Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_06611
- Subject:
- NM_008659.3
- Aligned Length:
- 3084
- Identities:
- 2737
- Gaps:
- 0
Alignment
Query 1 ATGGAGAGTGCGCTCACCGCCCGTGACCGGGTGGGGGTGCAGGATTTCGTGCTGCTGGAGAACTTCACCAGCGA 74
||||||||.||..|.||.|||||.||||||||.|||||||||||.||.||.|||||||||||.||||||||.||
Sbjct 1 ATGGAGAGCGCCTTGACTGCCCGAGACCGGGTAGGGGTGCAGGACTTTGTCCTGCTGGAGAATTTCACCAGTGA 74
Query 75 GGCCGCCTTCATCGAGAACCTGCGGCGGCGATTTCGGGAGAATCTCATCTACACCTACATTGGCCCCGTCCTGG 148
|||.||||||||.||||||||.||||||||.||.||||||||.|||||.||.||||||||.||.||.|||||.|
Sbjct 75 GGCTGCCTTCATTGAGAACCTCCGGCGGCGGTTCCGGGAGAACCTCATTTATACCTACATCGGTCCTGTCCTAG 148
Query 149 TCTCTGTCAATCCCTACCGGGACCTGCAGATCTACAGCCGGCAGCATATGGAGCGTTACCGTGGCGTCAGCTTC 222
|||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.|||
Sbjct 149 TCTCTGTCAATCCCTACCGAGACCTACAGATCTACAGCCGGCAGCATATGGAACGCTACCGTGGTGTCAGTTTC 222
Query 223 TATGAAGTGCCCCCTCACCTGTTTGCCGTGGCGGACACTGTGTACCGAGCACTGCGCACGGAGCGTCGGGACCA 296
||||||||.||.|||||..|||||||.|||||.||||||||.|||||.|||||.||.||.||||||||||||||
Sbjct 223 TATGAAGTACCACCTCATTTGTTTGCAGTGGCTGACACTGTATACCGGGCACTTCGTACTGAGCGTCGGGACCA 296
Query 297 GGCTGTGATGATCTCTGGGGAGAGCGGGGCAGGCAAGACCGAGGCCACCAAGAGGCTGCTGCAGTTCTATGCAG 370
|||.||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||
Sbjct 297 GGCAGTGATGATTTCTGGAGAGAGTGGGGCAGGCAAGACAGAGGCCACCAAGAGACTGCTCCAGTTCTATGCAG 370
Query 371 AGACCTGCCCAGCCCCCGAGCGCGGAGGTGCCGTGCGGGACCGGCTGCTACAGAGCAACCCGGTGCTGGAGGCC 444
||||||||||||||||.||.||.||.||.||.|||||.|||||.|||.|.|||||||||||.|||.|.||||||
Sbjct 371 AGACCTGCCCAGCCCCTGAACGGGGTGGCGCAGTGCGAGACCGCCTGTTGCAGAGCAACCCCGTGTTAGAGGCC 444
Query 445 TTTGGAAATGCCAAGACCCTCCGGAACGATAACTCCAGCAGGTTCGGGAAGTACATGGATGTGCAGTTTGACTT 518
|||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||.||||.||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 TTTGGGAATGCCAAGACTCTCCGCAACGATAACTCCAGCCGGTTTGGAAAGTACATGGATGTGCAGTTTGACTT 518
Query 519 CAAGGGTGCCCCCGTGGGTGGCCACATCCTCAGTTACCTCCTGGAAAAGTCACGAGTGGTGCACCAGAATCATG 592
||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||.|
Sbjct 519 CAAGGGTGCCCCCGTGGGAGGCCACATTCTCAGTTACCTCCTGGAAAAGTCCCGGGTGGTGCACCAAAATCACG 592
Query 593 GGGAGCGGAACTTCCACATCTTCTACCAGCTGCTGGAGGGGGGCGAGGAGGAGACTCTTCGCAGGCTGGGCTTG 666
|.|||||||||||||||.||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||..|||||||||||
Sbjct 593 GAGAGCGGAACTTCCACGTCTTTTACCAGCTACTGGAGGGGGGCGAGGAGGAGACTCTCCGTCGGCTGGGCTTG 666
Query 667 GAACGGAACCCCCAGAGCTACCTGTACCTGGTGAAGGGCCAGTGTGCCAAAGTCTCCTCCATCAACGACAAGAG 740
|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GAACGGAACCCCCAGAGCTACTTGTACCTGGTGAAGGGCCAGTGTGCCAAGGTCTCCTCCATCAACGACAAGAG 740
Query 741 TGACTGGAAGGTCGTCAGGAAGGCTCTGACAGTCATTGATTTCACCGAGGATGAAGTGGAGGACCTGCTGAGCA 814
||||||||||||..|.||||||||.|||.|.||||||||.|||||.||||||||||||||||||.||||.||||
Sbjct 741 TGACTGGAAGGTTATGAGGAAGGCGCTGTCCGTCATTGACTTCACTGAGGATGAAGTGGAGGACTTGCTCAGCA 814
Query 815 TCGTGGCCAGCGTCCTTCATTTGGGCAACATCCACTTTGCTGCCAACGAGGAGAGCAATGCCCAGGTCACCACC 888
||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||..|||||||.||||||||||||||.||.||.
Sbjct 815 TCGTGGCCAGCGTCCTACATCTGGGCAACATCCACTTTGCTGCTGACGAGGACAGCAATGCCCAGGTTACTACT 888
Query 889 GAGAACCAGCTCAAGTATCTGACCAGGCTCCTCAGCGTGGAAGGCTCGACGCTGCGAGAAGCCCTGACACACAG 962
||||||||||||||.|||||||||||||||||..|.||||||||..|.||.||..|.|||||||||||.|||||
Sbjct 889 GAGAACCAGCTCAAATATCTGACCAGGCTCCTTGGTGTGGAAGGTACAACACTTAGGGAAGCCCTGACCCACAG 962
Query 963 GAAGATCATCGCCAAGGGGGAGGAGCTCCTGAGCCCGCTGAACCTGGAGCAGGCCGCGTACGCACGAGACGCCC 1036
|||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.|||||.||.||.|||.|.||.||.|
Sbjct 963 GAAGATCATCGCCAAGGGGGAAGAGCTCCTGAGCCCACTGAACCTTGAACAGGCGGCATATGCAAGGGATGCGC 1036
Query 1037 TCGCCAAGGCTGTGTACAGCCGCACTTTTACCTGGCTCGTCGGGAAGATCAACAGGTCGCTGGCCTCCAAGGAC 1110
|.||||||||||||||||||||.||.||.||||||||.|||.|.||||||||.|||||.||||||||.||||||
Sbjct 1037 TTGCCAAGGCTGTGTACAGCCGGACATTCACCTGGCTGGTCAGAAAGATCAATAGGTCACTGGCCTCTAAGGAC 1110
Query 1111 GTGGAGAGCCCCAGCTGGCGGAGCACCACGGTTCTCGGGCTCCTGGATATTTATGGCTTTGAAGTGTTTCAGCA 1184
|..|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GCTGAGAGCCCCAGCTGGCGAAGCACCACGGTTCTTGGGCTCCTGGACATTTACGGCTTTGAAGTGTTTCAGCA 1184
Query 1185 TAACAGCTTTGAGCAGTTCTGCATCAATTACTGCAACGAGAAGCTGCAGCAGCTCTTCATCGAGCTCACGCTCA 1258
|||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||
Sbjct 1185 TAACAGCTTCGAGCAGTTCTGCATCAACTACTGCAATGAGAAGCTGCAGCAGCTCTTCATCGAGCTGACTCTCA 1258
Query 1259 AGTCGGAGCAGGAGGAGTACGAGGCAGAGGGCATCGCGTGGGAGCCCGTCCAGTATTTCAACAACAAAATCATC 1332
||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||||||
Sbjct 1259 AGTCGGAGCAGGAGGAATACGAGGCTGAGGGCATCGCGTGGGAACCTGTCCAGTACTTCAACAACAAGATCATC 1332
Query 1333 TGTGATCTGGTGGAGGAGAAGTTTAAGGGCATCATCTCGATTTTGGATGAGGAGTGTCTGCGCCCCGGGGAGGC 1406
|||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||.||.||||||||
Sbjct 1333 TGTGACCTGGTAGAGGAGAAGTTCAAGGGCATCATCTCCATCTTGGATGAAGAGTGCCTGCGTCCTGGGGAGGC 1406
Query 1407 CACAGACCTGACCTTCCTGGAGAAGCTGGAGGATACTGTCAAGCACCATCCACACTTCCTGACGCACAAGCTGG 1480
|||.|||||||||||.|||||||||.|||||||.||||||||||.|||.||.||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1407 CACGGACCTGACCTTTCTGGAGAAGTTGGAGGACACTGTCAAGCCCCACCCTCACTTCCTGACGCACAAGCTCG 1480
Query 1481 CTGACCAGCGGACCAGGAAATCTCTGGGCCGAGGGGAATTCCGCCTTCTGCACTATGCGGGGGAGGTGACCTAC 1554
||||||||..|||||||||||||||.|.|||||||||.||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||
Sbjct 1481 CTGACCAGAAGACCAGGAAATCTCTAGACCGAGGGGAGTTCCGCCTTCTGCATTATGCTGGAGAGGTGACCTAC 1554
Query 1555 AGCGTGACCGGGTTTCTGGACAAAAACAATGACCTTCTCTTCCGGAACCTTAAGGAGACCATGTGTAGCTCAAA 1628
||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||.
Sbjct 1555 AGTGTGACTGGGTTTCTGGATAAAAACAATGACCTCCTCTTCCGGAACCTGAAGGAGACCATGTGCAGCTCAAT 1628
Query 1629 GAATCCCATTATGAGCCAGTGCTTTGACCGGAGCGAGCTCAGTGACAAGAAGCGGCCAGAGACGGTCGCCACCC 1702
|||.|||||.|||..|||||||||||||..|||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1629 GAACCCCATCATGGCCCAGTGCTTTGACAAGAGTGAGCTCAGTGACAAGAAGCGGCCAGAGACGGTGGCCACCC 1702
Query 1703 AGTTCAAGATGAGCCTCCTGCAGCTGGTGGAGATCCTGCAGTCTAAGGAGCCCGCCTACGTCCGCTGCATCAAA 1776
|||||||||||||||||||||||||.||||||||||||..||||||||||||.|||||..||||.||||||||.
Sbjct 1703 AGTTCAAGATGAGCCTCCTGCAGCTCGTGGAGATCCTGAGGTCTAAGGAGCCTGCCTATATCCGGTGCATCAAG 1776
Query 1777 CCCAATGATGCCAAACAGCCCGGCCGCTTTGACGAGGTGCTGATCCGCCACCAGGTGAAGTACCTGGGGCTGTT 1850
||.||.||.|||||.|||||.||.||||||||.||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||.|
Sbjct 1777 CCAAACGACGCCAAGCAGCCGGGTCGCTTTGATGAGGTGCTCATCCGACATCAGGTGAAGTACCTGGGACTGAT 1850
Query 1851 GGAAAACCTGCGCGTGCGCAGAGCCGGCTTTGCCTATCGCCGCAAATACGAAGCTTTCCTGCAAAGGTACAAGT 1924
|||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||.||||||||||
Sbjct 1851 GGAGAATCTGCGCGTGCGCAGAGCTGGCTTTGCCTATCGTCGCAAATATGAGGCTTTCCTGCAGAGGTACAAGT 1924
Query 1925 CACTGTGCCCAGAGACGTGGCCCACGTGGGCAGGACGGCCGCAGGATGGGGTGGCTGTGCTGGTCCGACACCTG 1998
||||||||||||||||.|||||||.|||||||||||||||.||||||||.|||||.|||.|||||.|||||||.
Sbjct 1925 CACTGTGCCCAGAGACATGGCCCATGTGGGCAGGACGGCCCCAGGATGGTGTGGCCGTGTTGGTCAGACACCTC 1998
Query 1999 GGCTACAAGCCAGAAGAGTACAAGATGGGCAGGACCAAGATCTTCATCCGCTTCCCCAAGACCCTGTTTGCCAC 2072
|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||.||||||||||
Sbjct 1999 GGCTACAAGCCAGAAGAGTACAAAATGGGCAGGACTAAGATCTTCATCCGATTTCCCAAGACCTTGTTTGCCAC 2072
Query 2073 AGAGGATGCCCTGGAGGTCCGGCGGCAGAGCCTGGCCACAAAGATCCAAGCTGCCTGGAGGGGCTTTCACTGGC 2146
||||||..|||||||.||||||||||||||.||.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct 2073 AGAGGACTCCCTGGAAGTCCGGCGGCAGAGTCTAGCCACCAAGATCCAGGCGGCCTGGAGGGGCTTTCATTGGC 2146
Query 2147 GGCAGAAATTCCTCCGGGTGAAGAGATCAGCCATCTGCATCCAGTCGTGGTGGCGTGGAACACTGGGCCGGAGG 2220
|.||||||||.||||||||||||.|||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 2147 GACAGAAATTTCTCCGGGTGAAGCGATCAGCCATCTGTATCCAGTCATGGTGGCGTGGCACACTGGGCCGGAGG 2220
Query 2221 AAGGCAGCCAAGAGGAAGTGGGCGGCACAGACCATCCGGCGGCTCATCCGAGGCTTCATCCTGCGCCACGCCCC 2294
|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.||||||||.||||||||..|||||||..|.||
Sbjct 2221 AAGGCAGCCAAGAGGAAGTGGGCAGCCCAGACCATCCGTCGACTCATCCGTGGCTTCATTTTGCGCCATTCACC 2294
Query 2295 CCGCTGCCCCGAGAACGCCTTCTTCCTGGACCATGTGCGCACCTCTTTTTTGCTAAACCTGAGGCGGCAGCTGC 2368
|||.|||||.|||||.|||||||||.|||||||.||||||.||||.||||||||.||||||||||||||.||||
Sbjct 2295 CCGGTGCCCTGAGAATGCCTTCTTCTTGGACCACGTGCGCGCCTCATTTTTGCTTAACCTGAGGCGGCAACTGC 2368
Query 2369 CCCGGAATGTCCTGGACACCTCGTGGCCCACGCCCCCACCTGCCCTGCGTGAGGCCTCAGAGCTTCTGCGGGAG 2442
||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||.|.|||||||||||.||.||.|||||.
Sbjct 2369 CCCGGAATGTTCTGGACACCTCCTGGCCCACACCCCCACCTGCCCTGAGAGAGGCCTCAGAACTGCTACGGGAA 2442
Query 2443 TTGTGCATAAAGAACATGGTGTGGAAATACTGCCGGAGTATCAGCCCTGAGTGGAAGCAGCAGCTGCAGCAGAA 2516
.|||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 2443 CTGTGCATGAAGAACATGGTGTGGAAGTACTGCCGGAGCATCAGCCCTGAGTGGAAGCAGCAGCTGCAGCAAAA 2516
Query 2517 GGCCGTGGCTAGTGAGATCTTCAAGGGCAAGAAGGATAATTACCCTCAGAGTGTACCCAGGCTCTTCATCAGCA 2590
|||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.|||||.||||||||.||||
Sbjct 2517 GGCGGTGGCTAGTGAAATTTTCAAGGGCAAGAAGGACAACTACCCCCAGAGTGTCCCCAGACTCTTCATTAGCA 2590
Query 2591 CTCGGCTTGGTACAGATGAGATCAGCCCCCGAGTGCTGCAGGCCTTGGGCTCTGAGCCCATTCAGTATGCGGTG 2664
|.||||||||.|||||.||||||||||||.|||||||.||..|||||||||||||.|||||.||||||||.|||
Sbjct 2591 CACGGCTTGGCACAGAGGAGATCAGCCCCAGAGTGCTTCAATCCTTGGGCTCTGAACCCATCCAGTATGCCGTG 2664
Query 2665 CCTGTTGTGAAATACGACCGCAAGGGCTACAAGCCTCGCTCCCGGCAGCTGCTGCTCACGCCCAACGCCGTCGT 2738
||.||.||.|||||||||||.|||||.||||||||||||.||||||||||||||||||||||||..||.||.||
Sbjct 2665 CCCGTGGTAAAATACGACCGTAAGGGTTACAAGCCTCGCCCCCGGCAGCTGCTGCTCACGCCCAGTGCTGTGGT 2738
Query 2739 CATCGTGGAGGACGCCAAAGTCAAGCAGAGGATTGATTACGCCAACCTGACCGGAATCTCTGTCAGCAGCCTGA 2812
|||.||||||||.||.||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 2739 CATTGTGGAGGATGCTAAAGTCAAGCAGAGAATTGATTATGCCAACCTAACCGGAATCTCTGTCAGTAGCCTGA 2812
Query 2813 GCGACAGTCTTTTTGTGCTTCATGTACAGCGTGCGGACAATAAGCAAAAGGGAGATGTGGTGCTGCAGAGTGAC 2886
|.||.||.||.|||||||||||.||.|||||||..|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 2813 GTGATAGCCTATTTGTGCTTCACGTGCAGCGTGAAGACAACAAGCAGAAGGGAGATGTGGTGCTGCAGAGTGAT 2886
Query 2887 CACGTGATTGAGACGCTGACCAAGACAGCCCTCAGTGCCAACCGCGTGAACAGCATCAACATCAACCAGGGCAG 2960
||.|||||.|||||.||.||||||||.|||||||||||..||||||||||||..||||||||||||||||||||
Sbjct 2887 CATGTGATCGAGACACTAACCAAGACGGCCCTCAGTGCTGACCGCGTGAACAATATCAACATCAACCAGGGCAG 2960
Query 2961 CATCACGTTTGCAGGGGGCCCCGGCAGGGATGGCACCATTGACTTCACACCCGGCTCGGAGCTGCTCATCACCA 3034
|||.||||||||||||||.||.||||||||.||||.|||||||||||||.|.|||||.|||||.||||||||||
Sbjct 2961 CATAACGTTTGCAGGGGGTCCAGGCAGGGACGGCATCATTGACTTCACATCGGGCTCAGAGCTTCTCATCACCA 3034
Query 3035 AGGCCAAGAACGGGCACCTGGCTGTGGTCGCCCCACGGCTGAATTCTCGG 3084
||||.|||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 3035 AGGCTAAGAATGGCCACCTGGCTGTGGTGGCCCCACGGCTGAATTCTCGG 3084