Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_06377
• Subject: NM_018950.2
• Aligned Length: 1326
• Identities: 1036
• Gaps: 288

Alignment

Query    1  ATGGCGCCCCGAAGCCTCCTCCTGCTGCTCTCAGGGGCCCTGGCCCTGACCGATACTTGGGCAGGCTCCCACTC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGCCCCGAAGCCTCCTCCTGCTGCTCTCAGGGGCCCTGGCCCTGACCGATACTTGGGCGGGCTCCCACTC  74

Query   75  CTTGAGGTATTTCAGCACCGCTGTGTCGCGGCCCGGCCGCGGGGAGCCCCGCTACATCGCCGTGGAGTACGTAG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CTTGAGGTATTTCAGCACCGCTGTGTCGCGGCCCGGCCGCGGGGAGCCCCGCTACATCGCCGTGGAGTACGTAG  148

Query  149  ACGACACGCAATTCCTGCGGTTCGACAGCGACGCCGCGATTCCGAGGATGGAGCCGCGGGAGCCGTGGGTGGAG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ACGACACGCAATTCCTGCGGTTCGACAGCGACGCCGCGATTCCGAGGATGGAGCCGCGGGAGCCGTGGGTGGAG  222

Query  223  CAAGAGGGGCCGCAGTATTGGGAGTGGACCACAGGGTACGCCAAGGCCAACGCACAGACTGACCGAGTGGCCCT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CAAGAGGGGCCGCAGTATTGGGAGTGGACCACAGGGTACGCCAAGGCCAACGCACAGACTGACCGAGTGGCCCT  296

Query  297  GAGGAACCTGCTCCGCCGCTACAACCAGAGCGAGGCTGGGTCTCACACCCTCCAGGGAATGAATGGCTGCGACA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GAGGAACCTGCTCCGCCGCTACAACCAGAGCGAGGCTGGGTCTCACACCCTCCAGGGAATGAATGGCTGCGACA  370

Query  371  TGGGGCCCGACGGACGCCTCCTCCGCGGGTATCACCAGCACGCGTACGACGGCAAGGATTACATCTCCCTGAAC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TGGGGCCCGACGGACGCCTCCTCCGCGGGTATCACCAGCACGCGTACGACGGCAAGGATTACATCTCCCTGAAC  444

Query  445  GAGGACCTGCGCTCCTGGACCGCGGCGGACACCGTGGCTCAGATCACCCAGCGCTTCTATGAGGCAGAGGAATA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GAGGACCTGCGCTCCTGGACCGCGGCGGACACCGTGGCTCAGATCACCCAGCGCTTCTATGAGGCAGAGGAATA  518

Query  519  TGCAGAGGAGTTCAGGACCTACCTGGAGGGCGAGTGCCTGGAGTTGCTCCGCAGATACTTGGAGAATGGGAAGG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGCAGAGGAGTTCAGGACCTACCTGGAGGGCGAGTGCCTGGAGTTGCTCCGCAGATACTTGGAGAATGGGAAGG  592

Query  593  AGACGCTACAGCGCGCAGATCCTCCAAAGGCACACGTTGCCCACCACCCCATCTCTGACCATGAGGCCACCCTG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AGACGCTACAGCGCGCAGATCCTCCAAAGGCACACGTTGCCCACCACCCCATCTCTGACCATGAGGCCACCCTG  666

Query  667  AGGTGCTGGGCCCTGGGCTTCTACCCTGCGGAGATCACGCTGACCTGGCAGCGGGATGGGGAGGAACAGACCCA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AGGTGCTGGGCCCTGGGCTTCTACCCTGCGGAGATCACGCTGACCTGGCAGCGGGATGGGGAGGAACAGACCCA  740

Query  741  GGACACAGAGCTTGTGGAGACCAGGCCTGCAGGGGATGGAACCTTCCAGAAGTGGGCCGCTGTGGTGGTGCCTT  814
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  741  GGACACAGAGCTTGTGGAGACCAGGCCTGCAGGGGATGGAACCTTCCAGAAGTGGGCCGCTGTGGTGGTGCCTC  814

Query  815  CTGGAGAGGAACAGAGATACACATGCCATGTGCAGCACGAGGGGCTGCCCCAGCCCCTCATCCTGAGATGGGAG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CTGGAGAGGAACAGAGATACACATGCCATGTGCAGCACGAGGGGCTGCCCCAGCCCCTCATCCTGAGATGGGAG  888

Query  889  CAGTCTCCCCAGCCCACCATCCCCATCGTGGGCATCGTTGCTGGCCTTGTTGTCCTTGGAGCTGTGGTCACTGG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CAGTCTCCCCAGCCCACCATCCCCATCGTGGGCATCGTTGCTGGCCTTGTTGTCCTTGGAGCTGTGGTCACTGG  962

Query  963  AGCTGTGGTCGCTGCTGTGATGTGGAGGAAGAAGAGCTCAGATAGAAACAGAGGGAGCTACTCTCAGGCTGCAG  1036
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   
Sbjct  963  AGCTGTGGTCGCTGCTGTGATGTGGAGGAAGAAGAGCTCAGATAGAAACAGAGGGAGCTACTCTCAGGCTG---  1033

Query 1037  CCTACTCAGTGGTCAGCGGACTCTTGATGATAACATGGTGGTCAAGCTTATTTCTCCTGGGGGTGCTCTTCCAA  1110
                  |||||                                                               
Sbjct 1034  ------CAGTG---------------------------------------------------------------  1038

Query 1111  GGATATTTGGGCTGCCTCCGGAGTCACAGTGTCTTGGGCCGCCGGAAGGTGGGTGACATGTGGATCTTGTTTTT  1184
                                                                                      
Sbjct 1039  --------------------------------------------------------------------------  1038

Query 1185  TTTGTGGCTGTGGACATCTTTCAACACTGCCTTCTTGGCCTTGCAAAGCCTTCGCTTTGGCTTCGGCTTTAGGA  1258
                                                                                      
Sbjct 1039  --------------------------------------------------------------------------  1038

Query 1259  GGGGCAGGAGCTTCCTTCTTCGTTCTTGGCACCATCTTATGAAAAGGGTCCAGATTAAGATTTTTGAC  1326
                                                                                
Sbjct 1039  --------------------------------------------------------------------  1038