Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_06529
• Subject: NM_010721.2
• Aligned Length: 1765
• Identities: 1556
• Gaps: 8

Alignment

Query    1  ATGGCGACTGCGACCCCCGT---GCCGCCGCGGATGGGCAGCCGCGCTGGCGGCCCCACCACGCCGCTGAGCCC  71
            ||||||||.|||||||||||   ||.||.||||..||||||||||||..|||.||||.||||||||||.|||||
Sbjct    1  ATGGCGACCGCGACCCCCGTGCAGCAGCAGCGGGCGGGCAGCCGCGCCAGCGCCCCCGCCACGCCGCTCAGCCC  74

Query   72  CACGCGCCTGTCGCGGCTCCAGGAGAAGGAGGAGCTGCGCGAGCTCAATGACCGGCTGGCGGTGTACATCGACA  145
            |||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.|
Sbjct   75  CACGCGCCTGTCGCGCCTGCAGGAGAAAGAGGAGCTGCGGGAGCTCAACGACCGCCTGGCTGTGTACATCGATA  148

Query  146  AGGTGCGCAGCCTGGAGACGGAGAACAGCGCGCTGCAGCTGCAGGTGACGGAGCGCGAGGAGGTGCGCGGCCGT  219
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.
Sbjct  149  AGGTGCGCAGCCTGGAGACGGAGAACAGCGCGCTGCAGCTGCAGGTGACCGAGCGCGAGGAGGTGCGCGGCCGC  222

Query  220  GAGCTCACCGGCCTCAAGGCGCTCTACGAGACCGAGCTGGCCGACGCGCGACGCGCGCTCGACGACACGGCCCG  293
            ||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.||||||||||||||
Sbjct  223  GAGCTCACCGGCCTCAAGGCTCTCTACGAGACCGAGCTGGCCGACGCACGCCGCGCTCTGGACGACACGGCCCG  296

Query  294  CGAGCGCGCCAAGCTGCAGATCGAGCTGGGCAAGTGCAAGGCGGAACACGACCAGCTGCTCCTCAACTATGCTA  367
            |||||||||||||||.|||||||||||||||||||.||||||.||.||||||||||||||.|||||.|||||.|
Sbjct  297  CGAGCGCGCCAAGCTCCAGATCGAGCTGGGCAAGTTCAAGGCCGAGCACGACCAGCTGCTGCTCAATTATGCCA  370

Query  368  AGAAGGAATCTGATCTTAATGGCGCCCAGATCAAGCTTCGAGAATATGAAGCAGCACTGAATTCGAAAGATGCA  441
            ||||||||||||||||.|.|||.||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.||.||.||.|||||.
Sbjct  371  AGAAGGAATCTGATCTCAGTGGAGCCCAGATCAAGCTTCGAGAGTATGAGGCGGCACTAAACTCTAAGGATGCG  444

Query  442  GCTCTTGCTACTGCACTTGGTGACAAAAAAAGTTTAGAGGGAGATTTGGAGGATCTGAAGGATCAGATTGCCCA  515
            ||.||.||||||||.||.||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  445  GCGCTGGCTACTGCCCTAGGGGACAAAAAGAGTTTAGAGGGAGACTTGGAGGATCTGAAAGATCAGATTGCCCA  518

Query  516  GTTGGAAGCCTCCTTAGCTGCAGCCAAAAAACAGTTAGCAGATGAAACTTTACTTAAAGTAGATTTGGAGAATC  589
            |.|.|||||.||||||.||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct  519  GCTAGAAGCATCCTTATCTGCCGCCAAAAAGCAGTTAGCAGATGAAACTTTACTTAAAGTGGATTTGGAGAATC  592

Query  590  GTTGTCAGAGCCTTACTGAGGACTTGGAGTTTCGCAAAAGCATGTATGAAGAGGAGATTAACGAGACCAGAAGG  663
            |.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||..|||||||||||||||||.||.|||||.||.|||
Sbjct  593  GCTGTCAGAGCCTTACTGAGGACTTGGAGTTTCGTAAAAATATGTATGAAGAGGAGATCAATGAGACAAGGAGG  666

Query  664  AAGCATGAAACGCGCTTGGTAGAGGTGGATTCTGGGCGTCAAATTGAGTATGAGTACAAGCTGGCGCAAGCCCT  737
            ||||||||.||.||||||||.||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  667  AAGCATGAGACCCGCTTGGTGGAAGTGGACTCTGGGCGTCAGATTGAGTATGAGTACAAGCTGGCTCAAGCCCT  740

Query  738  TCATGAGATGAGAGAGCAACATGATGCCCAAGTGAGGCTGTATAAGGAGGAGCTGGAGCAGACTTACCATGCCA  811
            .|||||||||.|.|||||.||.||.||.||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||.||||
Sbjct  741  GCATGAGATGCGGGAGCAGCACGACGCGCAGGTGAGGCTGTACAAGGAAGAGCTGGAGCAGACCTACCACGCCA  814

Query  812  AACTTGAGAATGCCAGACTGTCATCAGAGATGAATACTTCTACTGTCAACAGTGCCAGGGAAGAACTGATGGAA  885
            |.|||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||.|||||||.||||||||.
Sbjct  815  AGCTTGAGAATGCCAGACTCTCCTCAGAGATGAACACTTCCACTGTCAACAGTGCCCGGGAAGAGCTGATGGAG  888

Query  886  AGCCGCATGAGAATTGAGAGCCTTTCATCCCAGCTTTCTAATCTACAGAAAGAGTCTAGAGCATGTTTGGAAAG  959
            |||||.|||||.||.||||||||.||.||.|||||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  889  AGCCGGATGAGGATCGAGAGCCTCTCCTCACAGCTCTCTAACCTGCAGAAAGAGTCTAGAGCGTGTTTGGAAAG  962

Query  960  GATTCAAGAATTAGAGGACTTGCTTGCTAAAGAAAAAGACAACTCTCGTCGCATGCTGACAGACAAAGAGAGAG  1033
            |||.||.|||||.||||||.||||||||||.||.|.|||||||||.||.|||||||||.|.||||.||||||||
Sbjct  963  GATCCAGGAATTGGAGGACATGCTTGCTAAGGAGAGAGACAACTCGCGCCGCATGCTGTCTGACAGAGAGAGAG  1036

Query 1034  AGATGGCGGAAATAAGGGATCAAATGCAGCAACAGCTGAATGACTATGAACAGCTTCTTGATGTAAAGTTAGCC  1107
            ||||||||||.||.|||||.||.||||||||.|||||||.|||.|||||.|||||.||.||.||.|||.|.|||
Sbjct 1037  AGATGGCGGAGATCAGGGACCAGATGCAGCAGCAGCTGAGTGATTATGAGCAGCTGCTGGACGTGAAGCTGGCC  1110

Query 1108  CTGGACATGGAAATCAGTGCTTACAGGAAACTCTTACAAGGCGAAGAAGAGAGGTTGAAGCTGTCTCCAAGCCC  1181
            |||||||||||.|||||.||.||||||||.|||.|..||||||||||||||.||||.|||||.|||||||||||
Sbjct 1111  CTGGACATGGAGATCAGCGCCTACAGGAAGCTCCTGGAAGGCGAAGAAGAGCGGTTAAAGCTCTCTCCAAGCCC  1184

Query 1182  TTCTTCCCGTGTGACAGTATCCCGAGCATCCTCAAGTCGTAGTGTACGTACAACTAGAGGAAAGCGGAAGAGGG  1255
            |||||||||.|||||.||.|||.||||.|||||.|||||.|||||.||.||.||.|||||||||||||||||.|
Sbjct 1185  TTCTTCCCGGGTGACCGTGTCCAGAGCGTCCTCCAGTCGCAGTGTGCGCACCACCAGAGGAAAGCGGAAGAGAG  1258

Query 1256  TTGATGTGGAAGAATCAGAGGCGAGTAGTAGTGTTAGCATCTCTCATTCCGCCTCAGCCACTGGAAATGTTTGC  1329
            ||||||||||.||.||.||||||||.||.|||||||||||.||.||.||.|||||||||||.||.||.||.|||
Sbjct 1259  TTGATGTGGAGGAGTCGGAGGCGAGCAGCAGTGTTAGCATTTCCCACTCTGCCTCAGCCACGGGGAACGTGTGC  1332

Query 1330  ATCGAAGAAATTGATGTTGATGGGAAATTTATCCGCTTGAAGAACACTTCTGAACAGGATCAACCAATGGGAGG  1403
            ||.|||||.||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  ATTGAAGAGATAGATGTTGATGGGAAGTTTATTCGCTTGAAGAACACTTCTGAGCAGGATCAACCAATGGGAGG  1406

Query 1404  CTGGGAGATGATCAGAAAAATTGGAGACACATCAGTCAGTTATAAATATACCTCAAGATATGTGCTGAAGGCAG  1477
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1407  CTGGGAGATGATCAGAAAAATTGGAGACACATCAGTCAGTTACAAATATACCTCAAGATATGTGCTGAAGGCTG  1480

Query 1478  GCCAGACTGTTACAATTTGGGCTGCAAACGCTGGTGTCACAGCCAGCCCCCCAACTGACCTCATCTGGAAGAAC  1551
            ||||||||||.|||.|.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  GCCAGACTGTCACAGTGTGGGCTGCAAATGCTGGCGTCACAGCCAGCCCTCCAACTGACCTCATCTGGAAGAAC  1554

Query 1552  CAGAACTCGTGGGGCACTGGCGAAGATGTGAAGGTTATATTGAAAAATTCTCAGGGAGAGGAGGTTGCTCAAAG  1625
            ||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1555  CAGAACTCTTGGGGTACTGGTGAAGATGTGAAGGTTATATTGAAGAATTCTCAGGGAGAGGAGGTTGCTCAGAG  1628

Query 1626  AAGTACAGTCTTTAAAACAACCATACCTGAAGAAGAGGAGGAGGAGGAAGAAGCAGC----TGGAGTGGTTGTT  1695
            |||.||||||||.||.||.||||||||.||.||.||||||||||||| ||.||.|||    .|||||||.|||.
Sbjct 1629  AAGCACAGTCTTCAAGACCACCATACCCGAGGAGGAGGAGGAGGAGG-AGGAGGAGCCCATCGGAGTGGCTGTG  1701

Query 1696  GAGGAAGAACTTTTCCACCAGCAGGGAACCCCAAGAGCATCCAATAGAAGCTGTGCAATTATG  1758
            |||||.||.|.||||||||||||||||.||||||||||||||||||.|||||||||.||||||
Sbjct 1702  GAGGAGGAGCGTTTCCACCAGCAGGGAGCCCCAAGAGCATCCAATAAAAGCTGTGCCATTATG  1764