Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_06613
• Subject: NM_027892.2
• Aligned Length: 3132
• Identities: 2659
• Gaps: 162

Alignment

Query    1  ATGCAGATGGCGGACGCGAAGCAGAAGCGGAACGAGCAGCTGAAACGCTGGATCGGCTCCGAGACGGACCTCGA  74
            |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAAGATGGCGGACGCGAAGCAGAAGCGGAACGAGCAGCTGAAGCGCTGGATCGGCTCCGAGACGGACCTCGA  74

Query   75  GCCTCCGGTGGTGAAGCGCCAGAAGACCAAGGTGAAGTTCGACGATGGCGCCGTCTTCCTGGCTGCTTGCTCCA  148
            |||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||
Sbjct   75  GCCGCCCGTGGTGAAGCGCCAGAAGACCAAGGTGAAGTTCGACGATGGCGCCGTCTTCCTCGCCGCCTGCTCCA  148

Query  149  GCGGCGACACGGACGAGGTCCTCAAGCTGCTGCACCGCGGCGCCGACATCAATTACGCCAATGTGGACGGACTC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GCGGCGACACGGACGAGGTCCTCAAGCTGCTGCACCGCGGCGCCGACATCAATTACGCCAATGTGGACGGACTC  222

Query  223  ACTGCCCTGCACCAGGCTTGCATTGATGACAATGTTGATATGGTGAAGTTTCTGGTAGAAAATGGAGCAAATAT  296
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ACCGCCCTGCACCAGGCTTGCATTGATGACAATGTTGATATGGTGAAGTTTCTGGTAGAAAATGGAGCAAATAT  296

Query  297  TAATCAACCTGATAATGAAGGCTGGATACCACTACATGCAGCAGCTTCCTGTGGATATCTTGATATTGCAGAGT  370
            .|||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct  297  CAATCAACCTGACAATGAAGGCTGGATACCACTCCATGCAGCTGCTTCCTGTGGATATCTCGATATTGCAGAGT  370

Query  371  TTTTGATTGGTCAAGGAGCACATGTAGGGGCTGTCAACAGTGAAGGAGATACACCTTTAGATATTGCGGAGGAG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||
Sbjct  371  TTTTGATTGGTCAAGGAGCACATGTAGGAGCTGTCAACAGTGAAGGAGACACACCTTTAGATATTGCAGAGGAG  444

Query  445  GAGGCAATGGAAGAGCTACTTCAAAATGAAGTTAATCGGCAAGGGGTTGATATAGAAGCAGCTCGAAAGGAAGA  518
            |||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.||.||
Sbjct  445  GAGGCGATGGAAGAGCTACTTCAAAATGAGGTTAATCGGCAAGGTGTTGATATAGAAGCGGCTCGGAAAGAGGA  518

Query  519  AGAACGGATCATGCTTAGAGATGCCAGGCAGTGGCTAAATAGTGGTCATATAAATGATGTCCGGCATGCAAAAT  592
            .||.|||.|.|||||.|||||.||.|||||||||.||||.||.||.||.||.|.|||.||||||||||||||.|
Sbjct  519  GGAGCGGGTAATGCTAAGAGACGCGAGGCAGTGGTTAAACAGCGGCCACATCAGTGACGTCCGGCATGCAAAGT  592

Query  593  CTGGAGGTACAGCACTTCACGTTGCAGCTGCTAAAGGCTATACGGAAGTTTTAAAACTTTTAATACAGGCAGGC  666
            |.||.||.||||||||.|||||.||.||.||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CCGGGGGCACAGCACTCCACGTGGCGGCCGCCAAAGGCTATACAGAAGTGTTAAAACTTTTAATACAGGCAGGC  666

Query  667  TATGATGTTAATATTAAAGACTATGATGGCTGGACACCTCTTCATGCTGCAGCTCATTGGGGTAAAGAAGAAGC  740
            ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TATGATGTTAATATTAAAGATTATGATGGCTGGACACCTCTTCATGCTGCAGCTCATTGGGGTAAAGAAGAAGC  740

Query  741  ATGTCGAATTTTAGTGGACAATCTGTGTGATATGGAGATGGTCAACAAAGTGGGCCAAACAGCCTTTGATGTAG  814
            ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  ATGTCGGATTTTAGTGGACAATCTGTGTGATATGGAGACGGTCAACAAAGTGGGCCAAACAGCCTTTGATGTAG  814

Query  815  CAGATGAAGACATTTTAGGATATTTAGAAGAGTTGCAAAAGAAACAAAATCTGCTCCATAGTGAAAAACGGGAC  888
            ||||||||||||||||.||||||.||||||||||||||||.|||||||.|||||||||||||||.||.|||||.
Sbjct  815  CAGATGAAGACATTTTGGGATATCTAGAAGAGTTGCAAAAAAAACAAACTCTGCTCCATAGTGAGAAGCGGGAT  888

Query  889  AAGAAATCTCCACTAATTGAATCAACAGCAAATATGGACAATAATCAGTCACAGAAGACCTTTAAAAACAAAGA  962
            ||||||||||||||.||.||.||.||||||||||||||.||.|||||..||||||||.|.|||||||||||.||
Sbjct  889  AAGAAATCTCCACTGATCGAGTCCACAGCAAATATGGAAAACAATCAACCACAGAAGGCTTTTAAAAACAAGGA  962

Query  963  GACGTTGATTATTGAACCAGAGAAAAATGCATCCCGTATTGAATCTCTGGAACAAGAAAAGGTTGATGAAGAAG  1036
            .||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||.||||||||.||.||.||||.||||||.||.|
Sbjct  963  AACGTTGATTATTGAGCCAGAGAAAAATGCATCTCGCATCGAGTCTCTGGAGCATGAGAAGGCTGATGAGGAGG  1036

Query 1037  AAGAAGGAAAGAAGGATGAGTCTAGCTGCTCTAGTGAAGAAGATGAGGAAGATGACTCGGAATCAGAAGCTGAA  1110
            |||||||.||||||||.|||||.|||||.||.|||||.||.||.|||||.||.||.||.||.|||||.||.||.
Sbjct 1037  AAGAAGGCAAGAAGGACGAGTCGAGCTGTTCCAGTGAGGAGGACGAGGAGGACGATTCAGAGTCAGAGGCAGAG  1110

Query 1111  ACAGATAAGACAAAACCCCTGGCTTCTGTAACTAATGCCAACACTTCTAGTACACAAGCAGCTCCTGTAGCTGT  1184
            ||||||||||||||.|||.||||||||||||..|||||..|.|||||.||.||.||.|||||.||||.||||||
Sbjct 1111  ACAGATAAGACAAAGCCCATGGCTTCTGTAAGCAATGCTCATACTTCCAGCACGCAGGCAGCCCCTGCAGCTGT  1184

Query 1185  TACAACACCTACTGTGTCATCAGGTCAAGCA----ACACCTACATCACCTATTAAAAAGTTTCCAACCACAGCT  1254
            ||||.||||||||.||||.||    |||.||    ||.||||||||||||.|||||||||||||||...|..||
Sbjct 1185  TACAGCACCTACTCTGTCTTC----CAACCAGGGGACCCCTACATCACCTGTTAAAAAGTTTCCAATATCGACT  1254

Query 1255  ACAAAAATTTCTCCCAAAGAAGAAGAGAGAAAAGATGAGTCTCCTGCAACTTGGAGGTTAGGACTTAGAAAGAC  1328
            |||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||.|.|||||||||||.|||.|||||||
Sbjct 1255  ACAAAAATTTCTCCCAAAGAAGAGGAAAGAAAAGATGAGTCTCCTGCATCCTGGAGGTTAGGGCTTCGAAAGAC  1328

Query 1329  GGGCAGCTATGGTGCACTTGCTGAAATCACAGCATCTAAAGAGGGTCAGAAAGAAAAAGATACTGCAGGTGTTA  1402
            .|||||.||.|||||.||.||||||||||..||.||||||||.|..|||||.||.|||||.||||||||.||.|
Sbjct 1329  TGGCAGTTACGGTGCCCTGGCTGAAATCAGTGCGTCTAAAGAAGCCCAGAAGGAGAAAGACACTGCAGGGGTGA  1402

Query 1403  CACGTTCAGCTTCAAGTCCCAGACTTTCCTCCTCTTTGGATAATAAAGAAAAGGAGAAAGATAGTAAAGGAACT  1476
            ..||.||.|||||.|||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||||||.
Sbjct 1403  TGCGGTCGGCTTCCAGTCCGAGACTCTCGTCCTCTTTGGATAATAAAGAAAAGGAGAAAGATAACAAAGGAACG  1476

Query 1477  AGGCTTGCATATGTTGCACCTACAATACCAAGACGACTAGCCAGTACATCTGACATTGAAGAGAAAGAAAACAG  1550
            ||.|||||.|||||..|.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||
Sbjct 1477  AGACTTGCGTATGTCACCCCTACAATCCCGAGACGACTAGCCAGTACATCTGACATTGAAGAGAAGGAGAACAG  1550

Query 1551  AGATTCTTCAAGTTTGCGAACAAGTAGTTCATATACAAGGAGAAAATGGGAAGATGATCTTAAAAAAAATAGCT  1624
            |||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|
Sbjct 1551  AGAGTCTTCAAGTTTGCGAACAAGTAGTTCTTACACAAGAAGAAAATGGGAAGATGATCTTAAAAAGAATAGTT  1624

Query 1625  CAGTTAATGAAGGATCAACGTATCATAAAAGTTGCTCCTTTGGTAGAAGACAAGATGATTTGATTAGTTCTAGT  1698
            |..|.|||||||||||.||.||.||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1625  CGATCAATGAAGGATCCACTTACCATAGAAGTTGCTCCTTTGGTAGAAGACAAGATGATTTGATTAGTTGTAGT  1698

Query 1699  GTTCCAAGCACCACATCAACACCAACAGTTACCTCTGCAGCTGGGCTTCAGAAAAGCCTGCTTTCCAGCACAAG  1772
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.||||||.|.||||||||||||
Sbjct 1699  GTTCCAAGCACCACATCAACACCAACAGTTACCTCTGCAGCGGGGCTTCAGAGAAGCCTCCCTTCCAGCACAAG  1772

Query 1773  CACTACTACAAAGATTACAACGGGTTCTTCCTCAGCAGGCACACAAAGCAGTACCTCAAATCGTTTGTGGGCTG  1846
            ||||.||.||||||.|.|..|||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1773  CACTGCTGCAAAGACTCCCCCGGGTTCCTCCTCCGCAGGCACACAGAGCAGTACCTCAAATCGTTTGTGGGCTG  1846

Query 1847  AGGATAGTACTGAGAAAGAAAAGGACAGTGTTCCTACGGCAGTGACCATTCCTGTTGCTCCAACTGTTGTAAAT  1920
            ||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1847  AGGATAGTACTGAGAAAGAAAAGGACAGTGCTCCTACTGCAGTGACCATTCCTGTGGCTCCAACTGTTGTAAAT  1920

Query 1921  GCTGCAG---CTTCTACCACAACCCTGACTACAACTACTGCTGGCACTGTCTCCTCCACAACAGAGGTCAGGGA  1991
            |||||||   ||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||         |||||||||||
Sbjct 1921  GCTGCAGCTCCTTCCACCACCACCCTGACTACAACTACTGCTGGCACTGTTTCC---------GAGGTCAGGGA  1985

Query 1992  GAGACGCAGATCATACCTCACTCCTGTTAGGGATGAAGAGTCTGAATCCCAAAGAAAAGCAAGATCTAGACAAG  2065
            |||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1986  GAGACGCAGGTCATACCTCACTCCTGTTAGGGACGAAGAGTCTGAATCCCAAAGAAAAGCAAGATCTAGACAAG  2059

Query 2066  CAAGACAATCTAGAAGATCAACACAGGGAGTGACATTAACTGATCTTCAAGAAGCTGAGAAAACAATAGGAAGA  2139
            |||||||.||||||.|.|||||||||||.||.|||.|.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 2060  CAAGACAGTCTAGACGGTCAACACAGGGGGTAACACTGACTGATCTTCAGGAAGCTGAAAAAACAATAGGAAGA  2133

Query 2140  AGTCGTTCTACCCGAACCAGAGAACAAGAAAATGAAGAAAAAGAAAAAGAGGAAAAAGAGAAACAAGATAAAGA  2213
            |||||||||||..|||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||.||.||.||||||||
Sbjct 2134  AGTCGTTCTACGAGAACCAGAGAACAAGAAAATGAAGAGAAAGAAAAAGAAGAAAAGGAAAAGCAGGATAAAGA  2207

Query 2214  GAAACAAGAAGAAAAGAAGGAGTCAGAAACATCTAGAGAAGATGAATATAAACAAAAGTACTCCAGAACGTATG  2287
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.|
Sbjct 2208  GAAACAAGAAGAAAAGAAGGAGTCAGAAGCATCTAGAGAAGATGAATATAAACAAAAGTATTCAAGAACATACG  2281

Query 2288  ATGAGACTTAC-CAGCGTTATAGGCCAGTATCAACTTCAAGTTCAACCACTC---CATCCTCTTCACTTTCTAC  2357
            ||||||||||| || ||||||||.||.||.||||||||||||||||.|.|||   |.||.||.|||||.|||||
Sbjct 2282  ATGAGACTTACACA-CGTTATAGACCTGTGTCAACTTCAAGTTCAAGCGCTCCGTCGTCGTCCTCACTCTCTAC  2354

Query 2358  TATGAGCAGTTCACTGTATGCTTCAAGTCAACTAAACAGGCCAAATAGTCTTGTAGGCATAACTTCTGCTTACT  2431
            |.|..||||..||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.||||
Sbjct 2355  TCTAGGCAGCACACTCTATGCCTCAAGTCAGCTCAACAGGCCAAACAGTCTTGTAGGTATAACCTCTGCCTACT  2428

Query 2432  CCAGAGGAATAACAAAAGAAAATGAAAGAGAGGGAGAAAAAAGAGAAGAGGAGAAAGAAGGAGAAGATAAATCA  2505
            ||.|.|||.||.|.||||||||.||.|||||||||||.||||.||||||||||||||||||.||||||||.|||
Sbjct 2429  CCCGGGGATTAGCCAAAGAAAACGAGAGAGAGGGAGAGAAAAAAGAAGAGGAGAAAGAAGGGGAAGATAAGTCA  2502

Query 2506  CAACCTAAATCAATCAGAGAACGACGACGACCAAGAGAGAAAAGAAGATCTACAGGAGTTTCATTTTGGACACA  2579
            ||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.||..||.|.|||||.|||||.||.||.||||||||
Sbjct 2503  CAGCCTAAGTCAATCAGAGAACGACGGCGACCCAGAGAAAAGCGACGGTCTACTGGAGTCTCCTTCTGGACACA  2576

Query 2580  AGATAGTGATGAAAATGAACAAGAACAACAATCAGACACAGAAGAGGGATCCAATAAGAAAGAAACTCAGACGG  2653
            ||||||||||||||||||.|||||.|..|||||.|||||.||.||.||.||||..||||.|||.||.|||||||
Sbjct 2577  AGATAGTGATGAAAATGAGCAAGAGCGGCAATCGGACACTGAGGACGGCTCCAGCAAGAGAGAGACGCAGACGG  2650

Query 2654  ATTCCATTTCTAGATATGAAACCAGTTCTACATCAGCTGGTGATCGATATGATTCCTTGCTGGGTCGCTCTGGA  2727
            ||||..||||.||.|||||.|.||||||.||||||.|..|||||||.|||||||||||||||||||||||||..
Sbjct 2651  ATTCTGTTTCCAGGTATGACAGCAGTTCCACATCATCAAGTGATCGGTATGATTCCTTGCTGGGTCGCTCTGCT  2724

Query 2728  TCATACAGTTACTTAGAAGAAAGAAAACCTTACAGCAGCAGGCTAGAAAAGGATGACTCAACTGACTTTAAAAA  2801
            ||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 2725  TCATACAGTTACTTAGAAGACAGAAAACCTTACAGTAGCAGGCTAGAAAAGGATGACTCAACTGACTTCAAAAA  2798

Query 2802  GCTTTATGAACAAATTCTAGCTGAAAATGAAAAGCTGAAGGCACAGCTACATGATACAAATATGGAACTAACAG  2875
            ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 2799  GCTTTATGAACAAATTTTAGCTGAAAATGAAAAGCTAAAAGCACAGCTACATGATACAAATATGGAACTAACGG  2872

Query 2876  ATCTTAAATTACAGTTGGAAAAGGCCACCCAGAGACAAGAAAGATTTGCTGATAGATCACTGTTGGAAATGGAA  2949
            ||||.||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||.||||||||||.||.||||..|||||.||||||
Sbjct 2873  ATCTAAAGTTGCAGTTGGAAAAGGCTACCCAGAGACAAGAACGATTTGCTGACAGGTCACAATTGGAGATGGAA  2946

Query 2950  AAAAG-------------------------------GGAACGAAGAGCTCTAGAAAGAAGAATATCTGAAATGG  2992
            |||||                               ||||||||||||||||||||||||||||||        
Sbjct 2947  AAAAGGGTGGCCGGCAAGAGTCAGTATCTTCTGGGCGGAACGAAGAGCTCTAGAAAGAAGAATATC--------  3012

Query 2993  AAGAAGAGCTCAAAATGTTACCAGACCTAAAAGCAGACAACCAGAGGCTAAAGGATGAAAATGGGGCCTTGATC  3066
                                                                                      
Sbjct 3013  --------------------------------------------------------------------------  3012

Query 3067  AGAGTTATAAGCAAACTTTCCAAA  3090
                                    
Sbjct 3013  ------------------------  3012