Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_06380
• Subject: NM_001242784.3
• Aligned Length: 2178
• Identities: 2177
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGAAGATAGACTCCACATGGATAATGGACTGGTACCCCAAAAGATTGTGTCGGTGCACTTGCAGGACTCCAC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAAGATAGACTCCACATGGATAATGGACTGGTACCCCAAAAGATTGTGTCGGTGCACTTGCAGGACTCCAC  74

Query   75  TCTGAAGGAAGTTAAGGATCAGGTCTCAAACAAGCAAGCCCAGATCCTAGAGCCGAAGCCTGAACCTTCTCTTG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TCTGAAGGAAGTTAAGGATCAGGTCTCAAACAAGCAAGCCCAGATCCTAGAGCCGAAGCCTGAACCTTCTCTTG  148

Query  149  AGATTAAGCCTGAGCAGGACGGTATGGAGCATGTTGGCAGAGATGACCCAAAGGCTCTTGGTGAAGAACCCAAA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AGATTAAGCCTGAGCAGGACGGTATGGAGCATGTTGGCAGAGATGACCCAAAGGCTCTTGGTGAAGAACCCAAA  222

Query  223  CAAAGGAGAGGCAGTGCCTCTGGGAGTGAGCCTGCTGGGGACAGTGACAGGGGAGGGGGCCCCGTTGAGCATTA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CAAAGGAGAGGCAGTGCCTCTGGGAGTGAGCCTGCTGGGGACAGTGACAGGGGAGGGGGCCCCGTTGAGCATTA  296

Query  297  TCACCTCCATCTGTCTAGTTGCCACGAGTGTCTGGAACTTGAGAACAGCACCATTGAGTCAGTCAAGTTTGCGT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TCACCTCCATCTGTCTAGTTGCCACGAGTGTCTGGAACTTGAGAACAGCACCATTGAGTCAGTCAAGTTTGCGT  370

Query  371  CTGCCGAGAACATTCCAGACCTTCCCTACGATTATAGCAGCAGTTTGGAGAGTGTTGCTGATGAGACCTCCCCC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CTGCCGAGAACATTCCAGACCTTCCCTACGATTATAGCAGCAGTTTGGAGAGTGTTGCTGATGAGACCTCCCCC  444

Query  445  GAAAGAGAAGGGAGGAGAGTCAACCTCACGGGAAAGGCACCCAACATCCTCCTCTATGTGGGCTCCGACTCCCA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GAAAGAGAAGGGAGGAGAGTCAACCTCACGGGAAAGGCACCCAACATCCTCCTCTATGTGGGCTCCGACTCCCA  518

Query  519  GGAAGCCCTCGGCCGGTTCCACGAGGTCCGGTCTGTGCTGGCCGACTGTGTGGACATTGACAGTTATATTCTCT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GGAAGCCCTCGGCCGGTTCCACGAGGTCCGGTCTGTGCTGGCCGACTGTGTGGACATTGACAGTTATATTCTCT  592

Query  593  ACCACCTGCTGGAGGACAGTGCTCTCAGAGACCCGTGGACGGACAACTGTCTGCTGTTGGTCATTGCTACCAGG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ACCACCTGCTGGAGGACAGTGCTCTCAGAGACCCGTGGACGGACAACTGTCTGCTGTTGGTCATTGCTACCAGG  666

Query  667  GAGTCCATTCCCGAAGACCTGTACCAGAAGTTCATGGCCTATCTTTCTCAGGGAGGGAAGGTGTTGGGCCTGTC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GAGTCCATTCCCGAAGACCTGTACCAGAAGTTCATGGCCTATCTTTCTCAGGGAGGGAAGGTGTTGGGCCTGTC  740

Query  741  TTCATCCTTCACCTTTGGTGGCTTTCAGGTGACAAGCAAGGGTGCACTGCACAAGACAGTCCAGAACTTGGTTT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TTCATCCTTCACCTTTGGTGGCTTTCAGGTGACAAGCAAGGGTGCACTGCACAAGACAGTCCAGAACTTGGTTT  814

Query  815  TCTCCAAGGCTGACCAGAGTGAGGTGAAGCTCAGCGTCTTGAGCAGTGGCTGCAGGTACCAGGAAGGCCCCGTC  888
            |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TCTCCAAGGCTGACCAGAGCGAGGTGAAGCTCAGCGTCTTGAGCAGTGGCTGCAGGTACCAGGAAGGCCCCGTC  888

Query  889  CGGCTCAGCCCCGGCAGGCTCCAGGGCCACCTGGAGAATGAGGACAAGGACAGGATGATTGTGCATGTGCCTTT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CGGCTCAGCCCCGGCAGGCTCCAGGGCCACCTGGAGAATGAGGACAAGGACAGGATGATTGTGCATGTGCCTTT  962

Query  963  TGGAACTCGCGGGGGAGAAGCTGTTCTTTGCCAGGTGCACTTAGAACTACCTCCCAGCTCCAACATAGTGCAAA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TGGAACTCGCGGGGGAGAAGCTGTTCTTTGCCAGGTGCACTTAGAACTACCTCCCAGCTCCAACATAGTGCAAA  1036

Query 1037  CTCCAGAAGATTTTAACTTGCTCAAGTCAAGCAATTTTAGAAGATACGAAGTCCTTAGAGAGATTCTGACAACC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CTCCAGAAGATTTTAACTTGCTCAAGTCAAGCAATTTTAGAAGATACGAAGTCCTTAGAGAGATTCTGACAACC  1110

Query 1111  CTTGGCCTCAGCTGTGACATGAAACAAGTTCCTGCCTTAACTCCTCTTTACTTGCTGTCAGCTGCGGAGGAAAT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CTTGGCCTCAGCTGTGACATGAAACAAGTTCCTGCCTTAACTCCTCTTTACTTGCTGTCAGCTGCGGAGGAAAT  1184

Query 1185  CAGGGATCCTCTTATGCAGTGGCTTGGGAAACATGTGGACTCCGAGGGAGAAATAAAATCCGGCCAGCTCTCTC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CAGGGATCCTCTTATGCAGTGGCTTGGGAAACATGTGGACTCCGAGGGAGAAATAAAATCCGGCCAGCTCTCTC  1258

Query 1259  TTAGATTTGTTTCATCCTACGTGTCTGAAGTAGAAATAACCCCATCTTGTATACCTGTGGTGACCAACATGGAG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TTAGATTTGTTTCATCCTACGTGTCTGAAGTAGAAATAACCCCATCTTGTATACCTGTGGTGACCAACATGGAG  1332

Query 1333  GCCTTCTCATCAGAACATTTCAACTTAGAGATCTATCGCCAAAATCTGCAGACCAAGCAGTTGGGGAAAGTAAT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GCCTTCTCATCAGAACATTTCAACTTAGAGATCTATCGCCAAAATCTGCAGACCAAGCAGTTGGGGAAAGTAAT  1406

Query 1407  TTTGTTTGCCGAAGTGACCCCCACAACGATGCGTCTCCTGGATGGGCTGATGTTTCAGACACCGCAGGAAATGG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TTTGTTTGCCGAAGTGACCCCCACAACGATGCGTCTCCTGGATGGGCTGATGTTTCAGACACCGCAGGAAATGG  1480

Query 1481  GCTTAATAGTGATCGCGGCCCGGCAGACCGAGGGCAAAGGACGGGGAGGGAATGTGTGGCTGAGCCCTGTGGGA  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  GCTTAATAGTGATCGCGGCCCGGCAGACCGAGGGCAAAGGACGGGGAGGGAATGTGTGGCTGAGCCCTGTGGGA  1554

Query 1555  TGTGCTCTTTCTACTCTGCTCATCTCCATTCCACTGAGATCCCAGCTGGGACAGAGGATCCCGTTTGTCCAGCA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  TGTGCTCTTTCTACTCTGCTCATCTCCATTCCACTGAGATCCCAGCTGGGACAGAGGATCCCGTTTGTCCAGCA  1628

Query 1629  TCTGATGTCCGTGGCTGTCGTGGAAGCAGTGAGGTCCATTCCCGAGTATCAGGATATCAACTTACGAGTGAAGT  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  TCTGATGTCCGTGGCTGTCGTGGAAGCAGTGAGGTCCATTCCCGAGTATCAGGATATCAACTTACGAGTGAAGT  1702

Query 1703  GGCCCAACGATATTTATTACAGTGACCTCATGAAGATCGGCGGAGTTCTGGTTAACTCAACACTCATGGGAGAA  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  GGCCCAACGATATTTATTACAGTGACCTCATGAAGATCGGCGGAGTTCTGGTTAACTCAACACTCATGGGAGAA  1776

Query 1777  ACATTTTATATACTTATTGGCTGTGGATTTAATGTGACTAACAGTAACCCTACCATCTGCATCAACGACCTCAT  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  ACATTTTATATACTTATTGGCTGTGGATTTAATGTGACTAACAGTAACCCTACCATCTGCATCAACGACCTCAT  1850

Query 1851  CACAGAATACAATAAACAACACAAGGCAGAACTGAAGCCCTTAAGAGCCGATTATCTCATCGCCAGAGTCGTGA  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  CACAGAATACAATAAACAACACAAGGCAGAACTGAAGCCCTTAAGAGCCGATTATCTCATCGCCAGAGTCGTGA  1924

Query 1925  CTGTGCTGGAGAAACTGATCAAAGAGTTTCAGGACAAAGGGCCCAACAGCGTCCTTCCCCTTTATTACCGATAC  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  CTGTGCTGGAGAAACTGATCAAAGAGTTTCAGGACAAAGGGCCCAACAGCGTCCTTCCCCTTTATTACCGATAC  1998

Query 1999  TGGGTCCACAGTGGTCAGCAAGTCCATCTGGGCAGCGCAGAGGGACCAAAGGTGTCCATCGTTGGCCTGGACGA  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  TGGGTCCACAGTGGTCAGCAAGTCCATCTGGGCAGCGCAGAGGGACCAAAGGTGTCCATCGTTGGCCTGGACGA  2072

Query 2073  TTCTGGCTTCCTCCAGGTTCACCAGGAGGGCGGCGAGGTTGTGACTGTGCACCCGGACGGCAACTCCTTCGACA  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  TTCTGGCTTCCTCCAGGTTCACCAGGAGGGCGGCGAGGTTGTGACTGTGCACCCGGACGGCAACTCCTTCGACA  2146

Query 2147  TGCTGAGAAACCTCATCCTCCCCAAACGGCGG  2178
            ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  TGCTGAGAAACCTCATCCTCCCCAAACGGCGG  2178