Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_06376
• Subject: NM_001243042.1
• Aligned Length: 1108
• Identities: 925
• Gaps: 59

Alignment

Query    1  AT---GGTAGATG-------GAACCCTCCTTTTACTCCTCTC-GGAGGCCCTGGCCCTTACCCAGACCTGGGCG  63
            ||   ||| .|||       ||.|||||||..|.||.||||| ||||| |||||||||.|||.||||||||||.
Sbjct    1  ATGCGGGT-CATGGCGCCCCGAGCCCTCCTCCTGCTGCTCTCGGGAGG-CCTGGCCCTGACCGAGACCTGGGCC  72

Query   64  GGCTCCCACTCCTTGAAGTATTTCCACACTTCCGTGTCCCGGCCCGGCCGCGGGGAGCCCCGCTTCATCTCTGT  137
            .|||||||||||.|||.|||||||.||||..||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||
Sbjct   73  TGCTCCCACTCCATGAGGTATTTCGACACCGCCGTGTCCCGGCCCGGCCGCGGAGAGCCCCGCTTCATCTCAGT  146

Query  138  GGGCTACGTGGACGACACCCAGTTCGTGCGCTTCGACAACGACGCCGCGAGTCCGAGGATGGTGCCGCGGGCGC  211
            ||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||.||||||||||||||||||...||.|||||||||||
Sbjct  147  GGGCTACGTGGACGACACGCAGTTCGTGCGGTTCGACAGCGACGCCGCGAGTCCGAGAGGGGAGCCGCGGGCGC  220

Query  212  CGTGGATGGAGCAGGAGGGGTCAGAGTATTGGGACCGGGAGACACGG-------AGCGCCAGGGACACCGCACA  278
            |||||.||||||||||||||.|.||||||||||||||||||||||.|       ||||||||       |||||
Sbjct  221  CGTGGGTGGAGCAGGAGGGGCCGGAGTATTGGGACCGGGAGACACAGAACTACAAGCGCCAG-------GCACA  287

Query  279  GATTTTCCGAGTGAACCTGCGGACGCTGCGCGGCTACTACAATCAGAGCGAGGCCGGGTCTCACACCCTGCAGT  352
            |..|..||||||||.||||||||..|||||||||||||||||.||||||||||.|||||||||||||||.|||.
Sbjct  288  GGCTGACCGAGTGAGCCTGCGGAACCTGCGCGGCTACTACAACCAGAGCGAGGACGGGTCTCACACCCTCCAGA  361

Query  353  GGATGCATGGCTGCGAGCTGGGGCCCGACAGGCGCTTCCTCCGCGGGTATGAACAGTTCGCCTACGACGGCAAG  426
            |||||.||||||||||.||||||||||||.|||||.||||||||||||||||.||||.||||||||||||||||
Sbjct  362  GGATGTATGGCTGCGACCTGGGGCCCGACGGGCGCCTCCTCCGCGGGTATGACCAGTCCGCCTACGACGGCAAG  435

Query  427  GATTATCTCACCCTGAATGAGGACCTGCGCTCCTGGACCGCGGTGGACACGGCGGCTCAGATCTCCGAGCAAAA  500
            |||||..||.|||||||.|||||||||||||||||||||||.|.||||||.||||||||||||.||.|||..||
Sbjct  436  GATTACATCGCCCTGAACGAGGACCTGCGCTCCTGGACCGCCGCGGACACCGCGGCTCAGATCACCCAGCGCAA  509

Query  501  GTCAAATGATGCCTCTGAGGCGGAGCACCAGAGAGCCTACCTGGAAGACACATGCGTGGAGTGGCTCCACAAAT  574
            ||...|.|..|||..||.|||||||||.|.|||||||||||||||.|.|||.||||||||||||||||.||.||
Sbjct  510  GTTGGAGGCGGCCCGTGCGGCGGAGCAGCTGAGAGCCTACCTGGAGGGCACGTGCGTGGAGTGGCTCCGCAGAT  583

Query  575  ACCTGGAGAAGGGGAAGGAGACGCTGCTTCACCTGGAGCCCCCAAAGACACACGTGACTCACCACCCCATCTCT  648
            ||||||||||.||||||||||||||||..|.|...||.||||||||||||||||||||.|||||||||.|||||
Sbjct  584  ACCTGGAGAACGGGAAGGAGACGCTGCAGCGCGCAGAACCCCCAAAGACACACGTGACCCACCACCCCCTCTCT  657

Query  649  GACCATGAGGCCACCCTGAGGTGCTGGGCCCTGGGCTTCTACCCTGCGGAGATCACACTGACCTGGCAGCAGGA  722
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  658  GACCATGAGGCCACCCTGAGGTGCTGGGCCCTGGGCTTCTACCCTGCGGAGATCACACTGACCTGGCAGCGGGA  731

Query  723  TGGGGAGGGCCATACCCAGGACACGGAGCTCGTGGAGACCAGGCCTGCAGGGGATGGAACCTTCCAGAAGTGGG  796
            ||||||||.|||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  732  TGGGGAGGACCAGACCCAGGACACCGAGCTTGTGGAGACCAGGCCAGCAGGAGATGGAACCTTCCAGAAGTGGG  805

Query  797  CAGCTGTGGTGGTGCCTTCTGGAGAGGAGCAGAGATACACGTGCCATGTGCAGCATGAGGGGCTACCCGAGCCC  870
            |||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||||||||||||.|||||||.||||||||.|..||||||
Sbjct  806  CAGCTGTGGTGGTGCCTTCTGGACAAGAGCAGAGATACACGTGCCATATGCAGCACGAGGGGCTGCAAGAGCCC  879

Query  871  GTCACCCTGAGATGGAAGCCGGCTTCCCAGCCCACCATCCCCATCGTGGGCATCATTGCTGGCCTGGTTCTCCT  944
            .||||||||||.|||.||||..|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||.|.||| 
Sbjct  880  CTCACCCTGAGCTGGGAGCCATCTTCCCAGCCCACCATCCCCATCATGGGCATCGTTGCTGGCCTGGCTGTCC-  952

Query  945  TGGATCT----GTGGTCTCTGGAGCTGTGGTTGCTGCTGTGATATGGAGGAAGAAGAGCTCAGGTGGAAAAGGA  1014
            |||.|.|    |..|||..||||||||||||..|.|||.||||.||.||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  953  TGGTTGTCCTAGCTGTCCTTGGAGCTGTGGTCACCGCTATGATGTGTAGGAGGAAGAGCTCAGGTGGAAAAGGA  1026

Query 1015  GGGAGCTACTCTAAGGCTGAGTGGAGCGACAGTGCCCAGGGGTCT---------------------------  1059
            |||||||.||||.||||||.|||.|||.|||||||||||||.|||                           
Sbjct 1027  GGGAGCTGCTCTCAGGCTGCGTGCAGCAACAGTGCCCAGGGCTCTGATGAGTCTCTCATCACTTGTAAAGCC  1098