Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_06380
• Subject: XM_024452065.1
• Aligned Length: 2178
• Identities: 2006
• Gaps: 171

Alignment

Query    1  ATGGAAGATAGACTCCACATGGATAATGGACTGGTACCCCAAAAGATTGTGTCGGTGCACTTGCAGGACTCCAC  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  TCTGAAGGAAGTTAAGGATCAGGTCTCAAACAAGCAAGCCCAGATCCTAGAGCCGAAGCCTGAACCTTCTCTTG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  AGATTAAGCCTGAGCAGGACGGTATGGAGCATGTTGGCAGAGATGACCCAAAGGCTCTTGGTGAAGAACCCAAA  222
                                   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  -----------------------ATGGAGCATGTTGGCAGAGATGACCCAAAGGCTCTTGGTGAAGAACCCAAA  51

Query  223  CAAAGGAGAGGCAGTGCCTCTGGGAGTGAGCCTGCTGGGGACAGTGACAGGGGAGGGGGCCCCGTTGAGCATTA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   52  CAAAGGAGAGGCAGTGCCTCTGGGAGTGAGCCTGCTGGGGACAGTGACAGGGGAGGGGGCCCCGTTGAGCATTA  125

Query  297  TCACCTCCATCTGTCTAGTTGCCACGAGTGTCTGGAACTTGAGAACAGCACCATTGAGTCAGTCAAGTTTGCGT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  126  TCACCTCCATCTGTCTAGTTGCCACGAGTGTCTGGAACTTGAGAACAGCACCATTGAGTCAGTCAAGTTTGCGT  199

Query  371  CTGCCGAGAACATTCCAGACCTTCCCTACGATTATAGCAGCAGTTTGGAGAGTGTTGCTGATGAGACCTCCCCC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  200  CTGCCGAGAACATTCCAGACCTTCCCTACGATTATAGCAGCAGTTTGGAGAGTGTTGCTGATGAGACCTCCCCC  273

Query  445  GAAAGAGAAGGGAGGAGAGTCAACCTCACGGGAAAGGCACCCAACATCCTCCTCTATGTGGGCTCCGACTCCCA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  274  GAAAGAGAAGGGAGGAGAGTCAACCTCACGGGAAAGGCACCCAACATCCTCCTCTATGTGGGCTCCGACTCCCA  347

Query  519  GGAAGCCCTCGGCCGGTTCCACGAGGTCCGGTCTGTGCTGGCCGACTGTGTGGACATTGACAGTTATATTCTCT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  348  GGAAGCCCTCGGCCGGTTCCACGAGGTCCGGTCTGTGCTGGCCGACTGTGTGGACATTGACAGTTATATTCTCT  421

Query  593  ACCACCTGCTGGAGGACAGTGCTCTCAGAGACCCGTGGACGGACAACTGTCTGCTGTTGGTCATTGCTACCAGG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  422  ACCACCTGCTGGAGGACAGTGCTCTCAGAGACCCGTGGACGGACAACTGTCTGCTGTTGGTCATTGCTACCAGG  495

Query  667  GAGTCCATTCCCGAAGACCTGTACCAGAAGTTCATGGCCTATCTTTCTCAGGGAGGGAAGGTGTTGGGCCTGTC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  496  GAGTCCATTCCCGAAGACCTGTACCAGAAGTTCATGGCCTATCTTTCTCAGGGAGGGAAGGTGTTGGGCCTGTC  569

Query  741  TTCATCCTTCACCTTTGGTGGCTTTCAGGTGACAAGCAAGGGTGCACTGCACAAGACAGTCCAGAACTTGGTTT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  570  TTCATCCTTCACCTTTGGTGGCTTTCAGGTGACAAGCAAGGGTGCACTGCACAAGACAGTCCAGAACTTGGTTT  643

Query  815  TCTCCAAGGCTGACCAGAGTGAGGTGAAGCTCAGCGTCTTGAGCAGTGGCTGCAGGTACCAGGAAGGCCCCGTC  888
            |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  644  TCTCCAAGGCTGACCAGAGCGAGGTGAAGCTCAGCGTCTTGAGCAGTGGCTGCAGGTACCAGGAAGGCCCCGTC  717

Query  889  CGGCTCAGCCCCGGCAGGCTCCAGGGCCACCTGGAGAATGAGGACAAGGACAGGATGATTGTGCATGTGCCTTT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  718  CGGCTCAGCCCCGGCAGGCTCCAGGGCCACCTGGAGAATGAGGACAAGGACAGGATGATTGTGCATGTGCCTTT  791

Query  963  TGGAACTCGCGGGGGAGAAGCTGTTCTTTGCCAGGTGCACTTAGAACTACCTCCCAGCTCCAACATAGTGCAAA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  792  TGGAACTCGCGGGGGAGAAGCTGTTCTTTGCCAGGTGCACTTAGAACTACCTCCCAGCTCCAACATAGTGCAAA  865

Query 1037  CTCCAGAAGATTTTAACTTGCTCAAGTCAAGCAATTTTAGAAGATACGAAGTCCTTAGAGAGATTCTGACAACC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  866  CTCCAGAAGATTTTAACTTGCTCAAGTCAAGCAATTTTAGAAGATACGAAGTCCTTAGAGAGATTCTGACAACC  939

Query 1111  CTTGGCCTCAGCTGTGACATGAAACAAGTTCCTGCCTTAACTCCTCTTTACTTGCTGTCAGCTGCGGAGGAAAT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  940  CTTGGCCTCAGCTGTGACATGAAACAAGTTCCTGCCTTAACTCCTCTTTACTTGCTGTCAGCTGCGGAGGAAAT  1013

Query 1185  CAGGGATCCTCTTATGCAGTGGCTTGGGAAACATGTGGACTCCGAGGGAGAAATAAAATCCGGCCAGCTCTCTC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1014  CAGGGATCCTCTTATGCAGTGGCTTGGGAAACATGTGGACTCCGAGGGAGAAATAAAATCCGGCCAGCTCTCTC  1087

Query 1259  TTAGATTTGTTTCATCCTACGTGTCTGAAGTAGAAATAACCCCATCTTGTATACCTGTGGTGACCAACATGGAG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1088  TTAGATTTGTTTCATCCTACGTGTCTGAAGTAGAAATAACCCCATCTTGTATACCTGTGGTGACCAACATGGAG  1161

Query 1333  GCCTTCTCATCAGAACATTTCAACTTAGAGATCTATCGCCAAAATCTGCAGACCAAGCAGTTGGGGAAAGTAAT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1162  GCCTTCTCATCAGAACATTTCAACTTAGAGATCTATCGCCAAAATCTGCAGACCAAGCAGTTGGGGAAAGTAAT  1235

Query 1407  TTTGTTTGCCGAAGTGACCCCCACAACGATGCGTCTCCTGGATGGGCTGATGTTTCAGACACCGCAGGAAATGG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1236  TTTGTTTGCCGAAGTGACCCCCACAACGATGCGTCTCCTGGATGGGCTGATGTTTCAGACACCGCAGGAAATGG  1309

Query 1481  GCTTAATAGTGATCGCGGCCCGGCAGACCGAGGGCAAAGGACGGGGAGGGAATGTGTGGCTGAGCCCTGTGGGA  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1310  GCTTAATAGTGATCGCGGCCCGGCAGACCGAGGGCAAAGGACGGGGAGGGAATGTGTGGCTGAGCCCTGTGGGA  1383

Query 1555  TGTGCTCTTTCTACTCTGCTCATCTCCATTCCACTGAGATCCCAGCTGGGACAGAGGATCCCGTTTGTCCAGCA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1384  TGTGCTCTTTCTACTCTGCTCATCTCCATTCCACTGAGATCCCAGCTGGGACAGAGGATCCCGTTTGTCCAGCA  1457

Query 1629  TCTGATGTCCGTGGCTGTCGTGGAAGCAGTGAGGTCCATTCCCGAGTATCAGGATATCAACTTACGAGTGAAGT  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1458  TCTGATGTCCGTGGCTGTCGTGGAAGCAGTGAGGTCCATTCCCGAGTATCAGGATATCAACTTACGAGTGAAGT  1531

Query 1703  GGCCCAACGATATTTATTACAGTGACCTCATGAAGATCGGCGGAGTTCTGGTTAACTCAACACTCATGGGAGAA  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1532  GGCCCAACGATATTTATTACAGTGACCTCATGAAGATCGGCGGAGTTCTGGTTAACTCAACACTCATGGGAGAA  1605

Query 1777  ACATTTTATATACTTATTGGCTGTGGATTTAATGTGACTAACAGTAACCCTACCATCTGCATCAACGACCTCAT  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1606  ACATTTTATATACTTATTGGCTGTGGATTTAATGTGACTAACAGTAACCCTACCATCTGCATCAACGACCTCAT  1679

Query 1851  CACAGAATACAATAAACAACACAAGGCAGAACTGAAGCCCTTAAGAGCCGATTATCTCATCGCCAGAGTCGTGA  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1680  CACAGAATACAATAAACAACACAAGGCAGAACTGAAGCCCTTAAGAGCCGATTATCTCATCGCCAGAGTCGTGA  1753

Query 1925  CTGTGCTGGAGAAACTGATCAAAGAGTTTCAGGACAAAGGGCCCAACAGCGTCCTTCCCCTTTATTACCGATAC  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1754  CTGTGCTGGAGAAACTGATCAAAGAGTTTCAGGACAAAGGGCCCAACAGCGTCCTTCCCCTTTATTACCGATAC  1827

Query 1999  TGGGTCCACAGTGGTCAGCAAGTCCATCTGGGCAGCGCAGAGGGACCAAAGGTGTCCATCGTTGGCCTGGACGA  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1828  TGGGTCCACAGTGGTCAGCAAGTCCATCTGGGCAGCGCAGAGGGACCAAAGGTGTCCATCGTTGGCCTGGACGA  1901

Query 2073  TTCTGGCTTCCTCCAGGTTCACCAGGAGGGCGGCGAGGTTGTGACTGTGCACCCGGACGGCAACTCCTTCGACA  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1902  TTCTGGCTTCCTCCAGGTTCACCAGGAGGGCGGCGAGGTTGTGACTGTGCACCCGGACGGCAACTCCTTCGACA  1975

Query 2147  TGCTGAGAAACCTCATCCTCCCCAAACGGCGG  2178
            ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1976  TGCTGAGAAACCTCATCCTCCCCAAACGGCGG  2007