Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_06482
• Subject: NM_001172417.1
• Aligned Length: 1080
• Identities: 837
• Gaps: 240

Alignment

Query    1  ATGGACAGCAGTAATTGCAAAGTTATTGCTCCTCTCCTAAGTCAAAGATACCGGAGGATGGTCACCAAGGATGG  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CCACAGCACACTTCAAATGGATGGCGCTCAAAGAGGTCTTGCATATCTTCGAGATGCTTGGGGAATCCTAATGG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  ACATGCGCTGGCGTTGGATGATGTTGGTCTTTTCTGCTTCTTTTGTTGTCCACTGGCTTGTCTTTGCAGTGCTC  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  TGGTATGTTCTGGCTGAGATGAATGGTGATCTGGAACTAGATCATGATGCCCCACCTGAAAACCACACTATCTG  296
                              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ------------------ATGAATGGTGATCTGGAACTAGATCATGATGCCCCACCTGAAAACCACACTATCTG  56

Query  297  TGTCAAGTATATCACCAGTTTCACAGCTGCATTCTCCTTCTCCCTGGAGACACAACTCACAATTGGTTATGGTA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   57  TGTCAAGTATATCACCAGTTTCACAGCTGCATTCTCCTTCTCCCTGGAGACACAACTCACAATTGGTTATGGTA  130

Query  371  CCATGTTCCCCAGTGGTGACTGTCCAAGTGCAATCGCCTTACTTGCCATACAAATGCTCCTAGGCCTCATGCTA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  131  CCATGTTCCCCAGTGGTGACTGTCCAAGTGCAATCGCCTTACTTGCCATACAAATGCTCCTAGGCCTCATGCTA  204

Query  445  GAGGCTTTTATCACAGGTGCTTTTGTGGCGAAGATTGCCCGGCCAAAAAATCGAGCTTTTTCAATTCGCTTTAC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  205  GAGGCTTTTATCACAGGTGCTTTTGTGGCGAAGATTGCCCGGCCAAAAAATCGAGCTTTTTCAATTCGCTTTAC  278

Query  519  TGACATAGCAGTAGTAGCTCACATGGATGGCAAACCTAATCTTATCTTCCAAGTGGCCAACACCCGACCTAGCC  592
            |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  279  TGACACAGCAGTAGTAGCTCACATGGATGGCAAACCTAATCTTATCTTCCAAGTGGCCAACACCCGACCTAGCC  352

Query  593  CTCTAACCAGTGTCCGGGTCTCAGCTGTACTCTATCAGGAAAGAGAAAATGGCAAACTCTACCAGACCAGTGTG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  353  CTCTAACCAGTGTCCGGGTCTCAGCTGTACTCTATCAGGAAAGAGAAAATGGCAAACTCTACCAGACCAGTGTG  426

Query  667  GATTTCCACCTTGATGGCATCAGTTCTGACGAATGTCCATTCTTCATCTTTCCACTAACGTACTATCACTCCAT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  427  GATTTCCACCTTGATGGCATCAGTTCTGACGAATGTCCATTCTTCATCTTTCCACTAACGTACTATCACTCCAT  500

Query  741  TACACCATCAAGTCCTCTGGCTACTCTGCTCCAGCATGAAAATCCTTCTCACTTTGAATTAGTTGTATTCCTTT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  501  TACACCATCAAGTCCTCTGGCTACTCTGCTCCAGCATGAAAATCCTTCTCACTTTGAATTAGTTGTATTCCTTT  574

Query  815  CAGCAATGCAGGAGGGCACTGGAGAAATATGCCAAAGGAGGACATCCTACCTACAGTCTGAAATCATGTTACAT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  575  CAGCAATGCAGGAGGGCACTGGAGAAATATGCCAAAGGAGGACATCCTACCTACCGTCTGAAATCATGTTACAT  648

Query  889  CACTGTTTTGCATCTCTGTTGACCCGAGGTTCCAAATGTGAATATCAAATCAAGATGGAGAATTTTGACAAGAC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  649  CACTGTTTTGCATCTCTGTTGACCCGAGGTTCCAAAGGTGAATATCAAATCAAGATGGAGAATTTTGACAAGAC  722

Query  963  TGTCCCTGAATTTCCAACTCCTCTGGTTTCTAAAAGCCCAAACAGGACTGACCTGGATATCCACATCAATGGAC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  723  TGTCCCTGAATTTCCAACTCCTCTGGTTTCTAAAAGCCCAAACAGGACTGACCTGGATATCCACATCAATGGAC  796

Query 1037  AAAGCATTGACAATTTTCAGATCTCTGAAACAGGACTGACAGAA  1080
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  797  AAAGCATTGACAATTTTCAGATCTCTGAAACAGGACTGACAGAA  840