Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_06321
• Subject: XM_017008053.1
• Aligned Length: 1851
• Identities: 1643
• Gaps: 207

Alignment

Query    1  ATGGAGCTCGAGAACATCGTGGCCAACTCGCTGCTGCTGAAAGCGCGTCAAGGAGGATATGGCAAAAAAAGTGG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAGCTCGAGAACATCGTGGCCAACTCGCTGCTGCTGAAAGCGCGTCAAGGAGGATATGGCAAAAAAAGTGG  74

Query   75  TCGTAGTAAAAAATGGAAGGAGATACTGACACTGCCTCCTGTCAGCCAGTGCAGTGAGCTTAGACATTCCATTG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TCGTAGTAAAAAATGGAAGGAGATACTGACACTGCCTCCTGTCAGCCAGTGCAGTGAGCTTAGACATTCCATTG  148

Query  149  AAAAGGATTATAGCAGTCTTTGTGACAAGCAACCGATAGGAAGACGTCTCTTCAGGCAGTTCTGTGATACCAAA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AAAAGGATTATAGCAGTCTTTGTGACAAGCAACCGATAGGAAGACGTCTCTTCAGGCAGTTCTGTGATACCAAA  222

Query  223  CCCACTCTAAAGAGGCACATTGAATTCTTGGATGCAGTGGCAGAATATGAAGTTGCCGATGATGAGGACCGAAG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CCCACTCTAAAGAGGCACATTGAATTCTTGGATGCAGTGGCAGAATATGAAGTTGCCGATGATGAGGACCGAAG  296

Query  297  TGATTGTGGACTGTCAATCTTAGATAGATTCTTCAATGATAAGTTGGCAGCCCCTTTACCAGAAATACCTCCAG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGATTGTGGACTGTCAATCTTAGATAGATTCTTCAATGATAAGTTGGCAGCCCCTTTACCAGAAATACCTCCAG  370

Query  371  ATGTTGTGACAGAATGTAGATTGGGACTGAAGGAGGAGAACCCTTCCAAAAAAGCCTTTGAGGAATGTACTAGA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ATGTTGTGACAGAATGTAGATTGGGACTGAAGGAGGAGAACCCTTCCAAAAAAGCCTTTGAGGAATGTACTAGA  444

Query  445  GTTGCCCATAACTACCTAAGAGGGGAACCATTTGAAGAATACCAAGAAAGCTCATATTTTTCTCAGTTTTTACA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GTTGCCCATAACTACCTAAGAGGGGAACCATTTGAAGAATACCAAGAAAGCTCATATTTTTCTCAGTTTTTACA  518

Query  519  ATGGAAATGGCTGGAAAGGCAACCCGTAACAAAGAACACATTTAGACATTACAGAGTTCTAGGAAAAGGCGGAT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  ATGGAAATGGCTGGAAAGGCAACCCGTAACAAAGAACACATTTAGACATTACAGAGTTCTAGGAAAAGGCGGAT  592

Query  593  TTGGAGAG------------------------------------------------------------------  600
            ||||||||                                                                  
Sbjct  593  TTGGAGAGCAGTCCCCTGTGGGGTGTGCAGTGGATGGGAGTTGGAAGAAACAGCAGCCTAATGTTGATGACACA  666

Query  601  ---------------------------------------------------GTTTGCGCCTGTCAAGTGCGAGC  623
                                                               |||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GAGGCACGGGGACCAGAACCTGAGGCTCATGATACTATTTTTTCCACTTTTGTTTGCGCCTGTCAAGTGCGAGC  740

Query  624  CACAGGAAAAATGTATGCCTGCAAAAAGCTACAAAAAAAAAGAATAAAGAAGAGGAAAGGTGAAGCTATGGCTC  697
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CACAGGAAAAATGTATGCCTGCAAAAAGCTACAAAAAAAAAGAATAAAGAAGAGGAAAGGTGAAGCTATGGCTC  814

Query  698  TAAATGAGAAAAGAATTCTGGAGAAAGTGCAAAGTAGATTCGTAGTTAGTTTAGCCTACGCTTATGAAACCAAA  771
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TAAATGAGAAAAGAATTCTGGAGAAAGTGCAAAGTAGATTCGTAGTTAGTTTAGCCTACGCTTATGAAACCAAA  888

Query  772  GATGCCTTGTGCTTGGTGCTCACCATTATGAATGGAGGGGATTTGAAGTTTCACATTTACAACCTGGGCAATCC  845
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GATGCCTTGTGCTTGGTGCTCACCATTATGAATGGAGGGGATTTGAAGTTTCACATTTACAACCTGGGCAATCC  962

Query  846  CGGCTTTGATGAGCAGAGAGCCGTTTTCTATGCTGCAGAGCTGTGTTGCGGCTTGGAAGATTTACAGAGGGAAA  919
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CGGCTTTGATGAGCAGAGAGCCGTTTTCTATGCTGCAGAGCTGTGTTGCGGCTTGGAAGATTTACAGAGGGAAA  1036

Query  920  GAATTGTATACAGAGACTTGAAGCCTGAGAATATTCTCCTTGATGATCGTGGACACATCCGGATTTCAGACCTC  993
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                        
Sbjct 1037  GAATTGTATACAGAGACTTGAAGCCTGAGAATATTCTCCTTGATGATCGT------------------------  1086

Query  994  GGTTTGGCCACAGAGATCCCAGAAGGACAGAGGGTTCGAGGAAGAGTTGGAACAGTCGGCTACATGGCACCTGA  1067
                                                                              ||||||||
Sbjct 1087  ------------------------------------------------------------------GCACCTGA  1094

Query 1068  AGTTGTCAATAATGAAAAGTATACGTTTAGTCCCGATTGGTGGGGACTTGGCTGTCTGATCTATGAAATGATTC  1141
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1095  AGTTGTCAATAATGAAAAGTATACGTTTAGTCCCGATTGGTGGGGACTTGGCTGTCTGATCTATGAAATGATTC  1168

Query 1142  AGGGACATTCTCCATTCAAAAAATACAAAGAGAAAGTCAAATGGGAGGAGGTCGATCAAAGAATCAAGAATGAT  1215
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1169  AGGGACATTCTCCATTCAAAAAATACAAAGAGAAAGTCAAATGGGAGGAGGTCGATCAAAGAATCAAGAATGAT  1242

Query 1216  ACCGAGGAGTATTCTGAGAAGTTTTCAGAGGATGCCAAATCTATCTGCAGGATGTTACTCACCAAGAATCCAAG  1289
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1243  ACCGAGGAGTATTCTGAGAAGTTTTCAGAGGATGCCAAATCTATCTGCAGGATGTTACTCACCAAGAATCCAAG  1316

Query 1290  CAAGCGGCTGGGCTGCAGGGGCGAGGGAGCGGCTGGGGTGAAGCAGCACCCCGTGTTCAAGGACATCAACTTCA  1363
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1317  CAAGCGGCTGGGCTGCAGGGGCGAGGGAGCGGCTGGGGTGAAGCAGCACCCCGTGTTCAAGGACATCAACTTCA  1390

Query 1364  GGAGGCTGGAGGCAAACATGCTGGAGCCCCCTTTCTGTCCTGATCCTCATGCCGTTTACTGTAAGGACGTCCTG  1437
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1391  GGAGGCTGGAGGCAAACATGCTGGAGCCCCCTTTCTGTCCTGATCCTCATGCCGTTTACTGTAAGGACGTCCTG  1464

Query 1438  GATATCGAGCAGTTCTCGGCGGTGAAAGGGATCTACCTGGACACCGCAGATGAAGACTTCTATGCTCGGTTTGC  1511
            |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1465  GATATCGAGCAGTTCTCGGTGGTGAAAGGGATCTACCTGGACACCGCAGATGAAGACTTCTATGCTCGGTTTGC  1538

Query 1512  TACCGGGTGTGTCTCCATCCCCTGGCAGAATGAGATGATCGAATCTGGGTGTTTCAAAGACATCAACAAAAGTG  1585
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1539  TACCGGGTGTGTCTCCATCCCCTGGCAGAATGAGATGATCGAATCTGGGTGTTTCAAAGACATCAACAAAAGTG  1612

Query 1586  AAAGTGAGGAAGCTTTGCCATTAGATCTAGACAAGAACATACATACCCCGGTTTCCAGACCAAACAGAGGCTTC  1659
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1613  AAAGTGAGGAAGCTTTGCCATTAGATCTAGACAAGAACATACATACCCCGGTTTCCAGACCAAACAGAGGCTTC  1686

Query 1660  TTCTATAGACTCTTCAGAAGAGGGGGCTGCCTGACCATGGTCCCCAGTGAGAAGGAAGTGGAACCCAAGCAATG  1733
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1687  TTCTATAGACTCTTCAGAAGAGGGGGCTGCCTGACCATGGTCCCCAGTGAGAAGGAAGTGGAACCCAAGCAATG  1760

Query 1734  C  1734
            |
Sbjct 1761  C  1761