Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_06389
- Subject:
- NM_001166429.1
- Aligned Length:
- 1245
- Identities:
- 1139
- Gaps:
- 0
Alignment
Query 1 ATGATGCTGGGCCCTGAGGGAGGTGAAGGCTTTGTGGTCAAGCTCCGTGGCCTGCCCTGGTCCTGCTCTGTTGA 74
|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||.||||||||||||||..||||
Sbjct 1 ATGATGCTGGGCCCTGAGGGAGGTGAAGGCTATGTGGTCAAACTCCGTGGCCTACCCTGGTCCTGCTCAATTGA 74
Query 75 GGACGTGCAGAACTTCCTCTCTGACTGCACGATTCATGATGGGGCCGCAGGTGTCCATTTCATCTACACTAGAG 148
||||||.||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||.|||||||||.||||||||.||.|||||||
Sbjct 75 GGACGTACAAAACTTCCTCTCCGACTGCACAATTCATGATGGGGTCGCAGGTGTTCATTTCATTTATACTAGAG 148
Query 149 AGGGCAGGCAGAGTGGTGAGGCTTTTGTTGAACTTGGATCAGAAGATGATGTAAAAATGGCCCTGAAAAAAGAC 222
|.||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||||||||||||||||.||||.||||||||||||
Sbjct 149 AAGGCAGGCAGAGTGGTGAGGCTTTTGTTGAACTTGAGTCAGAAGATGATGTAAAATTGGCTCTGAAAAAAGAC 222
Query 223 AGGGAAAGCATGGGACACCGGTACATTGAGGTGTTCAAGTCCCACAGAACCGAGATGGATTGGGTGTTGAAGCA 296
|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 AGGGAAAGCATGGGACACCGGTATATTGAGGTGTTCAAGTCACACAGAACCGAGATGGATTGGGTGTTGAAGCA 296
Query 297 CAGTGGTCCCAACAGTGCCGACAGCGCCAACGATGGCTTCGTGCGGCTTCGAGGACTCCCATTTGGATGCACAA 370
|||||||||.|||||.||||||||.|||||.||||||||.|||.|||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CAGTGGTCCAAACAGCGCCGACAGTGCCAATGATGGCTTTGTGAGGCTTCGGGGACTCCCATTTGGATGCACAA 370
Query 371 AGGAAGAAATTGTTCAGTTCTTCTCAGGGTTGGAAATTGTGCCAAACGGGATCACATTGCCTGTGGACCCCGAA 444
||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||.|||
Sbjct 371 AGGAAGAAATCGTTCAGTTCTTCTCAGGGTTGGAAATTGTGCCAAACGGGATCACACTACCTGTGGACCCGGAA 444
Query 445 GGCAAGATTACAGGGGAAGCGTTCGTGCAGTTTGCCTCGCAGGAGTTAGCTGAGAAGGCTCTAGGGAAACACAA 518
|||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.|||.|||||||.|||||
Sbjct 445 GGCAAGATTACAGGGGAGGCCTTCGTTCAGTTTGCCTCACAAGAGTTAGCTGAGAAAGCTTTAGGGAAGCACAA 518
Query 519 GGAGAGGATAGGGCACAGGTACATTGAGGTGTTTAAGAGCAGCCAGGAGGAAGTTAGGTCATACTCAGATCCCC 592
||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct 519 GGAGAGAATAGGGCACAGGTATATTGAAGTGTTTAAGAGCAGTCAGGAGGAAGTTAGATCATACTCAGATCCAC 592
Query 593 CTCTGAAGTTCATGTCCGTGCAGCGGCCAGGGCCCTATGACCGGCCCGGGACTGCCAGGAGGTACATTGGCATC 666
||||||||||.|||||.|||||..||||.|||||.||||||.||||.||.||.|||.||||||||||||||||.
Sbjct 593 CTCTGAAGTTTATGTCTGTGCAAAGGCCTGGGCCTTATGACAGGCCTGGCACAGCCCGGAGGTACATTGGCATT 666
Query 667 GTGAAGCAGGCAGGCCTGGAAAGGATGAGGCCTGGTGCCTACAGCACAGGCTACGGGGGCTACGAGGAGTACAG 740
|||||.||||||||.|||||.|||||||||.||||||||||.||..|||||||.||||||||.||.||.|||||
Sbjct 667 GTGAAACAGGCAGGTCTGGATAGGATGAGGTCTGGTGCCTATAGTGCAGGCTATGGGGGCTATGAAGAATACAG 740
Query 741 TGGCCTCAGTGATGGCTACGGCTTCACCACCGACCTGTTCGGGAGAGACCTCAGCTACTGTCTCTCCGGAATGT 814
||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||
Sbjct 741 TGGCCTCAGTGATGGCTATGGCTTCACCACTGACCTGTTTGGGAGAGACCTCAGCTATTGTCTCTCAGGAATGT 814
Query 815 ATGACCACAGATACGGCGACAGTGAGTTCACAGTGCAGAGCACCACAGGCCACTGTGTCCACATGAGGGGCCTG 888
|||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||.|||
Sbjct 815 ATGACCACAGATATGGAGACAGCGAGTTCACAGTGCAGAGCACCACCGGCCACTGCGTCCACATGAGAGGGCTG 888
Query 889 CCGTACAAAGCGACCGAGAACGACATTTACAACTTCTTCTCTCCTCTCAACCCTGTGAGAGTCCATATTGAGAT 962
||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 889 CCCTACAAAGCAACGGAGAACGACATTTACAACTTCTTCTCTCCACTCAACCCTGTGAGAGTTCATATTGAGAT 962
Query 963 TGGCCCAGATGGAAGAGTGACGGGTGAAGCAGATGTTGAGTTTGCTACTCATGAAGAATCTGTGGCAGCTATGT 1036
|||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||||
Sbjct 963 TGGTCCTGATGGAAGAGTGACGGGAGAAGCTGATGTTGAGTTTGCTACTCATGAAGAAGCAGTGGCAGCTATGT 1036
Query 1037 CCAAAGACAGGGCCAATATGCAGCACAGATATATAGAACTCTTCTTGAATTCAACAACAGGGGCCAGCAATGGG 1110
||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||.|||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1037 CCAAGGACAGGGCCAACATGCAGCACAGATACATAGAACTCTTCCTGAATTCAACAACAGGGGCTAGCAATGGG 1110
Query 1111 GCGTATAGCAGCCAGGTGATGCAAGGCATGGGGGTGTCTGCTGCCCAGGCCACTTACAGTGGCCTGGAGAGCCA 1184
||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GCTTATAGCAGCCAGGTGATGCAGGGCATGGGCGTGTCAGCTGCCCAGGCAACTTACAGTGGCCTGGAGAGCCA 1184
Query 1185 GTCAGTGAGTGGCTGTTACGGGGCCGGCTACAGTGGGCAGAACAGCATGGGTGGCTATGAC 1245
|||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||.|||||.
Sbjct 1185 GTCAGTGAGTGGCTGTTACGGGGCCGGCTACAGCGGTCAGAACAGCATGGGCGGATATGAT 1245