Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_06570
- Subject:
- XM_006724242.4
- Aligned Length:
- 2222
- Identities:
- 2151
- Gaps:
- 46
Alignment
Query 1 ATGTCGGGATTCGACGATCCTGGCATTTTCTACAGCGACAGCTTCGGGGGCGACGCCCAGGCCGACGAGGGGCA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGTCGGGATTCGACGATCCTGGCATTTTCTACAGCGACAGCTTCGGGGGCGACGCCCAGGCCGACGAGGGGCA 74
Query 75 GGCCCGCAAATCGCAGCTGCAGAGGCGCTTCAAGGAGTTCCTGCGGCAGTACCGAGTGGGCACCGACCGCACGG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GGCCCGCAAATCGCAGCTGCAGAGGCGCTTCAAGGAGTTCCTGCGGCAGTACCGAGTGGGCACCGACCGCACGG 148
Query 149 GCTTCACCTTCAAATACAGGGATGAACTCAAGCGGCATTACAACCTGGGGGAGTACTGGATTGAGGTGGAGATG 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 GCTTCACCTTCAAATACAGGGATGAACTCAAGCGGCATTACAACCTGGGGGAGTACTGGATTGAGGTGGAGATG 222
Query 223 GAGGATCTGGCCAGCTTTGATGAGGACCTGGCCGACTACTTGTACAAGCAGCCAGCCGAGCACCTGCAGCTGCT 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GAGGATCTGGCCAGCTTTGATGAGGACCTGGCCGACTACTTGTACAAGCAGCCAGCCGAGCACCTGCAGCTGCT 296
Query 297 GGAGGAAGCTGCCAAGGAGGTAGCTGATGAGGTGACCCGGCCCCGGCCTTCTGGGGAGGAGGTGCTCCAGGACA 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GGAGGAAGCTGCCAAGGAGGTAGCTGATGAGGTGACCCGGCCCCGGCCTTCTGGGGAGGAGGTGCTCCAGGACA 370
Query 371 TCCAGGTCATGCTCAAGTCGGACGCCAGCCCTTCCAGCATTCGTAGCCTGAAGTCGGACATGATGTCACACCTG 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TCCAGGTCATGCTCAAGTCGGACGCCAGCCCTTCCAGCATTCGTAGCCTGAAGTCGGACATGATGTCACACCTG 444
Query 445 GTGAAGATCCCTGGCATCATCATCGCGGCCTCTGCGGTCCGTGCCAAGGCCACCCGCATCTCTATCCAGTGCCG 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GTGAAGATCCCTGGCATCATCATCGCGGCCTCTGCGGTCCGTGCCAAGGCCACCCGCATCTCTATCCAGTGCCG 518
Query 519 CAGCTGCCGCAACACCCTCACCAACATTGCCATGCGCCCTGGCCTCGAGGGCTATGCCCTGCCCAGGAAGTGCA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CAGCTGCCGCAACACCCTCACCAACATTGCCATGCGCCCTGGCCTCGAGGGCTATGCCCTGCCCAGGAAGTGCA 592
Query 593 ACACAGATCAGGCTGGGCGCCCCAAATGCCCATTGGACCCGTACTTCATCATGCCCGACAAATGCAAATGCGTG 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 ACACAGATCAGGCTGGGCGCCCCAAATGCCCATTGGACCCGTACTTCATCATGCCCGACAAATGCAAATGCGTG 666
Query 667 GACTTCCAGACCCTGAAGCTGCAGGAGCTGCCTGATGCAGTCCCCCACGGGGAGATGCCCAGACACATGCAGCT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GACTTCCAGACCCTGAAGCTGCAGGAGCTGCCTGATGCAGTCCCCCACGGGGAGATGCCCAGACACATGCAGCT 740
Query 741 CTACTGCGACAGGTACCTGTGTGACAAGGTCGTCCCTGGGAACAGGGTTACCATCATGGGCATCTACTCCATCA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 CTACTGCGACAGGTACCTGTGTGACAAGGTCGTCCCTGGGAACAGGGTTACCATCATGGGCATCTACTCCATCA 814
Query 815 AGAAGTTTGGCCTGACCACCAGCAGGGGCCGTGACAGGGTGGGCGTGGGCATCCGAAGCTCCTACATCCGTGTC 888
||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 AGAAGTTTGGCCTGACTACCAGCAGGGGCCGTGACAGGGTGGGCGTGGGCATCCGAAGCTCCTACATCCGTGTC 888
Query 889 CTGGGCATCCAGGTGGACACAGATGGCTCTGGCCGCAGCTTTGCTGGGGCCGTGAGCCCCCAGGAGGAGGAGGA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 CTGGGCATCCAGGTGGACACAGATGGCTCTGGCCGCAGCTTTGCTGGGGCCGTGAGCCCCCAGGAGGAGGAGGA 962
Query 963 GTTCCGTCGCCTGGCTGCCCTCCCAAATGTCTATGAGGTCATCTCCAAGAGCATCGCCCCCTCCATCTTTGGGG 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GTTCCGTCGCCTGGCTGCCCTCCCAAATGTCTATGAGGTCATCTCCAAGAGCATCGCCCCCTCCATCTTTGGGG 1036
Query 1037 GCACAGACATGAAGAAGGCCATTGCCTGCCTGCTCTTTGGGGGCTCCCGAAAGAGGCTCCCTGATGGACTTACT 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 GCACAGACATGAAGAAGGCCATTGCCTGCCTGCTCTTTGGGGGCTCCCGAAAGAGGCTCCCTGATGGACTTACT 1110
Query 1111 CGCCGAGGAGACATCAACCTGCTGATGCTAGGGGACCCTGGGACAGCCAAGTCCCAGCTTCTGAAGTTTGTGGA 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 CGCCGAGGAGACATCAACCTGCTGATGCTAGGGGACCCTGGGACAGCCAAGTCCCAGCTTCTGAAGTTTGTGGA 1184
Query 1185 GAAGTGTTCTCCCATTGGGGTATACACGTCTGGGAAAGGCAGCAGCGCAGCTGGACTGACAGCCTCGGTGATGA 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 GAAGTGTTCTCCCATTGGGGTATACACGTCTGGGAAAGGCAGCAGCGCAGCTGGACTGACAGCCTCGGTGATGA 1258
Query 1259 GGGACCCTTCGTCCCGGAATTTCATCATGGAGGGCGGAGCCATGGTCCTGGCCGATGGTGGGGTCGTCTGTATT 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 GGGACCCTTCGTCCCGGAATTTCATCATGGAGGGCGGAGCCATGGTCCTGGCCGATGGTGGGGTCGTCTGTATT 1332
Query 1333 GACGAGTTTGACAAGATGCGAGAAGATGACCGTGTGGCAATCCACGAAGCCATGGAGCAGCAGACCATCTCTAT 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 GACGAGTTTGACAAGATGCGAGAAGATGACCGTGTGGCAATCCACGAAGCCATGGAGCAGCAGACCATCTCTAT 1406
Query 1407 CGCCAAGGCTGGGATCACCACCACCCTGAACTCCCGCTGCTCCGTCCTGGCTGCTGCCAACTCAGTGTTCGGCC 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 CGCCAAGGCTGGGATCACCACCACCCTGAACTCCCGCTGCTCCGTCCTGGCTGCTGCCAACTCAGTGTTCGGCC 1480
Query 1481 GCTGGGATGAGACGAAGGGGGAGGACAACATTGACTTCATGCCCACCATCTTGTCGCGCTTCGACATGATCTTC 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 GCTGGGATGAGACGAAGGGGGAGGACAACATTGACTTCATGCCCACCATCTTGTCGCGCTTCGACATGATCTTC 1554
Query 1555 ATCGTCAAGGATGAGCACAATGAGGAGAGGGATGTGATGCTGGCCAAGCATGTCATCACTCTGCACGTGAGCGC 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 ATCGTCAAGGATGAGCACAATGAGGAGAGGGATGTGATGCTGGCCAAGCATGTCATCACTCTGCACGTGAGCGC 1628
Query 1629 ACTGACACAGACACAGGCTGTGGAGGGCGAGATTGACCTGGCCAAGCTGAAGAAGTTTATTGCCTACTGCCGAG 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 ACTGACACAGACACAGGCTGTGGAGGGCGAGATTGACCTGGCCAAGCTGAAGAAGTTTATTGCCTACTGCCGAG 1702
Query 1703 TGAAATGTGGCCCCCGGCTGTCAGCAGAGGCTGCAGAGAAACTGAAGAACCGCTACATCATCATGCGGAGCGGG 1776
||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 TGAAGTGTGGCCCCCGGCTGTCAGCAGAGGCTGCAGAGAAACTGAAGAACCGCTACATCATCATGCGGAGCGGG 1776
Query 1777 GCCCGTCAGCACGAGAGGGACAGTGACCGCCGCTCCAGCATCCCCATCACTGTGCGGCAGCTGGAGGCCATTGT 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 GCCCGTCAGCACGAGAGGGACAGTGACCGCCGCTCCAGCATCCCCATCACTGTGCGGCAGCTGGAGGCCATTGT 1850
Query 1851 GCGCATCGCGGAAGCCCTCAGCAAGATGAAGCTGCAGCCCTTCGCCACAGAGGCAGATGTGGAGGAGGCCCTGC 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 GCGCATCGCGGAAGCCCTCAGCAAGATGAAGCTGCAGCCCTTCGCCACAGAGGCAGATGTGGAGGAGGCCCTGC 1924
Query 1925 GGCTCTTCCAAGTGTCCACGTTGGATGCTGCCTTGTCCGGTACCCTGTCAGGGGTGGAGGGCTTCACCAGCCAG 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 GGCTCTTCCAAGTGTCCACGTTGGATGCTGCCTTGTCCGGTACCCTGTCAGGGGTGGAGGGCTTCACCAGCCAG 1998
Query 1999 GAGGACCAGGAGATGCTGAGCCGCATCGAGAAGCAGCTCAAGCGCCGCTTTGCCATTGGCTCCCAGGTGTCTGA 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 GAGGACCAGGAGATGCTGAGCCGCATCGAGAAGCAGCTCAAGCGCCGCTTTGCCATTGGCTCCCAGGTGTCTGA 2072
Query 2073 GCACAGCATCATCAAGGACTTCACCAAGCAGAAATACCCGGAGCACGCCATCC-------ACAAGGTGCTGCAG 2139
||||||||||||||||||||||||||||| |||.|.||.||| |||| ||...||
Sbjct 2073 GCACAGCATCATCAAGGACTTCACCAAGC------------AGCTCTCCCTCCTGTCAGGACAA---GCAAAAG 2131
Query 2140 C-TCATGCTGCGGC-GCGGC-----GAGATCCAGCATCGCATG-----CAGCGCAAGGTTCTCTACCGC-CTCA 2200
| ||| |.|.| |.|.| |||||..|| ||| ||| .||..|||....||.|| .|..
Sbjct 2132 CATCA----GAGACAGAGACAGACAGAGATAGAG------ATGAAAGACAG-ACAGAGTTGGAGACGGCGATAG 2194
Query 2201 AG 2202
||
Sbjct 2195 AG 2196