Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_06611
Subject:
NM_008659.3
Aligned Length:
3084
Identities:
2737
Gaps:
0

Alignment

Query    1  ATGGAGAGTGCGCTCACCGCCCGTGACCGGGTGGGGGTGCAGGATTTCGTGCTGCTGGAGAACTTCACCAGCGA  74
            ||||||||.||..|.||.|||||.||||||||.|||||||||||.||.||.|||||||||||.||||||||.||
Sbjct    1  ATGGAGAGCGCCTTGACTGCCCGAGACCGGGTAGGGGTGCAGGACTTTGTCCTGCTGGAGAATTTCACCAGTGA  74

Query   75  GGCCGCCTTCATCGAGAACCTGCGGCGGCGATTTCGGGAGAATCTCATCTACACCTACATTGGCCCCGTCCTGG  148
            |||.||||||||.||||||||.||||||||.||.||||||||.|||||.||.||||||||.||.||.|||||.|
Sbjct   75  GGCTGCCTTCATTGAGAACCTCCGGCGGCGGTTCCGGGAGAACCTCATTTATACCTACATCGGTCCTGTCCTAG  148

Query  149  TCTCTGTCAATCCCTACCGGGACCTGCAGATCTACAGCCGGCAGCATATGGAGCGTTACCGTGGCGTCAGCTTC  222
            |||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.|||
Sbjct  149  TCTCTGTCAATCCCTACCGAGACCTACAGATCTACAGCCGGCAGCATATGGAACGCTACCGTGGTGTCAGTTTC  222

Query  223  TATGAAGTGCCCCCTCACCTGTTTGCCGTGGCGGACACTGTGTACCGAGCACTGCGCACGGAGCGTCGGGACCA  296
            ||||||||.||.|||||..|||||||.|||||.||||||||.|||||.|||||.||.||.||||||||||||||
Sbjct  223  TATGAAGTACCACCTCATTTGTTTGCAGTGGCTGACACTGTATACCGGGCACTTCGTACTGAGCGTCGGGACCA  296

Query  297  GGCTGTGATGATCTCTGGGGAGAGCGGGGCAGGCAAGACCGAGGCCACCAAGAGGCTGCTGCAGTTCTATGCAG  370
            |||.||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||
Sbjct  297  GGCAGTGATGATTTCTGGAGAGAGTGGGGCAGGCAAGACAGAGGCCACCAAGAGACTGCTCCAGTTCTATGCAG  370

Query  371  AGACCTGCCCAGCCCCCGAGCGCGGAGGTGCCGTGCGGGACCGGCTGCTACAGAGCAACCCGGTGCTGGAGGCC  444
            ||||||||||||||||.||.||.||.||.||.|||||.|||||.|||.|.|||||||||||.|||.|.||||||
Sbjct  371  AGACCTGCCCAGCCCCTGAACGGGGTGGCGCAGTGCGAGACCGCCTGTTGCAGAGCAACCCCGTGTTAGAGGCC  444

Query  445  TTTGGAAATGCCAAGACCCTCCGGAACGATAACTCCAGCAGGTTCGGGAAGTACATGGATGTGCAGTTTGACTT  518
            |||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||.||||.||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TTTGGGAATGCCAAGACTCTCCGCAACGATAACTCCAGCCGGTTTGGAAAGTACATGGATGTGCAGTTTGACTT  518

Query  519  CAAGGGTGCCCCCGTGGGTGGCCACATCCTCAGTTACCTCCTGGAAAAGTCACGAGTGGTGCACCAGAATCATG  592
            ||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||.|
Sbjct  519  CAAGGGTGCCCCCGTGGGAGGCCACATTCTCAGTTACCTCCTGGAAAAGTCCCGGGTGGTGCACCAAAATCACG  592

Query  593  GGGAGCGGAACTTCCACATCTTCTACCAGCTGCTGGAGGGGGGCGAGGAGGAGACTCTTCGCAGGCTGGGCTTG  666
            |.|||||||||||||||.||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||..|||||||||||
Sbjct  593  GAGAGCGGAACTTCCACGTCTTTTACCAGCTACTGGAGGGGGGCGAGGAGGAGACTCTCCGTCGGCTGGGCTTG  666

Query  667  GAACGGAACCCCCAGAGCTACCTGTACCTGGTGAAGGGCCAGTGTGCCAAAGTCTCCTCCATCAACGACAAGAG  740
            |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GAACGGAACCCCCAGAGCTACTTGTACCTGGTGAAGGGCCAGTGTGCCAAGGTCTCCTCCATCAACGACAAGAG  740

Query  741  TGACTGGAAGGTCGTCAGGAAGGCTCTGACAGTCATTGATTTCACCGAGGATGAAGTGGAGGACCTGCTGAGCA  814
            ||||||||||||..|.||||||||.|||.|.||||||||.|||||.||||||||||||||||||.||||.||||
Sbjct  741  TGACTGGAAGGTTATGAGGAAGGCGCTGTCCGTCATTGACTTCACTGAGGATGAAGTGGAGGACTTGCTCAGCA  814

Query  815  TCGTGGCCAGCGTCCTTCATTTGGGCAACATCCACTTTGCTGCCAACGAGGAGAGCAATGCCCAGGTCACCACC  888
            ||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||..|||||||.||||||||||||||.||.||.
Sbjct  815  TCGTGGCCAGCGTCCTACATCTGGGCAACATCCACTTTGCTGCTGACGAGGACAGCAATGCCCAGGTTACTACT  888

Query  889  GAGAACCAGCTCAAGTATCTGACCAGGCTCCTCAGCGTGGAAGGCTCGACGCTGCGAGAAGCCCTGACACACAG  962
            ||||||||||||||.|||||||||||||||||..|.||||||||..|.||.||..|.|||||||||||.|||||
Sbjct  889  GAGAACCAGCTCAAATATCTGACCAGGCTCCTTGGTGTGGAAGGTACAACACTTAGGGAAGCCCTGACCCACAG  962

Query  963  GAAGATCATCGCCAAGGGGGAGGAGCTCCTGAGCCCGCTGAACCTGGAGCAGGCCGCGTACGCACGAGACGCCC  1036
            |||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.|||||.||.||.|||.|.||.||.|
Sbjct  963  GAAGATCATCGCCAAGGGGGAAGAGCTCCTGAGCCCACTGAACCTTGAACAGGCGGCATATGCAAGGGATGCGC  1036

Query 1037  TCGCCAAGGCTGTGTACAGCCGCACTTTTACCTGGCTCGTCGGGAAGATCAACAGGTCGCTGGCCTCCAAGGAC  1110
            |.||||||||||||||||||||.||.||.||||||||.|||.|.||||||||.|||||.||||||||.||||||
Sbjct 1037  TTGCCAAGGCTGTGTACAGCCGGACATTCACCTGGCTGGTCAGAAAGATCAATAGGTCACTGGCCTCTAAGGAC  1110

Query 1111  GTGGAGAGCCCCAGCTGGCGGAGCACCACGGTTCTCGGGCTCCTGGATATTTATGGCTTTGAAGTGTTTCAGCA  1184
            |..|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GCTGAGAGCCCCAGCTGGCGAAGCACCACGGTTCTTGGGCTCCTGGACATTTACGGCTTTGAAGTGTTTCAGCA  1184

Query 1185  TAACAGCTTTGAGCAGTTCTGCATCAATTACTGCAACGAGAAGCTGCAGCAGCTCTTCATCGAGCTCACGCTCA  1258
            |||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||
Sbjct 1185  TAACAGCTTCGAGCAGTTCTGCATCAACTACTGCAATGAGAAGCTGCAGCAGCTCTTCATCGAGCTGACTCTCA  1258

Query 1259  AGTCGGAGCAGGAGGAGTACGAGGCAGAGGGCATCGCGTGGGAGCCCGTCCAGTATTTCAACAACAAAATCATC  1332
            ||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||||||
Sbjct 1259  AGTCGGAGCAGGAGGAATACGAGGCTGAGGGCATCGCGTGGGAACCTGTCCAGTACTTCAACAACAAGATCATC  1332

Query 1333  TGTGATCTGGTGGAGGAGAAGTTTAAGGGCATCATCTCGATTTTGGATGAGGAGTGTCTGCGCCCCGGGGAGGC  1406
            |||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||.||.||||||||
Sbjct 1333  TGTGACCTGGTAGAGGAGAAGTTCAAGGGCATCATCTCCATCTTGGATGAAGAGTGCCTGCGTCCTGGGGAGGC  1406

Query 1407  CACAGACCTGACCTTCCTGGAGAAGCTGGAGGATACTGTCAAGCACCATCCACACTTCCTGACGCACAAGCTGG  1480
            |||.|||||||||||.|||||||||.|||||||.||||||||||.|||.||.||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1407  CACGGACCTGACCTTTCTGGAGAAGTTGGAGGACACTGTCAAGCCCCACCCTCACTTCCTGACGCACAAGCTCG  1480

Query 1481  CTGACCAGCGGACCAGGAAATCTCTGGGCCGAGGGGAATTCCGCCTTCTGCACTATGCGGGGGAGGTGACCTAC  1554
            ||||||||..|||||||||||||||.|.|||||||||.||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||
Sbjct 1481  CTGACCAGAAGACCAGGAAATCTCTAGACCGAGGGGAGTTCCGCCTTCTGCATTATGCTGGAGAGGTGACCTAC  1554

Query 1555  AGCGTGACCGGGTTTCTGGACAAAAACAATGACCTTCTCTTCCGGAACCTTAAGGAGACCATGTGTAGCTCAAA  1628
            ||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||.
Sbjct 1555  AGTGTGACTGGGTTTCTGGATAAAAACAATGACCTCCTCTTCCGGAACCTGAAGGAGACCATGTGCAGCTCAAT  1628

Query 1629  GAATCCCATTATGAGCCAGTGCTTTGACCGGAGCGAGCTCAGTGACAAGAAGCGGCCAGAGACGGTCGCCACCC  1702
            |||.|||||.|||..|||||||||||||..|||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1629  GAACCCCATCATGGCCCAGTGCTTTGACAAGAGTGAGCTCAGTGACAAGAAGCGGCCAGAGACGGTGGCCACCC  1702

Query 1703  AGTTCAAGATGAGCCTCCTGCAGCTGGTGGAGATCCTGCAGTCTAAGGAGCCCGCCTACGTCCGCTGCATCAAA  1776
            |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||..||||||||||||.|||||..||||.||||||||.
Sbjct 1703  AGTTCAAGATGAGCCTCCTGCAGCTCGTGGAGATCCTGAGGTCTAAGGAGCCTGCCTATATCCGGTGCATCAAG  1776

Query 1777  CCCAATGATGCCAAACAGCCCGGCCGCTTTGACGAGGTGCTGATCCGCCACCAGGTGAAGTACCTGGGGCTGTT  1850
            ||.||.||.|||||.|||||.||.||||||||.||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||.|
Sbjct 1777  CCAAACGACGCCAAGCAGCCGGGTCGCTTTGATGAGGTGCTCATCCGACATCAGGTGAAGTACCTGGGACTGAT  1850

Query 1851  GGAAAACCTGCGCGTGCGCAGAGCCGGCTTTGCCTATCGCCGCAAATACGAAGCTTTCCTGCAAAGGTACAAGT  1924
            |||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||.||||||||||
Sbjct 1851  GGAGAATCTGCGCGTGCGCAGAGCTGGCTTTGCCTATCGTCGCAAATATGAGGCTTTCCTGCAGAGGTACAAGT  1924

Query 1925  CACTGTGCCCAGAGACGTGGCCCACGTGGGCAGGACGGCCGCAGGATGGGGTGGCTGTGCTGGTCCGACACCTG  1998
            ||||||||||||||||.|||||||.|||||||||||||||.||||||||.|||||.|||.|||||.|||||||.
Sbjct 1925  CACTGTGCCCAGAGACATGGCCCATGTGGGCAGGACGGCCCCAGGATGGTGTGGCCGTGTTGGTCAGACACCTC  1998

Query 1999  GGCTACAAGCCAGAAGAGTACAAGATGGGCAGGACCAAGATCTTCATCCGCTTCCCCAAGACCCTGTTTGCCAC  2072
            |||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||.||||||||||
Sbjct 1999  GGCTACAAGCCAGAAGAGTACAAAATGGGCAGGACTAAGATCTTCATCCGATTTCCCAAGACCTTGTTTGCCAC  2072

Query 2073  AGAGGATGCCCTGGAGGTCCGGCGGCAGAGCCTGGCCACAAAGATCCAAGCTGCCTGGAGGGGCTTTCACTGGC  2146
            ||||||..|||||||.||||||||||||||.||.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct 2073  AGAGGACTCCCTGGAAGTCCGGCGGCAGAGTCTAGCCACCAAGATCCAGGCGGCCTGGAGGGGCTTTCATTGGC  2146

Query 2147  GGCAGAAATTCCTCCGGGTGAAGAGATCAGCCATCTGCATCCAGTCGTGGTGGCGTGGAACACTGGGCCGGAGG  2220
            |.||||||||.||||||||||||.|||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 2147  GACAGAAATTTCTCCGGGTGAAGCGATCAGCCATCTGTATCCAGTCATGGTGGCGTGGCACACTGGGCCGGAGG  2220

Query 2221  AAGGCAGCCAAGAGGAAGTGGGCGGCACAGACCATCCGGCGGCTCATCCGAGGCTTCATCCTGCGCCACGCCCC  2294
            |||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.||||||||.||||||||..|||||||..|.||
Sbjct 2221  AAGGCAGCCAAGAGGAAGTGGGCAGCCCAGACCATCCGTCGACTCATCCGTGGCTTCATTTTGCGCCATTCACC  2294

Query 2295  CCGCTGCCCCGAGAACGCCTTCTTCCTGGACCATGTGCGCACCTCTTTTTTGCTAAACCTGAGGCGGCAGCTGC  2368
            |||.|||||.|||||.|||||||||.|||||||.||||||.||||.||||||||.||||||||||||||.||||
Sbjct 2295  CCGGTGCCCTGAGAATGCCTTCTTCTTGGACCACGTGCGCGCCTCATTTTTGCTTAACCTGAGGCGGCAACTGC  2368

Query 2369  CCCGGAATGTCCTGGACACCTCGTGGCCCACGCCCCCACCTGCCCTGCGTGAGGCCTCAGAGCTTCTGCGGGAG  2442
            ||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||.|.|||||||||||.||.||.|||||.
Sbjct 2369  CCCGGAATGTTCTGGACACCTCCTGGCCCACACCCCCACCTGCCCTGAGAGAGGCCTCAGAACTGCTACGGGAA  2442

Query 2443  TTGTGCATAAAGAACATGGTGTGGAAATACTGCCGGAGTATCAGCCCTGAGTGGAAGCAGCAGCTGCAGCAGAA  2516
            .|||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 2443  CTGTGCATGAAGAACATGGTGTGGAAGTACTGCCGGAGCATCAGCCCTGAGTGGAAGCAGCAGCTGCAGCAAAA  2516

Query 2517  GGCCGTGGCTAGTGAGATCTTCAAGGGCAAGAAGGATAATTACCCTCAGAGTGTACCCAGGCTCTTCATCAGCA  2590
            |||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.|||||.||||||||.||||
Sbjct 2517  GGCGGTGGCTAGTGAAATTTTCAAGGGCAAGAAGGACAACTACCCCCAGAGTGTCCCCAGACTCTTCATTAGCA  2590

Query 2591  CTCGGCTTGGTACAGATGAGATCAGCCCCCGAGTGCTGCAGGCCTTGGGCTCTGAGCCCATTCAGTATGCGGTG  2664
            |.||||||||.|||||.||||||||||||.|||||||.||..|||||||||||||.|||||.||||||||.|||
Sbjct 2591  CACGGCTTGGCACAGAGGAGATCAGCCCCAGAGTGCTTCAATCCTTGGGCTCTGAACCCATCCAGTATGCCGTG  2664

Query 2665  CCTGTTGTGAAATACGACCGCAAGGGCTACAAGCCTCGCTCCCGGCAGCTGCTGCTCACGCCCAACGCCGTCGT  2738
            ||.||.||.|||||||||||.|||||.||||||||||||.||||||||||||||||||||||||..||.||.||
Sbjct 2665  CCCGTGGTAAAATACGACCGTAAGGGTTACAAGCCTCGCCCCCGGCAGCTGCTGCTCACGCCCAGTGCTGTGGT  2738

Query 2739  CATCGTGGAGGACGCCAAAGTCAAGCAGAGGATTGATTACGCCAACCTGACCGGAATCTCTGTCAGCAGCCTGA  2812
            |||.||||||||.||.||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 2739  CATTGTGGAGGATGCTAAAGTCAAGCAGAGAATTGATTATGCCAACCTAACCGGAATCTCTGTCAGTAGCCTGA  2812

Query 2813  GCGACAGTCTTTTTGTGCTTCATGTACAGCGTGCGGACAATAAGCAAAAGGGAGATGTGGTGCTGCAGAGTGAC  2886
            |.||.||.||.|||||||||||.||.|||||||..|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 2813  GTGATAGCCTATTTGTGCTTCACGTGCAGCGTGAAGACAACAAGCAGAAGGGAGATGTGGTGCTGCAGAGTGAT  2886

Query 2887  CACGTGATTGAGACGCTGACCAAGACAGCCCTCAGTGCCAACCGCGTGAACAGCATCAACATCAACCAGGGCAG  2960
            ||.|||||.|||||.||.||||||||.|||||||||||..||||||||||||..||||||||||||||||||||
Sbjct 2887  CATGTGATCGAGACACTAACCAAGACGGCCCTCAGTGCTGACCGCGTGAACAATATCAACATCAACCAGGGCAG  2960

Query 2961  CATCACGTTTGCAGGGGGCCCCGGCAGGGATGGCACCATTGACTTCACACCCGGCTCGGAGCTGCTCATCACCA  3034
            |||.||||||||||||||.||.||||||||.||||.|||||||||||||.|.|||||.|||||.||||||||||
Sbjct 2961  CATAACGTTTGCAGGGGGTCCAGGCAGGGACGGCATCATTGACTTCACATCGGGCTCAGAGCTTCTCATCACCA  3034

Query 3035  AGGCCAAGAACGGGCACCTGGCTGTGGTCGCCCCACGGCTGAATTCTCGG  3084
            ||||.|||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 3035  AGGCTAAGAATGGCCACCTGGCTGTGGTGGCCCCACGGCTGAATTCTCGG  3084