Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_06622
- Subject:
- NM_001322019.1
- Aligned Length:
- 1153
- Identities:
- 1028
- Gaps:
- 116
Alignment
Query 1 ATGGCCTTGCGGCTCCTGAAGCTGGCAGCGACGTCCGCGTCCGCCCGGGTCGTGGCGGCGGGCGCCCAGCGCGT 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCCTTGCGGCTCCTGAAGCTGGCAGCGACGTCCGCGTCCGCCCGGGTCGTGGCGGCGGGCGCCCAGCGCGT 74
Query 75 GAGAGGAATTCATAGCAGTGTGCAGTGCAAGCTGCGCTATGGAATGTGGCATTTCCTACTTGGGGATAAAGCAA 148
||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GAGAGGAATTCATAGCAGTGTGCAGTGCAAACTGCGCTATGGAATGTGGCATTTCCTACTTGGGGATAAAGCAA 148
Query 149 GCAAAAGACTGACAGAACGCAGCAGAGTGATAACTGTAGATGGCAATATATGTACTGGAAAAGGCAAACTTGCA 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 GCAAAAGACTGACAGAACGCAGCAGAGTGATAACTGTAGATGGCAATATATGTACTGGAAAAGGCAAACTTGCA 222
Query 223 AAAGAAATAGCAGAGAAACTAGGCTTCAAGCACTTTCCTGAAGCGGGGATTCATTATCCAGACAGTACCACAGG 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 AAAGAAATAGCAGAGAAACTAGGCTTCAAGCACTTTCCTGAAGCGGGGATTCATTATCCAGACAGTACCACAGG 296
Query 297 AGATGGGAAGCCCCTCGCCACCGACTATAATGGCAACTGTAGTTTGGAGAAATTTTACGATGATCCGAGAAGCA 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 AGATGGGAAGCCCCTCGCCACCGACTATAATGGCAACTGTAGTTTGGAGAAATTTTACGATGATCCGAGAAGCA 370
Query 371 ATGATGGCAACAGTTACCGCCTGCAGTCCTGGTTGTACAGCAGTCGCCTGCTGCAGTACTCAGATGCCTTGGAG 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 ATGATGGCAACAGTTACCGCCTGCAGTCCTGGTTGTACAGCAGTCGCCTGCTGCAGTACTCAGATGCCTTGGAG 444
Query 445 CACTTGCTGACCACAGGACAAGGTGTTGTGTTGGAGCGCTCCATCTTCAGTGACTTTGTGTTCCTGGAGGCGAT 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CACTTGCTGACCACAGGACAAGGTGTTGTGTTGGAGCGCTCCATCTTCAGTGACTTTGTGTTCCTGGAGGCGAT 518
Query 519 GTACAACCAGGGATTCATCCGAAAGCAGTGTGTGGACCACTACAACGAGGTGAAGAGCGTCACCATCTGCGATT 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GTACAACCAGGGATTCATCCGAAAGCAGTGTGTGGACCACTACAACGAGGTGAAGAGCGTCACCATCTGCGATT 592
Query 593 ACCTGCCCCCCCACCTGGTGATTTACATCGATGTGCCCGTTCCAGAGGTCCAGAGGCGGATTCAGAAGAAAGGA 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 ACCTGCCCCCCCACCTGGTGATTTACATCGATGTGCCCGTTCCAGAGGTCCAGAGGCGGATTCAGAAGAAAGGA 666
Query 667 GATCCACATGAAATGAAGATCACCTCTGCCTATCTACAGGACATTGAGAATGCCTATAAGAAAACCTTTCTCCC 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GATCCACATGAAATGAAGATCACCTCTGCCTATCTACAGGACATTGAGAATGCCTATAAGAAAACCTTTCTCCC 740
Query 741 TGAGATGAGTGAAAAATGTGAGGTTTTACAGTATTCTGCAAGGGAAGCTCAAGATTCAAAAAAGGTGGTAGAGG 814
||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TGAGATGAGTGAAAAATGTGAGGTTTTACAATATTCTGCAAGGGAAGCTCAAGATTCAAAAAAGGTGGTAGAGG 814
Query 815 ACATTGAATACCTGAAGTTCGATAAAGGGCCGTGGCTCAAGCAGGACAATCGCACTTTATACCACCTGCGATTA 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 ACATTGAATACCTGAAGTTCGATAAAGGGCCGTGGCTCAAGCAGGACAATCGCACTTTATACCACCTGCGATTA 888
Query 889 CTGGTTCAGGATAAGTTTGAGGTGCTGAATTACACAAGCATTCCTATCTTTCTCCCGGAAGTCACCATTGGAGC 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 CTGGTTCAGGATAAGTTTGAGGTGCTGAATTACACAAGCATTCCTATCTTTCTCCCGGAAGTCACCATTGGAGC 962
Query 963 TCATCAGACTGACCGTGTCTTACATCAGTTCAGAGAGCTGCCGGGCCGCAAGTACAG------CCCTGGGTACA 1030
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||.||| |..||| |
Sbjct 963 TCATCAGACTGACCGTGTCTTACATCAGTTCAGAG---------------AGTTCAGTCTCTTCAATGG----A 1017
Query 1031 ACACCGAGGTGGGAGACAAGTG-------GAT-CTG-GC--------TGAAG---------------------- 1065
| ||.||.||..|| ||| ||| || |||||
Sbjct 1018 A---------GGAAGCCAGATGCTGTTAAGATACTGTGCTCCCTCCTTGAAGCTGATCGTTCCCTCCTTGAAGC 1082
Query 1066 ------------------------------------------- 1065
Sbjct 1083 TGATCGTTCCCTCCTTGAAGCTGATCGTGTCCAAGATAGTTGC 1125