Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_06413
• Subject: NM_010480.5
• Aligned Length: 2199
• Identities: 1982
• Gaps: 3

Alignment

Query    1  ATGCCTGAGGAAACCCAGACCCAAGACCAACCGATGGAGGAGGAGGAGGTTGAGACGTTCGCCTTTCAGGCAGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCCTGAGGAAACCCAGACCCAAGACCAACCAATGGAGGAGGAGGAGGTCGAGACCTTTGCCTTTCAGGCAGA  74

Query   75  AATTGCCCAGTTGATGTCATTGATCATCAATACTTTCTACTCGAACAAAGAGATCTTTCTGAGAGAGCTCATTT  148
            ||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|
Sbjct   75  AATTGCCCAGTTAATGTCCTTGATCATCAATACCTTCTACTCGAACAAAGAGATCTTTCTGAGGGAGCTCATCT  148

Query  149  CAAATTCATCAGATGCATTGGACAAAATCCGGTATGAAAGCTTGACAGATCCCAGTAAATTAGACTCTGGGAAA  222
            |.||||||||.||.||..||||.||||||||.||.||.|||.||||.||.|||||||||.|.|||||.|||||.
Sbjct  149  CCAATTCATCGGACGCTCTGGATAAAATCCGTTACGAGAGCCTGACGGACCCCAGTAAACTGGACTCGGGGAAG  222

Query  223  GAGCTGCATATTAACCTTATACCGAACAAACAAGATCGAACTCTCACTATTGTGGATACTGGAATTGGAATGAC  296
            ||||||||.||.||.||.||.||.|.||||||.||.|||||.||.||.|||||||||||.||.|||||||||||
Sbjct  223  GAGCTGCACATCAATCTCATTCCCAGCAAACAGGACCGAACCCTGACCATTGTGGATACCGGGATTGGAATGAC  296

Query  297  CAAGGCTGACTTGATCAATAACCTTGGTACTATCGCCAAGTCTGGGACCAAAGCGTTCATGGAAGCTTTGCAGG  370
            ||||||.||||||||||||||||||||.||.||.||||||||.||.||||||||.||||||||.||||||||||
Sbjct  297  CAAGGCCGACTTGATCAATAACCTTGGCACCATTGCCAAGTCGGGCACCAAAGCCTTCATGGAGGCTTTGCAGG  370

Query  371  CTGGTGCAGATATCTCTATGATTGGCCAGTTCGGTGTTGGTTTTTATTCTGCTTATTTGGTTGCTGAGAAAGTA  444
            |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.
Sbjct  371  CTGGTGCAGATATCTCTATGATTGGCCAGTTTGGTGTTGGTTTTTACTCTGCCTATTTGGTTGCTGAGAAAGTG  444

Query  445  ACTGTGATCACCAAACATAACGATGATGAGCAGTACGCTTGGGAGTCCTCAGCAGGGGGATCATTCACAGTGAG  518
            |||||.|||||.||.||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||
Sbjct  445  ACTGTCATCACGAAGCATAACGACGATGAGCAGTATGCCTGGGAGTCCTCAGCTGGGGGATCCTTCACAGTGAG  518

Query  519  GACAGACACAGGTGAACCTATGGGTCGTGGAACAAAAGTTATCCTACACCTGAAAGAAGACCAAACTGAGTACT  592
            |||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||.|.||.|||||||||||||||||.|||||.|
Sbjct  519  GACTGACACAGGTGAACCAATGGGTCGTGGAACAAAGGTTATCTTGCATCTGAAAGAAGACCAAACAGAGTATT  592

Query  593  TGGAGGAACGAAGAATAAAGGAGATTGTGAAGAAACATTCTCAGTTTATTGGATATCCCATTACTCTTTTTGTG  666
            ||||||||.|.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||
Sbjct  593  TGGAGGAAAGGAGAATAAAGGAGATCGTGAAGAAGCATTCTCAGTTCATTGGCTATCCCATTACTCTCTTTGTG  666

Query  667  GAGAAGGAACGTGATAAAGAAGTAAGCGATGATGAGGCTGAAGAAAAGGAAGACAAAGAAGAAGAAAAAGAAAA  740
            |||||||||||.|||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||
Sbjct  667  GAGAAGGAACGAGATAAGGAAGTCAGTGATGATGAGGCTGAAGAAAAGGAAGAGAAAGAGGAAGAGAAAGAAAA  740

Query  741  AGAAGAGAAAGAGTCGGAAGACAAACCTGAAATTGAAGATGTTGGTTCTGATGAGGAA---GAAGAAAAGAAGG  811
            ||||||.||.|||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||   ||.||.|||||||
Sbjct  741  AGAAGAAAAGGAGTCTGATGATAAACCTGAAATAGAAGATGTTGGCTCTGATGAAGAAGAGGAGGAGAAGAAGG  814

Query  812  ATGGTGACAAGAAGAAGAAGAAGAAGATTAAGGAAAAGTACATCGATCAAGAAGAGCTCAACAAAACAAAGCCC  885
            ||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.
Sbjct  815  ATGGTGACAAGAAGAAAAAGAAGAAGATAAAGGAAAAGTACATTGATCAAGAAGAACTCAACAAAACAAAGCCG  888

Query  886  ATCTGGACCAGAAATCCCGACGATATTACTAATGAGGAGTACGGAGAATTCTATAAGAGCTTGACCAATGACTG  959
            ||.|||||.||||||||.||.||.||.|||||||||||.||.|||||.|||||.||||||||.||.||.||.||
Sbjct  889  ATTTGGACGAGAAATCCTGATGACATCACTAATGAGGAATATGGAGAGTTCTACAAGAGCTTAACTAACGATTG  962

Query  960  GGAAGATCACTTGGCAGTGAAGCATTTTTCAGTTGAAGGACAGTTGGAATTCAGAGCCCTTCTATTTGTCCCAC  1033
            ||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.||||||.|.||||||||.|||||||||.
Sbjct  963  GGAAGAACACTTGGCAGTAAAGCATTTTTCTGTTGAAGGACAATTAGAATTCCGGGCCCTTCTTTTTGTCCCAA  1036

Query 1034  GACGTGCTCCTTTTGATCTGTTTGAAAACAGAAAGAAAAAGAACAATATCAAATTGTATGTACGCAGAGTTTTC  1107
            ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||.
Sbjct 1037  GACGCGCTCCTTTTGATCTGTTTGAAAACAGAAAGAAAAAGAACAACATCAAGTTGTATGTTCGCAGAGTTTTT  1110

Query 1108  ATCATGGATAACTGTGAGGAGCTAATCCCTGAATATCTGAACTTCATTAGAGGGGTGGTAGACTCGGAGGATCT  1181
            ||||||||||||||||||||..||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||.||.||.||||||||
Sbjct 1111  ATCATGGATAACTGTGAGGAATTAATCCCTGAGTATCTGAATTTCATTAGAGGGGTAGTGGATTCTGAGGATCT  1184

Query 1182  CCCTCTAAACATATCCCGTGAGATGTTGCAACAAAGCAAAATTTTGAAAGTTATCAGGAAGAATTTGGTCAAAA  1255
            |||||||||.||.||||||||.|||.||||||||||.||||||.|||||||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct 1185  CCCTCTAAATATTTCCCGTGAAATGCTGCAACAAAGTAAAATTCTGAAAGTTATCAGAAAGAATTTGGTCAAGA  1258

Query 1256  AATGCTTAGAACTCTTTACTGAACTGGCGGAAGATAAAGAGAACTACAAGAAATTCTATGAGCAGTTCTCTAAA  1329
            |||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||.|||
Sbjct 1259  AATGCTTAGAACTATTTACTGAACTAGCAGAAGATAAAGAGAACTACAAAAAGTTTTATGAGCAGTTCTCAAAA  1332

Query 1330  AACATAAAGCTTGGAATACACGAAGACTCTCAAAATCGGAAGAAGCTTTCAGAGCTGTTAAGGTACTACACATC  1403
            ||.||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||
Sbjct 1333  AATATAAAGCTTGGAATTCACGAGGACTCTCAGAATCGGAAGAAGCTTTCAGAGCTGTTGCGGTACTACACATC  1406

Query 1404  TGCCTCTGGTGATGAGATGGTTTCTCTCAAGGACTACTGCACCAGAATGAAGGAGAACCAGAAACATATCTATT  1477
            |||.|||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.|||||||
Sbjct 1407  TGCTTCTGGGGACGAGATGGTTTCTCTGAAGGACTACTGTACCAGAATGAAGGAAAACCAGAAGCACATCTATT  1480

Query 1478  ATATCACAGGTGAGACCAAGGACCAGGTAGCTAACTCAGCCTTTGTGGAACGTCTTCGGAAACATGGCTTAGAA  1551
            .|||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||||||||||||
Sbjct 1481  TTATCACAGGTGAGACCAAGGACCAGGTTGCTAACTCCGCCTTTGTGGAACGTCTCCGAAAGCATGGCTTAGAA  1554

Query 1552  GTGATCTATATGATTGAGCCCATTGATGAGTACTGTGTCCAACAGCTGAAGGAATTTGAGGGGAAGACTTTAGT  1625
            ||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||.||
Sbjct 1555  GTAATTTATATGATTGAGCCCATTGATGAGTATTGTGTGCAACAGCTGAAGGAATTTGAGGGCAAGACCTTGGT  1628

Query 1626  GTCAGTCACCAAAGAAGGCCTGGAACTTCCAGAGGATGAAGAAGAGAAAAAGAAGCAGGAAGAGAAAAAAACAA  1699
            |||.||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||.||||||||||||||.||||
Sbjct 1629  GTCTGTTACCAAAGAAGGACTGGAACTTCCAGAAGATGAAGAGGAAAAGAAGAAACAGGAAGAGAAAAAGACAA  1702

Query 1700  AGTTTGAGAACCTCTGCAAAATCATGAAAGACATATTGGAGAAAAAAGTTGAAAAGGTGGTTGTGTCAAACCGA  1773
            |.||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  AATTTGAGAACCTCTGCAAAATTATGAAAGATATTTTGGAGAAGAAGGTTGAAAAGGTGGTTGTGTCAAACCGA  1776

Query 1774  TTGGTGACATCTCCATGCTGTATTGTCACAAGCACATATGGCTGGACAGCAAACATGGAGAGAATCATGAAAGC  1847
            .||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  CTGGTGACATCCCCGTGCTGTATTGTCACAAGCACATATGGGTGGACAGCAAACATGGAGAGAATCATGAAAGC  1850

Query 1848  TCAAGCCCTAAGAGACAACTCAACAATGGGTTACATGGCAGCAAAGAAACACCTGGAGATAAACCCTGACCATT  1921
            |||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|
Sbjct 1851  TCAAGCCCTCAGAGACAACTCAACAATGGGTTACATGGCAGCAAAGAAACACCTGGAGATAAATCCTGATCACT  1924

Query 1922  CCATTATTGAGACCTTAAGGCAAAAGGCAGAGGCTGATAAGAACGACAAGTCTGTGAAGGATCTGGTCATCTTG  1995
            ||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  CCATTATTGAAACCTTAAGGCAAAAGGCAGAGGCTGACAAGAATGACAAATCTGTGAAGGATCTGGTCATCTTG  1998

Query 1996  CTTTATGAAACTGCGCTCCTGTCTTCTGGCTTCAGTCTGGAAGATCCCCAGACACATGCTAACAGGATCTACAG  2069
            ||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  CTGTATGAAACTGCACTCCTATCTTCTGGCTTCAGTCTGGAAGATCCCCAGACCCATGCTAACAGGATCTACAG  2072

Query 2070  GATGATCAAACTTGGTCTGGGTATTGATGAAGATGACCCTACTGCTGATGATACCAGTGCTGCTGTAACTGAAG  2143
            |||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||..|||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  GATGATCAAGCTTGGTCTAGGTATTGATGAGGATGATCCTACTGTGGATGACACCAGTGCTGCTGTAACTGAAG  2146

Query 2144  AAATGCCACCCCTTGAAGGAGATGACGACACATCACGCATGGAAGAAGTAGAC  2196
            |||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  AAATGCCTCCCCTGGAAGGAGATGACGACACATCACGCATGGAAGAAGTAGAC  2199