Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_06529
• Subject: NM_005573.4
• Aligned Length: 1758
• Identities: 1757
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGCGACTGCGACCCCCGTGCCGCCGCGGATGGGCAGCCGCGCTGGCGGCCCCACCACGCCGCTGAGCCCCAC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGACTGCGACCCCCGTGCCGCCGCGGATGGGCAGCCGCGCTGGCGGCCCCACCACGCCGCTGAGCCCCAC  74

Query   75  GCGCCTGTCGCGGCTCCAGGAGAAGGAGGAGCTGCGCGAGCTCAATGACCGGCTGGCGGTGTACATCGACAAGG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GCGCCTGTCGCGGCTCCAGGAGAAGGAGGAGCTGCGCGAGCTCAATGACCGGCTGGCGGTGTACATCGACAAGG  148

Query  149  TGCGCAGCCTGGAGACGGAGAACAGCGCGCTGCAGCTGCAGGTGACGGAGCGCGAGGAGGTGCGCGGCCGTGAG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGCGCAGCCTGGAGACGGAGAACAGCGCGCTGCAGCTGCAGGTGACGGAGCGCGAGGAGGTGCGCGGCCGTGAG  222

Query  223  CTCACCGGCCTCAAGGCGCTCTACGAGACCGAGCTGGCCGACGCGCGACGCGCGCTCGACGACACGGCCCGCGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CTCACCGGCCTCAAGGCGCTCTACGAGACCGAGCTGGCCGACGCGCGACGCGCGCTCGACGACACGGCCCGCGA  296

Query  297  GCGCGCCAAGCTGCAGATCGAGCTGGGCAAGTGCAAGGCGGAACACGACCAGCTGCTCCTCAACTATGCTAAGA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GCGCGCCAAGCTGCAGATCGAGCTGGGCAAGTGCAAGGCGGAACACGACCAGCTGCTCCTCAACTATGCTAAGA  370

Query  371  AGGAATCTGATCTTAATGGCGCCCAGATCAAGCTTCGAGAATATGAAGCAGCACTGAATTCGAAAGATGCAGCT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGGAATCTGATCTTAATGGCGCCCAGATCAAGCTTCGAGAATATGAAGCAGCACTGAATTCGAAAGATGCAGCT  444

Query  445  CTTGCTACTGCACTTGGTGACAAAAAAAGTTTAGAGGGAGATTTGGAGGATCTGAAGGATCAGATTGCCCAGTT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CTTGCTACTGCACTTGGTGACAAAAAAAGTTTAGAGGGAGATTTGGAGGATCTGAAGGATCAGATTGCCCAGTT  518

Query  519  GGAAGCCTCCTTAGCTGCAGCCAAAAAACAGTTAGCAGATGAAACTTTACTTAAAGTAGATTTGGAGAATCGTT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GGAAGCCTCCTTAGCTGCAGCCAAAAAACAGTTAGCAGATGAAACTTTACTTAAAGTAGATTTGGAGAATCGTT  592

Query  593  GTCAGAGCCTTACTGAGGACTTGGAGTTTCGCAAAAGCATGTATGAAGAGGAGATTAACGAGACCAGAAGGAAG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GTCAGAGCCTTACTGAGGACTTGGAGTTTCGCAAAAGCATGTATGAAGAGGAGATTAACGAGACCAGAAGGAAG  666

Query  667  CATGAAACGCGCTTGGTAGAGGTGGATTCTGGGCGTCAAATTGAGTATGAGTACAAGCTGGCGCAAGCCCTTCA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CATGAAACGCGCTTGGTAGAGGTGGATTCTGGGCGTCAAATTGAGTATGAGTACAAGCTGGCGCAAGCCCTTCA  740

Query  741  TGAGATGAGAGAGCAACATGATGCCCAAGTGAGGCTGTATAAGGAGGAGCTGGAGCAGACTTACCATGCCAAAC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGAGATGAGAGAGCAACATGATGCCCAAGTGAGGCTGTATAAGGAGGAGCTGGAGCAGACTTACCATGCCAAAC  814

Query  815  TTGAGAATGCCAGACTGTCATCAGAGATGAATACTTCTACTGTCAACAGTGCCAGGGAAGAACTGATGGAAAGC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TTGAGAATGCCAGACTGTCATCAGAGATGAATACTTCTACTGTCAACAGTGCCAGGGAAGAACTGATGGAAAGC  888

Query  889  CGCATGAGAATTGAGAGCCTTTCATCCCAGCTTTCTAATCTACAGAAAGAGTCTAGAGCATGTTTGGAAAGGAT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CGCATGAGAATTGAGAGCCTTTCATCCCAGCTTTCTAATCTACAGAAAGAGTCTAGAGCATGTTTGGAAAGGAT  962

Query  963  TCAAGAATTAGAGGACTTGCTTGCTAAAGAAAAAGACAACTCTCGTCGCATGCTGACAGACAAAGAGAGAGAGA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TCAAGAATTAGAGGACTTGCTTGCTAAAGAAAAAGACAACTCTCGTCGCATGCTGACAGACAAAGAGAGAGAGA  1036

Query 1037  TGGCGGAAATAAGGGATCAAATGCAGCAACAGCTGAATGACTATGAACAGCTTCTTGATGTAAAGTTAGCCCTG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TGGCGGAAATAAGGGATCAAATGCAGCAACAGCTGAATGACTATGAACAGCTTCTTGATGTAAAGTTAGCCCTG  1110

Query 1111  GACATGGAAATCAGTGCTTACAGGAAACTCTTACAAGGCGAAGAAGAGAGGTTGAAGCTGTCTCCAAGCCCTTC  1184
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GACATGGAAATCAGTGCTTACAGGAAACTCTTAGAAGGCGAAGAAGAGAGGTTGAAGCTGTCTCCAAGCCCTTC  1184

Query 1185  TTCCCGTGTGACAGTATCCCGAGCATCCTCAAGTCGTAGTGTACGTACAACTAGAGGAAAGCGGAAGAGGGTTG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TTCCCGTGTGACAGTATCCCGAGCATCCTCAAGTCGTAGTGTACGTACAACTAGAGGAAAGCGGAAGAGGGTTG  1258

Query 1259  ATGTGGAAGAATCAGAGGCGAGTAGTAGTGTTAGCATCTCTCATTCCGCCTCAGCCACTGGAAATGTTTGCATC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  ATGTGGAAGAATCAGAGGCGAGTAGTAGTGTTAGCATCTCTCATTCCGCCTCAGCCACTGGAAATGTTTGCATC  1332

Query 1333  GAAGAAATTGATGTTGATGGGAAATTTATCCGCTTGAAGAACACTTCTGAACAGGATCAACCAATGGGAGGCTG  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GAAGAAATTGATGTTGATGGGAAATTTATCCGCTTGAAGAACACTTCTGAACAGGATCAACCAATGGGAGGCTG  1406

Query 1407  GGAGATGATCAGAAAAATTGGAGACACATCAGTCAGTTATAAATATACCTCAAGATATGTGCTGAAGGCAGGCC  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GGAGATGATCAGAAAAATTGGAGACACATCAGTCAGTTATAAATATACCTCAAGATATGTGCTGAAGGCAGGCC  1480

Query 1481  AGACTGTTACAATTTGGGCTGCAAACGCTGGTGTCACAGCCAGCCCCCCAACTGACCTCATCTGGAAGAACCAG  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  AGACTGTTACAATTTGGGCTGCAAACGCTGGTGTCACAGCCAGCCCCCCAACTGACCTCATCTGGAAGAACCAG  1554

Query 1555  AACTCGTGGGGCACTGGCGAAGATGTGAAGGTTATATTGAAAAATTCTCAGGGAGAGGAGGTTGCTCAAAGAAG  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  AACTCGTGGGGCACTGGCGAAGATGTGAAGGTTATATTGAAAAATTCTCAGGGAGAGGAGGTTGCTCAAAGAAG  1628

Query 1629  TACAGTCTTTAAAACAACCATACCTGAAGAAGAGGAGGAGGAGGAAGAAGCAGCTGGAGTGGTTGTTGAGGAAG  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  TACAGTCTTTAAAACAACCATACCTGAAGAAGAGGAGGAGGAGGAAGAAGCAGCTGGAGTGGTTGTTGAGGAAG  1702

Query 1703  AACTTTTCCACCAGCAGGGAACCCCAAGAGCATCCAATAGAAGCTGTGCAATTATG  1758
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  AACTTTTCCACCAGCAGGGAACCCCAAGAGCATCCAATAGAAGCTGTGCAATTATG  1758