Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_06475
- Subject:
- NM_019931.1
- Aligned Length:
- 1965
- Identities:
- 1740
- Gaps:
- 57
Alignment
Query 1 ATGGCGGCCGGAGTTGCGGCCTGGCTGCCTTTTGCCCGGGCTGCGGCCATCGGGTGGATGCCGGTGGCCAACTG 74
||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||
Sbjct 1 ATGGCGGCAGGAGTTGCAGCCTGGCTGCCTTTTGCCCGGGCTGCGGCCATTGGATGGATGCCAGTGGCCAACTG 74
Query 75 CCCCATGCCCCTGGCCCCGGCCGACAAGAACAAGCGGCAGGATGAGCTGATTGTCCTCAACGTGAGTGGGCGGA 148
||||||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.|||||.||..
Sbjct 75 CCCCATGCCCCTAGCTCCAGCGGACAAGAACAAGCGGCAAGACGAGCTGATCGTCCTCAACGTAAGTGGACGAC 148
Query 149 GGTTCCAGACCTGGAGGACCACGCTGGAGCGCTACCCGGACACCCTGCTGGGCAGCACGGAGAAGGAGTTCTTC 222
||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||.|||||||.|||||.|||||||||||||||
Sbjct 149 GGTTCCAGACCTGGAGGACCACTCTGGAGCGCTATCCCGACACCTTGCTGGGTAGCACAGAGAAGGAGTTCTTC 222
Query 223 TTCAACGAGGACACCAAGGAGTACTTCTTCGACCGGGACCCCGAGGTGTTCCGCTGCGTGCTCAACTTCTACCG 296
|||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.||.||||||||.||.|||||.|||||||||||
Sbjct 223 TTCAATGAGGACACGAAGGAGTACTTCTTTGACCGTGACCCGGAAGTGTTCCGTTGTGTGCTTAACTTCTACCG 296
Query 297 CACGGGGAAGCTGCACTACCCGCGCTACGAGTGCATCTCTGCCTACGACGACGAGCTGGCCTTCTACGGCATCC 370
|||.|||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||
Sbjct 297 CACCGGGAAGCTGCACTACCCACGCTATGAATGCATCTCTGCCTACGACGATGAACTGGCCTTCTATGGCATCC 370
Query 371 TCCCGGAGATCATCGGGGACTGCTGCTACGAGGAGTACAAGGACCGCAAGAGGGAGAACGCCGAGCGGCTCATG 444
||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||.|||||||.||.||||||||||||
Sbjct 371 TCCCCGAGATCATCGGAGACTGCTGCTACGAGGAGTACAAAGACCGCAAGCGGGAGAATGCGGAGCGGCTCATG 444
Query 445 GACGACAACGACTCGGAGAACAACCAGGAGTCCATGCCCTCGCTCAGCTTCCGCCAGACCATGTGGCGGGCCTT 518
||.|||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GATGACAATGACTCTGAAAACAACCAGGAGTCCATGCCCTCTCTCAGCTTCCGTCAGACCATGTGGCGGGCCTT 518
Query 519 CGAGAACCCCCACACCAGCACGCTGGCCCTGGTCTTCTACTACGTGACTGGCTTCTTCATCGCTGTCTCGGTCA 592
|||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||
Sbjct 519 CGAGAACCCACACACCAGCACCCTGGCACTGGTCTTCTACTATGTGACTGGCTTCTTCATTGCCGTCTCGGTCA 592
Query 593 TCACCAACGTGGTGGAGACGGTGCCGTGCGGCACGGTCCCGGGCAGCAAGGAGCTGCCGTGCGGGGAGCGCTAC 666
|||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||.||.||||||||.
Sbjct 593 TCACCAATGTGGTGGAGACGGTGCCTTGCGGCACCGTGCCTGGGAGCAAGGAGCTGCCGTGTGGAGAGCGCTAT 666
Query 667 TCGGTGGCCTTCTTCTGCCTGGACACGGCGTGCGTCATGATCTTCACCGTGGAGTACCTCCTGCGGCTCTTCGC 740
||||||||.|||||.|||||||||||.||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.||
Sbjct 667 TCGGTGGCTTTCTTTTGCCTGGACACTGCCTGTGTAATGATCTTCACAGTGGAGTACCTCCTCCGACTCTTTGC 740
Query 741 GGCTCCCAGCCGCTACCGCTTCATCCGCAGCGTCATGAGCATCATCGACGTGGTGGCCATCATGCCCTACTACA 814
|||.||||||.|.|||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct 741 GGCACCCAGCAGATACCGCTTCATCCGCAGTGTGATGAGCATTATCGACGTTGTGGCCATCATGCCCTATTACA 814
Query 815 TCGGTCTGGTCATGACCAACAACGAGGACGTGTCCGGCGCCTTCGTCACGCTCCGGGTCTTCCGCGTCTTCAGG 888
|.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.||.|||||.||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 815 TTGGCCTGGTCATGACCAACAATGAGGACGTGTCTGGGGCATTTGTCACACTCCGGGTCTTCCGTGTCTTCAGG 888
Query 889 ATCTTCAAGTTTTCCCGCCACTCCCAGGGCCTGCGGATCCTGGGCTACACACTGAAGAGCTGTGCCTCCGAACT 962
|||||||||||.|||||.||.||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||
Sbjct 889 ATCTTCAAGTTCTCCCGACATTCCCAGGGTCTACGGATCCTGGGCTACACCCTGAAGAGCTGTGCCTCAGAACT 962
Query 963 GGGCTTTCTTCTCTTCTCCCTCACCATGGCCATCATCATCTTTGCCACTGTGATGTTTTATGCCGAGAAGGGCT 1036
|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 963 GGGCTTTCTTCTCTTCTCCCTTACCATGGCCATCATCATCTTTGCCACTGTGATGTTTTATGCTGAGAAGGGCT 1036
Query 1037 CCTCGGCCAGCAAGTTCACAAGCATCCCTGCCTCGTTTTGGTACACCATTGTCACCATGACCACACTGGGATAC 1110
||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.
Sbjct 1037 CCTCTGCCAGCAAGTTCACAAGCATCCCTGCATCTTTCTGGTACACCATAGTCACCATGACTACACTGGGATAT 1110
Query 1111 GGAGACATGGTGCCTAAGACGATTGCAGGGAAGATCTTCGGCTCCATCTGCTCCTTGAGTGGCGTCCTGGTCAT 1184
||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.|||||||||||||||.|.||.||.|||||||||||
Sbjct 1111 GGAGACATGGTGCCTAAGACAATCGCAGGGAAGATATTTGGCTCCATCTGCTCCCTCAGCGGTGTCCTGGTCAT 1184
Query 1185 TGCCCTGCCAGTCCCTGTGATTGTTTCCAACTTTAGCCGGATTTACCACCAGAATCAGAGAGCTGATAAACGCA 1258
|||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1185 TGCCCTGCCGGTCCCTGTGATAGTCTCCAACTTTAGCAGGATCTACCACCAGAATCAGAGAGCAGATAAACGCA 1258
Query 1259 GGGCACAAAAGAAGGCCCGCCTTGCCAGGATCCGTGTGGCCAAAACAGGCAGTTCGAATGCATACCTGCACAGC 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.||.|||||.||||||||||||
Sbjct 1259 GGGCACAAAAGAAGGCCCGCCTTGCCAGGATCCGGGTGGCCAAAACGGGAAGCTCCAATGCCTACCTGCACAGC 1332
Query 1333 AAGCGCAACGGGCTCCTCAACGAGGCGCTGGAGCTGACGGGCACCCCAGAAGAGGAGCACATGGGCAAGACCAC 1406
||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1333 AAGCGCAATGGGCTCCTCAATGAGGCCCTGGAGCTGACGGGCACCCCAGAAGAGGAGCAGATGGGCAAGACCAC 1406
Query 1407 CTCACTCATCGAGAGCCAGCATCATCACCTGCTGCACTGCCTGGAAAAAACCACT------------------- 1461
|||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||.|.|||||.||||||
Sbjct 1407 CTCACTCATCGAGAGCCAGCACCACCACCTGCTACACTGCTTAGAAAAGACCACTGGGTTATCCTATCTTGTGG 1480
Query 1462 --------------------------------------AACCACGAGTTTATTGATGAGCAGATGTTTGAGCAG 1497
|||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 ATGATCCCCTGTTATCTGTACGAACCTCCACCATCAAGAACCATGAGTTTATTGATGAGCAGATGTTTGAGCAG 1554
Query 1498 AACTGCATGGAGAGTTCAATGCAGAACTACCCATCCACAAGAAGTCCCTCACTGTCCAGCCACCCAGGCCTCAC 1571
||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||||||.|.||||||||
Sbjct 1555 AACTGCATGGAGAGCTCGATGCAGAACTACCCCTCCACCAGAAGTCCTTCTCTGTCCAGCCACTCGGGCCTCAC 1628
Query 1572 TACCACCTGCTGCTCCCGTCGTAGTAAGAAGACCACACACCTGCCCAATTCTAACCTGCCAGCTACTCGCCTGC 1645
.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.|||||||
Sbjct 1629 CACCACCTGCTGCTCCCGTCGTAGCAAGAAGACCACACACCTGCCCAACTCTAACCTGCCTGCCACCCGCCTGC 1702
Query 1646 GCAGCATGCAAGAGCTCAGCACGATCCACATCCAGGGCAGTGAGCAGCCCTCCCTCACAACCAGTCGCTCCAGC 1719
||||||||||.||||||||||||.||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1703 GCAGCATGCAGGAGCTCAGCACGCTCCACATCCAGGGCAGCGAGCAGCCCTCCCTCACCACCAGTCGCTCCAGC 1776
Query 1720 CTTAATTTGAAAGCAGACGACGGACTGAGACCAAACTGCAAAACATCCCAGATCACCACAGCCATCATCAGCAT 1793
||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||
Sbjct 1777 CTTAATTTGAAAGCAGACGATGGACTGAGACCAAACTGCAAAACATCCCAGATTACCACGGCCATCATCAGCAT 1850
Query 1794 CCCCACTCCCCCAGCGCTAACCCCAGAGGGGGAAAGTCGGCCACCCCCTGCCAGCCCAGGCCCCAACACGAACA 1867
||||||.||||||||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 CCCCACCCCCCCAGCTCTGACCCCCGAGGGAGAAAGTCGGCCACCCCCTGCCAGCCCAGGCCCCAACACGAACA 1924
Query 1868 TTCCTTCCATAGCCAGCAATGTTGTCAAGGTCTCCGCCTTG 1908
|||||||||||.||||||||||.|||||||||||.||||||
Sbjct 1925 TTCCTTCCATAACCAGCAATGTCGTCAAGGTCTCTGCCTTG 1965