGAGACTTGAAGCCTGAGAATATTCTCCTTGA 866
Query 963 TGATCGTGGACACATCCGGATTTCAGACCTCGGTTTGGCCACAGAGATCCCAGAAGGACAGAGGGTTCGAGGAA 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 867 TGATCGTGGACACATCCGGATTTCAGACCTCGGTTTGGCCACAGAGATCCCAGAAGGACAGAGGGTTCGAGGAA 940
Query 1037 GAGTTGGAACAGTCGGCTACATGGCACCTGAAGTTGTCAATAATGAAAAGTATACGTTTAGTCCCGATTGGTGG 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 941 GAGTTGGAACAGTCGGCTACATGGCACCTGAAGTTGTCAATAATGAAAAGTATACGTTTAGTCCCGATTGGTGG 1014
Query 1111 GGACTTGGCTGTCTGATCTATGAAATGATTCAGGGACATTCTCCATTCAAAAAATACAAAGAGAAAGTCAAATG 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1015 GGACTTGGCTGTCTGATCTATGAAATGATTCAGGGACATTCTCCATTCAAAAAATACAAAGAGAAAGTCAAATG 1088
Query 1185 GGAGGAGGTCGATCAAAGAATCAAGAATGATACCGAGGAGTATTCTGAGAAGTTTTCAGAGGATGCCAAATCTA 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1089 GGAGGAGGTCGATCAAAGAATCAAGAATGATACCGAGGAGTATTCTGAGAAGTTTTCAGAGGATGCCAAATCTA 1162
Query 1259 TCTGCAGGATGTTACTCACCAAGAATCCAAGCAAGCGGCTGGGCTGCAGGGGCGAGGGAGCGGCTGGGGTGAAG 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1163 TCTGCAGGATGTTACTCACCAAGAATCCAAGCAAGCGGCTGGGCTGCAGGGGCGAGGGAGCGGCTGGGGTGAAG 1236
Query 1333 CAGCACCCCGTGTTCAAGGACATCAACTTCAGGAGGCTGGAGGCAAACATGCTGGAGCCCCCTTTCTGTCCTGA 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1237 CAGCACCCCGTGTTCAAGGACATCAACTTCAGGAGGCTGGAGGCAAACATGCTGGAGCCCCCTTTCTGTCCTGA 1310
Query 1407 TCCTCATGCCGTTTACTGTAAGGACGTCCTGGATATCGAGCAGTTCTCGGCGGTGAAAGGGATCTACCTGGACA 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1311 TCCTCATGCCGTTTACTGTAAGGACGTCCTGGATATCGAGCAGTTCTCGGTGGTGAAAGGGATCTACCTGGACA 1384
Query 1481 CCGCAGATGAAGACTTCTATGCTCGGTTTGCTACCGGGTGTGTCTCCATCCCCTGGCAGAATGAGATGATCGAA 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1385 CCGCAGATGAAGACTTCTATGCTCGGTTTGCTACCGGGTGTGTCTCCATCCCCTGGCAGAATGAGATGATCGAA 1458
Query 1555 TCTGGGTGTTTCAAAGACATCAACAAAAGTGAAAGTGAGGAAGCTTTGCCATTAGATCTAGACAAGAACATACA 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1459 TCTGGGTGTTTCAAAGACATCAACAAAAGTGAAAGTGAGGAAGCTTTGCCATTAGATCTAGACAAGAACATACA 1532
Query 1629 TACCCCGGTTTCCAGACCAAACAGAGGCTTCTTCTATAGACTCTTCAGAAGAGGGGGCTGCCTGACCATGGTCC 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1533 TACCCCGGTTTCCAGACCAAACAGAGGCTTCTTCTATAGACTCTTCAGAAGAGGGGGCTGCCTGACCATGGTCC 1606
Query 1703 CCAGTGAGAAGGAAGTGGAACCCAAGCAATGC 1734
||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1607 CCAGTGAGAAGGAAGTGGAACCCAAGCAATGC 1638