Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_06575
- Subject:
- XM_017022197.2
- Aligned Length:
- 1521
- Identities:
- 1123
- Gaps:
- 396
Alignment
Query 1 ATGGGGCGGAAGAAAATACAAATCACACGCATAATGGATGAAAGGAACCGACAGGTCACTTTTACAAAGAGAAA 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 GTTTGGATTAATGAAGAAAGCCTATGAACTTAGTGTGCTCTGTGACTGTGAAATAGCACTCATCATTTTCAACA 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 GCTCTAACAAACTGTTTCAATATGCTAGCACTGATATGGACAAAGTTCTTCTCAAGTATACAGAATATAATGAA 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 CCTCATGAAAGCAGAACCAACTCGGATATTGTTGAGGCTCTGAACAAGAAGGAACACAGAGGGTGCGACAGCCC 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 AGACCCTGATACTTCATATGTGCTAACTCCACATACAGAAGAAAAATATAAAAAAATTAATGAGGAATTTGATA 370
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 371 ATATGATGCGGAATCATAAAATCGCACCTGGTCTGCCACCTCAGAACTTTTCAATGTCTGTCACAGTTCCAGTG 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 --ATGATGCGGAATCATAAAATCGCACCTGGTCTGCCACCTCAGAACTTTTCAATGTCTGTCACAGTTCCAGTG 72
Query 445 ACCAGCCCCAATGCTTTGTCCTACACTAACCCAGGGAGTTCACTGGTGTCCCCATCTTTGGCAGCCAGCTCAAC 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 73 ACCAGCCCCAATGCTTTGTCCTACACTAACCCAGGGAGTTCACTGGTGTCCCCATCTTTGGCAGCCAGCTCAAC 146
Query 519 GTTAACAGATTCAAGCATGCTCTCTCCACCTCAAACCACATTACATAGAAATGTGTCTCCTGGAGCTCCTCAGA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 147 GTTAACAGATTCAAGCATGCTCTCTCCACCTCAAACCACATTACATAGAAATGTGTCTCCTGGAGCTCCTCAGA 220
Query 593 GACCACCAAGTACTGGCAATGCAGGTGGGATGTTGAGCACTACAGACCTCACAGTGCCAAATGGAGCTGGAAGC 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 221 GACCACCAAGTACTGGCAATGCAGGTGGGATGTTGAGCACTACAGACCTCACAGTGCCAAATGGAGCTGGAAGC 294
Query 667 AGTCCAGTGGGGAATGGATTTGTAAACTCAAGAGCTTCTCCAAATTTGATTGGAGCTACTGGTGCAAATAGCTT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 295 AGTCCAGTGGGGAATGGATTTGTAAACTCAAGAGCTTCTCCAAATTTGATTGGAGCTACTGGTGCAAATAGCTT 368
Query 741 AGGCAAAGTCATGCCTACAAAGTCTCCCCCTCCACCAGGTGGTGGTAATCTTGGAATGAACAGTAGGAAACCAG 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 369 AGGCAAAGTCATGCCTACAAAGTCTCCCCCTCCACCAGGTGGTGGTAATCTTGGAATGAACAGTAGGAAACCAG 442
Query 815 ATCTTCGAGTTGTCATCCCCCCTTCAAGCAAGGGCATGATGCCTCCACTA------------------------ 864
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 443 ATCTTCGAGTTGTCATCCCCCCTTCAAGCAAGGGCATGATGCCTCCACTATCGGAGGAAGAGGAATTGGAGTTG 516
Query 865 AATACCCAAAGGATCAGTAGTTCTCAAGCCACTCAACCTCTTGCTACCCCAGTCGTGTCTGTGACAACCCCAAG 938
||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 517 AATACCCAGAGGATCAGTAGTTCTCAAGCCACTCAACCTCTTGCTACCCCAGTCGTGTCTGTGACAACCCCAAG 590
Query 939 CTTGCCTCCGCAAGGACTTGTGTACTCAGCAATGCCGACTGCCTACAACACTGATTATTCACTGACCAGCGCTG 1012
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 591 CTTGCCTCCGCAAGGACTTGTGTACTCAGCAATGCCGACTGCCTACAACACTGATTATTCACTGACCAGCGCTG 664
Query 1013 ACCTGTCAGCCCTTCAAGGCTTCAACTCGCCAGGAATGCTGTCGCTGGGACAGGTGTCGGCCTGGCAGCAGCAC 1086
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 665 ACCTGTCAGCCCTTCAAGGCTTCAACTCGCCAGGAATGCTGTCGCTGGGACAGGTGTCGGCCTGGCAGCAGCAC 738
Query 1087 CACCTAGGACAAGCAGCCCTCAGCTCTCTTGTTGCTGGAGGGCAGTTATCTCAGGGTTCCAATTTATCCATTAA 1160
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 739 CACCTAGGACAAGCAGCCCTCAGCTCTCTTGTTGCTGGAGGGCAGTTATCTCAGGGTTCCAATTTATCCATTAA 812
Query 1161 TACCAACCAAAACATCAGCATCAAGTCCGAACCGATTTCACCTCCTCGGGATCGTATGACCCCATCGGGCTTCC 1234
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 813 TACCAACCAAAACATCAGCATCAAGTCCGAACCGATTTCACCTCCTCGGGATCGTATGACCCCATCGGGCTTCC 886
Query 1235 AGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCCGCCGCCACCACCGCAGCCCCAGCCACAACCCCCGCAGCCC 1308
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 887 AGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCCGCCGCCACCACCGCAGCCCCAGCCACAACCCCCGCAGCCC 960
Query 1309 CAGCCCCGACAGGAAATGGGGCGCTCCCCTGTGGACAGTCTGAGCAGCTCTAGTAGCTCCTATGATGGCAGTGA 1382
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 961 CAGCCCCGACAGGAAATGGGGCGCTCCCCTGTGGACAGTCTGAGCAGCTCTAGTAGCTCCTATGATGGCAGTGA 1034
Query 1383 TCGGGAGGATCCACGGGGCGACTTCCATTCTCCAATTGTGCTTGGCCGACCCCCAAACACTGAGGACAGAGAAA 1456
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1035 TCGGGAGGATCCACGGGGCGACTTCCATTCTCCAATTGTGCTTGGCCGACCCCCAAACACTGAGGACAGAGAAA 1108
Query 1457 GCCCTTCTGTAAAGCGAATGAGGATGGACGCGTGGGTTACC 1497
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1109 GCCCTTCTGTAAAGCGAATGAGGATGGACGCGTGGGTGACC 1149