Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_06606
• Subject: XM_006537659.2
• Aligned Length: 2668
• Identities: 2068
• Gaps: 323

Alignment

Query    1  ATGAGAGAGCTCGTCAACATTCCACTGGTACATATTCTTACTCTGGTTGCCTTCAGCGGAACTGAGAAACTTCC  74
            |||||||||||.|||||||||||||||.||||.||.||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAGAGAGCTTGTCAACATTCCACTGTTACAGATGCTCACCCTGGTTGCCTTCAGCGGGACTGAGAAACTTCC  74

Query   75  AAAAGCTCCTGTCATCACCACTCCTCTTGAAACAGTGGATGCCTTAGTTGAAGAAGTGGCTACTTTCATGTGTG  148
            ||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||
Sbjct   75  AAAAGCCCCTGTCATCACCACGCCTCTTGAAACTGTAGATGCCTTGGTTGAAGAAGTAGCGACTTTCATGTGTG  148

Query  149  CAGTGGAATCCTACCCCCAGCCTGAGATTTCCTGGACTAGAAATAAAATTCTCATTAAACTCTTTGACACCCGG  222
            |.||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.
Sbjct  149  CCGTGGAATCCTACCCTCAGCCCGAGATTTCTTGGACCAGAAATAAAATTCTCATTAAGCTGTTTGACACCCGC  222

Query  223  TACAGCATCCGGGAGAATGGGCAGCTCCTCACCATCCTGAGTGTGGAAGACAGTGATGATGGCATTTACTGCTG  296
            ||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  223  TACAGCATCCGGGAGAATGGTCAGCTCCTCACCATTCTGAGCGTGGAAGACAGTGATGATGGCATCTACTGCTG  296

Query  297  CACGGCCAACAATGGTGTGGGAGGAGCTGTGGAGAGTTGTGGAGCCCTGCAAGTGAAGATGAAACCTAAAATAA  370
            ||..|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CATAGCCAACAATGGAGTGGGAGGAGCCGTGGAGAGTTGTGGTGCCCTGCAAGTGAAGATGAAACCTAAAATAA  370

Query  371  CTCGTCCTCCCATAAATGTGAAAATAATAGAAGGATTAAAAGCAGTCCTACCATGTACTACAATGGGTAATCCC  444
            |||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||.|||||.||.||.||.|||||.||||||||.|||
Sbjct  371  CTCGTCCTCCCATTAATGTAAAAATAATAGAGGGATTGAAGGCAGTTCTGCCGTGCACTACGATGGGTAACCCC  444

Query  445  AAACCATCAGTGTCTTGGATAAAGGGAGACAGCCCTCTCAGGGAAAATTCCCGAATTGCAGTTCTTGAATCTGG  518
            ||||||||.|||||.|||||.|||||.||||...|||||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||
Sbjct  445  AAACCATCTGTGTCCTGGATCAAGGGGGACAATGCTCTCAGGGAAAATTCCAGAATCGCAGTTCTTGAATCTGG  518

Query  519  GAGCTTGAGGATTCATAACGTACAAAAGGAAGATGCAGGACAGTATCGATGTGTGGCAAAAAACAGCCTCGGGA  592
            ||||||.|||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||.|
Sbjct  519  GAGCTTAAGGATCCATAATGTGCAAAAGGAAGATGCAGGACAGTACCGCTGTGTGGCCAAAAACAGCCTGGGCA  592

Query  593  CAGCATATTCCAAAGTGGTGAAGCTGGAAGTTGAG------------------------------GAAGAAAGT  636
            ||||.||.||||||.||||||||||||||||.|||                              |||||.||.
Sbjct  593  CAGCTTACTCCAAACTGGTGAAGCTGGAAGTGGAGGCTCTTAATATGACAAATGCCACAGAGAGAGAAGACAGA  666

Query  637  GAACCCGAACAAGATACTAAAGTTTTTGCCAGGATCCTGCGGGCTCCTGAATCCCACAATGTCACCTTTGGCTC  710
            |||||.||.||.||..|||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  667  GAACCTGAGCAGGACGCTAAAGTTTTTGCAAGAATCCTGCGTGCTCCTGAATCCCACAATGTCACCTTTGGTTC  740

Query  711  CTTTGTGACCCTGCACTGTACAGCAACAGGCATTCCTGTCCCCACCATCACCTGGATTGAAAACGGAAATGCTG  784
            ||||||.|||||.|.|||.|||||||.||||||.||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CTTTGTAACCCTACGCTGCACAGCAATAGGCATCCCTGTCCCCACCATCAGCTGGATTGAAAACGGAAATGCTG  814

Query  785  TTTCTTCTGGGTCCATTCAAGAGAGTGTGAAAGACCGAGTGATTGACTCAAGACTGCAGCTGTTTATCACCAAG  858
            |||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||
Sbjct  815  TTTCTTCAGGTTCCATTCAAGAGAGTGTGAAAGACCGAGTGATTGACTCAAGACTCCAGCTCTTCATCACAAAG  888

Query  859  CCAGGACTCTACACATGCATAGCTACCAATAAGCATGGGGAGAAGTTCAGTACTGCCAAGGCTGCAGCCACCAT  932
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||..|
Sbjct  889  CCAGGACTCTACACATGCATAGCTACCAATAAGCACGGAGAAAAGTTCAGTACCGCAAAGGCTGCAGCCACTGT  962

Query  933  CAGCATAGCAGAATGG----------------------------------------------------------  948
            ||||||||||||||||                                                          
Sbjct  963  CAGCATAGCAGAATGGAGTAAGTCACAGAAAGACAGCCAAGGCTACTGTGCCCAGTACAGAGGGGAGGTGTGTG  1036

Query  949  --------------------------------------------------------------------------  948
                                                                                      
Sbjct 1037  ATGCAGTCCTGGCGAAAGATGCTCTTGTCTTCTTCAACACCTCCTACCGGGACCCCGAGGACGCCCAGGAGCTG  1110

Query  949  --------------------------------------------------------------------------  948
                                                                                      
Sbjct 1111  CTGATCCACACTGCGTGGAATGAGCTGAAGGCTGTGAGTCCACTGTGCCGGCCAGCTGCTGAGGCTCTGCTGTG  1184

Query  949  ----------------------------------------------------------AGAGAGTACTGCTTGG  964
                                                                      ||||||||||||.|||
Sbjct 1185  TAACCACCTCTTCCAAGAGTGCAGCCCTGGAGTGGTACCTACTCCCATGCCCATTTGCAGAGAGTACTGCCTGG  1258

Query  965  CAGTAAAGGAGCTCTTCTGCGCAAAAGAATGGCTGGTAATGGAAGAGAAGACCCACAGAGGACTCTACAGATCC  1038
            |.|||||||||||||||||.|||||.|||||||.||.||||||||..|||.|||||.|.||.|||||||||||.
Sbjct 1259  CGGTAAAGGAGCTCTTCTGTGCAAAGGAATGGCAGGCAATGGAAGGAAAGGCCCACCGGGGCCTCTACAGATCT  1332

Query 1039  GAGATGCATTTGCTGTCC-GTGCCAGAATGCAGCAAGCTTCCCAGCATGCATTGGGACCCCACGGCCTGTGCCA  1111
            |.|||||||.|.|| ||| ||.|||||.|||||||||||||||||||||||..||||||||||.|||||..|.|
Sbjct 1333  GGGATGCATCTCCT-TCCGGTACCAGAGTGCAGCAAGCTTCCCAGCATGCACCGGGACCCCACAGCCTGCACAA  1405

Query 1112  GACTGCCACATCTAG------------------------CATTCCCACCAATGACGTCCTCAAAGCCAAGTGTG  1161
            ||||||||.||.|||                        |||||||..||||.||||||||.|.|||.||.|.|
Sbjct 1406  GACTGCCATATTTAGATTATAAAAAAGAAAACATAACAACATTCCCGTCAATAACGTCCTCCAGGCCGAGCGCG  1479

Query 1162  GACATTCCAAATCTGCCTTCCTCCTCCTCTTCTTCCTTCTCTGTCTCACCTACATACTCCATGACTGTAATAAT  1235
            |||||||||||.||||||.|||||.||   ||||||||..|.|||||.|||.|.|||||||||||.||.||.||
Sbjct 1480  GACATTCCAAACCTGCCTGCCTCCACC---TCTTCCTTTGCCGTCTCGCCTGCGTACTCCATGACCGTCATCAT  1550

Query 1236  CTCCATCATGTCCAGCTTTGCAATATTTGTGCTTCTTACCATAACTACTCTCTATTGCTGCCGAAGAAGAAAAC  1309
            |||||||.|||||||||||||..|.||||..|||||.|||||..||||||||||||||||||||||.||.|||.
Sbjct 1551  CTCCATCGTGTCCAGCTTTGCCCTGTTTGCTCTTCTCACCATCGCTACTCTCTATTGCTGCCGAAGGAGGAAAG  1624

Query 1310  AATGGAAAAATAAGAAAAGAGAATCAGCAGCAGTAACCCTCACCACACTGCCTTCTGAGCTCTTACTAGATAGA  1383
            ||||||||||||||||||||||.||..|.||.||.|||||||||||..|||||||.||||||.|.||.|||||.
Sbjct 1625  AATGGAAAAATAAGAAAAGAGAGTCGACCGCGGTGACCCTCACCACGTTGCCTTCCGAGCTCCTGCTGGATAGG  1698

Query 1384  CTTCATCCCAACCCCATGTACCAGAGGATGCCGCTCCTTCTGAACCCCAAATTGCTCAGCCTGGAGTATCCAAG  1457
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1699  CTCCATCCCAACCCCATGTACCAGAGGATGCCACTCCTTCTGAATCCTAAGTTGCTCAGCCTGGAGTATCCGAG  1772

Query 1458  GAATAACATTGAATATGTGAGAGACATCGGAGAGGGAGCGTTTGGAAGGGTGTTTCAAGCAAGGGCACCAGGCT  1531
            ||||||||||||.|||||..||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.|||||||||||.||.||||
Sbjct 1773  GAATAACATTGAGTATGTCCGAGACATCGGAGAGGGGGCGTTTGGAAGAGTCTTCCAAGCAAGGGCCCCTGGCT  1846

Query 1532  TACTTCCCTATGAACCTTTCACTATGGTGGCAGTAAAGATGCTCAAAGAAGAAGCCTCGGCAGATATGCAAGCG  1605
            |.||.||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.|||||.|||||.|||||.|||||||||
Sbjct 1847  TGCTGCCTTATGAACCTTTCACTATGGTGGCCGTGAAGATGCTTAAGGAAGAGGCCTCTGCAGACATGCAAGCG  1920

Query 1606  GACTTTCAGAGGGAGGCAGCCCTCATGGCAGAATTTGACAACCCTAACATTGTGAAGCTATTAGGAGTGTGTGC  1679
            |||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||||||||
Sbjct 1921  GACTTTCAGAGGGAGGCGGCCCTCATGGCAGAGTTTGACAACCCCAACATTGTGAAACTCTTAGGTGTGTGTGC  1994

Query 1680  TGTCGGGAAGCCAATGTGCCTGCTCTTTGAATACATGGCCTATGGTGACCTCAATGAGTTCCTCCGCAGCATGT  1753
            .||.||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||
Sbjct 1995  CGTTGGGAAGCCGATGTGTCTGCTCTTTGAATATATGGCCTATGGTGACCTCAATGAGTTCCTCCGAAGTATGT  2068

Query 1754  CCCCTCACACCGTGTGCAGCCTCAGTCACAGTGACTTGTCTATGAGGGCTCAGGTCTCCAGCCCTGGGCCCCCA  1827
            ||||.|||||.||.|||||||||||.|||||||||.||||.|.||||||||.|||.||.||||||||.||.|||
Sbjct 2069  CCCCGCACACTGTTTGCAGCCTCAGCCACAGTGACCTGTCCACGAGGGCTCGGGTGTCTAGCCCTGGTCCTCCA  2142

Query 1828  CCCCTCTCCTGTGCTGAGCAGCTTTGCATTGCCAGGCAGGTGGCAGCTGGCATGGCTTACCTCTCAGAACGTAA  1901
            ||.||.||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.||
Sbjct 2143  CCACTGTCCTGTGCAGAACAGCTCTGCATTGCCAGGCAGGTGGCAGCTGGCATGGCCTACCTTTCAGAGCGCAA  2216

Query 1902  GTTTGTTCACCGAGATTTAGCCACCAGGAACTGCCTGGTGGGCGAGAACATGGTGGTGAAAATTGCCGACTTTG  1975
            ||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||||||||.||.||||.||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 2217  GTTTGTCCACCGGGACTTAGCTACCAGGAACTGCCTGGTTGGGGAGACCATGGTGGTGAAAATTGCAGACTTTG  2290

Query 1976  GCCTCTCCAGGAACATCTACTCAGCAGACTACTACAAAGCTAATGAAAACGACGCTATCCCTATCCGTTGGATG  2049
            |||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||.|||.|||.|||||.|||||||||||.||||||
Sbjct 2291  GCCTCTCCAGGAACATCTATTCCGCAGACTACTACAAAGCTGATGGAAATGACGCCATCCCTATCCGCTGGATG  2364

Query 2050  CCACCAGAGTCCATTTTTTATAACCGCTACACTACAGAGTCTGATGTGTGGGCCTATGGCGTGGTCCTCTGGGA  2123
            ||.||.|||||.||.||.||.|||||||||||.||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 2365  CCGCCCGAGTCTATCTTCTACAACCGCTACACCACTGAGTCGGATGTATGGGCCTATGGTGTGGTCCTCTGGGA  2438

Query 2124  GATCTTCTCCTATGGCCTGCAGCCCTACTATGGGATGGCCCATGAGGAGGTCATTTACTACGTGCGAGATGGCA  2197
            |||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||.|||||||||
Sbjct 2439  GATCTTCTCCTATGGGCTGCAGCCCTACTATGGAATGGCCCACGAGGAGGTCATTTACTATGTGAGAGATGGCA  2512

Query 2198  ACATCCTCTCCTGCCCTGAGAACTGCCCCGTGGAGCTGTACAATCTCATGCGTCTATGTTGGAGCAAGCTGCCT  2271
            ||||||||.||||||||||||||||||||.||||.||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||
Sbjct 2513  ACATCCTCGCCTGCCCTGAGAACTGCCCCTTGGAACTGTACAACCTCATGCGCCTGTGTTGGAGCAAGCTGCCT  2586

Query 2272  GCAGACAGACCCAGTTTCACCAGTATTCACCGAATTCTGGAACGCATGTGTGAGAGGGCAGAGGGAACTGTGAG  2345
            ||.||.||||||||.|||..||||||.|||.|.||.|||.|.||||||||.|||||.|||||||||||.|||.|
Sbjct 2587  GCTGATAGACCCAGCTTCTGCAGTATCCACAGGATCCTGCAGCGCATGTGCGAGAGAGCAGAGGGAACGGTGGG  2660

Query 2346  TGTC  2349
            ||||
Sbjct 2661  TGTC  2664