Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_06321
• Subject: NM_001004057.2
• Aligned Length: 1734
• Identities: 1595
• Gaps: 138

Alignment

Query    1  ATGGAGCTCGAGAACATCGTGGCCAACTCGCTGCTGCTGAAAGCGCGTCAAGGAGGATATGGCAAAAAAAGTGG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAGCTCGAGAACATCGTGGCCAACTCGCTGCTGCTGAAAGCGCGTCAAGGAGGATATGGCAAAAAAAGTGG  74

Query   75  TCGTAGTAAAAAATGGAAGGAGATACTGACACTGCCTCCTGTCAGCCAGTGCAGTGAGCTTAGACATTCCATTG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TCGTAGTAAAAAATGGAAGGAGATACTGACACTGCCTCCTGTCAGCCAGTGCAGTGAGCTTAGACATTCCATTG  148

Query  149  AAAAGGATTATAGCAGTCTTTGTGACAAGCAACCGATAGGAAGACGTCTCTTCAGGCAGTTCTGTGATACCAAA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AAAAGGATTATAGCAGTCTTTGTGACAAGCAACCGATAGGAAGACGTCTCTTCAGGCAGTTCTGTGATACCAAA  222

Query  223  CCCACTCTAAAGAGGCACATTGAATTCTTGGATGCAGTGGCAGAATATGAAGTTGCCGATGATGAGGACCGAAG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CCCACTCTAAAGAGGCACATTGAATTCTTGGATGCAGTGGCAGAATATGAAGTTGCCGATGATGAGGACCGAAG  296

Query  297  TGATTGTGGACTGTCAATCTTAGATAGATTCTTCAATGATAAGTTGGCAGCCCCTTTACCAGAAATACCTCCAG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGATTGTGGACTGTCAATCTTAGATAGATTCTTCAATGATAAGTTGGCAGCCCCTTTACCAGAAATACCTCCAG  370

Query  371  ATGTTGTGACAGAATGTAGATTGGGACTGAAGGAGGAGAACCCTTCCAAAAAAGCCTTTGAGGAATGTACTAGA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ATGTTGTGACAGAATGTAGATTGGGACTGAAGGAGGAGAACCCTTCCAAAAAAGCCTTTGAGGAATGTACTAGA  444

Query  445  GTTGCCCATAACTACCTAAGAGGGGAACCATTTGAAGAATACCAAGAAAGCTCATATTTTTCTCAGTTTTTACA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GTTGCCCATAACTACCTAAGAGGGGAACCATTTGAAGAATACCAAGAAAGCTCATATTTTTCTCAGTTTTTACA  518

Query  519  ATGGAAATGGCTGGAAAGGCAACCCGTAACAAAGAACACATTTAGACATTACAGAGTTCTAGGAAAAGGCGGAT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  ATGGAAATGGCTGGAAAGGCAACCCGTAACAAAGAACACATTTAGACATTACAGAGTTCTAGGAAAAGGCGGAT  592

Query  593  TTGGAGAGGTTTGCGCCTGTCAAGTGCGAGCCACAGGAAAAATGTATGCCTGCAAAAAGCTACAAAAAAAAAGA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TTGGAGAGGTTTGCGCCTGTCAAGTGCGAGCCACAGGAAAAATGTATGCCTGCAAAAAGCTACAAAAAAAAAGA  666

Query  667  ATAAAGAAGAGGAAAGGTGAAGCTATGGCTCTAAATGAGAAAAGAATTCTGGAGAAAGTGCAAAGTAGATTCGT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ATAAAGAAGAGGAAAGGTGAAGCTATGGCTCTAAATGAGAAAAGAATTCTGGAGAAAGTGCAAAGTAGATTCGT  740

Query  741  AGTTAGTTTAGCCTACGCTTATGAAACCAAAGATGCCTTGTGCTTGGTGCTCACCATTATGAATGGAGGGGATT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AGTTAGTTTAGCCTACGCTTATGAAACCAAAGATGCCTTGTGCTTGGTGCTCACCATTATGAATGGAGGGGATT  814

Query  815  TGAAGTTTCACATTTACAACCTGGGCAATCCCGGCTTTGATGAGCAGAGAGCCGTTTTCTATGCTGCAGAGCTG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TGAAGTTTCACATTTACAACCTGGGCAATCCCGGCTTTGATGAGCAGAGAGCCGTTTTCTATGCTGCAGAGCTG  888

Query  889  TGTTGCGGCTTGGAAGATTTACAGAGGGAAAGAATTGTATACAGAGACTTGAAGCCTGAGAATATTCTCCTTGA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TGTTGCGGCTTGGAAGATTTACAGAGGGAAAGAATTGTATACAGAGACTTGAAGCCTGAGAATATTCTCCTTGA  962

Query  963  TGATCGTGGACACATCCGGATTTCAGACCTCGGTTTGGCCACAGAGATCCCAGAAGGACAGAGGGTTCGAGGAA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TGATCGTGGACACATCCGGATTTCAGACCTCGGTTTGGCCACAGAGATCCCAGAAGGACAGAGGGTTCGAGGAA  1036

Query 1037  GAGTTGGAACAGTCGGCTACATGGCACCTGAAGTTGTCAATAATGAAAAGTATACGTTTAGTCCCGATTGGTGG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GAGTTGGAACAGTCGGCTACATGGCACCTGAAGTTGTCAATAATGAAAAGTATACGTTTAGTCCCGATTGGTGG  1110

Query 1111  GGACTTGGCTGTCTGATCTATGAAATGATTCAGGGACATTCTCCATTCAAAAAATACAAAGAGAAAGTCAAATG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GGACTTGGCTGTCTGATCTATGAAATGATTCAGGGACATTCTCCATTCAAAAAATACAAAGAGAAAGTCAAATG  1184

Query 1185  GGAGGAGGTCGATCAAAGAATCAAGAATGATACCGAGGAGTATTCTGAGAAGTTTTCAGAGGATGCCAAATCTA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GGAGGAGGTCGATCAAAGAATCAAGAATGATACCGAGGAGTATTCTGAGAAGTTTTCAGAGGATGCCAAATCTA  1258

Query 1259  TCTGCAGGATGTTACTCACCAAGAATCCAAGCAAGCGGCTGGGCTGCAGGGGCGAGGGAGCGGCTGGGGTGAAG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TCTGCAGGATGTTACTCACCAAGAATCCAAGCAAGCGGCTGGGCTGCAGGGGCGAGGGAGCGGCTGGGGTGAAG  1332

Query 1333  CAGCACCCCGTGTTCAAGGACATCAACTTCAGGAGGCTGGAGGCAAACATGCTGGAGCCCCCTTTCTGTCCTGA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CAGCACCCCGTGTTCAAGGACATCAACTTCAGGAGGCTGGAGGCAAACATGCTGGAGCCCCCTTTCTGTCCTGA  1406

Query 1407  TCCTCATGCCGTTTACTGTAAGGACGTCCTGGATATCGAGCAGTTCTCGGCGGTGAAAGGGATCTACCTGGACA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TCCTCATGCCGTTTACTGTAAGGACGTCCTGGATATCGAGCAGTTCTCGGTGGTGAAAGGGATCTACCTGGACA  1480

Query 1481  CCGCAGATGAAGACTTCTATGCTCGGTTTGCTACCGGGTGTGTCTCCATCCCCTGGCAGAATGAGATGATCGAA  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          
Sbjct 1481  CCGCAGATGAAGACTTCTATGCTCGGTTTGCTACCGGGTGTGTCTCCATCCCCTGGCAGAATGA----------  1544

Query 1555  TCTGGGTGTTTCAAAGACATCAACAAAAGTGAAAGTGAGGAAGCTTTGCCATTAGATCTAGACAAGAACATACA  1628
                                                                                      
Sbjct 1545  --------------------------------------------------------------------------  1544

Query 1629  TACCCCGGTTTCCAGACCAAACAGAGGCTTCTTCTATAGACTCTTCAGAAGAGGGGGCTGCCTGACCATGGTCC  1702
                                                                  ||||||||||||||||||||
Sbjct 1545  ------------------------------------------------------GGGCTGCCTGACCATGGTCC  1564

Query 1703  CCAGTGAGAAGGAAGTGGAACCCAAGCAATGC  1734
            ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1565  CCAGTGAGAAGGAAGTGGAACCCAAGCAATGC  1596