Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_06606
• Subject: XM_006537661.2
• Aligned Length: 2644
• Identities: 2068
• Gaps: 299

Alignment

Query    1  ATGAGAGAGCTCGTCAACATTCCACTGGTACATATTCTTACTCTGGTTGCCTTCAGCGGAACTGAGAAACTTCC  74
            |||||||||||.|||||||||||||||.||||.||.||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAGAGAGCTTGTCAACATTCCACTGTTACAGATGCTCACCCTGGTTGCCTTCAGCGGGACTGAGAAACTTCC  74

Query   75  AAAAGCTCCTGTCATCACCACTCCTCTTGAAACAGTGGATGCCTTAGTTGAAGAAGTGGCTACTTTCATGTGTG  148
            ||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||
Sbjct   75  AAAAGCCCCTGTCATCACCACGCCTCTTGAAACTGTAGATGCCTTGGTTGAAGAAGTAGCGACTTTCATGTGTG  148

Query  149  CAGTGGAATCCTACCCCCAGCCTGAGATTTCCTGGACTAGAAATAAAATTCTCATTAAACTCTTTGACACCCGG  222
            |.||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.
Sbjct  149  CCGTGGAATCCTACCCTCAGCCCGAGATTTCTTGGACCAGAAATAAAATTCTCATTAAGCTGTTTGACACCCGC  222

Query  223  TACAGCATCCGGGAGAATGGGCAGCTCCTCACCATCCTGAGTGTGGAAGACAGTGATGATGGCATTTACTGCTG  296
            ||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  223  TACAGCATCCGGGAGAATGGTCAGCTCCTCACCATTCTGAGCGTGGAAGACAGTGATGATGGCATCTACTGCTG  296

Query  297  CACGGCCAACAATGGTGTGGGAGGAGCTGTGGAGAGTTGTGGAGCCCTGCAAGTGAAGATGAAACCTAAAATAA  370
            ||..|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CATAGCCAACAATGGAGTGGGAGGAGCCGTGGAGAGTTGTGGTGCCCTGCAAGTGAAGATGAAACCTAAAATAA  370

Query  371  CTCGTCCTCCCATAAATGTGAAAATAATAGAAGGATTAAAAGCAGTCCTACCATGTACTACAATGGGTAATCCC  444
            |||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||.|||||.||.||.||.|||||.||||||||.|||
Sbjct  371  CTCGTCCTCCCATTAATGTAAAAATAATAGAGGGATTGAAGGCAGTTCTGCCGTGCACTACGATGGGTAACCCC  444

Query  445  AAACCATCAGTGTCTTGGATAAAGGGAGACAGCCCTCTCAGGGAAAATTCCCGAATTGCAGTTCTTGAATCTGG  518
            ||||||||.|||||.|||||.|||||.||||...|||||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||
Sbjct  445  AAACCATCTGTGTCCTGGATCAAGGGGGACAATGCTCTCAGGGAAAATTCCAGAATCGCAGTTCTTGAATCTGG  518

Query  519  GAGCTTGAGGATTCATAACGTACAAAAGGAAGATGCAGGACAGTATCGATGTGTGGCAAAAAACAGCCTCGGGA  592
            ||||||.|||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||.|
Sbjct  519  GAGCTTAAGGATCCATAATGTGCAAAAGGAAGATGCAGGACAGTACCGCTGTGTGGCCAAAAACAGCCTGGGCA  592

Query  593  CAGCATATTCCAAAGTGGTGAAGCTGGAAGTTGAG------------------------------GAAGAAAGT  636
            ||||.||.||||||.||||||||||||||||.|||                              |||||.||.
Sbjct  593  CAGCTTACTCCAAACTGGTGAAGCTGGAAGTGGAGGCTCTTAATATGACAAATGCCACAGAGAGAGAAGACAGA  666

Query  637  GAACCCGAACAAGATACTAAAGTTTTTGCCAGGATCCTGCGGGCTCCTGAATCCCACAATGTCACCTTTGGCTC  710
            |||||.||.||.||..|||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  667  GAACCTGAGCAGGACGCTAAAGTTTTTGCAAGAATCCTGCGTGCTCCTGAATCCCACAATGTCACCTTTGGTTC  740

Query  711  CTTTGTGACCCTGCACTGTACAGCAACAGGCATTCCTGTCCCCACCATCACCTGGATTGAAAACGGAAATGCTG  784
            ||||||.|||||.|.|||.|||||||.||||||.||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CTTTGTAACCCTACGCTGCACAGCAATAGGCATCCCTGTCCCCACCATCAGCTGGATTGAAAACGGAAATGCTG  814

Query  785  TTTCTTCTGGGTCCATTCAAGAGAGTGTGAAAGACCGAGTGATTGACTCAAGACTGCAGCTGTTTATCACCAAG  858
            |||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||
Sbjct  815  TTTCTTCAGGTTCCATTCAAGAGAGTGTGAAAGACCGAGTGATTGACTCAAGACTCCAGCTCTTCATCACAAAG  888

Query  859  CCAGGACTCTACACATGCATAGCTACCAATAAGCATGGGGAGAAGTTCAGTACTGCCAAGGCTGCAGCCACCAT  932
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||..|
Sbjct  889  CCAGGACTCTACACATGCATAGCTACCAATAAGCACGGAGAAAAGTTCAGTACCGCAAAGGCTGCAGCCACTGT  962

Query  933  CAGCATAGCAGAATGG----------------------------------------------------------  948
            ||||||||||||||||                                                          
Sbjct  963  CAGCATAGCAGAATGGAGTAAGTCACAGAAAGACAGCCAAGGCTACTGTGCCCAGTACAGAGGGGAGGTGTGTG  1036

Query  949  --------------------------------------------------------------------------  948
                                                                                      
Sbjct 1037  ATGCAGTCCTGGCGAAAGATGCTCTTGTCTTCTTCAACACCTCCTACCGGGACCCCGAGGACGCCCAGGAGCTG  1110

Query  949  --------------------------------------------------------------------------  948
                                                                                      
Sbjct 1111  CTGATCCACACTGCGTGGAATGAGCTGAAGGCTGTGAGTCCACTGTGCCGGCCAGCTGCTGAGGCTCTGCTGTG  1184

Query  949  ----------------------------------------------------------AGAGAGTACTGCTTGG  964
                                                                      ||||||||||||.|||
Sbjct 1185  TAACCACCTCTTCCAAGAGTGCAGCCCTGGAGTGGTACCTACTCCCATGCCCATTTGCAGAGAGTACTGCCTGG  1258

Query  965  CAGTAAAGGAGCTCTTCTGCGCAAAAGAATGGCTGGTAATGGAAGAGAAGACCCACAGAGGACTCTACAGATCC  1038
            |.|||||||||||||||||.|||||.|||||||.||.||||||||..|||.|||||.|.||.|||||||||||.
Sbjct 1259  CGGTAAAGGAGCTCTTCTGTGCAAAGGAATGGCAGGCAATGGAAGGAAAGGCCCACCGGGGCCTCTACAGATCT  1332

Query 1039  GAGATGCATTTGCTGTCC-GTGCCAGAATGCAGCAAGCTTCCCAGCATGCATTGGGACCCCACGGCCTGTGCCA  1111
            |.|||||||.|.|| ||| ||.|||||.|||||||||||||||||||||||..||||||||||.|||||..|.|
Sbjct 1333  GGGATGCATCTCCT-TCCGGTACCAGAGTGCAGCAAGCTTCCCAGCATGCACCGGGACCCCACAGCCTGCACAA  1405

Query 1112  GACTGCCACATCTAGCATTCCCACCAATGACGTCCTCAAAGCCAAGTGTGGACATTCCAAATCTGCCTTCCTCC  1185
            ||||||||.||.||||||||||..||||.||||||||.|.|||.||.|.||||||||||||.||||||.|||||
Sbjct 1406  GACTGCCATATTTAGCATTCCCGTCAATAACGTCCTCCAGGCCGAGCGCGGACATTCCAAACCTGCCTGCCTCC  1479

Query 1186  TCCTCTTCTTCCTTCTCTGTCTCACCTACATACTCCATGACTGTAATAATCTCCATCATGTCCAGCTTTGCAAT  1259
            .||   ||||||||..|.|||||.|||.|.|||||||||||.||.||.|||||||||.|||||||||||||..|
Sbjct 1480  ACC---TCTTCCTTTGCCGTCTCGCCTGCGTACTCCATGACCGTCATCATCTCCATCGTGTCCAGCTTTGCCCT  1550

Query 1260  ATTTGTGCTTCTTACCATAACTACTCTCTATTGCTGCCGAAGAAGAAAACAATGGAAAAATAAGAAAAGAGAAT  1333
            .||||..|||||.|||||..||||||||||||||||||||||.||.|||.||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1551  GTTTGCTCTTCTCACCATCGCTACTCTCTATTGCTGCCGAAGGAGGAAAGAATGGAAAAATAAGAAAAGAGAGT  1624

Query 1334  CAGCAGCAGTAACCCTCACCACACTGCCTTCTGAGCTCTTACTAGATAGACTTCATCCCAACCCCATGTACCAG  1407
            |..|.||.||.|||||||||||..|||||||.||||||.|.||.|||||.||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1625  CGACCGCGGTGACCCTCACCACGTTGCCTTCCGAGCTCCTGCTGGATAGGCTCCATCCCAACCCCATGTACCAG  1698

Query 1408  AGGATGCCGCTCCTTCTGAACCCCAAATTGCTCAGCCTGGAGTATCCAAGGAATAACATTGAATATGTGAGAGA  1481
            ||||||||.|||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||..||||
Sbjct 1699  AGGATGCCACTCCTTCTGAATCCTAAGTTGCTCAGCCTGGAGTATCCGAGGAATAACATTGAGTATGTCCGAGA  1772

Query 1482  CATCGGAGAGGGAGCGTTTGGAAGGGTGTTTCAAGCAAGGGCACCAGGCTTACTTCCCTATGAACCTTTCACTA  1555
            ||||||||||||.|||||||||||.||.||.|||||||||||.||.|||||.||.||.||||||||||||||||
Sbjct 1773  CATCGGAGAGGGGGCGTTTGGAAGAGTCTTCCAAGCAAGGGCCCCTGGCTTGCTGCCTTATGAACCTTTCACTA  1846

Query 1556  TGGTGGCAGTAAAGATGCTCAAAGAAGAAGCCTCGGCAGATATGCAAGCGGACTTTCAGAGGGAGGCAGCCCTC  1629
            |||||||.||.||||||||.||.|||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1847  TGGTGGCCGTGAAGATGCTTAAGGAAGAGGCCTCTGCAGACATGCAAGCGGACTTTCAGAGGGAGGCGGCCCTC  1920

Query 1630  ATGGCAGAATTTGACAACCCTAACATTGTGAAGCTATTAGGAGTGTGTGCTGTCGGGAAGCCAATGTGCCTGCT  1703
            ||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||||||||.||.||||||||.|||||.|||||
Sbjct 1921  ATGGCAGAGTTTGACAACCCCAACATTGTGAAACTCTTAGGTGTGTGTGCCGTTGGGAAGCCGATGTGTCTGCT  1994

Query 1704  CTTTGAATACATGGCCTATGGTGACCTCAATGAGTTCCTCCGCAGCATGTCCCCTCACACCGTGTGCAGCCTCA  1777
            |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.||.||||||||||
Sbjct 1995  CTTTGAATATATGGCCTATGGTGACCTCAATGAGTTCCTCCGAAGTATGTCCCCGCACACTGTTTGCAGCCTCA  2068

Query 1778  GTCACAGTGACTTGTCTATGAGGGCTCAGGTCTCCAGCCCTGGGCCCCCACCCCTCTCCTGTGCTGAGCAGCTT  1851
            |.|||||||||.||||.|.||||||||.|||.||.||||||||.||.|||||.||.||||||||.||.|||||.
Sbjct 2069  GCCACAGTGACCTGTCCACGAGGGCTCGGGTGTCTAGCCCTGGTCCTCCACCACTGTCCTGTGCAGAACAGCTC  2142

Query 1852  TGCATTGCCAGGCAGGTGGCAGCTGGCATGGCTTACCTCTCAGAACGTAAGTTTGTTCACCGAGATTTAGCCAC  1925
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.||||||||.|||||.||.|||||.||
Sbjct 2143  TGCATTGCCAGGCAGGTGGCAGCTGGCATGGCCTACCTTTCAGAGCGCAAGTTTGTCCACCGGGACTTAGCTAC  2216

Query 1926  CAGGAACTGCCTGGTGGGCGAGAACATGGTGGTGAAAATTGCCGACTTTGGCCTCTCCAGGAACATCTACTCAG  1999
            |||||||||||||||.||.||||.||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|
Sbjct 2217  CAGGAACTGCCTGGTTGGGGAGACCATGGTGGTGAAAATTGCAGACTTTGGCCTCTCCAGGAACATCTATTCCG  2290

Query 2000  CAGACTACTACAAAGCTAATGAAAACGACGCTATCCCTATCCGTTGGATGCCACCAGAGTCCATTTTTTATAAC  2073
            |||||||||||||||||.|||.|||.|||||.|||||||||||.||||||||.||.|||||.||.||.||.|||
Sbjct 2291  CAGACTACTACAAAGCTGATGGAAATGACGCCATCCCTATCCGCTGGATGCCGCCCGAGTCTATCTTCTACAAC  2364

Query 2074  CGCTACACTACAGAGTCTGATGTGTGGGCCTATGGCGTGGTCCTCTGGGAGATCTTCTCCTATGGCCTGCAGCC  2147
            ||||||||.||.|||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 2365  CGCTACACCACTGAGTCGGATGTATGGGCCTATGGTGTGGTCCTCTGGGAGATCTTCTCCTATGGGCTGCAGCC  2438

Query 2148  CTACTATGGGATGGCCCATGAGGAGGTCATTTACTACGTGCGAGATGGCAACATCCTCTCCTGCCCTGAGAACT  2221
            |||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 2439  CTACTATGGAATGGCCCACGAGGAGGTCATTTACTATGTGAGAGATGGCAACATCCTCGCCTGCCCTGAGAACT  2512

Query 2222  GCCCCGTGGAGCTGTACAATCTCATGCGTCTATGTTGGAGCAAGCTGCCTGCAGACAGACCCAGTTTCACCAGT  2295
            |||||.||||.||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||..||||
Sbjct 2513  GCCCCTTGGAACTGTACAACCTCATGCGCCTGTGTTGGAGCAAGCTGCCTGCTGATAGACCCAGCTTCTGCAGT  2586

Query 2296  ATTCACCGAATTCTGGAACGCATGTGTGAGAGGGCAGAGGGAACTGTGAGTGTC  2349
            ||.|||.|.||.|||.|.||||||||.|||||.|||||||||||.|||.|||||
Sbjct 2587  ATCCACAGGATCCTGCAGCGCATGTGCGAGAGAGCAGAGGGAACGGTGGGTGTC  2640