Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_06506
• Subject: NM_002274.4
• Aligned Length: 1374
• Identities: 1257
• Gaps: 114

Alignment

Query    1  ATGAGCCTCCGCCTGCAGAGCTCCTCTGCCAGCTATGGAGGTGGTTTCGGGGGTGGCTCTTGCCAGCTGGGAGG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAGCCTCCGCCTGCAGAGCTCCTCTGCCAGCTATGGAGGTGGTTTCGGGGGTGGCTCTTGCCAGCTGGGAGG  74

Query   75  AGGCCGTGGTGTCTCTACCTGTTCAACTCGGTTTGTGTCTGGGGGATCAGCTGGGGGCTATGGAGGCGGCGTGA  148
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AGGCCGTGGTGTCTCTACCTGTTCAACTCGGTTTGTGTCCGGGGGATCAGCTGGGGGCTATGGAGGCGGCGTGA  148

Query  149  GCTGTGGTTTTGGTGGAGGGGCTGGTAGTGGCTTTGGAGGTGGCTATGGAGGTGGCCTTGGAGGTGGCTATGGA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GCTGTGGTTTTGGTGGAGGGGCTGGTAGTGGCTTTGGAGGTGGCTATGGAGGTGGCCTTGGAGGTGGCTATGGA  222

Query  223  GGTGGCCTTGGAGGTGGCTTTGGTGGGGGTTTTGCTGGTGGCTTTGTTGACTTTGGTGCTTGTGATGGCGGCCT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GGTGGCCTTGGAGGTGGCTTTGGTGGGGGTTTTGCTGGTGGCTTTGTTGACTTTGGTGCTTGTGATGGCGGCCT  296

Query  297  CCTCACTGGCAATGAGAAGATCACCATGCAGAACCTCAACGACCGCCTGGCTTCCTACCTGGAGAAGGTGCGCG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCTCACTGGCAATGAGAAGATCACCATGCAGAACCTCAACGACCGCCTGGCTTCCTACCTGGAGAAGGTGCGCG  370

Query  371  CCCTGGAGGAGGCCAACGCTGACCTGGAGGTGAAGATCCGTGACTGGCACCTGAAGCAGAGCCCAGCTAGCCCT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CCCTGGAGGAGGCCAACGCTGACCTGGAGGTGAAGATCCGTGACTGGCACCTGAAGCAGAGCCCAGCTAGCCCT  444

Query  445  GAGCGGGACTACAGCCCCTACTACAAGACCATTGAAGAGCTCCGGGACAAGATCCTGACCGCCACCATTGAAAA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GAGCGGGACTACAGCCCCTACTACAAGACCATTGAAGAGCTCCGGGACAAGATCCTGACCGCCACCATTGAAAA  518

Query  519  CAACCGGGTCATCCTGGAGATTGACAATGCCAGGCTGGCTGTGGACGACTTCAGGCTCAAGTATGAGAATGAGC  592
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CAACCGGGTCATCCTGGAGATTGACAATGCCAGGCTGGCTGCGGACGACTTCAGGCTCAAGTATGAGAATGAGC  592

Query  593  TGGCCCTGCGCCAGAGCGTGGAGGCCGACATCAACGGCCTGCGCCGGGTGCTGGATGAGCTCACTCTGTCTAAG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TGGCCCTGCGCCAGAGCGTGGAGGCCGACATCAACGGCCTGCGCCGGGTGCTGGATGAGCTCACTCTGTCTAAG  666

Query  667  ACTGACCTGGAGATGCAGATCGAGAGCCTGAATGAAGAGCTAGCCTACATGAAGAAGAACCATGAAGAGGAGAT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ACTGACCTGGAGATGCAGATCGAGAGCCTGAATGAAGAGCTAGCCTACATGAAGAAGAACCATGAAGAGGAGAT  740

Query  741  GAAGGAATTTAGCAACCAGGTGGTCGGCCAGGTCAACGTGGAGATGGATGCCACCCCAGGCATTGACCTGACCC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GAAGGAATTTAGCAACCAGGTGGTCGGCCAGGTCAACGTGGAGATGGATGCCACCCCAGGCATTGACCTGACCC  814

Query  815  GCGTGCTGGCAGAGATGAGGGAGCAGTACGAGGCCATGGCAGAGAGGAACCGCCGGGATGCTGAGGAATGGTTC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GCGTGCTGGCAGAGATGAGGGAGCAGTACGAGGCCATGGCAGAGAGGAACCGCCGGGATGCTGAGGAATGGTTC  888

Query  889  CACGCCAAGAGTGCAGAGCTGAACAAGGAGGTGTCTACCAACACTGCCATGATTCAGACCAGCAAGACAGAGAT  962
            |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CACACCAAGAGTGCAGAGCTGAACAAGGAGGTGTCTACCAACACTGCCATGATTCAGACCAGCAAGACAGAGAT  962

Query  963  CACGGAGCTCAGGCGCACGCTCCAAGGCCTGGAGATTGAGCTGCAGTCCCAGCTGAGCATGAAAGCGGGGCTGG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CACGGAGCTCAGGCGCACGCTCCAAGGCCTGGAGATTGAGCTGCAGTCCCAGCTGAGCATGAAAGCGGGGCTGG  1036

Query 1037  AGAACACGGTGGCAGAGACGGAGTGCCGCTATGCCCTGCAGCTGCAGCAGATCCAGGGACTCATCAGCAGCATC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AGAACACGGTGGCAGAGACGGAGTGCCGCTATGCCCTGCAGCTGCAGCAGATCCAGGGACTCATCAGCAGCATC  1110

Query 1111  GAGGCCCAGCTGAGCGAGCTCCGCAGTGAGATGGAGTGCCAGAACCAAGAGTACAAGATGCTGCTGGACATCAA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GAGGCCCAGCTGAGCGAGCTCCGCAGTGAGATGGAGTGCCAGAACCAAGAGTACAAGATGCTGCTGGACATCAA  1184

Query 1185  GACACGTCTGGAGCAGGAGATCGCCACCTACCGCAGCCTGCTCGAGGGCCAGGACGCCAAGATGATTGGTTTCC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              
Sbjct 1185  GACACGTCTGGAGCAGGAGATCGCCACCTACCGCAGCCTGCTCGAGGGCCAGGACGCCAA--------------  1244

Query 1259  CTTCCTCAGCAGGAAGCGTCAGCCCCCGTAGCACCTCTGTTACCACGACTTCTAGTGCCTCTGTTACCACCACC  1332
                        ||||||||||||||||                                              
Sbjct 1245  ------------GAAGCGTCAGCCCCCG----------------------------------------------  1260

Query 1333  TCTAATGCCTCTGGTCGCCGCACTTCTGATGTCCGTAGGCCT  1374
                                                      
Sbjct 1261  ------------------------------------------  1260