Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_06575
• Subject: XM_017022196.1
• Aligned Length: 1533
• Identities: 1123
• Gaps: 408

Alignment

Query    1  ATGGGGCGGAAGAAAATACAAATCACACGCATAATGGATGAAAGGAACCGACAGGTCACTTTTACAAAGAGAAA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GTTTGGATTAATGAAGAAAGCCTATGAACTTAGTGTGCTCTGTGACTGTGAAATAGCACTCATCATTTTCAACA  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  GCTCTAACAAACTGTTTCAATATGCTAGCACTGATATGGACAAAGTTCTTCTCAAGTATACAGAATATAATGAA  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  CCTCATGAAAGCAGAACCAACTCGGATATTGTTGAGGCTCTGAACAAGAAGGAACACAGAGGGTGCGACAGCCC  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  AGACCCTGATACTTCATATGTGCTAACTCCACATACAGAAGAAAAATATAAAAAAATTAATGAGGAATTTGATA  370
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  371  ATATGATGCGGAATCATAAAATCGC------------ACCTGGTCTGCCACCTCAGAACTTTTCAATGTCTGTC  432
              |||||||||||||||||||||||            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  --ATGATGCGGAATCATAAAATCGCAGTGAGTACTAAACCTGGTCTGCCACCTCAGAACTTTTCAATGTCTGTC  72

Query  433  ACAGTTCCAGTGACCAGCCCCAATGCTTTGTCCTACACTAACCCAGGGAGTTCACTGGTGTCCCCATCTTTGGC  506
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   73  ACAGTTCCAGTGACCAGCCCCAATGCTTTGTCCTACACTAACCCAGGGAGTTCACTGGTGTCCCCATCTTTGGC  146

Query  507  AGCCAGCTCAACGTTAACAGATTCAAGCATGCTCTCTCCACCTCAAACCACATTACATAGAAATGTGTCTCCTG  580
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  147  AGCCAGCTCAACGTTAACAGATTCAAGCATGCTCTCTCCACCTCAAACCACATTACATAGAAATGTGTCTCCTG  220

Query  581  GAGCTCCTCAGAGACCACCAAGTACTGGCAATGCAGGTGGGATGTTGAGCACTACAGACCTCACAGTGCCAAAT  654
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  221  GAGCTCCTCAGAGACCACCAAGTACTGGCAATGCAGGTGGGATGTTGAGCACTACAGACCTCACAGTGCCAAAT  294

Query  655  GGAGCTGGAAGCAGTCCAGTGGGGAATGGATTTGTAAACTCAAGAGCTTCTCCAAATTTGATTGGAGCTACTGG  728
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  295  GGAGCTGGAAGCAGTCCAGTGGGGAATGGATTTGTAAACTCAAGAGCTTCTCCAAATTTGATTGGAGCTACTGG  368

Query  729  TGCAAATAGCTTAGGCAAAGTCATGCCTACAAAGTCTCCCCCTCCACCAGGTGGTGGTAATCTTGGAATGAACA  802
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  369  TGCAAATAGCTTAGGCAAAGTCATGCCTACAAAGTCTCCCCCTCCACCAGGTGGTGGTAATCTTGGAATGAACA  442

Query  803  GTAGGAAACCAGATCTTCGAGTTGTCATCCCCCCTTCAAGCAAGGGCATGATGCCTCCACTA------------  864
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            
Sbjct  443  GTAGGAAACCAGATCTTCGAGTTGTCATCCCCCCTTCAAGCAAGGGCATGATGCCTCCACTATCGGAGGAAGAG  516

Query  865  ------------AATACCCAAAGGATCAGTAGTTCTCAAGCCACTCAACCTCTTGCTACCCCAGTCGTGTCTGT  926
                        ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  517  GAATTGGAGTTGAATACCCAGAGGATCAGTAGTTCTCAAGCCACTCAACCTCTTGCTACCCCAGTCGTGTCTGT  590

Query  927  GACAACCCCAAGCTTGCCTCCGCAAGGACTTGTGTACTCAGCAATGCCGACTGCCTACAACACTGATTATTCAC  1000
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  591  GACAACCCCAAGCTTGCCTCCGCAAGGACTTGTGTACTCAGCAATGCCGACTGCCTACAACACTGATTATTCAC  664

Query 1001  TGACCAGCGCTGACCTGTCAGCCCTTCAAGGCTTCAACTCGCCAGGAATGCTGTCGCTGGGACAGGTGTCGGCC  1074
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  665  TGACCAGCGCTGACCTGTCAGCCCTTCAAGGCTTCAACTCGCCAGGAATGCTGTCGCTGGGACAGGTGTCGGCC  738

Query 1075  TGGCAGCAGCACCACCTAGGACAAGCAGCCCTCAGCTCTCTTGTTGCTGGAGGGCAGTTATCTCAGGGTTCCAA  1148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  739  TGGCAGCAGCACCACCTAGGACAAGCAGCCCTCAGCTCTCTTGTTGCTGGAGGGCAGTTATCTCAGGGTTCCAA  812

Query 1149  TTTATCCATTAATACCAACCAAAACATCAGCATCAAGTCCGAACCGATTTCACCTCCTCGGGATCGTATGACCC  1222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  813  TTTATCCATTAATACCAACCAAAACATCAGCATCAAGTCCGAACCGATTTCACCTCCTCGGGATCGTATGACCC  886

Query 1223  CATCGGGCTTCCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCCGCCGCCACCACCGCAGCCCCAGCCACAA  1296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  887  CATCGGGCTTCCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCCGCCGCCACCACCGCAGCCCCAGCCACAA  960

Query 1297  CCCCCGCAGCCCCAGCCCCGACAGGAAATGGGGCGCTCCCCTGTGGACAGTCTGAGCAGCTCTAGTAGCTCCTA  1370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  961  CCCCCGCAGCCCCAGCCCCGACAGGAAATGGGGCGCTCCCCTGTGGACAGTCTGAGCAGCTCTAGTAGCTCCTA  1034

Query 1371  TGATGGCAGTGATCGGGAGGATCCACGGGGCGACTTCCATTCTCCAATTGTGCTTGGCCGACCCCCAAACACTG  1444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1035  TGATGGCAGTGATCGGGAGGATCCACGGGGCGACTTCCATTCTCCAATTGTGCTTGGCCGACCCCCAAACACTG  1108

Query 1445  AGGACAGAGAAAGCCCTTCTGTAAAGCGAATGAGGATGGACGCGTGGGTTACC  1497
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1109  AGGACAGAGAAAGCCCTTCTGTAAAGCGAATGAGGATGGACGCGTGGGTGACC  1161